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KANAMARU KengoGraduate School of Agricultural Science / Department of AgrobioscienceAssociate Professor
Researcher basic information
■ Research Keyword- ゼルンボン
- ゼニゴケ
- transcription factor
- Arabidopsis
- 葉緑体分裂
- 5-aminolevurinic acid
- tetrapyrrole
- sigma factor
- trasncription machinary
- chloroplast
- Life sciences / Plants: molecular biology and physiology
- Life sciences / Molecular biology
- Life sciences / Applied molecular and cellular biology
- Life sciences / Applied biochemistry
Research activity information
■ Paper- Abstract CYP2C19 is a member of the human microsomal cytochrome P450 (CYP). Significant variation in CYP2C19 levels and activity can be attributed to polymorphisms in this gene. Wildtype CYP2C19 and 13 mutants (CYP2C19.1B, CYP2C19.5A, CYP2C19.5B, CYP2C19.6, CYP2C19.8, CYP2C19.9, CYP2C19.10, CYP2C19.11, CYP2C19.13, CYP2C19.16, CYP2C19.19, CYP2C19.23, CYP2C19.30, and CYP2C19.33) were coexpressed with NADPH‐cytochrome P450 reductase in Escherichia coli. Hydroxylase activity toward testosterone and progesterone was also examined. Ten CYP2C19 variants showed Soret peaks (450 nm) typical of P450 in the reduced CO‐difference spectra. CYP2C19.11 and CYP2C19.23 showed higher testosterone 11α, 16α‐/17‐ and progesterone 6β‐,21‐,16α‐/17α‐hydroxylase activities than CYP2C19.1B. CYP2C19.6, CYP2C19.16, CYP2C19.19, and CYP2C19.30 showed lower activity than CYP2C19.1B. CYP2C19.9, CYP2C19.10. CYP2C19.13, and CYP2C19.33 showed different hydroxylation activities than CYP2C19.1B. These results indicated that CYP2C19 variants have very different substrate specificities for testosterone and progesterone.Wiley, Oct. 2023, Biopharmaceutics & Drug Disposition, English[Refereed]Scientific journal
- Biology Centre, AS CR, Mar. 2023, European Journal of Entomology, 120, 93 - 104, English[Refereed]Scientific journal
- Dec. 2022, RIKEN Accelerator Progress Report, EnglishArgon-ion-induced mutations in Arabidopsis EGY1 gene affect chloroplast development in leaf guard cells.[Refereed]Research institution
- Springer Science and Business Media LLC, Sep. 2022, Histochemistry and Cell Biology, 159(2) (2), 199 - 208, English[Refereed]Scientific journal
- MDPI AG, Jun. 2021, Plants, 10(6) (6), 1254 - 1254[Refereed]Scientific journal
- Argon-ion beam is an effective mutagen capable of inducing a variety of mutation types. In this study, an argon ion-induced pale green mutant of Arabidopsis thaliana was isolated and characterized. The mutant, designated Ar50-33-pg1, exhibited moderate defects of growth and greening and exhibited rapid chlorosis in photosynthetic tissues. Fluorescence microscopy confirmed that mesophyll chloroplasts underwent substantial shrinkage during the chlorotic process. Genetic and whole-genome resequencing analyses revealed that Ar50-33-pg1 contained a large 940 kb deletion in chromosome V that encompassed more than 100 annotated genes, including 41 protein-coding genes such as TYRAAt1/TyrA1, EGY1, and MBD12. One of the deleted genes, EGY1, for a thylakoid membrane-localized metalloprotease, was the major contributory gene responsible for the pale mutant phenotype. Both an egy1 mutant and F1 progeny of an Ar50-33-pg1 × egy1 cross-exhibited chlorotic phenotypes similar to those of Ar50-33-pg1. Furthermore, ultrastructural analysis of mesophyll cells revealed that Ar50-33-pg1 and egy1 initially developed wild type-like chloroplasts, but these were rapidly disassembled, resulting in thylakoid disorganization and fragmentation, as well as plastoglobule accumulation, as terminal phenotypes. Together, these data support the utility of heavy-ion mutagenesis for plant genetic analysis and highlight the importance of EGY1 in the structural maintenance of grana in mesophyll chloroplasts.Apr. 2021, Plants (Basel, Switzerland), 10(5) (5), English, International magazine[Refereed]Scientific journal
- 2021, EUROPEAN JOURNAL OF ENTOMOLOGY, 118, 307 - 314, English[Refereed]Scientific journal
- Springer Science and Business Media LLC, Dec. 2019, Microbial Cell Factories, 18(1) (1)[Refereed]Scientific journal
- Jan. 2019, Histochemistry and Cell Biology, 151, 187 - 198, EnglishFunctional characterization of insect-specific RabX6 of Bombyx mori[Refereed]Scientific journal
- Metabolism of steroids by cytochrome P450 2C9 variants.CYP2C9 is a human microsomal cytochrome P450c (CYP). Much variation in CYP2C9 levels and activity can be attributed to polymorphisms of this gene. Wild-type CYP2C9 and ten mutants were co-expressed with NADPH-cytochrome P450 reductase in Escherichia coli. The hydroxylase activities toward steroids were examined. CYP2C9.2, CYP2C9.3, CYP2C9.4, CYP2C9.16, CYP2C9.28, CYP2C9.48 andAug. 2018, Biopharmaceutics & Drug Disposition, 39(8) (8), 371 - 377, English[Refereed]Scientific journal
- John Wiley and Sons Ltd, Nov. 2017, Biopharmaceutics and Drug Disposition, 38(8) (8), 486 - 493, English[Refereed]Scientific journal
- Sep. 2017, ARCHIVES OF INSECT BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY, 96(1) (1), English[Refereed]Scientific journal
- Jul. 2016, HISTOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY, 146(1) (1), 59 - 69, English[Refereed]Scientific journal
- May 2016, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 80(5) (5), 863 - 869, English[Refereed]Scientific journal
- Sep. 2015, ENVIRONMENTAL TOXICOLOGY AND PHARMACOLOGY, 40(2) (2), 360 - 368, English[Refereed]Scientific journal
- Jul. 2015, Biopharmaceutics & Drug Disposition, 36(8) (8), 552 - 563, EnglishPoint mutation of cytochrome P450 2A6 (a polymorphic allele CYP2A6.25) confers new substrate specificity towards flavonoids[Refereed]Scientific journal
- Mar. 2014, HISTOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY, 141(3) (3), 311 - 320, English[Refereed]Scientific journal
- Jan. 2014, PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 74(1) (1), 92 - 98, English[Refereed]Scientific journal
- Metabolism of 7-ethoxycoumarin, safrole, flavanone and hydroxyflavanone by cytochrome P450 2A6 variants.多種の生体異物を代謝するヒトシトクロームP450 2A6の野生型および13種の変異型酵素をNADPH-シトクロームP450還元酵素とともに大腸菌で発現し、組換え酵素の7-エトキシクマリン、サロール、フラバノン、水酸化フラバノンの代謝を解析し、2A6ファミリーがフラボノイドを代謝することを明らかにした。Nov. 2013, Biopharm Drug Dispos., 34(2) (2), 87 - 97, English[Refereed]Scientific journal
- Feb. 2013, HISTOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY, 139(2) (2), 299 - 308, English[Refereed]Scientific journal
- Feb. 2012, Wheat Information Service, 113, 9 - 11, EnglishComparison of three hemA1 cDNA sequences putatively encoding a glutamyl tRNA reductase in common wheatResearch society
- Dec. 2011, JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 53(12) (12), 942 - 950, English[Refereed][Invited]Scientific journal
- Oct. 2011, PESTICIDE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY, 101(2) (2), 93 - 102, English[Refereed]Scientific journal
- Dec. 2010, HISTOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY, 134(6) (6), 615 - 622, English[Refereed]Scientific journal
- Sep. 2010, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 285(39) (39), 29797 - 29807, English[Refereed]Scientific journal
- Jun. 2010, BIOLOGY LETTERS, 6(3) (3), 379 - 381, English[Refereed]Scientific journal
- Jul. 2009, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 73(7) (7), 1693 - 1697, English[Refereed]Scientific journal
- Feb. 2009, Archives of Insect Biochemistry and Physiology, 70(2) (2), 77 - 89, English[Refereed]Scientific journal
- Czech Academy of Sciences, 2009, European Journal of Entomology, 106(4) (4), 499 - 506, English[Refereed]Scientific journal
- 2009, JOURNAL OF THE INSTITUTE OF BREWING, 115(2) (2), 116 - 121, EnglishFerulic Acid Production in the Brewing of Rice Wine (Sake)[Refereed]Scientific journal
- Jan. 2009, PLANTA, 229(2) (2), 403 - 413, English[Refereed]Scientific journal
- Aug. 2008, BIOTECHNOLOGY AND APPLIED BIOCHEMISTRY, 50, 165 - 171, English[Refereed]Scientific journal
- Apr. 2008, COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY C-TOXICOLOGY & PHARMACOLOGY, 147(3) (3), 278 - 285, English[Refereed]Scientific journal
- Oct. 2007, EUROPEAN JOURNAL OF ENTOMOLOGY, 104(4) (4), 641 - 645, EnglishMonoclonal antibody against rab8 from Bombyx mori (Lepidoptera : Bombycidae)[Refereed]Scientific journal
- Oct. 2007, ARCHIVES OF INSECT BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY, 66(2) (2), 89 - 97, English[Refereed]Scientific journal
- Feb. 2007, PHOTOSYNTHESIS RESEARCH, 91(2-3) (2-3), 267 - 267, EnglishCoordinated functions of plastid sigma factors in chloroplast development and gene expression
- 2007, Kobe Univ. Frontier Technology Forum 2007, 17, EnglishCloning and characterization of soybean GmGT-1 that binds to a light-responsive cis-element in ELIP promoter.[Refereed]Symposium
- 2007, Kobe Univ. Frontier Technology Forum 2007, 18, EnglishDevelopment and characterization of photo-autophilic Arabidopsis cultured cells[Refereed]Symposium
- 2007, Kobe Univ. Frontier Technology Forum 2007, 19Small GTP binding proteins; Rab GTPases from Bombyx mori.[Refereed]
- 2007, Comprehensive biochemistry and physiology C Toxicology Pharamacology, 147, 278 - 285, EnglishBioconversion by functional P450 1A9 and 1C1of Anguillus japonica,[Refereed]Scientific journal
- Dec. 2006, JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 33(12) (12), 1043 - 1050, English[Refereed]Scientific journal
- May 2006, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 70(5) (5), 1200 - 1209, EnglishRice bifunctional alpha-amylase/subtilisin inhibitor: Cloning and characterization of the recombinant inhibitor expressed in Escherichia coli[Refereed]Scientific journal
- Biochemical characterization of Rab proteins from Bombyx mori,The small GTPases known as Rab proteins are key regulators of membrane trafficking. We used RT-PCR to isolate cDNA clones of insect-specific Rab proteins (BRabN1 and BRabN2) showing low homology with known Rab proteins from other animals, from mRNA of Bombyx mori. These 2 Rabs were produced in Escherichia coli and purified. BRabN1 bound [(3)H]-GDP and [(35)S]-GTPgammaS with dis2006, Archives of Insect Biochemistry and Physiology, 70, 77 - 89, English[Refereed]Scientific journal
- Aug. 2005, J Insect Sci, 5:8, 1-8Expression, purification and characterization of methyl DNA binding protein from Bombyx mori.[Refereed]Scientific journal
- Glutamyl-tRNA mediates a switch in RNA polymerase use during chloroplast biogenesis.Chloroplast genes of higher plants are transcribed by two types of RNA polymerase that are encoded by nuclear (NEP (nuclear-encoded plastid RNA polymerase)) or plastid (PEP (plastid-encoded plastid RNA polymerase)) genomes. NEP is largely responsible for the transcription of housekeeping genes during early chloroplast development. Subsequent light-dependent chloroplast maturatiJun. 2005, EMBO Rep., 6(6) (6), 545 - 50, English, International magazine[Refereed]Scientific journal
- Nov. 2004, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 68(11) (11), 2215 - 2223, EnglishRoles of chloroplast RNA polymerase sigma factors in chloroplast development and stress response in higher plants[Refereed]
- Mar. 2004, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 68(3) (3), 694 - 704, EnglishDNA microarray analysis of plastid gene expression in an Arabidopsis mutant deficient in a plastid transcription factor sigma, SIG2[Refereed]Scientific journal
- The plastid genome contains more than one hundred genes and the expression is regulated depending on plastid types and environmental conditions. Sigma factors determine the specificity of the eubacteria-type plastid RNA polymerase (PEP), and the roles of sigma factors for chloroplast gene expression remain largely unknown. In this study, we analyzed the expression of the sigma factors (SIG1-6) under various stress conditions, and found that the SIG5 transcript was rapidly and drastically induced under various stresses conditions. Because this induction was well correlated with the activation of the light-responsive promoter (LRP) of psbD, and because the psbD-LRP activation was abolished in the newly identified sig5 mutant (sig5-2), we conclud that SIG5 is a stress-responsive sigma factor in Arabidopsis, and responsible for the psbD-LRP transcription. We also found that the restoration of PSII activity after high light irradiation was delayed in the sig5 mutant, suggesting roles of SIG5 under stress conditions.The Japanese Society of Plant Physiologists, 2004, Plant and Cell Physiology, 45, S33 - 23[Refereed]
- 2004, Endocytobiosis and Cell Research, 15,218-234, EnglishFunction of a neclear-encoded sigma factor in chloroplasts; SIG2-dependent expression of some plastid-encoded tRNA genes including trnE in Arabidopsis thaliana.[Refereed]Scientific journal
- 2004, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 45(4) (4), 357 - 368, EnglishThe multiple-stress responsive plastid sigma factor, SIG5, directs activation of the psbD blue light-responsive promoter (BLRP) in Arabidopsis thaliana[Refereed]Scientific journal
- Molecular genetic analysis of chloroplast gene promoters dependent on SIG2, a nucleus-encoded sigma factor for the plastid-encoded RNA polymerase, in Arabidopsis thaliana.Most photosynthesis-related genes in mature chloroplasts are transcribed by a eubacterial-type RNA polymerase (PEP) whose core subunits are encoded by the plastid genome. It has been shown previously that six putative nuclear genes (SIG1 to SIG6) encode promoter-specificity factors for PEP in Arabidopsis thaliana, and we isolated a T-DNA insertion line of SIG2 (sig2-1 mutant) tDec. 2003, Nucleic Acids Res., 31(24) (24), 7090 - 8, English, International magazine[Refereed]Scientific journal
- Oct. 2001, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 42(10) (10), 1034 - 1043, EnglishAn Arabidopsis sigma factor (SIG2)-dependent expression of plastid-encoded tRNAs in chloroplasts[Refereed]Scientific journal
- Nov. 2000, MOLECULAR MICROBIOLOGY, 38(4) (4), 805 - 816, EnglishSdiA, an Escherichia coli homologue of quorum-sensing regulators, controls the expression of virulence factors in enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 : H7[Refereed]Scientific journal
- Nov. 2000, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 64(11) (11), 2508 - 2511, EnglishRegulation of virulence factors of enterohemorrhagic Escherichia coli O157 : H7 by self-produced extracellular factors[Refereed]Scientific journal
- Nov. 2000, FEBS LETTERS, 485(2-3) (2-3), 178 - 182, EnglishChloroplast development in Arabidopsis thaliana requires the nuclear-encoded transcription factor Sigma B[Refereed]Scientific journal
- Oct. 2000, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 41(10) (10), 1119 - 1128, EnglishChloroplast targeting, distribution and transcriptional fluctuation of AtMinD1, a eubacteria-type factor critical for chloroplast division[Refereed]Scientific journal
- Sep. 2000, FEBS LETTERS, 481(1) (1), 47 - 52, EnglishThree new nuclear genes, sigD, sigE and sigF, encoding putative plastid RNA polymerase sigma factors in Arabidopsis thaliana[Refereed]Scientific journal
- Aug. 1999, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 40(8) (8), 832 - 842, EnglishPlastidic RNA polymerase sigma factors in Arabidopsis[Refereed]Scientific journal
- Feb. 1999, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 274(7) (7), 4160 - 4165, EnglishSer-534 in the hinge 1 region of Arabidopsis nitrate reductase is conditionally required for binding of 14-3-3 proteins and in vitro inhibition[Refereed]Scientific journal
- Nov. 1997, PLANT PHYSIOLOGY, 115(3) (3), 1135 - 1143, EnglishAnalysis of wild-type and mutant plant nitrate reductase expressed in the methylotrophic yeast Pichia pastoris[Refereed]Scientific journal
- May 1996, JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 178(10) (10), 2994 - 2997, EnglishA novel member of the cspA family of genes that is induced by cold shock in Escherichia coli[Refereed]Scientific journal
- Dec. 1994, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 58(12) (12), 2299 - 2300, EnglishCLONING AND SEQUENCING OF A SYNECHOCOCCUS GENE ENCODING A PROTEIN VERY SIMILAR TO MAMMALIAN ALDEHYDE DEHYDROGENASES[Refereed]Scientific journal
- Jul. 1994, MOLECULAR MICROBIOLOGY, 13(2) (2), 369 - 377, EnglishA COPPER-TRANSPORTING P-TYPE ATPASE FOUND IN THE THYLAKOID MEMBRANE OF THE CYANOBACTERIUM SYNECHOCOCCUS SPECIES PCC7942[Refereed]Scientific journal
- Sep. 1993, FEBS LETTERS, 330(1) (1), 99 - 104, EnglishTHE CYANOBACTERIUM, SYNECHOCOCCUS SP PCC7942, POSSESSES 2 DISTINCT GENES ENCODING CATION-TRANSPORTING P-TYPE ATPASES[Refereed]Scientific journal
- Jan. 1993, MOLECULAR MICROBIOLOGY, 7(1) (1), 109 - 116, EnglishSIGNAL TRANSDUCTION BETWEEN THE 2 REGULATORY COMPONENTS INVOLVED IN THE REGULATION OF THE KDPABC OPERON IN ESCHERICHIA-COLI - PHOSPHORYLATION-DEPENDENT FUNCTIONING OF THE POSITIVE REGULATOR, KDPE[Refereed]Scientific journal
- Apr. 1992, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 111(4) (4), 425 - 430, EnglishSIGNAL TRANSDUCTION AND OSMOREGULATION IN ESCHERICHIA-COLI - A NOVEL MUTANT OF THE POSITIVE REGULATOR, OMPR, THAT FUNCTIONS IN A PHOSPHORYLATION-INDEPENDENT MANNER[Refereed]Scientific journal
- Jul. 1991, FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 82(1) (1), 43 - 47, EnglishOSMOREGULATORY EXPRESSION OF THE PORIN GENES IN ESCHERICHIA-COLI - EVIDENCE FOR SIGNAL TITRATION IN THE SIGNAL TRANSDUCTION THROUGH ENVZ-OMPR PHOSPHOTRANSFER[Refereed]Scientific journal
- 1991, Journal of Biological Chemistry, 266(17) (17), 10775 - 10780, EnglishSignal transduction and osmoregulation in Escherichia coli: A novel type of mutation in the phosphorylation domain of the activator protein, OmpR, results in a defect in its phosphorylation-dependent DNA binding[Refereed]Scientific journal
- Sep. 1990, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 108(3) (3), 483 - 487, EnglishTRANSMEMBRANE SIGNAL TRANSDUCTION AND OSMOREGULATION IN ESCHERICHIA-COLI .1. ANALYSIS BY SITE-DIRECTED MUTAGENESIS OF THE AMINO-ACID-RESIDUES INVOLVED IN PHOSPHOTRANSFER BETWEEN THE 2 REGULATORY COMPONENTS, ENVZ AND OMPR[Refereed]Scientific journal
- Lead, Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, 1990, KAGAKU TO SEIBUTSU, 28(8) (8), 498 - 505, Japanese[Invited]Scientific journal
- Dec. 1989, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 264(36) (36), 21633 - 21637, EnglishSIGNAL TRANSDUCTION AND OSMOREGULATION IN ESCHERICHIA-COLI - A SINGLE AMINO-ACID CHANGE IN THE PROTEIN-KINASE, ENVZ, RESULTS IN LOSS OF ITS PHOSPHORYLATION AND DEPHOSPHORYLATION ABILITIES WITH RESPECT TO THE ACTIVATOR PROTEIN, OMPR[Refereed]Scientific journal
- 2007, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 48, S117 - S117, EnglishDynamism of chloroplast tRNA expression in ArabidopsisSummary international conference
- 2007, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 48, S65 - S65, EnglishFunctional involvement of cGMP and NO in light regulation of gene expression of soybean flavonoid-biosynthetic enzymesSummary international conference
- 2007, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 48, S84 - S84, EnglishAnalysis of a knock-out mutant of an Arabidopsis T7 phage-type RNA polymerase, RpoTp (RpoT;3)Summary international conference
- 2006, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 47, S69 - S69, EnglishFunctional analysis of a T7 phage-type RNA polymerase RpoT;2 in ArabidopsisSummary international conference
- 2006, PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 47, S187 - S187, EnglishSummary international conference
- 2004, 日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 27th葉緑体分化における2種の色素体転写装置のスイッチング機構
- Contributor, 第4章 遺伝子による環境ストレス制御メカニズム/第3節 5-アミノレブリン酸(5-ALA)による遺伝子発現と環境ストレス耐性メカニズム, エヌ・ティー・エス, Apr. 2022, ISBN: 9784860437695バイオスティミュラントハンドブック 植物の生理活性プロセスから資材開発、適用事例まで
- Joint work, Springer, May 2013, English, The major function of chloroplasts in green plants and algae is oxygenic photosynthesis. Further, chloroplasts manufacture essential metabolites and phytohormones. Because of the extensive interconnection with cellular metabolic and regulatory networks, development of the organelle and the organism are coordinately regulated. Conversion of proplastids to chloroplasts is associaAdvances in Photosynthesis and Respiration, Vol. 36 "Plastid Development in Leaves during Growth and Senescence" #10. Dynamic Features of the Plastid Genome and its Transcriptional Control in Plastid DevelopmentScholarly book
- Joint work, Research Signpost, Kerala, India, Dec. 2008, English"Adaptive Gene Regulations from Microorganisms to Organelles" #4 Function of plastidial T7 phage- types RNA polymerase in plantsScholarly book
- Others, 共立出版社, Jan. 2002, Japanese, ポストゲノム時代をむかえ,高価なアレイ解析をかずさDNA研究所からのcDNAライブラリーの提供などの協力の下,全国の植物研究者でコンソーシアムを組織してマクロアレイを共同作成した活動について紹介。PNE: Activity of The Japanese Consortium for Arabidopsis Thaliana DNA array (JCAA)Scholarly book
- 第65回日本植物生理学会, Mar. 2024, EnglishExpression and Physiological Functions of Two Transcription Factors ERF105 and ERF104 in ArabidopsisPoster presentation
- 第65回日本植物生理学会年会, Mar. 2024, EnglishCharacterization of an Arabidopsis double mutant, which defects both transcription and division systems of chloroplastsPoster presentation
- 第62回日本植物生理学会年会, Mar. 2021, EnglishCharacterization of enzyme activity, multimerization, and gene expression of two ALADs in ArabidopsisOral presentation
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- JSPP, Mar. 2019, Japanese, Nagoya University, Domestic conferenceTranscriptional regulation in response to 5-aminolevulinic acid in ArabidopsisOral presentation
- 10th International Symposium of iBioK, Jan. 2019, English, Kobe University, International conferenceOverexpression and characterization of Arabidopsis 5-aminolevulinic acid dehydratases in E. coliPoster presentation
- 10th International Symposium of iBioK, Jan. 2019, English, Kobe University, International conference5-aminolevulinic acid responsive genes related to increasing stress tolerance in ArabidopsisPoster presentation
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- 若手フロンティア研究会2017, Dec. 2017, Japanese, Kobe University, Domestic conference5-アミノレブリン酸近縁物質による 「正」の遺伝子発現制御Poster presentation
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- 第39回日本分子生物学会年会, Dec. 2016, Japanese, 日本分子生物学会, パシフィコ横浜, Domestic conferenceMolecular mechanisms of 5-aminolevulinic acid (ALA)-induced stress tolerance in ArabidopsisPoster presentation
- 第39回日本分子生物学会年会, Dec. 2016, Japanese, 日本分子生物学会, パシフィコ横浜, Domestic conferenceFunction of Arabidopsis 5-aminolevulinic acid transporter, ALT1, ALT2Poster presentation
- 4th International ALA&Porphyrin Symposium, IAPS4, Dec. 2016, English, ALA and Porphyrin Research Society, Ryoujun Hall, Nagasaki University School of Medicine, International conferenceALA-induced gene expression and stress tolerance in ArabidopsisOral presentation
- 日本農芸化学会関西支部第497回例会, Dec. 2016, Japanese, 日本農芸化学会関西支部, 神戸大学, Domestic conference5-アミノレブリン酸誘導性転写応答による植物のマルチストレス耐性向上のメカニズムOral presentation
- 若手フロンティア研究会2016, Dec. 2016, Japanese, 神戸大学研究基盤センター, Domestic conference5-アミノレブリン酸(ALA)の膜輸送機構 〜変異株における細胞内ALA濃度と遺伝子発現への影響Poster presentation
- 若手フロンティア研究会2016, Dec. 2016, Japanese, 神戸大学研究基盤センター, Domestic conference5-アミノレブリン酸(ALA)の分子機能 〜ALA誘導性遺伝子による植物のストレス耐性増強Poster presentation
- 第11回トランスポーター研究会, Jul. 2016, Japanese, Kyoto University, 5-アミノレブリン酸(ALA)は、ヘムやクロロフィル等テトラピロール化合物生合成の共通前駆体である。植物では低濃度のALA投与で成長促進効果が、高濃度投与で光傷害誘導による枯死効果があることから、ALA含有肥料はすでに上市され,除草剤としても検討がされてきた。更に近年、中濃度のALA投与で様々な環境ストレスへの耐性が向上することがわかり、我々は新規植物活性化剤としての用途開発を視野にその分子機構について基盤研究を進めている。そのひとつがALAトランスポーターである。ALAトランスポーターの同定と機能解析は、植物アミノ酸輸送系の新たな一例となるだけでなく、ALAの生理効果を最大化して農業に活用する技術の開発基盤にもなる。 我々は動物ALAトランスポーターの情報や,推定される構造的・機能的特徴,局在性予測に基づき植物ALAトランスポーターの候補遺伝子, Domestic conference植物5-アミノレブリン酸(ALA)膜トランスポーターの局在性および機能解析Poster presentation
- 第57回日本植物生理学会, Mar. 2016, Japanese, 岩手大学, Domestic conferenceTranscriptional Regulation and Improvement of Stress Tolerance Induced by 5-Amino Levulinic AcidPoster presentation
- The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK), Jan. 2016, English, Kobe University, International conferencePossible 5-aminolevulinic acid (ALA) transporters (ALT) in ArabidopsisPoster presentation
- The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK), Jan. 2016, English, Kobe University, International conference5-aminolevulinic acid (ALA)-upregulated genes (ALU) and ALA-induced multi-stress tolerance in ArabidopsisPoster presentation
- The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK), Jan. 2016, English, Kobe University, International conference5-aminolevulinic acid (ALA)-responsive transcription factors (ALR) and regulatory gene expression in ArabidopsisPoster presentation
- 若手フロンティア2015, Dec. 2015, Japanese, Kobe University, Domestic conference植物をストレス耐性化する5-アミノレブリン酸の作用機構Poster presentation
- 神戸大学若手フロンティア2015, Dec. 2015, Japanese, 神戸大学, Domestic conference稲わらのバイオリファイナリーに向けた特性の解析と多様性の評価Poster presentation
- 日本農芸化学会関西支部第492例会, Dec. 2015, Japanese, 神戸大学, Domestic conferenceバイオリファイナリー利用に向けた稲わらの希硫酸前処理後グルコース含量の自然変異Oral presentation
- 第38回日本分子生物学会年会, Dec. 2015, Japanese, 神戸ポートアイランド, Domestic conferenceMolecular mechanism of 5-aminolevulinic acid (ALA)-dependent gene expression and increase of environmental stress tolerance in plantOral presentation
- 第38回日本分子生物学会年会, Dec. 2015, Japanese, 神戸ポートアイランド, 植物バイオマスの増産は,近年バイオリファイナリー産業の原料としての重要性が高まっており,植物の潜在的な生命力や環境適応力を最大限引き出す植物活性化物質の活用はその一法として有望である。 そこで我々は5-アミノレブリン酸(ALA)の生理活性に注目した。ALAはほぼ全ての生物が有するテトラピロール合成経路の中間基質で,合成されたヘムやクロロフィルは種々の酸化反応酵素や光合成集光色素の活性中心をなす。一方,植物種子や幼苗をALAで前処理しておくと塩や低温ストレスなど様々な環境ストレスへの耐性が長期間高まる現象が観察されている。この分子機構を解明すれば,ALAを肥料成分として以外に,塩害土壌などへの可耕地拡大,気象変動等による生育不良の改善など植物活性化物質として植物バイオマス増産に活用できる。 我々はまずトマトのストレス応答性転写因子からALA誘導性も, Domestic conferenceMolecular mechanism of 5-aminolevulinic acid (ALA)-dependent gene expression and increase of environmental stress tolerance in plantPoster presentation
- 日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Japanese, 岡山大学, Domestic conference青色光/UV-AシグナルによるダイズELIP遺伝子の転写調節機構Oral presentation
- 日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Japanese, 岡山大学, Domestic conferenceヌクレオシド三リン酸によるACC酸化酵素の活性化機構の解析Oral presentation
- 日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Japanese, Domestic conferenceククミシン遺伝子の果実特異的発現機構 -転写調節と形質転換トマトにおける発現解析-Oral presentation
- 日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Japanese, 岡山大学, Domestic conferenceAtNAS1プロモーター中のNO応答性シスエレメントの解析Oral presentation
- BMB2015, Mar. 2015, Japanese, 神戸国際展示場, 植物バイオマスの増産は,近年バイオリファイナリー産業の原料としての重要性が高まっており,植物の潜在的な生命力や環境適応力を最大限引き出す植物活性化物質の活用はその一法として有望である。 そこで我々は5-アミノレブリン酸(ALA)の生理活性に注目した。ALAはほぼ全ての生物が有するテトラピロール合成経路の中間基質で,合成されたヘムやクロロフィルは種々の酸化反応酵素や光合成集光色素の活性中心をなす。一方,植物種子や幼苗をALAで前処理しておくと塩や低温ストレスなど様々な環境ストレスへの耐性が長期間高まる現象が観察されている。この分子機構を解明すれば,ALAを肥料成分として以外に,塩害土壌などへの可耕地拡大,気象変動等による生育不良の改善など植物活性化物質として植物バイオマス増産に活用できる。 我々はまずトマトのストレス応答性転写因子からALA誘導性も, Domestic conference5-アミノレブリン酸(ALA)による植物遺伝子発現調節と環境ストレス耐性向上の分子機構Poster presentation
- 日本生物工学会大会講演要旨集, 2015, Japanese, 日本生物工学会3P-083 Development of 5-aminolevulinic acid production using engineered S. cerevisiae
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2014, Japanese, ダイズELIP(early light-inducible protein)遺伝子(GmELIP)の発現は青色光/UV-A照射により特異的に誘導される。GmELIPプロモーター中のGT-1-like boxとG boxの2つのシスエレメントが青色光/UV-A応答に必要かつ十分な制御配列である。転写因子GmGT-1がこれら両シスエレメントに結合することを既に報告したがG-box配列はbZIP型転写因子の標的配列でもある。そこで、今回は青色光/UV-AによるGmELIPの発現誘導におけるbZIP型転写因子の機能を解析した。 ダイズ光独立栄養培養細胞(SB-P細胞)中のGmELIPのUV-Aによる発現誘導はシクロヘキシミドによって強く阻害されたことから、この過程には新たなタンパク質合成が必要であることが示唆された。DNAマイクロアレイ分析による網羅的解析に, Domestic conference青色光/UV-AによるダイズELIP遺伝子の転写調節機構Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2014, Japanese, 神戸大学会館, エチレンは、花芽の形成や果実の追熟、器官脱離、老化、感染防御など様々な生理現象を制御している重要な植物ホルモンであり、メチオニンからS-アデノシルメチオニン、1-アミノシクロプロパン-1- カルボン酸(ACC)を経て合成される。ACC酸化酵素(ACO)はACCを酸化しエチレンに変換する最後の反応を触媒するが、その特性には不明な点が多い。本研究では、シロイヌナズナのAtACO2とトマトのLeACO1について新たな酵素学的特性を見出した。まず大腸菌で発現・精製したACOがアルカリ性で可逆的に失活することを明らかにした。次に、AtACO2の活性は12 mMヌクレオシド三リン酸(NTP)により約5倍に増加するのに対し、LeACO1は逆に約1/2に減少することを見出した。また、NTPのACCや各補因子に対するKm、Vmaxへの影響を調べた。一般的にNTPによる, Domestic conferenceヌクレオシド三リン酸によるACC酸化酵素の活性化機構の解析Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2014, Japanese, 神戸大学会館, メロン果実のセリンプロテアーゼ、ククミシンは果実の全可溶性タンパク質の10%以上を占める主要タンパク質で、受粉後10日前後の若い果実の果芯部でのみ発現する。ククミシンプロモーターの果実特異的発現能はトマトにおいても機能することを報告した。また、ククミシン遺伝子のプロモーター中に存在する、G-boxを含む20塩基の配列がククミシンの果実特異的な発現を制御するエンハンサーとして機能することが明らかにされ、その配列に結合する転写因子候補として、CmbZIP1とCmbZIP2が単離された。また、CmbZIP1とCmbZIP2自体が果実特異的に発現することも報告された。本研究では、CmbZIP1とCmbZIP2の果実内動態とDNA結合特性の解明を目的とした。受粉後10-15 日のメロン果実の核タンパク質中に上記のククミシンエンハンサーに結合するDNA結合タンパ, Domestic conferenceククミシン遺伝子の果実特異的発現機構Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2014, Japanese, 神戸大学会館, 一酸化窒素(NO)は植物において根の伸長や鉄の取り込み、気孔の閉鎖、植物ホルモンのシグナル伝達、病原菌感染や非生物的ストレスに対する適応応答等の様々な生理的過程に関与する重要なシグナル伝達分子である。動物に比べ、植物におけるNOシグナル伝達や遺伝子発現調節機構には不明な点が多い。本研究では、NOによる植物の遺伝子発現調節機構を転写レベルで明らかにすることを目的とした。シロイヌナズナの光独立栄養培養細胞(T87細胞)を用いたDNAマイクロアレイ解析により、NOによって発現が強く誘導される遺伝子としてニコチアナミン合成酵素遺伝子1(AtNAS1)が見出された。AtNAS1プロモーターの部分配列とGUSレポーター遺伝子の融合遺伝子をT87細胞のプロトプラストにPEG法で導入し、100 µM ニトロプルシドナトリウム(SNP、NO発生剤)で3時間処理後、GU, Domestic conferenceAtNAS1プロモーター中のNO応答性シスエレメントの解析Poster presentation
- Plant Biology 2014, Jul. 2014, English, アメリカ植物生物学会, アメリカ・オレゴン州ポートランド・コンベンションセンター, Cucumisin is a subtilisin-like serine protease found in melon fruits. We reported the primary structure and characterization of cucumisin (1, 2). Cucumisin is synthesized in the central parts of young fruits and secreted into the juice; it comprises more than 15% of the total juice protein. A 20 bp enhancer element in the cucumisin promoter is responsible for the fruit-specific, International conferenceTranscriptional control of fruit-secific expression of melon cucumisinPoster presentation
- 第55回日本植物生理学会年会, Mar. 2014, Japanese, 富山大学, Domestic conferenceシロイヌナズナRPOTmpの葉緑体光防護における役割Oral presentation
- 平成26年度 蚕糸・昆虫機能利用学術講演会, Mar. 2014, Japanese, Domestic conferenceカイコ脳における低分子量GTP結合蛋白質(Rab)の免疫組織学的解析Oral presentation
- 2013神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2013, Japanese, 神戸大学, Domestic conference葉緑体・ミトコンドリア両局在性RNAPの光ストレス低減機能Poster presentation
- 第36回日本分子生物学会年会, Dec. 2013, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conference青色光/UV-AによるダイズELIP遺伝子の発現制御機構Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2013, Japanese, Domestic conference青色光/UV-AによるダイズELIP遺伝子の発現制御機構Poster presentation
- 第36回日本分子生物学会年会, Dec. 2013, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conferenceメロン・ククミシン遺伝子プロモーターのトマトにおける発現解析Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2013, Japanese, Domestic conferenceメロン・ククミシン遺伝子プロモーターのトマトにおける発現解析Poster presentation
- 第36回日本分子生物学会年会, Dec. 2013, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conferenceメロン・ククミシンの果実特異的発現を調節する転写因子CmbZIP1/2の特性解析Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2013, Japanese, Domestic conferenceメロン・ククミシンの果実特異的発現を調節する転写因子CmbZIP1/2の特性解析Poster presentation
- 第36回日本分子生物学会年会, Dec. 2013, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conferenceシロイヌナズナRPOTmpの光ストレス応答における重要性Poster presentation
- 第36回日本分子生物学会年会, Dec. 2013, English, 神戸国際会議場, Domestic conferenceAnalysis of cis-element responsible for cGMP in the promoter of soybean chalcone synthase genePoster presentation
- 神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2013, English, Domestic conferenceA cis-element responsible for cGMP in the promoter of the soybean chalcone synthase genePoster presentation
- 平成25年度日本水産学会秋季大会, Sep. 2013, Japanese, 三重大学, Domestic conference大腸菌で発現したウナギシトクロムP450(CYP1A9,CYP1C1)の機能解Oral presentation
- 25th Congress of the Scandinavian Plant Physiology Society, Aug. 2013, English, Scandinavian Plant Physiology Society, Helsinger, Denmark, International conferenceTranscriptional control of fruit-specific expression of melon cucumisin.Poster presentation
- 日本蚕糸学会第83回大会, Mar. 2013, Japanese, つくば, Domestic conference免疫組織化学を用いたカイコ低分子量GTP結合タンパク質(Rab)の機能解析Oral presentation
- 第55回日本植物生理学会年会, Mar. 2013, Japanese, Toyama University, An Arabidopsis nuclear-encoded T7 phage-type RNA polymerase (NEP) named RPOTmp is a mitochondria/plastid dual targeting protein and fuction for the mitochondrial transcription of some respiratory chain complex genes, plastidic transcription of rrn operon during early development, and compensation of RPOTp function at some extent. We focused on the RPOTmp function for envirronme, Domestic conferenceInvolvement of Arabidopsis RPOTmp in chloroplast photoprotectionOral presentation
- 第54回日本植物生理学会年会, Mar. 2013, Japanese, 岡山大学, Domestic conferenceFunction of Arabidopsis RPOTmp under light stress conditionPoster presentation
- 第54回日本植物生理学会年会, Mar. 2013, Japanese, 岡山大学, Domestic conferenceA study of the molecular function of 5-aminolevulinic acid for enhancement of salt-stress tolerance in higher plantsPoster presentation
- 第85回日本生化学会大会, Dec. 2012, Japanese, 福岡国際会議場, Domestic conference5-アミノレブリン酸による植物塩ストレス耐性向上と遺伝子発現応答Poster presentation
- 日本農芸化学会2011年度大会, Mar. 2011, Japanese, 京都女子大学, Domestic conference色素体局在性脂肪酸合成律速酵素の発現と機能Oral presentation
- 2010神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2010, Japanese, 神戸大学, Domestic conference植物アセチルCoAカルボキシラーゼの発現と機能の解析Poster presentation
- BMB2010(第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会), Dec. 2010, Japanese, 神戸ポートアイランド, Domestic conferenceトマトにおける5-アミノレブリン酸の分子・生理機能Poster presentation
- 日本農芸化学会2010年度大会, Mar. 2010, Japanese, 東京大学, Domestic conference色素体σ因子SIG6と発現相関する新規PPRの機能Oral presentation
- 第32回日本分子生物学会年会, Dec. 2009, Japanese, パシフィコ横浜, Domestic conference葉緑体発達に必須なシロイヌナズナPPRの分子機能解析.Poster presentation
- 研究会ピロール系色素化合物の科学, Dec. 2009, Japanese, 神戸大学, Domestic conference動植物におけるテトラピロール合成系化合物の生理活性と産業利用[Invited]Invited oral presentation
- WINPTech 2009, Dec. 2009, Japanese, 神戸大学, International conferenceMolecular and physiological function of PPRTp, a pentatricopeptide repeat protein, in Arabidopsis (2)Poster presentation
- WINPTech2009, Dec. 2009, Japanese, 神戸大学, International conferenceMolecular and physiological function of PPRTp, a pentatricopeptide repeart protein, in Arabidopsis (1)Poster presentation
- WINPTech 2009, Dec. 2009, Japanese, 神戸大学, International conferenceMolecular and physiological function of PPRS6a and PPRS6b, pentatricopeptide repeat proteins, in ArabidopsisPoster presentation
- 生化学若い研究者の会京都支部秋のセミナー, Nov. 2009, Japanese, 京都大学, Domestic conference高等植物色素体の遺伝子発現と細胞機能の統御[Invited]Invited oral presentation
- 日本生化学会 2009年度大会, Oct. 2009, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conferenceシロイヌナズナ色素体accD遺伝子のRNA編集に関与するPPRの多面的効果Oral presentation
- The 5th International iBiok Workshop, Sep. 2009, English, 神戸大学, International conferenceIntergenomic gene expression and primary material production in the ultimate symbiont, chloroplastOral presentation
- 日本農芸化学会2009年度大会, Mar. 2009, Japanese, 福岡国際会議場, Domestic conferenceシロイヌナズナにおける5-ALAと関連分子の生理・分子作用Poster presentation
- 第50回日本植物生理学会年会, Mar. 2009, Japanese, 名古屋, Domestic conferencePhysiological and molecular functions of RPOTmp (RPOT;2) in ArabidopsisOral presentation
- 第50回日本植物生理学会年会, Mar. 2009, Japanese, 名古屋, Domestic conferencePhysiological and molecular functions of a RPOTp (RPOT;3)-related gene in ArabidopsisKeynote oral presentation
- 2008神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conference色素体転写装置RPOTmp欠損変異株の生化学的解析Poster presentation
- 2008神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conference色素体転写・翻訳装置と機能相関する因子の探索と解析Poster presentation
- 2008神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conference色素体アセチルCoAカルボキシラーゼの発現と機能Poster presentation
- 日本農芸化学会関西支部第457回講演会, Dec. 2008, Japanese, 日本盛 酒蔵通り煉瓦館, Domestic conference色素体T7ファージ型RNAポリメラーゼと高い発現相関性をもつPPRTpの機能Oral presentation
- 第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会大会合同大会, Dec. 2008, Japanese, 神戸国際会議場, Domestic conference色素体T7ファージ型RNAポリメラーゼRpoTmpの機能解析Oral presentation
- 先端膜工学研究推進機構. 第2回膜工学サロン, Dec. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conferenceバクテリアも相談しながら大事業を成し遂げている[Invited]Invited oral presentation
- 平成20年度 神戸大学農学研究科公開講座, Nov. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conference「生き物のつながりをゲノムから眺めたら?〜インターゲノミクスで拓くこれからの農学〜」植物は元バクテリアの葉緑体ともちつもたれつ[Invited]Invited oral presentation
- 日本触媒学会「固体触媒とバイオリファイナリーの接点:現状と展望」, Nov. 2008, Japanese, 神戸大学, Domestic conferenceテトラピロール化合物の新規生理機能とバイオプロダクション[Invited]Invited oral presentation
- WINPTech 2008, Nov. 2008, Japanese, 神戸大学, International conferenceArabidopsis PPRTp is crucial for post-transcriptional regulation of plastidic accD gene.Poster presentation
- 玉川大学農学部セミナー, Oct. 2008, Japanese, 玉川大学, Domestic conference葉緑体の遺伝子発現から細胞の機能統御へ[Invited]Invited oral presentation
- 第19回関西光合成研究会, Sep. 2008, Japanese, 神戸学院大学, Domestic conference色素体ゲノムの転写と細胞機能の統御[Invited]Invited oral presentation
- 第19回関西光合成研究会, Sep. 2008, Japanese, 神戸学院大学, Domestic conferenceDevelopment and characterization of photo- autotrophic Arabidopsis T87 cellsPoster presentation
- 特定領域研究「植物の環境応答戦略としてのオルガネラ分化」第四回若手ワークショップ, Aug. 2008, Japanese, 京都・聖護院御殿荘, Domestic conference葉緑体ゲノム転写制御からみた色素体分化Oral presentation
- 特定領域研究「植物の環境応答戦略としてのオルガネラ分化」第四回若手ワークショップ, Aug. 2008, Japanese, 京都・聖護院御殿荘, Domestic conference色素体転写装置と相関するPPRの機能Oral presentation
- 兵庫バイオテクノロジー研究会“第72回定例会”, Mar. 2008, Japanese, 神戸大学農学部, Domestic conference葉緑体一核の転写・翻訳系の相互作用からみた植物像[Invited]Invited oral presentation
- 2007神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2007, Japanese, 神戸大学, Domestic conference緑色培養細胞の光独立栄養培養法の改良と細胞特性の解析Poster presentation
- 東京工業大学大学院生命理工学研究科公開セミナー, Dec. 2007, Japanese, 東京工業大学, Domestic conference植物色素体ヘテロ転写系の機能および細胞統御との関連性[Invited]Invited oral presentation
- 2007神戸大学研究基盤センター若手フロンティア研究会, Dec. 2007, Japanese, 神戸大学, Domestic conferenceシロイヌナズナ5-ALAデヒドラターゼの生理機能および 酵素学的性質の解析Poster presentation
- 特定領域研究「植物の環境応答戦略としてのオルガネラ分化」第3回若手ワークショップ, Oct. 2007, Japanese, 瀬戸市, Domestic conferenceシロイヌナズナALAD1過剰発現体の解析Oral presentation
- Kobe University Frontier Technology Forum 2007 Satellite Workshop "Dynamics of Biological Networks in and around Plant Cells", Oct. 2007, English, 神戸大学, Domestic conferenceChloroplast gene expression and its effect on whole plant function.Oral presentation
- 平成19年度蚕糸・昆虫利用学術講演会, Apr. 2007, Japanese, Domestic conferenceカイコGTP結合タンパク質(Rab)の機能解析Oral presentation
- 日本植物生理学会2007年度年会, Mar. 2007, Japanese, 松山, Domestic conference葉緑体tRNAは動的に発現調節されているOral presentation
- 日本薬学会2007年度会, Mar. 2007, Japanese, 富山, Domestic conference高等生物のP450大腸菌発現系を用いたバイオコンバージョンシステムとその応用Oral presentation
- 日本植物生理学会2007年度年会, Mar. 2007, Japanese, 松山, Domestic conference光シグナル、cGMPおよびNOによるダイズフラボノイド合成系酵素遺伝子群の発現調節Oral presentation
- 日本植物生理学会2007年度年会, Mar. 2007, Japanese, Domestic conferenceシロイヌナズナT7ファージ型RNAポリメラーゼRpoTp(RpoT;3)欠損株の解析Oral presentation
- 2007年度日本農芸化学会, Mar. 2007, Japanese, 東京, Domestic conferenceシロイヌナズナgatABCホモローグ遺伝子の局在性と機能Oral presentation
- 2007年度日本農芸化学会, Mar. 2007, Japanese, Domestic conferenceククミシン遺伝子の果実特異的発現機構の解析と果実の形質転換への応用Oral presentation
- 2007年度日本農芸化学会, Mar. 2007, Japanese, 東京, Domestic conferenceククミシンプロ配列の自己阻害活性に重要な領域Oral presentation
- PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 2007, EnglishAnalysis of a knock-out mutant of an Arabidopsis T7 phage-type RNA polymerase, RpoTp (RpoT;3)
- PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 2007, EnglishDynamism of chloroplast tRNA expression in Arabidopsis
- PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 2007, EnglishFunctional involvement of cGMP and NO in light regulation of gene expression of soybean flavonoid-biosynthetic enzymes
- 神大会館, Dec. 2006, Japanese, Domestic conference葉緑体tRNAの動的な発現調節とその分子機構Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター2006若手フロンティア研究会, Dec. 2006, Japanese, 神大会館, Domestic conference高等植物tRNAトランスアミデーション酵素の機能解析Poster presentation
- 神戸大学研究基盤センター2006若手フロンティア研究会, Dec. 2006, Japanese, 神大会館, Domestic conferenceククミシンプロ配列の自己阻害に重要な領域Poster presentation
- Kobe University Frontier Technology Forum, Nov. 2006, English, 神戸大学瀧川記念学術交流会館, Domestic conferenceRegulation of gene expression of soybean flavonoid-biosynthetic enzymes by cGMPPoster presentation
- Kobe University Frontier Technology Forum, Nov. 2006, English, 神戸大学瀧川記念学術交流会館, Domestic conferenceMolecular function of a T7 phage-type RNA polymerase in chloroplastsPoster presentation
- Basis and application of expression of two 5’-ALA related enzymes in plants, Nov. 2006, English, 神戸大学瀧川記念学術交流会館, Domestic conferenceBasis and application of expression of two 5-ALA related enzymes in plantsPoster presentation
- 11th IUPAC, Aug. 2006, English, 神戸, International conferenceCharacterization of plastidic glutamyl-tRNA synthetase and ALA dehydratase in Arabidopsis.Poster presentation
- 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology, Jun. 2006, English, IUBMB, 京都国際会館, International conferencePro-region of cucumisin precursor acts as a potent inhibitor of cucumisinPoster presentation
- The 53rd NIBB Conference "Dynamic Organelles in Plant", Jun. 2006, English, Okazaki, International conferenceFunction of T7 Phage-Type RNA Polymerases in Arabidopsis (2) : RpoTmp (RpoT;2)Poster presentation
- The 53rd NIBB Conference "Dynamic Organelles in Plant, Jun. 2006, English, Okazaki, International conferenceFunction of T7 Phage-Type RNA Polymerases in Arabidopsis (1) : RpoTp (RpoT;3)Poster presentation
- 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology, Jun. 2006, English, 京都, International conferenceCorrelative and compensatory function of heterologous transcription systems in plastidsPoster presentation
- 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology, Jun. 2006, English, 京都, International conferenceCloning of cDNAs for Rab proteins from the brain of Bombyx mori and phosphorylation of their proteins expressed in Escherichia coli.Poster presentation
- 日本農芸化学会大会2006年度大会, Mar. 2006, Japanese, 京都, Domestic conferenceダイズフラボノイド合成系酵素遺伝子の発現調節におけるcGMPとNOの機能相関Poster presentation
- 日本植物生理学会2006年度年会, Mar. 2006, Japanese, つくば, Domestic conferenceシロイヌナズナT7ファージ型RNAポリメラーゼRpoT;2の機能解析Oral presentation
- 日本農芸化学会大会2006年度大会, Mar. 2006, Japanese, 京都, Domestic conferenceククミシンプロ配列の自己阻害活性Poster presentation
- 日本農芸化学会2006年度大会, Mar. 2006, Japanese, 京都, Domestic conferenceNO及びcGMPによって発現が調節されるシロイヌナズナ遺伝子の網羅的解析Poster presentation
- PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 2006, EnglishAn Arabidopsis double mutant sig2sig6 exhibits albino phenotype.
- 第28回日本分子生物学会 講演要旨集p.449(f), Dec. 2005, Japanese, 日本分子生物学会, 福岡, Domestic conferenceシロイヌナズナT7ファージ型RNAポリメラーゼRpoT;2(RpoTmp)の機能解析Oral presentation
- 日本法科学技術学会第11回学術集会, Nov. 2005, Japanese, 日本法科学技術学会, 大阪, Domestic conference葉緑体DNA分析によるケシ科植物の識別Oral presentation
- 第78回日本生化学会大会 講演要旨集p.868(f), Oct. 2005, Japanese, 日本生化学会, 神戸, Domestic conferenceシロイヌナズナT87細胞の独立/混合条件における光応答の解析Oral presentation
- 第12回日本光生物学協会年会 要旨集p.59(f), Aug. 2005, Japanese, 日本光生物学協会, 京都, Domestic conferenceダイズELIP遺伝子の青色光/UV-A応答性発現を調節するシスエレメントOral presentation
- 第23回日本植物分子細胞生物学会 p.193(f), Aug. 2005, Japanese, 日本植物分子細胞生物学会, 京都, Domestic conferenceシロイヌナズナT87細胞の混合栄養培養と独立栄養培養における光応答の転写解析Oral presentation
- 第52回日本生化学会近畿支部例会 要旨集p.38(f), May 2005, Japanese, 日本生化学会近畿支部, 神戸大学, Domestic conferenceダイズフラボノイド合成系遺伝子のcGMP およびNO による発現調節Oral presentation
- 第52回日本生化学会近畿支部例会 要旨集p.37(f), May 2005, Japanese, 日本生化学会近畿支部, 神戸大学, Domestic conferenceカイコのメチル化DNA 結合タンパク質の分子特性Oral presentation
- 第75回蚕糸昆虫機能学術講演会, Apr. 2005, Japanese, 日本蚕糸学会, 東京, Domestic conference昆虫の脳に存在する蛋白質のPKCによるリン酸化およびその機能解析Oral presentation
- 第20回Combinatorial Chemistry研究会, Apr. 2005, Japanese, Combinatorial Chemistry研究会, 大阪, Domestic conference1原子酸素添加酵素チトクロームP450 を用いたバイオコンビケムへの応用Oral presentation
- 日本農芸化学会大会2005年度大会 要旨集p.150, Mar. 2005, Japanese, 日本農芸化学会, 札幌, Domestic conference果実特異的遺伝子発現を調節するエンハンサー因子のcDNA クローニングと特性解析Oral presentation
- 日本農芸化学会大会2005年度大会 要旨集p.149(f), Mar. 2005, Japanese, 日本農芸化学会, 札幌, Domestic conferenceダイズフラボノイド合成系酵素遺伝子のcGMPおよび光による発現調節Oral presentation
- 日本農芸化学会大会2005年度大会 要旨集p.150(f), Mar. 2005, Japanese, 日本農芸化学会, 札幌, Domestic conferenceシロイヌナズナ葉緑体tRNA の発現ダイナミクスOral presentation
- 日本農芸化学会大会2005年度大会 要旨集p.311(f), Mar. 2005, Japanese, 日本農芸化学会, 札幌, Domestic conferenceイネ種子二機能性酵素インヒビター(RASI)の大腸菌における発現およびα� アミラーゼ阻害特性Oral presentation
- 第21回Combinatorial Chemistry 研究会, 2005, Japanese, Combinatorial Chemistry 研究会, 東京, Domestic conference1原子酸素添加酵素チトクロームP450 を用いたバイオコンビケムへの応用Oral presentation
- 日本植物生理学会年会要旨集, 2004シロイヌナズナ葉緑体のストレス応答シグマ因子SIG5の解析
- 第27回日本分子生物学会年会, 2004, Japanese, 日本分子生物学会, 未記入, Domestic conference葉緑体分化における2種の色素体転写装置のスイッチング機構Oral presentation
- 日本農芸化学会関西支部第437回講演会), 2004, Japanese, 日本農芸化学会関西支部, 未記入, Domestic conference高等植物葉緑体におけるtRNA発現の重要性とそのダイナミクスOral presentation
- 第3回JBA・一日神戸大学, 2004, Japanese, 未記入, 未記入, Domestic conferenceナノマシンが集積した葉緑体が拓く可能性Oral presentation
- 日本農芸化学会2004年度大会, 2004, Japanese, 日本農芸化学会, 未記入, Domestic conferenceダイズELIP遺伝子プロモーターの青色光/紫外光に対する光応答能Oral presentation
- 第25回種子生理生化学研究会, 2004, Japanese, 未記入, 未記入, Domestic conferenceイネ種子二機能性酵素インヒビター(RASI)の大腸菌における発現およびα-アミラーゼ阻害特性Oral presentation
- 日本農芸化学会関西支部第432回講演会, Dec. 2003, Japanese, 日本農芸化学会関西支部, 神戸大学, Domestic conferenceダイズフラボノイド合成系酵素遺伝子のcGMP による発現調節Oral presentation
- ISPMB 2003, International Society of Plant Molecular Biology, Jun. 2003, English, 未記入, Barcelona, Spain, International conferenceTranscriptional regulation of plastid genes by interaction of eukaryotic RPL32-like protein with NEP RNA polymerase in Arabidopsis thaliana.Oral presentation
- 日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 2003シロイヌナズナの葉緑体におけるT7ファージ型RNAポリメラーゼ(NEP)と相互作用する真核型リボソームL32-likeタンパク質の機能解析
- 東京理科大セミナー, 2003, Japanese, 東京理科大学, 未記入, Domestic conference細菌型因子を駆使した核戦略による葉緑体支配Oral presentation
- かずさDNA研究所セミナー, 2003, Japanese, かずさDNA研究所, かずさDNA研究所セミナー室, Domestic conference高等植物葉緑体の発達と遺伝子発現Oral presentation
- シロイヌナズナDNAアレイワークショップ, 2003, Japanese, 未記入, 未記入, Domestic conferenceシロイヌナズナ「JCAA アレイの入手方法、使用状況」Oral presentation
- Japan-Korea Joint Seminar on Sericultural Sciences and Insect Industry, 2003, English, 未記入, 未記入, International conferenceSmall GTP binding proteins from the brain of Bombyx mori.Oral presentation
- 日本植物生理学会年会要旨集, 2001シロイヌナズナの葉緑体転写制御におけるsigBの役割
- Plant and cell physiology, 2001, English, Japanese Society of Plant PhysiologistsTHE ROLE OF SIGB IN TRANSCRIPTIONAL REGULATION OF ARABIDOPSIS THALIANA CHLOROPLASTS :
- Plant and cell physiology, 2001, English, Japanese Society of Plant PhysiologistsPLASTID-ENCODED GENE EXPRESSION DEPENDING ON A NUCLEAR-ENCODED σFACTOR FOR TRANSLATION BURST IN DEVELOPING CHLOROPLASTS :
- Plant and cell physiology, 2000, English, Japanese Society of Plant PhysiologistsCharacterization of Nuclear-Encoded Plastid RNA Polymerase Sigma Factors in Arabidopsis thaliana :
- Plant and cell physiology, Mar. 1999, EnglishCHARACTERIZATION OF CHLOROPLAST RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR GENES IN Arabidopsis thaliana
- Plant and cell physiology, May 1998, EnglishARABIDOPSIS NITRATE REDUCTASE (NR) IS PHOSPHORYLATED AND BINDS TO 14-3-3 PROTEINS (GF14s)
- コスモ石油, 共同研究, 2016 - 2020, Principal investigatorHAVAの生理効果と分子機構
- 文科省・JST, 先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム, 振興調整費, 神戸大学, 2008 - 2018, Coinvestigatorバイオプロダクション次世代農工連携拠点形成
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Kobe University, Apr. 2015 - Mar. 2017, Principal investigatorPositive plant-plant interaction, named companion plants, is known as phenomena but not proved well in view of molecular mechanism. Scientific clarification of the phenomena in molecular level, even in a part, would contribute both maintenance of agro-environment and sustainable agriculture mediated by spread of companion planting, and we succeeded. That is, we found an unidentified compound (encourage factor) contained in or emitted from roots of a specific plant promotes various plant's growth, and the encourage factor transcriptionally induces some transcription factors and stress responsive genes leading the growth promotion. Furthermore, we succeeded to identify about 10 candidates of the encourage factor. We have applied a patent based on these data with a chemical company.
- カネカ, 共同研究, 2016 - 2017, Principal investigatorカモミール抽出物の植物生育促進効果の解析
- カネカ, カネカ-神戸大学包括連携, 共同研究, 神戸大学, 2010 - 2015, Principal investigator食糧生産支援
- 共同研究(コスモ石油), 2014 - 2014, Principal investigator5-ALAによる遺伝子発現
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Kobe University, 2011 - 2013, Principal investigator5-aminolevulinic acid (ALA) is a primary metabolite which almost all living organism produce by theirselves. It's metabolic products, tetrapyrrole compounds, play critical roles as heme in blood and various oxidases, siroheme in N/S assimilation enzymes, chlorophyll in plant, and vitamin B12. Furthermore, external ALA-feeding confers increase of resistance to environmental stress to plants. In this study, we examined carefully the phenomena and tried to clarify the molecular mechanisms. We found that exogenous ALA contributes recovery of heme but not directly of chlorophyll and identified ALA-inducible transcription factors from tomato and Arabidopsis.
- 科学研究費補助金/基盤研究(C), 2009Competitive research funding
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas, Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas, Kobe University, 2007 - 2008, Principal investigatorMolecular function correlation and control mechanism centered on the plastid heterotranscription system<目的>色素体ヘテロ転写系を構成するPEP(複数のσ因子が存在)とNEP(すなわちRpoTpとRpoTmp)相互のあるいは制御因子を介した相関性を紐解き、核と色素体のゲノム間相互作用によるオルガネラ分化、細胞機能、形態形成の統御ネットワークを解明する。 <成果>モデル植物シロイヌナズナにおいてNEPと発現相関性が高いPPR(35アミノ酸の繰り返し構造をもつ一群のタンパク質で特異的RNA結合能が示唆されている)のひとつに焦点を当てた。そして葉緑体に局在するこのタンパク質が脂肪酸合成の初期段階を律速する酵素の1サブユニット発現における転写後調節(mRNA前駆体の特定C残基がU残基デアミネーションされる反応)に関わっていることを欠損変異株の解析から明らかにした。さらにこの欠損株は葉緑体の発達不全だけでなく、植物固体全体の形態形成にも重篤な欠損な欠損を示し、色素体機能が細胞統御に及ぶことを示した。 <意義>究極の共生体である色素体は少なくとも双子葉類において遺伝子発現レベルで脂肪酸合成系の根幹を今なお握っており、「もちつもたれつ」の関係があることを明らかにした。同時に植物での脂肪酸合成を人為的に制御、向上させる標的分子としてこのPPRは有望である。同じ遺伝子における同様の転写後調節現象はアブラナ科、マツ、マメ類においても知られており、これらの油糧系作物の脂肪酸合成促進を当該PPRもしくはそのホモローグを用いて達成可能であると考え、シロイヌナズナで実際にその効果が示唆されたため国際特許を申請した。
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Kobe University, 2004 - 2006, CoinvestigatorIdentification of phototransducer and analysis of signaling network in plants1. Several specific mutants of Arabidopsis for phytochrome A-signaling were isolated and back-crossed for 3 generation. 2. The phenotype of AtGC1-mutant was characterized. There was no difference between the mutant and wild-type plant. 3. A protein (named as GIP1) that interacts with heterotrimeric G protein alpha subunit was isolated using yeast two-hybrid system, and the interaction between GIP1 and G alpha was characterized. 4. Several genes for enzymes involved in flavonoid biosynthetic pathway in soybean were induced by cGMP, NO and light illumination. The inductions of gene expression by NO were inhibited by LY83583, suggesting the involvement of guanylate-cyclase. 5. For the induction of gene expression of soybean early light-inducible protein (ELIP) by blue/UV-A light, the combination of two cis-element, GT-1 like box and G-box elements were necessary. Soybean GmGT-1 cDNA was cloned and characterized.
- 科学研究費補助金/特定領域研究, 2005, Principal investigatorCompetitive research funding
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Grant-in-Aid for Scientific Research (C), The University of Tokyo, 2001 - 2002, Principal investigatorAnalysis of the preiotropic effects of a nucleus-encoded σ factor during chloroplast developmentA eubacterial-type RNA polymerase (PEP) in higher plants plays crucial roles in chloroplast development. Six regulatory sigma factor genes (SIG1 to SIG6) encoded in the nuclear DNA are found in Arabidpopsis, however, the definite gene specificity of each sigma factor is still unknown. We recently identified an Arabidopsis recessive pale-green mutant sig2-1 (formerly named abc1) in which T-DNA is inserted in SIG2 (formerly named sigB ; Atlg08540). This mutant could develop almost normal etioplasts under dark conditions but barely develop the small chloroplasts with poor thylakoid membranes and stacked lamellar under light conditions. In the sig2-1 mutant, both chlorophyll and photosynthetic and photosynthesis-related proteins were remarkably reduced. However, amounts of mRNAs for these plastid-encoded proteins were not altered. Further analyzes revealed that several plastid-encoded tRNAs including trnE-UUC were drastically reduced in the mutant. The plastid-encoded tRNA-Glu is indispensable for not only protein synthesis (translation) but also tetrapyrrole (chlorophyll and heme) biogenesis. We could assign -35 like and -10 like sequences to upstream of these SIG2-dependent tRNA genes, which are conserved in Arabidopsis, tobacco, spinach, rice and maize. On the other hand, transcripts of nucleus-encoded T7 phage-type RNA polymerase (NEP)-dependent genes were steadily accumulated in this mutant. These results indicate that SIG2 plays crucial roles in chloroplast development mediated by expression of some plastid-encoded tRNAs and negative regulation of NEP.
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C), Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C), The University of Tokyo, 2001 - 2001, Principal investigatorMacroarray analysis of nuclear genes involved in chloroplast development<マクロアレイのケミルミでの検出・解析法の確立>ビオチン標識したcDNAプローブをハイブリさせたマクロアレイを化学発光させて蛍光イメージアナライザーでシグナルを取り込み、数値化して解析する手法を確立した。本研究代表らが設立したJCAAは、昨夏以降、高品質、低価格での委託作成の段取りを整え、第二期メンバーを公募して全国90研究グループを超えるコンソーシアムになった。本研究代表らによるDNAスポット量やデプローブ条件の最適化を済ませ、マクロアレイ355セットを5月迄に配分できる予定である。(蛋白質・核酸・酵素2002,Vol47,91-93)。 <データベース構築とアレイ解析結果の対比>JCAAアレイ上のESTクローン用のデータベース(名大鈴木孝征氏作成)を改良し、検索対象を全推定遺伝子に拡大、オルガネラ移行予測検索結果などを加えたDARTを全国の研究者に公開した。このDBによりJCAAマクロアレイ上には全遺伝子の4割、葉緑体移行が予測される蛋白質の半分以上の遺伝子が網羅されていることがわかった。そこで手始めに、光漂自剤の影響と葉緑体発達不全変異株についてアレイ解析した。 <国内外での成果の位置づけ>葉緑体関連遺伝子のアレイ解析によるグループ化において本研究は世界的にもパイオニア的取り組みである。特に定量性でマイクロアレイより優れたマクロアレイを汎用性の高いケミルミ法でシロイヌナズナでも解析できるようにした意義は大きい。誰でも利用できる国産cDNAアレイを有志活動で供給する試みは共同作成から委託作成へと拡大、発展している。これらにより本研究遂行に十分な数のマクロアレイが確保できた。さらに、残ったPCR産物を活用して効率的にサブアレイ作成ができるシステムを新年度から動かす予定で、自身を含め我が国におけるシロイヌナズナのマクロアレイ研究は今後急速に成果を挙げると期待される。
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), The University of Tokyo, 1999 - 2000Nuclear control and sequentiality in gene expression of chloroplast constituents in higher plants高等植物葉緑体は個有のDNAをもち120前後の遺伝子がコードされている.これらは真正細菌型のRNAポリメラーゼ(PEP)とTワファージ型のNEPによって転写されるが葉緑体への分化には特にPEPが必須である.このコア酵素は葉緑体DNAにコードされているが調節因子のシグマファクターが少くとも6つ核にコードされていることを見い出した.中でもsigBは重要でこの欠損によってpale greenになり葉緑体が小さく貧弱になることから、又sigB自身の発現が発芽のごく初期から起こることから更に解析中である.一方藍藻に起源をもつ葉緑体は転写の他に分裂についてもバクテリアのシステムを一部そのまま利用している.そのひとつがMinDのホモローグであり、後に移行したこの遺伝子の発現はもうひとつの因子FtsZと同様のパターンを示しつつ、機能的には逆の働きをもっていた.すなわち、その大量発現によって分裂は抑制され一細胞に1〜2個の巨大葉緑体ができた.又このタンパク質の局在は葉緑体の内外両方である可能性も示唆された.更に遺伝学的にすでに知られていたarc6変異は表現型がAtMinDlの大量発現株と非常に類似していたがFtsZの発現はほぼ正常でAcMinDlの発現が数倍になっていることも確認できた.
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), National Institute of Genetics, 1995 - 1995, Principal investigatorAnalysis of the synthesis and action of the diffusible signaling factor homoserine lactone in Escherichia coliグラム陰性細菌の一部で、動植物への浸入、感染の初期過程にみられる菌体濃度依存的転写誘導は、拡散性化学シグナルとLuxRファミリーによる細胞間情報伝達系によって制御されている。大腸菌からも、LuxRホモローグSdiAが細胞分裂装置遺伝子ftsQAZに特異的な正の転写因子として報告されている。我々はSdiAがftsQAZ以外の何らかの酵素の発現も制御しているのではないかと考えた。そしてSdiAの過剰発現によって細胞内に27kDaのタンパク質が顕著に蓄積することをみつけた。アミノ酸配列を決定したところ、このタンパク質は一次胆汁酸脱水素酵素7α-ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼであることが明らかとなった。そこでこの酵素の構造遺伝子hdhAを小原ライブラリーよりクローン化し、hdhA-lacZフュージョンによる解析とノーザン解析を行った。その結果、hdhAの総転写量は対数増殖期から定常期への増殖相移行に伴って20〜30倍に増加し、しかもhdhAの転写誘導はSdiAだけでなく増殖定常期特異的σ因子(σ38)にも依存していることが明らかとなった。さらにプライマー伸長法により、両因子は互いに34bp離れたプロモーターから別々に転写を制御し、対数増殖期にはSdiA依存的な転写が増加し続け、定常期突入直前で急速に減少、かわってσ38依存性の転写が一過的に起こっていることが示唆された。SdiA自身の発現はσ38に全く依存しないが、rpoS欠失株では対数増殖期のSdiA依存的なhdhAの転写量が増加した。化学シグナルの存在証拠は得られなかったが、SdiAとσ38による転写の独立二重制御はftsQAZでも機能しており、細胞分裂装置と二次胆汁酸合成酵素の発現が、増殖相の移行、もしくは細胞濃度上昇によって同様に転写制御されていると思われ、腸内環境における適応応答系の一例であることが期待される。今後、転写活性化の分子機構と二重制御の生理的意義についてさらに解析を進めたい。
- Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A), National Institute of Genetics, 1994 - 1994, Principal investigatorAnalysis of coupling mechanism of cell division and LPS synthesis in Escherichia coli当研究室が保有する400株以上の温度感受性大腸菌分裂変異株のうち染色体27分にマップされる7株について解析した。その結果、変異は全てkdsA遺伝子を含むDNA領域で相補された。kdsAの相補鎖にも未知のORFが存在するが、部位特異的変異法によって、KdsAのアミノ酸を置換することなく相補鎖側のORFの5'末端にstopコドンを導入したDNA断片でも、温度感受性分裂異常を相補できたことから、変異株ではkdsAが変異していることが予想された。変異株のkdsAの塩基配列決定の結果、GA transition(変異剤にNTG)によって、たしかに284a.a.からなるKdsAタンパク質に各々以下の1アミノ酸置換を起こす変異が同定された。 14Ala→Thr、73Gly→Asp、118Leu→Phe、203Ala→Thr、227Ala→Val、234Ala→Thr kdsAは外膜の物理的安定性に重要なリポ多糖の構成因子KDOの前駆体KDO-8ーリン酸の合成酵素をコードしており、変異株では外膜タンパク質の合成パターンに変化が見られたこともあり、外膜の不安定化、膜タンパク質(分裂装置構成タンパク質?)の局在異常によって分裂阻害が引き起こされていることが予想される。これまでの細胞分裂研究は、分裂装置タンパク質の側から主に進められてきたが、これらkdsA変異を用いた解析から膜合成そのものと細胞分裂の共役関係が明らかになるかも知れず、今後の生化学的解析が期待される。