Research activity information

• Sep. 2017 一般社団法人産業応用工学会, Best Paper Award, Estimation of Calf Weight from Fixed-Point Stereo Camera Images Using Three-Dimensional Successive Cylindrical Model

  山下 歩, OHKAWA TAKENAO, 大山 憲二, 太田 能, 西出 亮, 本多 健

  International society


• Aug. 2016 Secretariat for AAAP2016, 17th AAAP Animal Science Congress Young Scientists Award, Estimation of genetic parameters for stillbirth of Japanese Black cattle in Kagoshima

  Oyama H, Nishi K, Imamura K, Sakamoto S, Kawabe K, Okamoto S, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, Shimogiri T

  International society

• Estimation of genetic parameters for carcass grading traits, image analysis traits, and monounsaturated fatty acids in Japanese Black cattle from Hyogo Prefecture.

  Namiko Kohama, Emi Yoshida, Tatsunori Masaki, Eiji Iwamoto, Moriyuki Fukushima, Takeshi Honda, Kenji Oyama

  Genetic parameters for carcass grading traits, image analysis traits, and monounsaturated fatty acid (MUFA) percentages were estimated in 29,942 Japanese Black cattle from Hyogo Prefecture. The analyzed traits included five carcass grading traits, two image analysis traits, fat area ratio and fineness index, and two MUFA traits, one measured in intermuscular fat using near-infrared spectroscopy (NIRS) and the other in intramuscular fat using gas chromatography (GC). The heritability estimates of image analysis traits and MUFA were moderate to high, ranging from 0.395 to 0.740, and it was considered that they could be improved simultaneously with carcass grading traits because no severe genetic antagonism was observed. Although the heritability of the NIRS-based intermuscular MUFA was slightly lower than that of the GC-based intramuscular MUFA, the genetic correlation between the two methods was as high as 0.804. These results indicate that the NIRS method can be used as an alternative evaluation procedure to predict MUFA in intramuscular fat in the longissimus muscle.

  Dec. 2021, Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho, 92(1) (1), e13664, English, International magazine

  Scientific journal

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• Effects of carcass traits, proportion of monounsaturated fatty acids and fineness index of marbling on the carcass unit price of Japanese Black cattle in Hyogo prefecture

  Namiko KOHAMA, Takayuki AKIYAMA, Moriyuki HUKUSHIMA, Takeshi HONDA, Kenji OYAMA

  Japanese Society of Animal Science, Nov. 2021, Nihon Chikusan Gakkaiho, 92(4) (4), 511 - 517

  Scientific journal


• A Novel Indicator for Evaluating the Change of Genetic Composition of a Developed Pig Strain

  Takeshi Honda, Kenji Oyama, Masahiro Sato

  Sep. 2021, The Japanese Journal of Swine Science, 58(3) (3), 125 - 133, Japanese

  [Refereed]


• Estimation of genetic parameters for stillbirth of Japanese Black cattle in Kagoshima

  Hidemi OYAMA, Kiyoto IMAMURA, Shinichi SAKAMOTO, Kazutaka NISHI, Kotaro KAWABE, Shin OKAMOTO, Takeshi HONDA, Kenji OYAMA, Takeshi SHIMOGIRI

  Japanese Society of Animal Science, Aug. 2021, Nihon Chikusan Gakkaiho, 92(3) (3), 285 - 291

  Scientific journal


• Detection of candidate polymorphisms around the QTL for fat area ratio to rib eye area on BTA7 using whole‐genome resequencing in Japanese Black cattle

  Shinji Sasazaki, Fuki Kawaguchi, Ayaka Nakajima, Raito Yamamoto, Takayuki Akiyama, Namiko Kohama, Emi Yoshida, Eiji Kobayashi, Takeshi Honda, Kenji Oyama, Hideyuki Mannen

  Wiley, Jan. 2020, Animal Science Journal, 91(1) (1), e13335

  [Refereed]

  Scientific journal

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• Estimation of genetic parameters of defective appearances in Japanese Black heifer calves in Kagoshima

  Oyama H, Imamura K, Sakamoto S, Nishi K, Kawabe K, Okamoto S, Honda T, Oyama K, Shimogiri T

  Jan. 2020, Animal Science Journal, 91, e13338

  [Refereed]

  Scientific journal


• Estimation of lethal equivalents in the Tajima beef cattle

  Takeshi Honda, Kenji Oyama

  Lead, Nov. 2019, 日本畜産学会報, 90(4) (4), 337 - 340, Japanese

  [Refereed]

  Scientific journal


• Pool-based genome-wide association study identified novel candidate regions on BTA9 and 14 for oleic acid percentage in Japanese Black cattle

  Fuki Kawaguchi, Hiroto Kigoshi, Ayaka Nakajima, Yuta Matsumoto, Yoshinobu Uemoto, Moriyuki Fukushima, Emi Yoshida, Eiji Iwamoto, Takayuki Akiyama, Namiko Kohama, Eiji Kobayashi, Takeshi Honda, Kenji Oyama, Hideyuki Mannen, Shinji Sasazaki

  Wiley, Aug. 2018, Animal Science Journal, 89(8) (8), 1060 - 1066, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• A genome-wide association study for fat-related traits computed by image analysis in Japanese Black cattle

  Ayaka Nakajima, Fuki Kawaguchi, Yoshinobu Uemoto, Moriyuki Fukushima, Emi Yoshida, Eiji Iwamoto, Takayuki Akiyama, Namiko Kohama, Eiji Kobayashi, Takeshi Honda, Kenji Oyama, Hideyuki Mannen, Shinji Sasazaki

  Wiley, May 2018, Animal Science Journal, 89(5) (5), 743 - 751, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Calf Weight Estimation with Stereo Camera Using Three-Dimensional Successive Cylindrical Model

  Ayumi Yamashita, Takenao Ohkawa, Kenji Oyama, Chikara Ohta, Ryo Nishide, Takeshi Honda

  Various studies have been conducted on methods for estimating the weight of cattle. In this study, we propose a method to estimate body weight by modeling the shape of calf using three-dimensional information extracted from the stereo images. Initially, a stereo camera is set with two fixed network cameras, to take a motion image of a calf. Three-dimensional coordinate is calcu

  The Institute of Industrial Applications Engineers, Jan. 2018, Journal of the Institute of Industrial Applications Engineers (JIIAE), 6(1) (1), 39 - 46, English

  [Refereed]

  Scientific journal

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• 鹿児島県産黒毛和種における損徴発生状況に関する調査研究

  小山 秀美, 今村 清人, 坂元 信一, 西 和隆, 井上 慶一, 河邊 弘太郎, 岡本 新, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, 下桐 猛

  Defects in appearance of Japanese Black cattle are not only impairing the characteristics of the breed but also inflicting economic losses on farmers in Japan. The objective of this study was to investigate the incidence of the four kinds of defects using 511,337 calf test records of Japanese Black heifer calves born in Kagoshima prefecture in April 1999 through March 2015. The defects included were white spotting (WS), tongue's defect (TD), nipple's defect (ND) and defect of coat color (DC). The defect incidence rate ranged from 0.29% for DC to 3.68% for WS. All incidences increased from 1999 to 2015. In addition, site of occurrence for WS has changed, and a decreased trend in ratio of udder-specific WS was observed. Regression coefficients of the incidences of WS on the level of inbreeding were significantly positive (P<0.05). The defect incidence of daughters was significantly different between normal and defective dams (P<0.01) except for DC. Moreover, highly positive correlations were found between the sire-by-sire incidence rates crossed with normal dams and defective dams in WS and TD, suggesting that sires could be influential factor for the incidence. Our results showed the possibility to reduce the appearance defects of Japanese Black by considering the mates.

  Japanese Society of Animal Science, Nov. 2017, 日本畜産学会報, 88(4) (4), 425 - 430, Japanese

  [Refereed]

  Scientific journal


• Preservation of Genetic Diversity of the Asian Native Goats

  Honda T, Shibano M, Matsumoto H, Sasazaki S, Oyama K, Mannen H

  Sep. 2017, Animal Veterinary Sciences, 5, 69 - 72, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Estimation of Calf Weight from Fixed-Point Stereo Camera Images Using Three-Dimensional Successive Cylindrical Model

  Ayumi Yamashita, Takenao Ohkawa, Kenji Oyama, Chikara Ohta, Ryo Nishide, Takeshi Honda

  Various studies have been conducted on methods for estimating the weight of cattle. In this study, we propose a method to estimate body weight by modeling the shape of calf using three-dimensional information extracted from the stereo images. Initially, a stereo camera is set with two fixed network cameras, to take a motion image of a calf. Three-dimensional coordinate is calcu

  The Institute of Industrial Applications Engineers, Jul. 2017, The 5th IIAE International Conference on Intelligent Systems and Image Processing 2017 (ICISIP2017), 247 - 254, English

  [Refereed]

  International conference proceedings


• Genetic relationships between meat quality traits and fatty acid composition in Japanese black cattle

  Keiichi Inoue, Noriaki Shoji, Takeshi Honda, Kenji Oyama

  Jan. 2017, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 88(1) (1), 11 - 18, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Inferring phenotypic causal structures among meat quality traits and the application of a structural equation model in Japanese Black cattle

  K. Inoue, B. D. Valente, N. Shoji, T. Honda, K. Oyama, G. J. M. Rosa

  Oct. 2016, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 94(10) (10), 4133 - 4142, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Identification of SNP associated with fertility trait using pool-based genome-wide association study in Japanese Black cattle.

  H. Ozaki, T. Tamura, K. Fukazawa, Y. Uemoto, M. Nishio, E. Kobayashi, T. Matsuhashi, S. Maruyama, T. Honda, K. Oyama, S. Sasazaki, H. Mannen

  Sep. 2016, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 94, 21 - 21, English


• Identification of polymorphisms associated with oleic acid percentage by pool-based genome-wide association study in Japanese Black cattle.

  F. Kawaguchi, A. Nakajima, Y. Matsumoto, Y. Uemoto, M. Fukushima, E. Yoshida, E. Iwamoto, T. Akiyama, N. Kohama, E. Kobayashi, T. Honda, K. Oyama, H. Mannen, S. Sasazaki

  Sep. 2016, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 94, 17 - 18, English


• Genome-wide association study identifies a QTL for fat percentage in ribeye area on BTA10 in Japanese Black cattle.

  A. Inoue, T. Nakajima, A. Nakajima, Y. Uemoto, M. Fukushima, E. Yoshida, E. Iwamoto, T. Akiyama, N. Kohama, E. Kobayashi, K. Oyama, T. Honda, H. Mannen, S. Sasazaki

  Sep. 2016, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 94, 17 - 17, English


• Estimation of genetic parameters for carcass defects of Japanese Black cattle in Kagoshima

  Kazutaka Nishi, Takeshi Shimogiri, Akinori Kusano, Shinichi Sakamoto, Kiyomi Shiromoto, Kotaro Kawabe, Shin Okamoto, Takeshi Honda, Kenji Oyama

  May 2016, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 87(5) (5), 655 - 660, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Economic losses related to internal diseases in Japanese black cattle

  Keiichi Inoue, Takeshi Honda, Kenji Oyama

  May 2016, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 87(5) (5), 736 - 741, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Change of fatty acid composition of the lumbar longissimus during the final stage of fattening in the Japanese Black cattle

  Takeshi Honda, Takafumi Ishida, Ikuo Kobayashi, Yusuke Oguri, Yuto Mizuno, Hideyuki Mannen, Hiroaki Iwaisaki, Shiro Kuge, Kunihiko Saito, Kenji Oyama

  Apr. 2016, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 87(4) (4), 578 - 583, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Extraction of Interaction Information Between Breeding Cows with GPS and Its Application to Estrus Detection

  Kengo Matsumoto, Kenji Oyama, Takeshi Honda, Takenao Ohkawa

  2016, 2016 INTERNATIONAL JOINT CONFERENCE ON NEURAL NETWORKS (IJCNN), 2967 - 2972, English

  [Refereed]

  International conference proceedings


• A Method of Detecting Interaction Between Breeding Cows from Time-series Bird's Eye Pictures of Pasture

  Yoji Hosomi, Kenji Oyama, Takeshi Honda, Takenao Ohkawa

  2016, 2016 INTERNATIONAL JOINT CONFERENCE ON NEURAL NETWORKS (IJCNN), 2973 - 2978, English

  [Refereed]

  International conference proceedings


• 放牧場の俯瞰動画データを用いた繁殖牛のインタラクション検出

  HOSOMI YOJI, OHKAWA TAKENAO, OYAMA Kenji, HONDA Takeshi

  May 2015, 電気学会 第62回情報システム研究会, IS-15-009, Japanese

  Symposium


• GPSを利用した放牧牛のインタラクション情報の取得とその分析

  MATSUMOTO Kengo, OHKAWA TAKENAO, OYAMA Kenji, HONDA Takeshi

  May 2015, 電気学会 第62回情報システム研究会, IS-15-001, Japanese

  Symposium


• Genetic relationships between internal diseases diagnosed at slaughter and carcass traits in Japanese Black cattle

  Inoue K, Honda T, Oyama K

  May 2015, Journal of Animal Science, 93(6) (6), 2714 - 2721, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Searching for phenotypic causal links among meat quality traits in Japanese Black cattle

  Inoue K, Valente DB, Shoji N, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, Rosa JMG

  Aug. 2014, Proceedings of 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 749, English

  [Refereed]

  International conference proceedings


• 兵庫系黒毛和種における育種集団毎の遺伝的多様性評価

  福島 護之, 本多 健, 小路 怜子, 小浜 菜美子, 秋山 敬孝, 坂瀬 充洋, 岡 章生, 大山 憲二

  (公社)日本畜産学会, Sep. 2013, 日本畜産学会大会講演要旨集, 117回, 65 - 65, Japanese


• Comparative analysis on gene expression profiles in longissimus dorsi muscle of Japanese Black cattle

  MATSUMOTO H, OGURI Y, MIZUNO Y, ISHIDA T, KOBAYASHI I, IWAISAKI H, SAITO K, SASAGO N, KOBAYASHI E, KUGE S, HONDA Takeshi, SASAZAKI Shinji, OYAMA Kenji, MANNEN Hideyuki

  Recently, fatty acid composition has been recognized as an important economic trait of Japanese Black cattle. The aim of this study was to seek for candidate genes which might be useful for beef breeding to increase the mono-unsaturated fatty acid (MUFA) level. For this purpose, we compared gene expression profile of Japanese Black cattle which showed high percentage of MUFA in

  日本動物遺伝育種学会, Jun. 2013, The Journal of Animal Genetics, 41(1) (1), 7 - 14, Japanese

  [Refereed]

  Scientific journal


• Sampling method for estimating neutral allele frequency in a pedigreed population

  Takeshi Honda, Shinji Sasazaki, Kenji Oyama, Fumio Mukai, Tetsuro Nomura

  Jun. 2012, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 129(3) (3), 226 - 233, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Heritabilities and genetic correlations of fatty acid compositions in longissimus muscle lipid with carcass traits in Japanese Black cattle

  T. Nogi, T. Honda, F. Mukai, T. Okagaki, K. Oyama

  Mar. 2011, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 89(3) (3), 615 - 621, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Estimates of milk yield until 90 days after calving in Japanese Black cows

  TSUJI Emi, HONDA Takeshi, KUGE Shiro, OYAMA Kenji

  2011, 肉用牛研究会報, 90, 10 - 14, Japanese

  [Refereed]

  Scientific journal


• Demographic analysis of breeding structure in Japanese thoroughbred population

  Jun Yamashita, Hironori Oki, Telhisa Hasegawa, Takeshi Honda, Tetsuro Nomura

  Jun. 2010, Journal of Equine Science, 21(2) (2), 11 - 16, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Genetic variability of semen characteristics in Japanese Black bulls

  NISHIMURA Kenichi, HONDA Takeshi, OYAMA Kenji

  2010, The Journal of Animal Genetics, 38(2) (2), 73 - 76, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Gene dropping analysis of ancestral contributions and allele survival in Japanese Thoroughbred population

  Jun Yamashita, Hironori Oki, Telhisa Hasegawa, Takeshi Honda, Tetsuro Nomura

  2010, Journal of Equine Science, 21(3) (3), 39 - 45, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Simulation Study on Parentage Analysis with SNPs in the Japanese Black Cattle Population

  Takeshi Honda, Tomohiro Katsuta, Fumio Mukai

  Oct. 2009, ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES, 22(10) (10), 1351 - 1358, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Number of Calves Produced at Specified Age as a Measure of Reproductive Performance in Beef Cattle under Artificially-Inseminated Breeding Scheme

  Kenji Oyama, Shinya Fujiwara, Tomohiro Katsuta, Takeshi Honda, Fumio Mukai

  Feb. 2009, ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES, 22(2) (2), 162 - 167, English

  [Refereed]

  Scientific journal


• Evaluation of genetic diversity in Japanese Brown cattle population by pedigree analysis

  T Honda, T Fujii, T Nomura, F Mukai

  Jun. 2006, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 123(3) (3), 172 - 179, English

  [Refereed]

  Scientific journal

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• Monitoring and preservation of genetic diversity in livestock breeds: a case study of the Japanese Black cattle population

  Nomura Tetsuro, MUKA Fumio, Honda Takeshi

  2006, Current Topics in Genetics, Vol.1 pp59-71, English

  [Refereed]


• Prediction of inbreeding in commercial females maintained by rotational mating with partially isolated sire lines

  T Honda, T Nomura, F Mukai

  Oct. 2005, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 122(5) (5), 340 - 348, English

  [Refereed]

  Scientific journal

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• Conservation of genetic diversity in the Japanese Black cattle population by the construction of partially isolated lines

  T Honda, T Nomura, F Mukai

  Jun. 2005, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 122(3) (3), 188 - 194, English

  [Refereed]

  Scientific journal

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• 但馬牛集団のジーンドロッピング法による系統分類の試み

  福島 護之, 坂瀬 充洋, 野田 昌信, 武田 和士, 上野 悟, 本多 健, 大山 憲二, 向井 文雄

  但馬牛における始祖個体遺伝子の消長をジーンドロッピング法で調べ，その結果を基に普遍的な系統分類の方法を検討した．1 現存牛の血統を可能な限り遡り出現した牛のうち名号，生年月日が明らかで，産地が兵庫県内の牛を始祖個体としたところ，条件を全て満たす個体は1,461頭(累計遺伝的寄与率0.773)となった．系統分類のための始祖個体は，Pr(lost)の小さい100頭に限定した．2 始祖個体の生産地は城崎郡14頭(累積寄与率0.0314)，出石郡2頭(累積寄与率0.0002)，美方郡82頭(累積寄与率0.637)と養父郡2頭であったが，当時の郡境からは養父郡の2頭は美方郡に分類されていると考えられ，美方郡産が84頭にのぼり寄与率が高かった．3 現存個体27,138頭に対する始祖個体からの遺伝的寄与率を計算し，その結果を基に主成分分析を行った．第3主成分までで約85％を説明でき，現在個体の頭数割合が3.7～25.9％の8グループに分類できた．4 各グループ内及びグループ間の平均血縁係数から，G1～G4とG8ではグループ間の平均血縁係数がグループ内の平均血縁係数よりも高いグループが存在し，近年は系統外の種雄牛との交配が増加したことに起因すると考えられた．G5～G7では，グループ内の平均血縁係数が最も高く，依然，系統内交配が主流であると考えられた．5 グループ毎の近交係数は，16,143頭の結果からG1～G4では13.0～17.8％と低く，G5～G8で18.7～23.2％と高い傾向にあった．6 グループ毎の枝肉重量の育種価の平均は-8.1～-2.7とグループ間でばらついていた．BMS育種価の平均に関しても，0.63～1.00とばらついていたが，各グループともに最大値をみると1.477～2.137と能力が高い個体から含まれていた．以上の結果から，ジーンドロッピング法により選定した100頭の始祖個体を元にした系統分類法によって現在の但馬牛を分類することが可能であり，頭数や産肉能力から見ても遺伝的多様性を保持しつつ，今後の改良が可能であることが明らかとなった．

  兵庫県立農林水産技術総合センター, 2005, 兵庫県立農林水産技術総合センター研究報告〔畜産編〕, 41 16-21(41) (41), 16 - 21, Japanese

  [Refereed]

  Scientific journal


• Genealogical relationship between pedigree and microsatellite information and analysis of genetic structure of a highly inbred Japanese black cattle strain

  S Sasazaki, T Honda, M Fukushima, K Oyama, H Mannen, F Mukai, S Tsuji

  Oct. 2004, ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES, 17(10) (10), 1355 - 1359, English

  Scientific journal


• Reduction of inbreeding in commercial females by rotational mating with several sire lines

  T Honda, T Nomura, F Mukai

  Lead, Sep. 2004, GENETICS SELECTION EVOLUTION, 36(5) (5), 509 - 526, English

  [Refereed]

  Scientific journal

  Link to Kobe Univ. Repository (Kernel)


• Monitoring of genetic diversity in the Japanese Black cattle population by the use of pedigree information

  T Honda, T Nomura, Y Yamaguchi, F Mukai

  Aug. 2004, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 121(4) (4), 242 - 252, English

  [Refereed]

  Scientific journal

  Link to Kobe Univ. Repository (Kernel)


• Pedigree analysis of genetic subdivision in a population of Japanese Black cattle

  HONDA Takeshi, NOMURA Tetsuro, YAMAGUCHI Yuki, MUKAI Fumio

  Dec. 2002, Anim. Sci. J., 73(6) (6), 445 - 452, English


• Gene dropping analysis of founder contributions in a closed Japanese black cattle population

  HONDA Takeshi, NOMURA Tetsuro, FUKUSHIMA Moriyuki, MUKAI Fumio

  Apr. 2002, Anim. Sci. J., 73(2) (2), 105 - 111, English


• Inbreeding and effective population size of Japanese Black cattle

  T Nomura, T Honda, F Mukai

  Feb. 2001, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 79(2) (2), 366 - 370, English

  [Refereed]

  Scientific journal

• A consideration on the sampling method for fecal microbiota studies in a cattle population

  Takeshi Honda, Ryoto Murata, Daisuke Tanaka, Itsuko Fukuda, Kenji Oyama

  Lead, May 2024, Kansai Journal of Animal Science, (181) (181), 7 - 11, Japanese

  [Refereed]

  Report scientific journal


• 但馬牛における遺伝的多様性の維持のための取り組みと致死相当量の推定

  本多健

  Lead, Jun. 2020, 畜産技術, (781) (781), 2 - 6, Japanese


• 黒毛和種の遺伝的多様性の評価と維持・回復のための方策

  NOMURA TETSURO, HONDA TAKESHI

  2012, 最新農業技術 畜産, 4, 127 - 136, Japanese

  Introduction other


• 黒毛和種の遺伝的多様性の評価と維持・回復のための方策

  NOMURA TETSURO, HONDA TAKESHI

  2011, 農業技術体系・畜産編追録, (30) (30), 154の32 - 154の41, Japanese

  Introduction other


• 黒毛和種の集団構造に関する遺伝学的分析

  HONDA TAKESHI

  全国和牛登録協会, 2009, 和牛, 60(3) (3), 4 - 10, Japanese

  Introduction other


• テントウムシ集団の遺伝学的研究 (バイオリージョナリズムに基礎をおく京都の自然と生活文化に関する調査およびその展開) (平成16年度共同研究プロジェクト研究成果報告)

  野村 哲郎, 飯田 智, 祝前 博明, 本多 健

  京都産業大学, Jul. 2005, 京都産業大学総合学術研究所所報, 3, 131 - 148, Japanese

• 捕獲した野生動物集団の遺伝的構成を維持するための新しい遺伝的管理法

  本多健, 大山憲二

  日本生態学会第69回全国大会, Mar. 2022


• 但馬牛の系統分類が長期的な遺伝的多様性に与える効果

  山田栞, 本多健, 小浜菜美子, 坂瀬充洋, 大山憲二

  日本畜産学会大会講演要旨, 2019


• 黒毛和種で発生する白斑と枝肉形質との関連性の調査

  小山秀美, 有木 啓, 今村清人, 坂元信一, 大里和弘, 西 和隆, 河邊弘太郎, 岡本 新, 本多健, OYAMA KENJI, 下桐 猛

  日本動物遺伝育種学会第18回大会, Sep. 2018, Japanese, Domestic conference

  Poster presentation


• ゲノムリシーケンスデータを用いたウシ10番染色体におけるロース脂肪割合の原因変異の探索

  安栖梨理, 井上麻美, 小林 栄治, 福島 護之, 小浜 菜美子, 大山 憲二, 本多 健, 万年 英之, 笹崎 晋史

  第18回日本動物遺伝育種学会大会, Sep. 2018, Japanese, 京都, Domestic conference

  Oral presentation


• 兵庫県黒毛和種集団におけるSLC27A6遺伝子多型のロース脂肪割合に対する効果の検討

  中島彩華, 栖原功太郎, 小林 栄治, 福島 護之, 吉田 恵実, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 大山 憲二, 本多 健, 万年 英之, 笹崎 晋史

  第124回日本畜産学会大会, Mar. 2018, Japanese, 日本畜産学会, 東京, Domestic conference

  Oral presentation


• ゲノムリシーケンスデータを利用したウシ7番染色体におけるロース脂肪割合に関わる遺伝子変異の探索

  中島彩華, 中嶋翼, 上本吉伸, 小林 栄治, 福島 護之, 岩本 英治, 吉田 恵実, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 大山 憲二, 本多 健, 万年 英之, 笹崎 晋史

  第67回関西畜産学会大会, Sep. 2017, Japanese, 関西畜産学会, 大阪, Domestic conference

  Oral presentation


• PLAG1 polymorphism (ss319607405) is associated with oleic acid percentage in Japanese Black cattle

  Kawaguchi F, kigoshi H, Nakajima A, Matsumoto Y, Uemoto Y, Fukushima M, Yoshida E, Iwamoto E, Akiyama T, Kohama N, Kobayashi E, Honda T, Oyama K, Mannen H, Sasazaki S

  36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul. 2017, English, International Society for Animal Genetics, Dublin, Ireland, International conference

  Poster presentation


• Association of VNN1 gene polymorphism with fatty acid composition in Japanese Black cattle

  Kigoshi H, Matsumoto Y, Kawaguchi F, Uemoto Y, Fukushima M, Yoshida E, Iwamoto E, Akiyama T, Kohama N, Oyama K, Honda T, Mannen H, Sasazaki S

  36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul. 2017, English, International Society for Animal Genetics, Dublin, Ireland, International conference

  Poster presentation


• 黒毛和種の損徴に関する遺伝育種学的研究

  小山 秀美, 今村 清人, 坂元 信一, 西 和隆, 河邊 弘太郎, 岡本 新, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, 下桐 猛

  日本畜産学会第122回大会, Mar. 2017, Japanese, 神戸大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 鹿児島県産黒毛和種で発生する白斑に関する遺伝育種学的研究

  小山 秀美, 今村 清人, 坂元 信一, 西 和隆, 河邊 弘太郎, 岡本 新, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, 下桐 猛

  日本動物遺伝育種学会第17回大会, Nov. 2016, Japanese, Domestic conference

  Poster presentation


• 鹿児島県産黒毛和種における死産と母牛の審査時形質との関連性

  小山 秀美, 西 和隆, 今村 清人, 坂元 信一, 河邊 弘太郎, 岡本 新, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, 下桐 猛

  日本暖地畜産学会第9回山口大会, Oct. 2016, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• Estimation of genetic parameters for stillbirth of Japanese Black cattle in Kagoshima

  Oyama H, Nishi K, Imamura K, Sakamoto S, Kawabe K, Okamoto S, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI, Shimogiri T

  Proceedings of 17th AAAP Animal Science Congress, Aug. 2016, English, International conference

  Poster presentation


• Identification of SNP associated with fertility trait using pool-based genome-wide association study in Japanese Black cattle

  Ozaki H, Tamura T, Fukazawa K, Uemoto Y, Nishio M, Kobayashi E, Matsuhashi T, Maruyama S, Honda T, Oyama K, Sasazaki S, Mannen H

  35th International Society for Animal Genetics Conference, Jul. 2016, English, International Society for Animal Genetics, Slat Lake City, USA, International conference

  Poster presentation


• Identification of polymorphisms associated with oleic acid percentage by pool-based genome wide association study (GWAS) in Japanese Black

  Kawaguchi F, Nakajima A, Matsumoto Y, Uemoto Y, Fukushima M, Yoshida E, Iwamoto E, Akiyama T, Kohama N, Kobayashi E, Honda T, Oyama K, Mannen H, Sasazaki S

  35th International Society for Animal Genetics Conference, Jul. 2016, English, International Society for Animal Genetics, Slat Lake City, USA, International conference

  Poster presentation


• ウシ10番染色体におけるロース脂肪割合に影響する遺伝子の探索

  井上麻美, 中島彩華, 中嶋翼, 上本吉伸, 小林 栄治, 福島 護之, 岩本 英治, 吉田 恵実, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 大山 憲二, 本多 健, 万年英之, 笹崎晋史

  第121回日本畜産学会大会, Mar. 2016, Japanese, 日本畜産学会, 東京, Domestic conference

  Poster presentation


• 兵庫県黒毛和種集団の遺伝的多様性に対する「系統らしさ」指標の長期的な有効性

  NAKATSUKA MACHI, HONDA TAKESHI, FUKUSHIMA MORIYUKI, OYAMA KENJI

  日本動物遺伝育種学会第16回大会, Nov. 2015, Japanese, 神戸, Domestic conference

  Poster presentation


• 兵庫県黒毛和種集団におけるオレイン酸含有率に対するゲノムワイド関連解析

  松本祐汰, 中島彩華, 上本 吉伸, 小林栄治, 福島 護之, 岩本 英治, 吉田 恵実, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 笹崎晋史, 本多健, 大山憲二, 万年英之

  第16回日本動物遺伝育種学会大会, Nov. 2015, Japanese, 神戸, Domestic conference

  Poster presentation


• 黒毛和種における産肉形質関連マーカーの繁殖形質に対する効果の推定

  深澤謙治, 笹崎晋史, 大山憲二, 本多健, 小林栄治, 福島 護之, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 万年英之

  第16回日本動物遺伝育種学会大会, Nov. 2015, Japanese, 神戸, Domestic conference

  Poster presentation


• 岐阜県黒毛和種の繁殖形質を対象としたゲノムワイド関連解析

  田村朋子, 深澤謙治, 尾崎弘樹, 上本吉伸, 西尾元秀, 小林栄治, 松橋珠子, 丸山新, 本多健, 笹崎晋史, 大山憲二, 万年英之

  第16回日本動物遺伝育種学会大会, Nov. 2015, Japanese, 神戸, Domestic conference

  Poster presentation


• GWASを用いた黒毛和種集団におけるロース脂肪割合に関わる遺伝子座の探索

  中嶋翼, 中島彩華, 上本吉伸, 小林 栄治, 福島 護之, 岩本 英治, 吉田 恵実, 秋山 敬孝, 小浜 菜美子, 大山憲二, 本多健, 万年英之, 笹崎晋史

  第16回日本動物遺伝育種学会大会, Nov. 2015, Japanese, 神戸, Domestic conference

  Poster presentation


• 放牧場の俯瞰動画データを用いた繁殖牛のインタラクション検出

  細見 洋司, 大川 剛直, 大山 憲二, 本多 健

  第62回情報システム研究会, May 2015, Japanese, 神戸大学, Domestic conference

  Oral presentation


• GPSを利用した放牧牛のインタラクション情報の取得とその分析

  松本 健吾, 大川 剛直, 大山 憲二, 本多 健

  第62回情報システム研究会, May 2015, Japanese, 神戸大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 兵庫県黒毛和種集団の遺伝的多様性に対する「系統らしさ」指標の有効性

  NAKATSUKA MACHI, HONDA TAKESHI, FUKUSHIMA MORIYUKI, OYAMA KENJI

  日本畜産学会, Mar. 2015, Japanese, 宇都宮大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種における内臓疾病に関連した経済的損失

  INOUE KEIICHI, HONDA TAKESHI, OYAMA KENJI

  日本畜産学会, Mar. 2015, Japanese, 宇都宮大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 見島ウシの集団構造に関する基礎的研究

  HIRAMOTO AGEHA, HONDA TAKESHI, 稲吉 洋裕, OYAMA KENJI

  日本畜産学会, Mar. 2015, Japanese, 宇都宮大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 鹿児島県産黒毛和種の枝肉における瑕疵間の遺伝相関の推定

  西 和隆, 下桐 猛, 草野 昭徳, 坂元 信一, 城元 清巳, 河邊 弘太郎, 岡本 新, 本多 健, 大山 憲二

  日本畜産学会第118回大会, Mar. 2014, Japanese, つくば市, Domestic conference

  Oral presentation


• Searching for causal structures among internal diseases and carcass traits in Japanese Black cattle

  井上 慶一, Valente Brouno D, 本多 健, OYAMA KENJI, Rosa Guilherme J

  日本畜産学会第118回大会, Mar. 2014, English, つくば市, Domestic conference

  Poster presentation


• 兵庫系黒毛和種における育種集団毎の遺伝的多様性評価

  福島 護之, 本多 健, 小路 怜子, 小浜 菜美子, 秋山 敬孝, 坂瀬 充洋, 岡 章生, 大山 憲二

  日本畜産学会第117回大会, 2013, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• 鹿児島県産黒毛和種を用いた瑕疵と枝肉6形質の遺伝相関及び表型相関

  西 和隆, 下桐 猛, 草野 昭徳, 坂元 信一, 城元 清巳, 河邊 弘太郎, 岡本 新, 本多 健, 大山 憲二

  2013年度日本暖地畜産学会, 2013, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• 鹿児島県産黒毛和種の枝肉で発生する瑕疵に関する遺伝的パラメータの推定

  西 和隆, 下桐 猛, 草野 昭徳, 坂元 信一, 城元 清巳, 河邊 弘太郎, 岡本 新, 本多 健, 大山 憲二

  日本畜産学会第117回大会, 2013, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• 兵庫県黒毛和種集団における系統内交配による遺伝的分化の可能性

  木綿 萌, 本多 健, 福島 護之, 大山 憲二

  第13回日本動物遺伝育種学会大会, Oct. 2012, Japanese, 日本動物遺伝育種学会, 仙台, Domestic conference

  Poster presentation


• 黒毛和種の肥育後期における胸最長筋および腰最長筋の脂肪酸組成の経時的変化

  小栗 佑介, 柳原 佳代子, 石田 孝史, 本多 健, 万年 英之, 小林 郁雄, 大山憲二

  第62回関西畜産学会大会, 2012, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種の肥育後期における腰最長筋の筋肉内脂肪および脂肪酸組成の経時的変化

  小栗 佑介, 水野 雄仁, 本多 健, 万年 英之, 石田 孝史, 祝前 博明, 久下 志朗, 齋藤 邦彦, 大山 憲二

  日本畜産学会第114回大会, 2011, Japanese, Domestic conference

  Poster presentation


• 中立遺伝子頻度を推定するための血統情報を用いた個体の抽出方法

  HONDA TAKESHI, NOMURA TETSURO

  日本畜産学会第112回大会, 2010, Japanese, 東京, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種の遺伝的多様性に関する研究

  HONDA TAKESHI

  日本畜産学会若手企画シンポジウム，日本畜産学会第112回大会奨励賞受賞記念ポスター講演, 2010, Japanese, 東京, Domestic conference

  [Invited]

  Invited oral presentation


• Sampling method for estimating neutral allele frequency in a pedigreed population

  HONDA Takeshi, SASAZAKI Shinji, OYAMA Kenji, NOMURA Tetsuro, MUKAI Fumio

  9th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 2010, English, International conference

  Poster presentation


• 黒毛和種繁殖雌牛の近年の泌乳量

  辻 絵美, 本多 健, 久下 志朗, 大山 憲二

  日本畜産学会第111回大会, 2009, Japanese, Domestic conference

  Oral presentation


• SNPsを活用した黒毛和種の親子鑑定の精度に関する検討

  HONDA TAKESHI, KATSUTA TOMOHIRO, MUKAI FUMIO

  日本畜産学会第110回大会, 2009, Japanese, 神奈川, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種種雄牛の遺伝的関連性に関する研究

  本多 健, 藤井 俊英, 穴田 勝人, 向井 文雄

  関西畜産学会第55回大会, Sep. 2005, Japanese, 関西畜産学会, Ehime, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種の遺伝的多様性の維持に寄与する分集団の評価

  本多 健, 出野 直樹, 野村 哲郎, 向井 文雄

  日本畜産学会第105回大会, Sep. 2005, Japanese, 日本畜産学会, Hokkaido, Domestic conference

  Poster presentation


• 褐毛和種の集団構造と遺伝的多様性に関する研究

  藤井 俊英, 本多 健, 野村 哲郎, 向井 文雄

  日本畜産学会第105回大会, Sep. 2005, Japanese, 日本畜産学会, Hokkaido, Domestic conference

  Poster presentation


• 複数の育種集団を用いた黒毛和種集団の遺伝的多様性の維持および近交係数の抑制

  本多 健, 野村 哲郎, 向井 文雄

  日本畜産学会第104 回大会, Mar. 2005, Japanese, 日本畜産学会, Tokyo, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種の遺伝的多様性維持に際して優先すべき分集団の特定

  野村 哲郎, 本多 健, 出野 直樹, 向井 文雄

  第102回日本畜産学会, 2003, Japanese, 日本畜産学会, 岐阜大学, Domestic conference

  Oral presentation


• 黒毛和種の遺伝的多様性の現状と課題

  本多 健

  第41回家畜育種研究会, 2003, Japanese, 未記入, 未記入, Domestic conference

  Oral presentation


• 近交係数および遺伝的多様性からにみた育種集団の構造上の留意点

  本多 健, 野村 哲郎, 向井 文雄

  第102回日本畜産学会, 2003, Japanese, 日本畜産学会, 岐阜大学, Domestic conference

  Oral presentation

• 日本畜産学会

• ウシ体脂肪の脂肪酸組成に関る責任遺伝子群の総合的解明

  万年 英之

  科学研究費補助金／基盤研究(B), Apr. 2016 - Mar. 2020

  Competitive research funding


• 遺伝子発現量を基盤とした黒毛和種の不飽和脂肪酸に関与する遺伝子の探索

  大山 憲二

  科学研究費補助金／基盤研究(C), Apr. 2012 - Mar. 2015

  Competitive research funding


• 国際標準ＳＮＰシステムの構築に基づくアジア在来家畜集団の遺伝的多様性解析と保全策

  万年 英之

  科学研究費補助金／基盤研究(B), 2011

  Competitive research funding


• 黒毛和種の遺伝的多様性の評価と維持システムに関する研究

  本多 健

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 特別研究員奨励費, 神戸大学, 2003 - 2004

  本年度は,黒毛和種の遺伝的多様性の維持・回復のため,品種の遺伝子給源となる種牛供給系統群と,その遺伝子を導入する繁殖雌集団からなる機能的階層構造を想定し,系統群を維持・管理する上で留意すべき以下の2点について理論的検討を行った. 1.繁殖雌集団の近交係数の抑制 2.系統内の近交係数の抑制と系統群全体および系統間における遺伝的多様性の維持 検討事項1に対しては,輪番交配をモデルとして採用し,系統群の集団構造を変量とした雌集団の近交係数の漸化式を導出した.数値計算からは,世代当たり数頭の雄からなる4,5個の系統を確保できれば,系統内の有効サイズの大きさに関わらず,雌集団の近交係数を低いレベルに抑制できることを明らかにした. 検討事項2に対しては,中国5県において系統が造成・維持されている分集団構造をモデル化し,系統群の集団構造の影響について検討を加えた.また,家畜育種学および保全生物学における知見を基に,系統内の近交係数の上昇率,10世代後の系統群全体および系統間の遺伝的多様性指数に目標値を設定し,それらを満たす最適な系統内の雄の数(N_m)と系統間における雄の交換率(d_m)の探索を行った.諸条件から導かれた各目標値の変化を総合的に勘案した結果,N_m=10およびd_m=0.1が最適値であると結論付けた. 系統間における雄の交換は雌集団の近交係数を増加させる危険性があるため,本研究では上述した2つのモデルを融合させ,雌集団の近交係数の漸化式を再導出し,検討事項1について再度検討を行った.数値計算の結果,系統間で一定の割合で雄の交換が行われていても,4,5個の系統が確保できれば,輪番交配は雌集団の近交抑制に有効であることを明らかにした.さらに,上述した最適値に基づいて,中国5県集団を基礎とする5系統を維持すれば,同品種の近交係数は無視し得るほど低いレベルにまで抑制できることを示した.