研究活動情報

• Lobe‐Less, a long noncoding RNA that regulates Drosophila mushroom body morphogenesis.

  Sachi Inagaki, Natsuki Nakamura, Mitsutaka Kadota, Sean D. Keeley, Shigehiro Kuraku, Masanao Sato, Shinichi Nakagawa, Mari Mito, Kevin G. Nyberg, Kaori Niimi, Hidenori Kiyosawa, Satoru Kobayashi, Yuji Kageyama

  ABSTRACT Long noncoding RNAs (lncRNAs) are abundantly transcribed in eukaryotes, but most of their physiological roles, especially in neural development, remain unclear due to limited in vivo studies. Here we show that Lobe‐less (LOL) lncRNA of Drosophila is expressed in developing neuronal cells and is required for the development of the mushroom body, a center of memory and learning in the insect brain. lol mutant flies exhibit defective morphology of the mushroom body and axon branch patterns, as well as misregulation of neurogenic genes. LOL RNA forms nuclear puncta and genetically interacts with Polycomb group genes in the regulation of homeotic genes. These findings demonstrate that this long ncRNA plays a critical role in the epigenetic control of neural circuit formation.

  Wiley, 2025年12月, Genes to Cells, 31(1) (1), 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Pri smORF Peptides Are Wide Mediators of Ecdysone Signaling, Contributing to Shape Spatiotemporal Responses

  Azza Dib, Jennifer Zanet, Alexandra Mancheno-Ferris, Maylis Gallois, Damien Markus, Philippe Valenti, Simon Marques-Prieto, Serge Plaza, Yuji Kageyama, Hélène Chanut-Delalande, François Payre

  There is growing evidence that peptides encoded by small open-reading frames (sORF or smORF) can fulfill various cellular functions and define a novel class regulatory molecules. To which extend transcripts encoding only smORF peptides compare with canonical protein-coding genes, yet remain poorly understood. In particular, little is known on whether and how smORF-encoding RNAs might need tightly regulated expression within a given tissue, at a given time during development. We addressed these questions through the analysis of Drosophila polished rice (pri, a.k.a. tarsal less or mille pattes), which encodes four smORF peptides (11–32 amino acids in length) required at several stages of development. Previous work has shown that the expression of pri during epidermal development is regulated in the response to ecdysone, the major steroid hormone in insects. Here, we show that pri transcription is strongly upregulated by ecdysone across a large panel of cell types, suggesting that pri is a core component of ecdysone response. Although pri is produced as an intron-less short transcript (1.5 kb), genetic assays reveal that the developmental functions of pri require an unexpectedly large array of enhancers (spanning over 50 kb), driving a variety of spatiotemporal patterns of pri expression across developing tissues. Furthermore, we found that separate pri enhancers are directly activated by the ecdysone nuclear receptor (EcR) and display distinct regulatory modes between developmental tissues and/or stages. Alike major developmental genes, the expression of pri in a given tissue often involves several enhancers driving apparently redundant (or shadow) expression, while individual pri enhancers can harbor pleiotropic functions across tissues. Taken together, these data reveal the broad role of Pri smORF peptides in ecdysone signaling and show that the cis-regulatory architecture of the pri gene contributes to shape distinct spatial and temporal patterns of ecdysone response throughout development.

  Frontiers Media SA, 2021年08月, Frontiers in Genetics, 12, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• polished rice mediates ecdysone‐dependent control of Drosophila embryonic organogenesis.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  Wiley, 2021年03月, Genes to Cells, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Shavenbaby and Yorkie mediate Hippo signaling to protect adult stem cells from apoptosis.

  Jérôme Bohère, Alexandra Mancheno-Ferris, Sandy Al Hayek, Jennifer Zanet, Philippe Valenti, Kohsuke Akino, Yuya Yamabe, Sachi Inagaki, Hélène Chanut-Delalande, Serge Plaza, Yuji Kageyama, Dani Osman, Cédric Polesello, François Payre

  2018年12月, Nature Communications, 9(1) (1), 5123, 英語, 国際誌, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Pri peptides are mediators of ecdysone for the temporal control of development

  Hélène Chanut-Delalande, Yoshiko Hashimoto, Anne Pelissier-Monier, Rebecca Spokony, Azza Dib, Takefumi Kondo, Jérome Bohere, Kaori Niimi, Yvan Latapie, Sachi Inagaki, Laurence Dubois, Philippe Valenti, Cédric Polesello, Satoru Kobayashi, Bernard Moussian, Kevin P. White, Serge Plaza, Yuji Kageyama, François Payre

  2014年10月, Nat. Cell Biol., 16(11) (11), 1035 - 1044, 英語, 国際誌, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• The binding of multiple nuclear receptors to a single regulatory region is important for the proper expression of EDG84A in Drosophila melanogaster.

  Kazutaka Akagi, Kageyama, Y, Kayashima, Y, Takakura, Y, Hirose, S, Ueda, H

  2013年01月, J. Mol. Biol., 425(1) (1), 71 - 81, 英語, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Small peptides switch the transcriptional activity of shavenbaby during drosophila embryogenesis

  T. Kondo, S. Plaza, J. Zanet, E. Benrabah, P. Valenti, Y. Hashimoto, S. Kobayashi, F. Payre, Y. Kageyama

  A substantial proportion of eukaryotic transcripts are considered to be noncoding RNAs because they contain only short open reading frames (sORFs). Recent findings suggest, however, that some sORFs encode small bioactive peptides. Here, we show that peptides of 11 to 32 amino acids encoded by the polished rice (.pri) sORF gene control epidermal differentiation in Drosophila by modifying the transcription factor Shavenbaby (Svb). Pri peptides trigger the amino-terminal truncation of the Svb protein, which converts Svb from a repressor to an activator. Our results demonstrate that during Drosophila embryogenesis, Pri sORF peptides provide a strict temporal control to the transcriptional program of epidermal morphogenesis.

  2010年07月, Science, 329(5989) (5989), 336 - 339, 国際誌, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• MLE activates transcription via the minimal transactivation domain in Drosophila

  Satoko Aratani, Yuji Kageyama, Akira Nakamura, Hidetoshi Fujita, Ryoji Fujii, Kusuki Nishioka, Toshihiro Nakajima

  2008年04月, International Journal of Molecular Medicine, 21(4) (4), 469 - 476, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Drosophila blimp-1 is a transient transcriptional repressor that controls timing of the ecdysone-induced developmental pathway

  Yasuo Agawa, Moustafa Sarhan, Yuji Kageyama, Kazutaka Akagi, Masayoshi Takai, Kazuya Hashiyama, Tadashi Wada, Hiroshi Handa, Akihiro Iwamatsu, Susumu Hirose, Hitoshi Ueda

  2007年12月, Molecular and Cellular Biology, 27(24) (24), 8739 - 8747, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Small peptide regulators of actin-based cell morphogenesis encoded by a polycistronic mRNA

  Takefumi Kondo, Yoshiko Hashimoto, Kagayaki Kato, Sachi Inagaki, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  2007年06月, Nature Cell Biology, 9(6) (6), 660 - 665, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• [Physiological roles of non-coding RNAs: lessons from model organisms].

  Yuji Kageyama, Sachi Inagaki

  2006年12月, Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 51(16 Suppl) (16 Suppl), 2425 - 30, 日本語, 国内誌

  研究論文（学術雑誌）


• Rapid construction of Drosophila RNAi transgenes using pRISE, a P-element-mediated transformation vector exploiting an in vitro recombination system

  Takefumi Kondo, Sachi Inagaki, Kunio Yasuda, Yuji Kageyama

  2006年, Genes and Genetic Systems, 81(2) (2), 129 - 134, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Bruno-like protein is localized to zebrafish germ plasm during the early cleavage stages

  Yoshiko Hashimoto, Hitoshi Suzuki, Yuji Kageyama, Kunio Yasuda, Kunio Inoue

  2006年01月, Gene Expression Patterns, 6(2) (2), 201 - 205, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Identification and expression analysis of putative mRNA-like non-coding RNA in Drosophila

  Sachi Inagaki, Koji Numata, Takefumi Kondo, Masaru Tomita, Kunio Yasuda, Akio Kanai, Yuji Kageyama

  2005年12月, Genes to Cells, 10(12) (12), 1163 - 1173, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Dmaf, a novel member of Maf transcription factor family is expressed in somatic gonadal cells during embryonic development and gametogenesis in Drosophila

  Tomo Kawashima, Akira Nakamura, Kunio Yasuda, Yuji Kageyama

  2003年10月, Gene Expression Patterns, 3(5) (5), 663 - 667, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Sequence-specific targeting of Drosophila roX genes by the MSL dosage compensation complex

  Yongkyu Park, Gabrielle Mengus, Xiaoying Bai, Yuji Kageyama, Victoria H. Meller, Peter B. Becker, Mitzi I. Kuroda

  2003年04月, Molecular Cell, 11(4) (4), 977 - 986, 国際誌, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• The stability of the lens-specific Maf protein is regulated by fibroblast growth factor (FGF)/ERK signaling in lens fiber differentiation

  Haruki Ochi, Hajime Ogino, Yuji Kageyama, Kunio Yasuda

  2003年01月, Journal of Biological Chemistry, 278(1) (1), 537 - 544, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Association and spreading of the Drosophila dosage compensation complex from a discrete roX1 chromatin entry site

  Y. Kageyama, G. Mengus, G. Gilfillan, H. G. Kennedy, C. Stuckenholz, R. L. Kelley, P. B. Becker, M. I. Kuroda

  2001年05月, EMBO Journal, 20(9) (9), 2236 - 2245, 国際誌, 国際共著している

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Temporal regulation of the mid-prepupal gene FTZ-F1: DHR3 early late gene product is one of the plural positive regulators

  Yuji Kageyama, Shoko Masuda, Susumu Hirose, Hitoshi Ueda

  1997年, Genes to Cells, 2(9) (9), 559 - 569, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Regulation of the EDG84a gene by FTZ-F1 during metamorphosis in Drosophila melanogaster

  Takehide Murata, Yuji Kageyama, Susumu Hirose, Hitoshi Ueda

  1996年, Molecular and Cellular Biology, 16(11) (11), 6509 - 6515, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Completion of development in Athalia rosae (Hymenoptera) eggs matured with heterospecific Athalia infumata yolk protein

  Masatsugu Hatakeyama, Yuji Kageyama, Tetsu Kinoshita, Kugao Oishi

  1995年04月, Journal of Insect Physiology, 41(4) (4), 351 - 355, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Cloning of cDNA for Vitellogenin of Athalia rosae (Hymenoptera) and characterization of the vitellogenin gene expression

  Yuji Kageyama, Tetsu Kinoshita, Yoshihiko Umesono, Masatsugu Hatakeyama, Kugao Oishi

  Athalia rosae (Hymenoptera) was previously shown to have two vitellins (L-Vn and S-Vn) and the two corresponding vitellogenins (L-Vg and S-Vg). A cDNA expression library was constructed from poly(A)+ RNA prepared from adult female fat body cells, and was screened for the vitellogenins by using antisera against the L- and S-Vn, respectively. Examinations of cloned cDNAs show that the vitellogenin gene is transcribed as a single unit, with the 5′-terminal site coding for the S-Vg and the 3′-terminal site for the L-Vg. Nucleotide sequence at the 5′-end suggests the presence of a 16 amino acid-long signal peptide. Deduced amino acid sequence following the signal peptide shows a complete match with up to the 28 N-terminal amino acid sequence determined on S-Vn. The S-L Vg boundary with deduced amino acid sequence matching with 6 N-terminal amino acid sequence determined on L-Vn is also detected. Northern blot hybridization analysis shows that the vitellogenin gene is expressed in the female fat body as a single 6.5 kb mRNA but not in the ovary, and not in the male fat body. Western blot analysis detects a large precursor polypeptide, reacting with the anti-L-Vn and S-Vn antisera, in the adult female fat body. © 1994.

  1994年06月, Insect Biochemistry and Molecular Biology, 24(6) (6), 599 - 605, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

• 【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】(第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 転写制御IncRNA ショウジョウバエroX RNA ヒストン修飾酵素複合体と相互作用するRNAの発見

  影山 裕二

  (株)羊土社, 2015年12月, 実験医学, 33(20) (20), 3274 - 3275, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】(第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 その他のIncRNA関連トピック 小さなペプチドの発見から学ぶ事

  稲垣 幸, 影山 裕二

  (株)羊土社, 2015年12月, 実験医学, 33(20) (20), 3306 - 3307, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• Nuclear lncRNAs as epigenetic regulators-beyond skepticism.

  Nakagawa S, Kageyama Y

  2014年03月, Biochimica et biophysica acta, 1839(3) (3), 215 - 222

  [査読有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• Lobe-less RNAはポリコーム複合体と相互作用し,ショウジョウバエにおけるキノコ体の形態形成を制御している

  稲垣幸, 佐藤昌直, 佐藤昌直, 中村奈月, 小林悟, 小林悟, 影山裕二, 影山裕二

  2014年, 日本RNA学会年会要旨集, 16th


• RNAの機能的多様性 - mRNAとnon-coding RNAの境界点

  影山 裕二, 稲垣 幸

  (株)羊土社, 2013年05月, 実験医学, 31(7) (7), 1143 - 1149, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• Lobe-less RNAはショウジョウバエキノコ体の形態形成を介して学習・記憶を制御している

  稲垣幸, 佐藤昌直, 宮下知之, 中村奈月, 小林悟, 小林悟, 斉藤実, 影山裕二, 影山裕二

  2013年, 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 36th


• Coding vs non-coding: Translatability of short ORFs found in putative non-coding transcripts.

  Yuji Kageyama, Kondo T, Hashimoto Y

  2011年11月, Biochimie., 93(11) (11), 1981 - 1986, 英語, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り][招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• 【ゲノムの"ダークマター"長鎖ncRNAが制御する多彩な生命現象】概論 長鎖ncRNA研究のはじまりの終わり

  中川 真一, 影山 裕二

  (株)羊土社, 2011年07月, 実験医学, 29(11) (11), 1702 - 1708, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 【ノンコーディングRNA:現状と問題点】コーディングvsノンコーディング:ショウジョウバエから学ぶこと

  影山 裕二, 稲垣 幸

  共立出版(株), 2008年12月, 蛋白質・核酸・酵素, 53(15) (15), 1950 - 1956, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• Lilliputians get into the limelight: novel class of small peptide genes in morphogenesis.

  Hashimoto Y, Kondo T, Kageyama Y

  2008年06月, Dev Growth Differ, 50(SUPPL. 1) (SUPPL. 1), 269 - 276, 英語, 国際誌, 国際共著していない

  [査読有り][招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• 臨床に必要な神経薬理・化学 ポリシストロニックにコードされる短鎖ペプチド

  影山 裕二, 近藤 武史

  (株)中外医学社, 2008年03月, Clinical Neuroscience, 26(3) (3), 242 - 243, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• short ORFにコードされる短鎖ペプチドの機能

  近藤 武史, 影山 裕二

  共立出版, 2008年01月, 蛋白質核酸酵素, 53(1) (1), 20 - 27, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 【RNAと生命】non-coding RNA non-coding RNAの生理機能 モデル生物を用いた解析

  影山 裕二, 稲垣 幸

  共立出版(株), 2006年12月, 蛋白質・核酸・酵素, 51(16) (16), 2425 - 2430, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 【RNAと創薬】未知なるRNAと創薬の地平 創薬科学におけるnon-coding RNAの可能性

  影山 裕二

  (株)メディカルドゥ, 2006年01月, 遺伝子医学MOOK, (4) (4), 204 - 209, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• non-coding RNAが支配するエピジェネティックな遺伝子発現制御機構 (特集 なぜ今non-coding RNAなのか?)

  影山 裕二

  共立出版, 2004年12月, 蛋白質核酸酵素, 49(16) (16), 2529 - 2541, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 【躍進するRNA研究】RNAによる遺伝子発現調節 ゲノムとncRNA RNAに何ができるか? mRNA-like non-coding RNAの機能とその生理学的役割

  影山 裕二, 稲垣 幸

  (株)羊土社, 2004年11月, 実験医学, 22(17) (17), 2495 - 2502, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• Guilt by association: Non-coding RNAs, chromosome-specific proteins and dosage compensation in Drosophila

  Carsten Stuckenholz, Yuji Kageyama, Mitzi I. Kuroda

  1999年11月01日, Trends in Genetics, 15(11) (11), 454 - 458

  [査読有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• ショウジョウバエFIZ-F1遺伝子の転写調節機構の解析

  増田 祥子, 影山 佑二, 広瀬 進, 上田 均

  1998年12月01日, 日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 21, 416 - 416, 日本語


• Genetics and biology of the sawfly, Athalia rosae (Hymenoptera)

  K. Oishi, M. Sawa, M. Hatakeyama, Y. Kageyama

  1993年06月, Genetica, 88(2-3) (2-3), 119 - 127

  [査読有り][招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

• 動物の事典

  末光, 隆志

  3.7.1 ノンコーディングRNAの種類, 朝倉書店, 2020年11月, 日本語, ISBN: 9784254171662


• 機能性RNAの分子生物学

  河合, 剛太, 清澤, 秀孔

  クバプロ, 2010年12月, 日本語, ISBN: 9784878051135


• 小分子RNAの解析からRNAiへの応用まで

  稲田, 利文, 塩見, 春彦

  羊土社, 2008年, 日本語, ISBN: 9784897069258


• 機能性Non-coding RNA

  クバプロ, 2006年


• RNAi実験プロトコール : より効果的な遺伝子の発現抑制を行うための最新テクニック

  多比良, 和誠

  羊土社, 2004年10月, 日本語, ISBN: 4897064171

• 胚発生期の「変態」と細胞死

  影山裕二

  第13回さきがけ「RNAと生体機能」研究会, 2025年01月, 日本語

  口頭発表（一般）


• エクジステロイドはショウジョウバエ背部閉塞における細胞死に必須である

  徳重仁志, 平雄樹, 笹原雷蔵, 影山裕二

  第47回分子生物学会年会, 2024年11月, 日本語

  ポスター発表


• The ecdysone-inducible gene polished rice temporally regulates Drosophila embryonic organogenesis.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第14回日本ショウジョウバエ研究会, 2021年09月, 英語

  口頭発表（一般）


• polished rice regulates Drosophila organogenesis in an ecdysone-dependent manner.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第54回日本発生生物学会年会, 2021年06月, 英語

  ポスター発表


• A temporal ecdysone signal mediated by polished rice modulates tracheal cell fate in Drosophila embryogenesis.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第43回日本分子生物学会, 2020年12月

  ポスター発表


• A temporal ecdysone signal mediated by polished rice modulates cell fate decision in Drosophila tracheal development.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第53回日本発生生物学会, 2020年05月, 英語

  口頭発表（一般）


• Temporal ecdysone signaling mediated by polished rice decides the cell fates in Drosophila embryonic tracheal development.

  平雄樹, 和田宝生, 林茂生, 影山裕二

  第42回日本分子生物学会年会, 2019年12月

  ポスター発表


• Ecdysone-inducible polished rice temporally regulates fate decision of tracheal tip cells in embryonic tracheal morphogenesis.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第51回日本発生生物学会年会

  口頭発表（一般）


• Ecdysone-inducible polished rice gene temporally regulates fate decision of tracheal tip cells in embryonic tracheal morphogenesis.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  60th Annual Drosophila Research Conference, 英語

  ポスター発表


• polished rice mediates a temporal ecdysone signal during embryogenesis and regulates fate decision of tip cells in tracheal dorsal branch development.

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, Yuji Kageyama

  第13回日本ショウジョウバエ研究会

  ポスター発表


• Lobe-less RNAはショウジョウバエの胚発生期において軸索走行制御に寄与する長鎖ノンコーディングRNAである

  稲垣幸, 中村奈月, 佐藤昌直, 門田光隆, Sean D. Keeley, 工樂樹洋, 影山裕二

  第20回日本RNA学会年会

  ポスター発表


• マイクロペプチドによるショウジョウバエ胚発生の制御

  影山裕二, 平雄樹

  第18回日本蛋白質科学会年会, 2018年06月, 日本語

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• A long noncoding RNA regulates Drosophila axon guidance during embryogenesis.

  Sachi Inagaki, Natsuki Nakamura, Masanao Sato, Mitsutaka Kadota, Sean D Keeley, Shigehiro Kuraku, Yuji Kageyama

  第51回日本発生生物学会年会, 2018年06月, 英語

  ポスター発表


• polished rice mediates temporal ecdysone signal and is essential for coordinated development in the Drosophila tracheal system.

  Yuki Taira, Yuji Kageyama

  KEY Forum 2018 “International Synposium on Stem Cell Traits and Developmental Systems”, 2018年01月, 英語, 熊本大学発生医学研究所, 熊本, 国際会議

  口頭発表（一般）


• polished rice mediates temporal ecdysone signal and is essential for coordinated development in the Drosophila tracheal system.

  平雄樹, 和田宝成, 林茂生, 影山裕二

  第40回日本分子生物学会年会, 2017年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  ポスター発表


• Lobe-less RNAは、胚発生期において神経母細胞に発現し、軸索走行制御を介した神経回路形成に寄与している

  稲垣幸, 門田光隆, Sean D. Keeley, 工樂樹洋, 影山裕二

  第40回日本分子生物学会年会, 2017年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  ポスター発表


• ショウジョウバエLobe-less RNAはキノコ体において軸索走行制御因子の発現を制御している

  稲垣幸, 中野美幸, 中村奈月, 門田光隆, Sean D. Keeley, 佐藤昌直, 工樂樹洋, 影山 裕二

  第19回RNA学会年会, 2017年07月, 日本語, 富山, 国内会議

  ポスター発表


• 長鎖 noncoding RNA Lobe-less はショウジョウバエ中枢神経系 において、キノコ体の軸索投射に寄与している.

  稲垣幸, 中村奈月, 佐藤昌直, 小林悟, 門田光孝, Sean D. Keeley, 工樂樹洋, 影山 裕二

  第50回発生生物学会年会, 2017年06月, 日本語, 東京, 国内会議

  口頭発表（一般）


• ショウジョウバエpolished rice遺伝子は気管のtip cellの分化およびdorsal branchの融合に必須である.

  平雄樹, 和田宝成, 林茂生, 影山裕二

  第50回発生生物学会年会, 2017年06月, 日本語, 東京, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Lobe-less, a long noncoding RNA that regulates Drosophila mushroom body morphogenesis.

  Sachi Inagaki, Yuji Kageyama, Natsuki Nakamura, Masanao Sato, Mitsuhiro Kadota, Sean D. Keeley, Shigehiro Kuraku

  The 22nd Annual Meeting of the RNA society, 2017年05月, 英語, Plague, 国際会議

  ポスター発表


• Screening for modifier genes of polished rice gain-of-function phenotypes:Results of second and third chromosomes.

  Yuya Yamabe, Yuki Hamada, Kosuke Akino, Yuki Yoshida, Sachi Inagaki, 影山 裕二

  第12回日本ショウジョウバエ研究会, 2016年09月, 英語, 東京, 国内会議

  ポスター発表


• polished rice is essential for tip cell specification and tubular fusion of tracheal dorsal branch

  Yuki Taira, Housei Wada, Shigeo Hayashi, 影山 裕二

  第12回日本ショウジョウバエ研究会, 2016年09月, 英語, 東京, 国内会議

  ポスター発表


• Lobe-less RNA is necessary for establishment of neural circuits in Drosophila mushroom body

  Miyuki Nakano, Sachi Inagaki, Natsuki Nakamura, 影山 裕二

  第12回日本ショウジョウバエ研究会, 2016年09月, 英語, 東京, 国内会議

  ポスター発表


• Lobe-less RNA regulates axon guidance of mushroom body neurons in Drosophila and genetically interacts with PRC1 components

  影山 裕二, Sachi Inagaki

  21st Annual Conference of the RNA Society, 2016年06月, 英語, Kyoto, 国際会議

  ポスター発表


• 脳内神経回路形成と長鎖noncoding RNA：ショウジョウバエのキノコ体形成におけるLobe-less RNAの役割

  影山 裕二, 稲垣 幸

  第38回日本分子生物学会年会, 2015年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 長鎖noncoding RNA Lobe-lessはショウジョウバエ中枢神経系においてキノコ体の軸索投射及び脳内回路形成に寄与している

  影山 裕二, 稲垣 幸

  第38回日本分子生物学会年会, 2015年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  ポスター発表


• ゲノムの舞台袖に控える役者たち：ノンコーディングRNAとマイクロペプチド

  影山 裕二

  第23回山形分子生物学セミナー, 2015年12月, 日本語, 山形, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• coding vs noncoding

  影山 裕二

  第20回分生研シンポジウム, 2015年10月, 日本語, 東京, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Lobe-less RNA はショウジョウバエキノコ体の軸索走行制御を介して神経回路形成に寄与している

  稲垣 幸, 影山 裕二, 中村 奈月

  第17回RNA学会年会, 2015年07月, 日本語, 札幌, 国内会議

  口頭発表（一般）


• The function of long noncoding RNA in the central nervous system: Analysis of the lobe-less gene in Drosophila

  Natsuki Nakamura, Sachi Inagaki, Yuji Kageyama

  jajRNA2014, 2014年11月, 英語, Sydney, 国際会議

  ポスター発表


• Long noncoding RNA in the brain: Lobe-less RNA is essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila

  影山 裕二

  The 16th Tokyo RNA Club, 2014年11月, 英語, Tokyo, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Lobe-less RNA is a new member of Polycomb group genes and essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila

  Sachi Inagaki, Masanao Sato, Natsuki Nakamura, Satoru Kobayashi, 影山 裕二

  jajRNA2014, 2014年11月, 英語, Sydney, 国際会議

  ポスター発表


• 長鎖ノンコーディングRNA の神経系における機能:ショウジョウバエlobe-less 変異体の細胞学的解析

  中村 奈月, 稲垣 幸, 影山 裕二

  第16回日本RNA学会年会, 2014年07月, 日本語, 名古屋, 国内会議

  ポスター発表


• Lobe-less RNAはポリコーム複合体と相互作用し、ショウジョウバエにおけるキノコ体の形態形成を制御している

  稲垣幸, 影山 裕二

  第16回日本RNA学会年会, 2014年07月, 日本語, 名古屋, 国内会議

  ポスター発表


• MRE32/Lobe-less RNA is essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila.

  稲垣 幸, 佐藤 昌直, 中村 奈月, 小林 悟, 影山 裕二

  第15回日本RNA学会年会55th Annual Drosophila Research Conference, 2014年03月, 英語, San Diego (USA), 国際会議

  口頭発表（一般）


• ショウジョウバエ成虫脳の形態形成と記憶・学習を制御する長鎖ノンコーディングRNA

  影山 裕二, 稲垣 幸

  第35回日本分子生物学会ワークショップ, 2013年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  口頭発表（招待・特別）


• Lobe-less RNA はショウジョウバエキノコ体の形態形成を介して学習・記憶を制御している

  稲垣 幸, 佐藤 昌直, 宮下 知之, 中村 奈月, 小林 悟, 斉藤 実, 影山 裕二

  第35回日本分子生物学会, 2013年12月, 日本語, 神戸, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Drosophila Lobe-less RNA is essential for axon guidance in development of mushroom body neurons.

  Sachi Inagaki, Natsuki Nakamura, Masanao Sat, Satoru Kobayashi, Yuji Kageyama

  2014 Riboclub Annual Meeting, 2013年09月, 英語, Orford (Canada), 国際会議

  口頭発表（一般）


• MRE32/Lobe-less RNA is essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila.

  稲垣 幸, 佐藤 昌直, 中村 奈月, 小林 悟, 影山 裕二

  第15回日本RNA学会年会, 2013年07月, 英語, 松山, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Lobe-less RNA is essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila.

  Sachi Inagaki, Natsuki Nakamura, Masanao Sat, Satoru Kobayashi, Yuji Kageyama

  第46回日本発生生物学会年会, 2013年05月, 日本語, 松江, 国内会議

  口頭発表（一般）


• MRE32 RNA is essential for mushroom body morphogenesis in Drosophila adult brain.

  Sachi Inagaki, Masanao Sato, 影山 裕二

  The 23rd CDB Meeting: Building multicellular systems from cellular cross-talk, 2013年01月, 英語, Kobe, 国際会議

  ポスター発表


• Physiological roles of long non-coding RNA MRE32 in the central nervous system and wing development.

  Sachi Inagaki, Masanao Sato, Yuji Kageyama

  第10回日本ショウジョウバエ研究会, 2012年10月, 英語, Kobe, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Physiological roles of MRE32 RNA in Drosophila optic lobe and wing development.

  Sachi Inagaki, 影山 裕二

  第14回日本RNA学会年会, 2012年07月, 英語, 仙台, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Physiological roles of MRE32 RNA in Drosophila optic lobe and wing development.

  Sachi Inagaki, Masanao Sato, Yuji Kageyama

  The 22nd CDB Meeting: RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II, 2012年06月, 英語, Kobe, 国際会議

  ポスター発表


• A small peptide gene polished rice is essential for trichome formation and metamorphosis in Drosophila.

  Yoshiko Hashimoto, Kaori Niimi, Takefumi Kondo, Yuji Kageyama

  44回日本発生生物学会年会シンポジウム「Genetic Control of Morophogenesis」, 2011年05月, 英語, 国内会議

  口頭発表（招待・特別）

• RNA society


• Genetic Society of America


• 日本RNA学会


• 日本発生生物学会

• エクジステロイドによる器官形成制御機構

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 神戸大学, 2023年04月01日 - 2026年03月31日

  動物の発生においては、時期特異的な遺伝子発現制御と空間特異的な遺伝子発現制御が重要であり、細胞種特異的な空間的制御はしばしば発生段階に応じた時期特異的な制御のもとに行われる。変態は時期特異的な発生制御の例であり、ショウジョウバエではエクジソンが変態の時期を決定していることがよく知られている。一方で、エクジソンのピークは胚発生中期にも存在し、エクジソン合成酵素の変異個体は適正な器官形成の進行が阻害され、形態的な異常あるいは発生の停止が起こることが報告されている。しかしながら、器官形成におけるエクジソンの欠損が細胞レベルでどのような影響を及ぼすのかについての知見はごく限られており、胚発生期の器官形成におけるエクジソンによる時期特異的な遺伝子発現制御の役割については不明な点が多く残されている。 本研究では、エクジソンが器官形成において果たす機能を明らかにすることを目的とする。今年度は背部閉塞をモデル系に用い、当該発生現象におけるエクジソン関連遺伝子の変異体の表現型を解析した。エクジソン生合成に関与する遺伝子であるspook（spo）およびエクジソン応答性遺伝子であるpolished rice（pri）の変異体の表現型を観察したところ、spo変異体では背側部に大きな開口部が残ったまま発生が停止しており、pri変異体においても一部の個体では開口部が完全には閉鎖していないことが明らかになった。背部閉塞の進行には開口部の羊漿膜細胞の細胞死が必要であることが知られているため、TUNEL法により羊漿膜におけるアポトーシスの検出を行ったところ、いずれの変異体の羊漿膜においても顕著なアポトーシスの抑制が見られた。これらの結果は、エクジソンが羊漿膜におけるDcp-1の活性化とアポトーシスの誘導に必要であり、背部閉塞の適正な進行を制御していることを強く示唆するものである。


• ノンコーディングRNAネオタクソノミの実現を加速する国際活動支援

  廣瀬 哲郎, 中川 真一, 淺原 弘嗣, 泊 幸秀, 鈴木 勉, 塩見 美喜子, 影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型), 北海道大学, 2015年11月06日 - 2019年03月31日

  本年度も各国際活動支援班員が、それぞれの国際活動（国際共同研究、海外研究者の訪問、海外著名研究者の招聘など）を精力的に展開し、その結果数多くの国際共著論文の発表などの実質的な活動成果をあげることができた。代表的な活動内容は、以下の通りである。まず領域代表の廣瀬は、昨年に引き続き核内構造体の微細構造の電子顕微鏡観察、RNP相互作用解析をフランスCNRSと西オーストラリア大、イギリスのクリック研究所との共同研究を継続し、Mol Cellをはじめ5報の国際共著論文を発表した。中川は、lncRNA KOマウスを用いた機能解析研究を米国マウントサイナイ、オーガスタ大などとの共同研究で実施し、PNAS誌を含む6本の国際共著論文発表に至った。また浅原は米国スクリプス研究所との国際共同研究を継続し2報の国際共著論文を発表した。この他の班員も継続して欧米、中国との国際共同研究を継続し研究発展に努めた。 一方で、領域班員及び関連若手研究者の海外研究機関への短期滞在の支援も実施し計5名を米国テキサス大学、イスラエルワイズマン研究所などの海外研究機関に派遣し、国際共同研究のより一層の推進をサポートした。この他に、本領域主催の国際ミーティング（JAJ2018）に合わせてオーストラリアのRNA研究者20名を招聘し、共同研究に関する直接的なディスカッションの場を設けることによって国際共同研究の推進を後押しした。さらに当該研究分野の海外著名研究者をコロラド大学、マックスプランク研究所、カリフォルニア大学などから招聘した。


• 高次神経機能制御に関わるncRNA機能の解明

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型), 神戸大学, 2014年07月10日 - 2019年03月31日, 研究代表者

  トランスクリプトーム解析により、真核生物では膨大な数の長鎖ノンコーディングRNA（long noncoding RNA： lncRNA）が存在することが明らかにされている。これらのlncRNAのほとんどは機能未知のRNA分子であり、現在でもその体系的な理解はほとんど進んでいない。本研究の目的は、中枢神経系に発現するlncRNAの詳細な解析を行うことで、中枢神経系で機能するRNAの「作動エレメント」を同定し、高次神経機能を制御するncRNAタクソンを確立することにある。これを踏まえ、今年度は以下の研究を行った。 前年度までに、ショウジョウバエ近縁種のゲノム配列の比較により、lobe-less遺伝子には近縁種間で特に保存性の高い領域（conserved region：CR）が5箇所存在し、それ以外の領域の保存性が極めて低いことが明らかにしている。そこで上記のCR領域について、5箇所の領域のみを含むトランスジーン（lol-CR）および5箇所全てを欠損しているトランスジーン（lol-ΔCR）を発現する系統を作成してlol変異系統に導入し、表現型の回復を指標とした解析を行ったところ、lol-CRにはほとんど活性が見られず、またlol-ΔCRは野生型lol全長を含むトランスジーン（lol-FL）と同等の活性を保持していた。これらの結果から、lolの遺伝子活性には少なくともCR領域のみでは不十分であることが明らかになった。次にlol遺伝子の転写領域を約1ｋｂの4つの領域に分断し、それぞれの領域を欠損したトランスジーン（lol-Δ1～Δ4）を作成して同様の解析を行ったところ、lol-Δ2のみが遺伝子活性の減少を示した。今後はこの領域について詳細な解析を行うことにより、LOL RNAの活性を担う作動エレメントを同定することが可能になると期待される。

  競争的資金


• マイクロペプチドの作用機構

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(B), 基盤研究(B), 神戸大学, 2012年04月01日 - 2015年03月31日, 研究代表者

  真核生物のゲノムには、ごく短いORFから生産される小さな機能性ペプチド（マイクロペプチド）をコードする遺伝子が多数存在する。マイクロペプチドは、よく知られた分泌型ペプチド性因子とは異なり、細胞内で機能すると予測されるが、その作用機構の詳細については不明である。本研究では、マイクロペプチドをコードするショウジョウバエpolished rice (pri)遺伝子の解析を行い、pri遺伝子が変態期に一過的に発現すること、pri遺伝子がエクジソンにより発現が誘導されること、pri遺伝子が変態期におけるエクジソン依存的な遺伝子発現制御に必須であることを示した。

  競争的資金


• 脊椎動物におけるマイクロペプチドの探索と分子機能の解析

  深見 泰夫, 影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 神戸大学, 2013年04月01日 - 2014年03月31日

  昆虫や植物では１０～数１０アミノ酸残基のマイクロペプチドと呼ばれる小さいペプチドが個体発生や形態形成において重要な働きをしている事が知られているが、同様な機能を持ったマイクロペプチドが脊椎動物にも存在するかどうかは明らかになっていない。そこで、脊椎動物におけるマイクロペプチドの存在を明らかにするため、アフリカツメガエル卵抽出液よりマイクロペプチドを含むと思われる短鎖ペプチド群を単離する事を試みた。アフリカツメガエルの卵は、通常の動物組織や細胞と異なり、細胞質が非常に大きく遠心操作によって容易に素早く破砕できるので、大量の細胞質因子をタンパク質分解酵素による分解を最小限に抑えた状態で得る事ができるという利点がある。 アフリカツメガエル卵を遠心によって破砕して得た疎抽出液から超遠心法によって細胞質分画を調製し、さらに熱処理によって変性するタンパク質を除いた上澄を限外濾過膜で３分画（分子量１０万以上、１０万～１万、１万～３千）に分画したものを、SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動により解析した。その結果、分子量３千～１万の分画に、クマシー染色や銀染色されるペプチドと思われる数多くのバンドを認めた。これらのペプチドバンドを質量分析機により解析した所、いくつかのペプチドは大きなタンパク質の分解産物であったが、その他のほとんどのペプチドは用意したmRNA配列情報（EST Database）からは同定できなかった。この理由としては、用意したEST Databaseが通常の１００アミノ酸以上のオープンリーディングフレームを持つものであったことが考えられ、今後はより短いオープンリーディングフレームに対応するEST Databaseを用意する必要がある。また、さらに十分な量のペプチドを調製し、MS/MS解析により内部アミノ酸配列を明らかにしていく必要がある。

  競争的資金


• 非コードRNA作用マシナリー

  泊 幸秀, 影山 裕二, 鈴木 健夫, 程 久美子, 中澤 敬信, 和田 猛, 佐渡 敬, 塩見 美喜子, 宮川 さとみ, 中川 真一, 竹下 文隆, 小田 健昭, 山下 暁朗, 西村 教子

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型), 東京大学, 2009年07月23日 - 2014年03月31日

  H21～25年度の新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」領域からは非コードRNA動作原理に関する優れた研究成果が多数生み出され、本領域はホームページや雑誌企画、ワークショップ、一般向けのプレスリリースなど、外部に対して積極的に情報を発信し、得られた研究成果を社会に還元するように努めてきた。これまで、当該分野で顕著な成果を上げている海外の研究者と共に国際シンポジウムを開催することで、国際的にもこの分野を牽引する日本の非コードRNA研究を世界に向けて発信してきた。平成26年度の本研究取りまとめにおいては、過去の実績を踏まえ、本領域の研究期間である５年間を通して得られた研究成果を取りまとめ、その全体像を当該学問領域のみならず、一般国民に分かりやすく還元すると共に情報の発信を継続することを目的として下記の計画を遂行した。 ①本分野をリードする著名な海外の研究者を第37回日本分子生物学会年会シンポジウムおよびワークショップに招聘するとともに、本領域主催の「非コードRNA作用マシナリー」をテーマとした国際シンポジウムの開催し、領域の研究成果を国内外に発信すると共に海外の研究者との情報交換を強化した。②領域の研究成果を広く社会・国民に発信するためのアウトリーチ活動の一環として、領域班員がRNA関連研究を伝える活動を地域の教育・研究機関で行った。③領域の研究成果や上記イベント等を広報するために、引き続きncrna.jpドメインを維持し、ホームページやブログを継続公開・更新した。④研究成果をわかりやすくまとめた成果報告書を作成し、本領域外の科学分野面にも広く配布した。 以上のように、本領域の研究成果を当該分野のみならず、広く一般国民に還元することができたと考える。


• 遺伝学的アプローチによる高分子非コードＲＮＡマシナリーの生理機能解析

  影山 裕二, 中川 真一

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型), 2009年07月23日 - 2014年03月31日, 研究代表者

  ショウジョウバエの高分子非コードRNAについて突然変異系統を用いた遺伝学的な解析を行い、非コードRNAが脳内の神経回路形成を支配していることを示した。また、哺乳類の遺伝子量補償において、X染色体の不活性化に決定的な役割を果たしているXist RNAについて、Xist RNAがhnRNP Uと呼ばれるRNA結合タンパク質を介してX染色体と結合していることを示した。さらには、従来高分子非コードRNAと考えられていたRNAの中に、実際にはごく小さなペプチドをコードするものが存在し、このようなごく小さなペプチドが多数の遺伝子発現を制御しているケースがあることを示した。

  競争的資金


• シグナル配列を持たない短鎖ペプチドはいかにして細胞間情報を伝えるか?

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究, 挑戦的萌芽研究, 神戸大学, 2011年 - 2012年, 研究代表者

  ショウジョウバエpolished rice(pri)遺伝子がコードしている、11および32アミノ酸のごく短いペプチド(PRIペプチド)は、細胞間相互作用を示すものの、シグナル配列を含んでいないことが知られている。PRIペプチドの細胞間相互作用の分子機構を明らかにするため、PRIペプチド安定的に発現する培養細胞株を用い、PRIペプチドと相互作用する因子の同定を試みたところ、タグ付き融合ペプチドとして発現させたPRIペプチドと共沈する因子を複数同定することができた

  競争的資金


• 上皮細胞の形態を制御する短鎖ペプチドの機能

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(B), 基盤研究(B), 2008年 - 2011年

  ショウジョウバエpolished rice(pri)遺伝子がコードしている、11 および 32 アミノ酸のごく短いペプチド(PRI ペプチド)は、細胞外に分泌されない新しいタイプの活性ペプチドと考えられている。PRI ペプチドの作用機構を明らかにするため、遺伝的相互作用を示す遺伝子を探索したところ、転写因子をコードするshavenbaby(svb)遺伝子が同定された。SVB タンパク質は上皮細胞の形態形成を制御するマスター因子であるが、PRI ペプチド存在下では SVB タンパク質の活性化が起こることが明らかになった。


• ショウジョウバエをモデル系としたmRNA型non-coding RNAの解析

  ＪＳＴ戦略的創造研究推進制度（個人研究型） （個人研究推進事業：さきがけ研究２１‐ＰＲＥＳＴＯ）, 2006年 - 2009年

  競争的資金


• ショウジョウバエパターン形成に関わる新規ペプチド遺伝子の機能

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2006年 - 2007年

  これまでの研究により、pri遺伝子がショウジョウバエ幼虫腹部上皮にある歯状突起の形成に関与していることが明らかになっており、器官形成におけるパターン形成の機構を探る上で、pri遺伝子の機能を明らかにすることは意義深いと思われる。本研究ではpri遺伝子の詳細な解析を行い、pri遺伝子産物の生理機能を明らかにすることを目指した。 pri遺伝子のORFは最も長いものでも49アミノ酸に過ぎず、ごく短い短鎖ペプチドが遺伝子産物であると考えられた。この可能性を検証するため、培養細胞系を用いたレポーターアッセイを行ったところ、少なくとも4個の非常に短いORF(それぞれ11,11,11,32aa)がポリシストロニックに翻訳されていることが明らかとなった。また、各ORFを過剰発現型するトランスジーンがそれぞれpri表現型を完全に回復することができること、フレームシフト変異を導入したトランスジーンでは活性が完全になくなることから、個々のORFが完全な遺伝子活性を持つペプチドをコードすることが示された。 pri遺伝子の生理機能を詳細に調べるため、歯状突起の形成に重要であることが知られているアクチン細胞骨格の動態を解析したところ、pri変異体では表皮細胞に特異的に見られるアクチン束が観察されなかった。また、pri変異体において、歯状突起形成のマスター遺伝子であるshavenbaby(svb)およびその標的遺伝子であるアクチン制御因子群の発現解析を行ったところ、svbの標的遺伝子群の発現消失は観察されるものの、svbについては顕著な発現変化は見られないことから、svbによる下流遺伝子の転写制御にpriが必要であると考えられた。 上記の実験結果により、ショウジョウバエpri遺伝子は複数の極めて短いペプチドをコードし、アクチンネットワークの制御を介して、幼虫表皮や気管といった上皮性組織の形成に重要な役割を果たすと結論づけられた。

  競争的資金


• ショウジョウバエ器官形成におけるmRNA様非翻訳RNAの機能

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特定領域研究, 特定領域研究, 奈良先端科学技術大学院大学, 2005年 - 2006年

  これまでに同定した32個のmRNA様非翻訳RNA候補(MRE)が、実際に非翻訳RNA(ncRNA)であるかどうかを検証するため、前年度に引き続き、ノーザン解析による時期特異的発現パターンの解析および近傍のタンパク質遺伝子との発現パターンの比較による検証を行った。MREのうち、保存性の高いORFを持ち、短鎖ペプチドをコードしている可能性が高いことが判明した2個と、ncRNAであることがほぼ確定した4個を除いた26個のncRNA候補遺伝子のうち、7個はイントロンRNAの分解産物であり、6個は近傍のタンパク質遺伝子の5'あるいは3'UTRの一部であると推測された。他の13個については近傍のタンパク質遺伝子とは発現パターンが一致しなかったが、ncRNA遺伝子であるかどうかについてはさらなる検証が必要である。これらの結果は、ゲノムプロジェクトで用いられている網羅的な解析では効率よくncRNAを同定することは困難であり、個々のncRNA候補遺伝子の実験的検証が必要であることを強く示唆している。 ncRNAであることがほぼ確定した4個(MRE3,MRE16,MRE31,MRE32)について、その生理機能を明らかにするため、MRE32,MRE33の転写領域を完全に欠失した系統、およびMRE3転写量域の3'側4分の3を欠いた系統をそれぞれ作成し、その表現型を解析した。これらの系統は全て生存し、生体において必須な遺伝子ではないことが示唆されたが、MRE32の欠失変異系統は成虫への脱皮時期が顕著に遅れることが明らかとなり、発生のタイミングに関わる何らかのメカニズムに関与していることが示唆された。また、cDNAアレイを用いた遺伝子発現プロファイルの解析の結果、約145個の遺伝子が顕著な発現量の変化を見せることが明らかとなり、MRE32がこれらの遺伝子の発現制御に何らかの形で関与していることが考えられた。

  競争的資金


• ショウジョウバエ高分子量機能性RNAの網羅的検索

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特定領域研究, 特定領域研究, 奈良先端科学技術大学院大学, 2003年 - 2004年

  近年の研究から、哺乳類をはじめとした生物のゲノムには、予想をはるかに超える数のmRNA-like non-coding RNA遺伝子が存在することが強く示唆されている。これらRNAのほとんどが新規の分子であり、ゲノムの包括的理解のためにはその機能を明らかにすることが急務であると考えられる。本研究課題ではショウジョウバエをモデル系とし、1)ショウジョウバエゲノム中にいくつのmRNA-like non-coding RNA遺伝子が存在するのか、2)これらnon-coding RNA遺伝子の生体内の機能は何かを明らかにすることを目標とした。 1)全長の塩基配列が明らかにされている10,165のショウジョウバエcDNAを対象にin silicoスクリーニングを行い、287個の非翻訳RNA候補を見い出した。これらのうち、既知のタンパク質遺伝子の相同性が低く、かつ直近に遺伝子が存在しないものを選別し、136個のmRNA-like ncRNAを得た。これらncRNAを近縁種のゲノム配列と比較したところ、mRNA-like ncRNAの進化速度が非常に速いことが示唆された。 2)in situハイブリダイゼーション法により、136個のmRNA-like ncRNAのうち、126個について発現解析を行った。これらnon-coding RNAの約5分の1(32個)が胚発生期に発現しており、特に神経系において特異的に発現するものが多く見られた(18個)。これらの組織特異的なnon-coding RNAについて、RNAiによる機能阻害を行ったところ、2個について特定の表現型が得られた。これら遺伝子の表現型の詳細については現在解析を進めているところである。

  競争的資金


• 染色体上を伝播する活性化クロマチンの可視化とその分子機構

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 若手研究(B), 若手研究(B), 奈良先端科学技術大学院大学, 2002年 - 2003年

  クロマチン構造の活性化(脱凝縮)においては、ときに数Mbpにおよぶ広大なゲノム領域が同時に制御されることが知られている。本研究ではこのような広範囲のクロマチン構造の活性化機構を解明するため、ショウジョウバエの遺伝子量補正をモデル系として、1)X染色体における活性化クロマチン領域の細胞学的挙動の可視化、および2)X染色体特異的なクロマチンリモデリング因子であるMSL complexの標的遺伝子への結合に関与する遺伝子の同定を研究課題とし、以下の成果を得た。 1)活性化クロマチン状態の分子マーカーとして、MSL complexのサブユニットの一つであるMSL-2とGFPとの融合タンパク質を用い、この融合タンパク質が確かにX染色体特異的に結合し、もうひとつの活性化クロマチンマーカーであるH4Ac16と共局在することを示した。またMSL-2の過剰発現系を用いた実験から、MSL complexおよびH4Ac16のX染色体における局在化が胚発生期に確立すること、それ以降の発生段階ではクロマチンの活性化を誘導することができないことを明らかにした。 2)これまでの研究でroX1遺伝子中にMSL complexの標的配列が存在することが研究代表者らによって明らかにされていたが、これ以外にroX2遺伝子中にもMSL complexの標的配列が存在し、この配列を含む領域がDNase I感受性部位であることを示した。また、この領域中に突然変異を導入することにより、GAGAGの繰り返しを含む複数のモチーフがMSL complexの認識に心要であることを明らかにした。


• ショウジョウバエMSL複合体の核内局在化機構

  影山 裕二

  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特定領域研究, 特定領域研究, 奈良先端科学技術大学院大学, 2002年 - 2002年

  ショウジョウバエMSL complexはroX1およびroX2とよばれるnon-coding RNAを含むリボ核タンパク質(RNP)複合体であり、X染色体特異的なクロマチンリモデリング因子である。X染色体という広大なゲノム領域をRNP複合体がいかにして認識するか、その分子メカニズムを解析し、以下の結果を得た。 1)MSL complex結合配列の同定 研究代表者が以前に同定した約200bpのMSL複合体の一次標的領域のうち、GAGAの繰り返しを含む配列がMSL complexの認識において重要であることをtransgenic flyを用いた実験により示した。また、同様な配列がroX2遺伝子上に存在することを明らかにした。近縁種のroX1およびroX2を単離し塩基配列を比較したところ、上記の配列が進化的に保存されていることが明らかとなった。 2)転写依存的なMSL complex一次標的配列の同定 構成的な活性を持つHsp83プロモーター存在下でのみMSL complexと結合する領域が、roX1ゲノム断片中にあることを見いだした。プロモーター存在下でのみおこるMSL complexの結合は、Hsp83-anitsense-roX1トランスジェニック系統では見られないことから、転写産物の配列に依存しないことが示唆された。現在この新たなMSL complexの結合領域をさらに狭い領域に同定するため、transgenic flyを用いた解析が進行中である。