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上田 修司
大学院農学研究科 生命機能科学専攻
助教

研究者基本情報

■ 学位
  • 博士(医学), 神戸大学
■ 研究キーワード
  • プロテアソーム
  • ヒートショックタンパク質
  • 動物性食品由来の機能性成分
  • 筋肉
  • 加齢
  • 低分子量G蛋白質
■ 研究分野
  • ライフサイエンス / 栄養学、健康科学 / 細胞生物学、メタポロミクス解析、動物実験
■ 委員歴
  • 2025年 - 2027年, 神戸大学国際連携推進機構, アジア・オセアニア部門員
  • 2025年06月, 日本食肉科学会, 常務理事
  • 2025年, 関西畜産学会, 評議員

研究活動情報

■ 受賞
  • 2024年12月 神戸大学, 神戸大学全学共通教育ベストティーチャー賞

  • 2023年11月 関西畜産学会, 関西畜産学会賞, 黒毛和種牛肉における筋内脂肪および香りの形成に機能する分子機構の探索

  • 2023年03月 国立大学法人神戸大学, 六篠業績賞

  • 2022年06月 伊藤記念財団, 伊藤記念財団賞, 畜産物の品質評価、付加価値の向上に向けたメタボロミクス技術の応用に関する研究

■ 論文
  • Shuji Ueda, Yuka Yoshida, Yuka Tateoka, Biniam Kebede, Masakazu Shinohara, Hiroki Nakanishi, Itsuko Fukuda, Yasuhito Shirai
    Background: Japanese Black beef is known for its high intramuscular fat content, an important factor in its distinctive Wagyu aroma. Wet aging, which involves vacuum-packing meat and storing it at low temperatures, enhances flavor, texture, and tenderness and is essential for maintaining and improving meat quality. In this study, changes in metabolites and lipid profiles were investigated during the wet aging of Japanese Black and Holstein beef. Methods/Results: Gas chromatography-mass spectrometry identified 113 metabolites in Japanese Black beef and 94 in Holstein beef, with significant increases in metabolites like aspartic acid and maleic acid over the aging period. Regarding lipid composition, total free fatty acids significantly increased with wet aging, with Japanese Black beef showing significantly higher concentrations of oleic and linoleic acids than Holstein beef. Additionally, lipid analysis by liquid chromatography-mass spectrometry revealed a reduction in specific phospholipids, particularly lysophosphatidylcholine (LPC) and lysophosphatidylethanolamine (LPE), with notable decreases in LPC (18:1), LPC (18:2), LPE (18:1), and LPE (18:2). Conclusions: These results suggest that wet aging influences the stability of membrane lipids, facilitating the degradation of phospholipids into free fatty acids, and improving the flavor of Japanese Black beef.
    2025年02月, Metabolites, 15(2) (2), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Yuka Yoshida, Biniam Kebede, Chiaki Kitamura, Ryo Sasaki, Masakazu Shinohara, Itsuko Fukuda, Yasuhito Shirai
    Efficient cold-chain delivery is essential for maintaining a sustainable global food supply. This study used metabolomic analysis to examine meat quality changes during the "wet aging" of crossbred Wagyu beef during cold storage. The longissimus thoracic (Loin) and adductor muscles (Round) of hybrid Wagyu beef, a cross between the Japanese Black and Holstein-Friesian breeds, were packaged in vacuum film and refrigerated for up to 40 days. Sensory evaluation indicated an increase in the umami and kokumi taste owing to wet aging. Comprehensive analysis using gas chromatography-mass spectrometry identified metabolite changes during wet aging. In the Loin, 94 metabolites increased, and 24 decreased; in the Round, 91 increased and 18 decreased. Metabolites contributing to the umami taste of the meat showed different profiles during wet aging. Glutamic acid increased in a cold storage-dependent manner, whereas creatinine and inosinic acid degraded rapidly even during cold storage. In terms of lipids, wet aging led to an increase in free fatty acids. In particular, linoleic acid, a polyunsaturated fatty acid, increased significantly among the free fatty acids. These results provide new insight into the effects of wet aging on Wagyu-type beef, emphasizing the role of free amino acids, organic acids, and free fatty acids generated during cold storage.
    2024年01月, Metabolites, 14(2) (2), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Hazuki Akazawa, Itsuko Fukuda, Haruna Kaneda, Shoichi Yoda, Mamoru Kimura, Ryohei Nomoto, Shuji Ueda, Yasuhito Shirai, Ro Osawa
    Hyaluronan (HA) is a high-molecular-weight glycosaminoglycan and widely distributed in all connective tissues and organs with diverse biological functions. HA has been increasingly used as dietary supplements targeted to joint and skin health for humans. We here first report isolation of bacteria from human feces that are capable of degrading HA to lower molecular weight HA oligosaccharides (oligo-HAs). The bacteria were successfully isolated via a selective enrichment method, in which the serially diluted feces of healthy Japanese donors were individually incubated in an enrichment medium containing HA, followed by the isolation of candidate strains from streaked HA-containing agar plates and selection of HA-degrading strains by measuring HA using an ELISA. Subsequent genomic and biochemical assays identified the strains as Bacteroides finegoldii, B. caccae, B. thetaiotaomicron, and Fusobacterium mortiferum. Furthermore, our HPLC analysis revealed that the strains degraded HA to oligo-HAs of various lengths. Subsequent quantitative PCR assay targeting the HA degrading bacteria showed that their distribution in the Japanese donors varied. The evidence suggests that dietary HA is degraded by the human gut microbiota with individual variation to oligo-HAs components, which are more absorbable than HA, thereby exerting its beneficial effects.
    2023年, PloS one, 18(5) (5), e0284517, 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Daiki Hayashi, Varnavas D Mouchlis, Seika Okamoto, Tomoka Namba, Liuqing Wang, Sheng Li, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Hirofumi Tachibana, Hiroyuki Arai, Hitoshi Ashida, Edward A Dennis, Yasuhito Shirai
    It is generally recognized that the main function of α-tocopherol (αToc), which is the most active form of vitamin E, is its antioxidant effect, while non-antioxidant effects have also been reported. We previously found that αToc ameliorates diabetic nephropathy via diacylglycerol kinase alpha (DGKα) activation in vivo, and the activation was not related to the antioxidant effect. However, the underlying mechanism of how αToc activates DGKα have been enigmatic. We report that the membrane-bound 67 kDa laminin receptor (67LR), which has previously been shown to serve as a receptor for epigallocatechin gallate (EGCG), also contains a novel binding site for vitamin E, and its association with Vitamin E mediates DGKα activation by αToc. We employed hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX/MS) and molecular dynamics (MD) simulations to identify the specific binding site of αToc on the 67LR and discovered the conformation of the specific hydrophobic pocket that accommodates αToc. Also, HDX/MS and MD simulations demonstrated the detailed binding of EGCG to a water-exposed hydrophilic site on 67LR, while in contrast αToc binds to a distinct hydrophobic site. We demonstrated that 67LR triggers an important signaling pathway mediating non-antioxidant effects of αToc, such as DGKα activation. This is the first evidence demonstrating a membrane receptor for αToc and one of the underlying mechanisms of a non-antioxidant function for αToc.
    2022年12月, The Journal of nutritional biochemistry, 110, 109129 - 109129, 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Moeka Nishihara, Yuuki Hioka, Ken-Ichi Yoshino, Soichiro Yamada, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    Protein homeostasis, including protein folding, refolding, and degradation, is thought to decline with aging. HSPB5 (also known as αB-crystallin) prevents target protein aggregation as a molecular chaperone and exhibits a cytoprotective function against various cell stresses. To elucidate the effect of HSPB5 on endoplasmic reticulum (ER) stress, we searched for novel binding proteins of HSPB5 using the proximity-dependent biotin labeling method. Proteins presumed to interact with HSPB5 in cells treated with the proteasome inhibitor MG132 were identified by a reversible biotin-binding capacity method combining tamavidin2-REV magnetic beads and mass spectrometry. We discovered a new binding protein for HSPB5, polo-like kinase 2 (PLK2), which is an apoptosis-related enzyme. The expression of PLK2 was upregulated by MG132 treatment, and it was co-localized with HSPB5 near the ER in L6 muscle cells. Inhibition of PLK2 decreased ER stress-induced phosphorylation of serine 19 in HSPB5 and increased apoptosis by activation of caspase 3 under ER stress. Overexpression of HSPB5 (WT) suppressed the ER stress-induced caspase 3 activity, but this was not observed with phospho-deficient HSPB5 (3A) mutants. These results clarify the role of HSPB5 phosphorylation during ER stress and suggest that the PLK2/HSPB5 pathway plays an essential role in cytoprotection against proteasome inhibition-induced ER stress.
    2022年09月, International journal of molecular sciences, 23(19) (19), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Yasuharu Takashima, Yunosuke Gotou, Ryo Sasaki, Rio Nakabayashi, Takeshi Suzuki, Shinji Sasazaki, Ituko Fukuda, Biniam Kebede, Yuki Kadowaki, Maiko Tamura, Hiroki Nakanishi, Yasuhito Shirai
    Japanese Black cattle (Japanese Wagyu) beef is attracting attention for its aroma and marbling, and its handling is increasing worldwide. Here, we focused on the origin discrimination of Wagyu beef and analyzed the nutritional components of Japanese Wagyu (produced in multiple prefectures of Japan), Hybrid Wagyu (a cross between Angus and Wagyu cattle born in Australia and transported to Japan), and Australian Wagyu beef using mass spectrometry (MS). Triple-quadrupole liquid chromatography-MS was used to clarify the molecular species of lipids in Wagyu beef. Fourteen classes of lipids were separated, and 128 different triacylglycerides (TGs) were detected. A simple comparative analysis of these TGs using high-performance liquid chromatography revealed significantly higher levels of triolein (C18:1/C18:1/C18:1; abbreviated OOO) and C18:1/C18:1/C16:1 (OOPo) in Japanese Wagyu. Wagyu elements beef were comprehensively analyzed using inductively coupled plasma (ICP)-MS and ICP-optical emission spectrometry. We found significant differences in the rubidium, cesium, and lithium levels of Japanese and Australian Wagyu beef. On comparing metabolites using gas chromatography-MS, we identified significant differences in the levels of amino acids and other components of the Japanese and Australian Wagyu beef. These results suggest the possibility of determining the origin of Wagyu cattle breeds using MS and genetic discrimination.
    2022年08月, Metabolites, 12(9) (9), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Mana Hosoda, Kumi Kasamatsu, Masahiro Horiuchi, Rio Nakabayashi, Bubwoong Kang, Masakazu Shinohara, Hiroki Nakanishi, Takayo Ohto-Nakanishi, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    Aroma is an essential factor for meat quality. The meat of Japanese Black cattle exhibits fine marbling and a rich and sweet aroma with a characteristic lactone composition. The mechanism of lactone formation associated with beef aroma has not been elucidated. In this study, we examined the precursors of γ-hexalactone, an indicator of the sweet aroma of beef and identified the mechanism underlying γ-hexalactone production. A low-temperature vacuum system was used to prepare beef tallow from Japanese Black cattle and Holstein cattle. The odor components were identified using headspace-gas chromatography. The analysis revealed that γ-hexalactone, γ-dodecalactone, δ-tetradecalactone, and δ-hexadecalactone were present as sweet aroma components of beef tallow prepared from marbling and muscle. Since we previously reported that γ-hexalactone formation correlates with linoleic acid content in beef, we analyzed ten oxidized fatty acids derived from linoleic acid by liquid chromatography-triple quadrupole mass spectrometry and detected two hydroxy-octadecadienoic acids (9S-HODE and 13S-HODE) in beef tallow. Significant differences in arachidonic acid 15-lipoxygenase and cyclooxygenase protein expression levels among subcutaneous fat, intramuscular fat, and muscle tissue were observed. Our results suggest that the combination of linoleic acid and the expression of lipid oxidase derived from beef muscle and intramuscular fat produce hydroxy fatty acids that result in a sweet aroma.
    2022年04月, Metabolites, 12(4) (4), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Takuya Kano, Ryosuke Tsumagari, Akio Nakashima, Ushio Kikkawa, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Nobuyuki Takei, Yasuhito Shirai
    Diacylglycerol kinase β (DGKβ) is an enzyme that converts diacylglycerol to phosphatidic acid and is mainly expressed in the cerebral cortex, hippocampus and striatum. We previously reported that DGKβ induces neurite outgrowth and spinogenesis, contributing to higher brain functions, including emotion and memory. To elucidate the mechanisms involved in neuronal development by DGKβ, we investigated the importance of DGKβ activity in the induction of neurite outgrowth using human neuroblastoma SH-SY5Y cells. Interestingly, both wild-type DGKβ and the kinase-negative (KN) mutant partially induced neurite outgrowth, and these functions shared a common pathway via the activation of mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1). In addition, we found that DGKβ interacted with the small GTPase RalA and that siRNA against RalA and phospholipase D (PLD) inhibitor treatments abolished DGKβKN-induced neurite outgrowth. These results indicate that binding of RalA and activation of PLD and mTORC1 are involved in DGKβKN-induced neurite outgrowth. Taken together with our previous reports, mTORC1 is a key molecule in both kinase-dependent and kinase-independent pathways of DGKβ-mediated neurite outgrowth, which is important for higher brain functions.
    2021年12月, Biomolecules, 11(12) (12), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Mana Hosoda, Ken-ichi Yoshino, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    Japanese Black cattle (Japanese Wagyu) have a unique phenotype in which ectopic intramuscular fat accumulates in skeletal muscle, producing finely marbled beef. However, the mechanism of intramuscular fat formation in Japanese Black cattle remains unclear. To investigate the key genes involved in intramuscular fat accumulation, we comprehensively analyzed mRNA levels in subcutaneous and intramuscular fat tissues using RNA sequence (RNA-seq) analysis, which detected 27,606 genes. We identified eight key genes, namely carboxypeptidase E, tenascin C, transgelin, collagen type IV alpha 5 (COL4A5), cysteine and glycine-rich protein 2, PDZ, and LIM domain 3, phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14A, and regulator of calcineurin 2. These genes were highly and specifically expressed in intramuscular fat tissue. Immunohistochemical analysis revealed a collagen network, including COL4A5, in the basement membrane around the intramuscular fat tissue. Moreover, pathway analysis revealed that, in intramuscular fat tissue, differentially expressed genes are related to cell adhesion, proliferation, and cancer pathways. Furthermore, pathway analysis showed that the transforming growth factor-β (TGF-β) and small GTPases regulators RASGRP3, ARHGEF26, ARHGAP10, ARHGAP24, and DLC were upregulated in intramuscular fat. Our study suggests that these genes are involved in intramuscular fat formation in Japanese Black cattle.
    MDPI AG, 2021年07月, Genes, 12(8) (8), 1107 - 1107
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Joleen S Cheah, Kyle A Jacobs, Tzu Wei Lai, Reca Caballelo, Jacqueline L Yee, Shuji Ueda, Volkmar Heinrich, Soichiro Yamada
    Sensing physical forces is a critical first step in mechano-transduction of cells. Zyxin, a LIM domain-containing protein, is recruited to force-bearing actin filaments and is thought to repair and strengthen them. Yet, the precise force-induced protein interactions surrounding zyxin remain unclear. Using BioID analysis, we identified proximal proteins surrounding zyxin under normal and force-bearing conditions by label-free mass spectrometry analysis. Under force-bearing conditions, increased biotinylation of α-actinin 1, α-actinin 4, and AFAP1 were detected, and these proteins accumulated along force-bearing actin fibers independently from zyxin, albeit at a lower intensity than zyxin. VASP also accumulated along force-bearing actin fibers in a zyxin-dependent manner, but the biotinylation of VASP remained constant regardless of force, supporting the model of a free zyxin-VASP complex in the cytoplasm being corecruited to tensed actin fibers. In addition, ARHGAP42, a RhoA GAP, was also identified as a proximal protein of zyxin and colocalized with zyxin along contractile actin bundles. The overexpression of ARHGAP42 reduced the rate of small wound closure, a zyxin-dependent process. These results demonstrate that the application of proximal biotinylation can resolve the proximity and composition of protein complexes as a function of force, which had not been possible with traditional biochemical analysis.
    2021年06月, Molecular biology of the cell, 32(13) (13), 1221 - 1228, 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Ryo Sasaki, Rio Nakabayashi, Minoru Yamanoue, Yasuhito Sirai, Eiji Iwamoto
    The meat from Japanese Black cattle (Japanese Wagyu) is finely marbled and exhibits a rich and sweet aroma known as Wagyu beef aroma. To clarify the key metabolites involved in the aroma, we analyzed the correlation between lactone and lipid composition in Japanese Black cattle. Using gas chromatography-olfactometry, we identified 39 characteristic odorants of the intermuscular fat. Seven characteristic lactones considered to be involved in Wagyu beef aroma were quantified and compared in the marbled area and intermuscular fat using a stable isotope dilution assay. Among them, γ-hexalactone was the only lactone whose level was significantly higher in the marbled area. To explore the lipid species involved in lactone formation, we analyzed samples with different aroma characteristics. Liquid chromatography-mass spectrometry revealed eight lipid classes and showed significant differences in triacylglycerides (TAGs). To determine the molecular species of TAGs, we performed high-performance liquid chromatography analysis and identified 14 TAG species. However, these analyses showed that seven lactones had a low correlation with the TAGs. However, γ-hexalactone showed a positive correlation with linoleic acid. This study suggests that lipid composition affects the characteristic lactone profile involved in the Wagyu beef aroma.
    2021年03月, Metabolites, 11(4) (4), 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Ryosuke Tsumagari, Kenta Maruo, Takaaki Nakao, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    Senescence-accelerated mouse prone 8 (SAMP8) is an animal model of age-related central nervous system (CNS) disorders. Although SAMP8 shows deficits in learning, memory, and emotion, its motor coordination has not been clarified. We have recently reported that DGKγ-regulated PKCγ activity is important for cerebellar motor coordination. However, involvement of the functional correlation between the kinases in age-related motor dyscoordination still remains unknown. Therefore, we have investigated the motor coordination in SAMP8 and involvement of the functional correlation between DGKγ and PKCγ in the age-related motor dyscoordination. Although 6 weeks old SAMP8 showed equivalent motor coordination with control mice (SAMR1) in the rotarod test, 24 weeks old SAMP8 exhibited significantly less latency in the rotarod test and more frequent slips in the beam test compared to the age-matched SAMR1. Furthermore, 24 weeks old SAMP8 showed the higher locomotor activity in open field test and Y-maze test. Western blotting revealed that DGKγ expression decreased in the cerebellum of 24 weeks old SAMP8, while PKCγ was upregulated. These results suggest that SAMP8 is a useful model of age-related motor dysfunction and that the DGKγ-regulated PKCγ activity is involved in the age-related motor dyscoordination.
    Frontiers Media SA, 2021年01月, Frontiers in Aging Neuroscience, 13
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Yasuhito Sirai, Eiji Iwamoto
    Beef from Japanese Black cattle (Japanese Wagyu) is renowned for its flavor characteristics. To clarify the key metabolites contributing to this rich and sweet aroma of beef, an omics analysis combined with GC-olfactometry (GC-O) and metabolomics analysis with gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) were applied. GC-O analysis identified 39 odor-active odorants from the volatile fraction of boiled beef distilled by solvent-assisted flavor evaporation. Eight odorants predicted to contribute to Wagyu beef aroma were compared between Japanese Black cattle and Holstein cattle using a stable isotope dilution assay with GC-tandem quadrupole mass spectrometry. By correlating the sensory evaluation values of retronasal aroma, γ-hexalactone, γ-d2ecalactone, and γ-undecalactone showed a high correlation with the Wagyu beef aroma. Metabolomics data revealed a high correlation between the amounts of odorants and multiple metabolites, such as glutamine, decanoic acid, lactic acid, and phosphoric acid. These results provide useful information for assessing the aroma and quality of beef.
    2021年01月, Metabolites, 11(1) (1), 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Yasuhito Shirai, Hisakazu Kobayashi, Shuji Ueda, Yun Sang Soon, Akiho Kushiya, Ryosuke Tsumagari, Minoru Yamanoue
    Background: Global warming causes severe heat conditions. Heat stress contributes to higher morbidity of heatstroke in human and mortality in livestock. To protect them from heat stress, thermotolerance mechanisms were widely studied, and some studies suggest relationship between heat shock proteins (HSPs) and thermotolerance. HSPs were not induced by only heat shock but also some stimulations including bioactive compounds from plants. Zingiber zerumbet is a perennial herb found in many tropical countries, including Thailand. The rhizome of Zingiber zerumbet contains zerumbone that is a bioactive compound to induce HSPs expression in animal cells.Objective: To prevent higher morbidity of heatstroke in human and mortality in livestock by the heat stress, we investigated the effect of zerumbone, the extract of Zingiber zerumbet Smith, on thermotolerance, using a cell line and mice.Methods: The murine liver hepatoma cell line, Hepa1c1c7 cells, were incubated in medium supplemented with extract from rhizome of Zingiber zerumbet Simith containing zerumbone, and then the expression of heat shock proteins (HSP) 40, 70 and 90 were investigated by western blotting. Furthermore, we established the evaluation system of thermotolerance using mice, and studied the effect of the extract on the growth rate of mice under the heat shock treatment. Briefly, 4 weeks old C57BL6 mice were fed that with the extract (or vehicle) for a week before the first heat shock treatment (38 °C for an hour). Before and after five days heat treatment, body weights were measured. The protein expressions of heat shock proteins in liver were measured by western blotting using HSPs antibodies.Results: The extract of Zingiber zerumbet rhizome, equivalent to 50 μM zerumbone, significantly increased the expression of heat shock proteins (HSP40, HSP70, HSP90). The growth rate of the mice under the heat treatment were lower than control. The feeding with the extract containing 25 ppm zerumbone have significantly attenuated the decline of the growth rate led by the heat treatment, whereas there was little effect on mouse growth rate grown under normal conditions. The protein expression of HSP70 in the liver of zerumbone-fed mice was upregulated compared with control mice, equivalent to heat treatment without zerumbone. On the other hand, both treatments of zerumbone and heat resulted in highest HSP70 expression among four groups.Conclusion: Our study demonstrated that oral administration of the extract of Zingiber zerumbet Smith led to the attenuation of decline of growth rate induced by heat treatment. HSP70 expression in murine liver was enhanced by either feeding the extract or heat treatment. More interestingly, HSP70 expression was further enhanced by both treatments of zerumbone and heat. These results suggested that zerumbone may contribute to thermotolerance via, at least, HSP70 expression.Keywords: Zingiber zerumbet, thermotolerance, heat shock protein
    Functional Food Center, 2021年01月, Bioactive Compounds in Health and Disease, 4(1) (1), 1 - 1
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Daiki Hayashi, Liuqing Wang, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Hitoshi Ashida, Yasuhito Shirai
    AbstractSignificant efforts have been made to ameliorate diabetic nephropathy (DN) by inhibiting protein kinase C. However, these efforts have not been successful in human trials, suggesting that novel therapeutic strategies are required. Thus far, it has been reported that green tea polyphenol epigallocatechin gallate (EGCg) improved albuminuria in DN in a human trial. Our previous study revealed that activation of diacylglycerol kinase α (DGKα) plays a crucial role in the amelioration of DN and that EGCg activates DGKα. Here, we investigated whether and how DGKα contributes to the amelioration of DN upon stimulation by EGCg by using streptozotocin-induced type 1 diabetic model mice. Our results revealed that EGCg ameliorated albuminuria in DN through DGKα in vivo, and methylated EGCg, which has higher absorption in the plasma improved albuminuria in DN effectively. Additionally, we showed that c-Src mediated EGCg-induced DGKα translocation and colocalized with the 67 kDa laminin receptor, which is an EGCg receptor. Furthermore, EGCg attenuated the loss of podocytes in DN by preventing a decrease in focal adhesion under high glucose conditions. Our results indicate that the DGKα pathway is an attractive therapeutic target and that activating this pathway is a novel strategy for treating DN.
    Springer Science and Business Media LLC, 2020年12月, Scientific Reports, 10(1) (1)
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Ryosuke Tsumagari, Kenta Maruo, Sho Kakizawa, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Hiromitsu Saito, Noboru Suzuki, Yasuhito Shirai
    Diacylglycerol kinase γ (DGKγ) is a lipid kinase to convert diacylglycerol (DG) to phosphatidic acid (PA) and indirectly regulates protein kinase C γ (PKCγ) activity. We previously reported that the basal PKCγ upregulation impairs cerebellar long-term depression (LTD) in the conventional DGKγ knockout (KO) mice. However, the precise mechanism in impaired cerebellar LTD by upregulated PKCγ has not been clearly understood. Therefore, we first produced Purkinje cell-specific DGKγ KO (tm1d) mice to investigate the specific function of DGKγ in Purkinje cells and confirmed that tm1d mice showed cerebellar motor dysfunction in the rotarod and beam tests, and the basal PKCγ upregulation but not PKCα in the cerebellum of tm1d mice. Then, the LTD-induced chemical stimulation, K-glu (50 mM KCl + 100 µM, did not induce phosphorylation of PKCα and dissociation of GluR2 and glutamate receptor interacting protein (GRIP) in the acute cerebellar slices of tm1d mice. Furthermore, treatment with the PKCγ inhibitor, scutellarin, rescued cerebellar LTD, with the phosphorylation of PKCα and the dissociation of GluR2 and GRIP. In addition, nonselective transient receptor potential cation channel type 3 (TRPC3) was negatively regulated by upregulated PKCγ. These results demonstrated that DGKγ contributes to cerebellar LTD by regulation of the basal PKCγ activity.
    2020年10月, International journal of molecular sciences, 21(21) (21), 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • 67kDaラミニンレセプターはビタミンEとの結合によりパルミトイル化修飾を受ける
    岡本 聖香, 林 大輝, 足立 直子, Varnavas Mouchlis, 上田 修司, 山之上 稔, Dennis Edward, 斎藤 尚亮, 伊藤 俊樹, 白井 康仁
    (公社)日本生化学会, 2020年09月, 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集, 93回, [1Z09 - 161)], 日本語

  • Susumu Muroya, Shuji Ueda, Tomohiko Komatsu, Takuya Miyakawa, Per Ertbjerg
    In the past decades, metabolomics has been used to comprehensively understand a variety of food materials for improvement and assessment of food quality. Farm animal skeletal muscles and meat are one of the major targets of metabolomics for the characterization of meat and the exploration of biomarkers in the production system. For identification of potential biomarkers to control meat quality, studies of animal muscles and meat with metabolomics (MEATabolomics) has been conducted in combination with analyses of meat quality traits, focusing on specific factors associated with animal genetic background and sensory scores, or conditions in feeding system and treatments of meat in the processes such as postmortem storage, processing, and hygiene control. Currently, most of MEATabolomics approaches combine separation techniques (gas or liquid chromatography, and capillary electrophoresis)-mass spectrometry (MS) or nuclear magnetic resonance (NMR) approaches with the downstream multivariate analyses, depending on the polarity and/or hydrophobicity of the targeted metabolites. Studies employing these approaches provide useful information to monitor meat quality traits efficiently and to understand the genetic background and production system of animals behind the meat quality. MEATabolomics is expected to improve the knowledge and methodologies in animal breeding and feeding, meat storage and processing, and prediction of meat quality.
    2020年05月, Metabolites, 10(5) (5), 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Hiroko Nakai, Ryosuke Tsumagari, Kenta Maruo, Akio Nakashima, Ushio Kikkawa, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Naoaki Saito, Nobuyuki Takei, Yasuhito Shirai
    Diacylglycerol kinase β (DGKβ) is an enzyme converting DG to phosphatidic acid (PA) and is specifically expressed in neurons, especially those in the cerebral cortex, hippocampus and striatum. We previously reported that DGKβ induces neurite outgrowth and spinogenesis, contributing to higher brain function including emotion and memory, and plasma membrane localization of DGKβ via the C1 domain and a cluster of basic amino acids at the C-terminus is necessary for its function. To clarify the mechanisms involved in neuronal development by DGKβ, we investigated whether DGKβ activity induces neurite outgrowth using human neuroblastoma SH-SY5Y cells. DGKβ induced neurite outgrowth by activation of mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) through a kinase-dependent pathway. In addition, in primary cultured cortical and hippocampal neurons, inhibition of mTORC1 abolished DGKβ induced-neurite outgrowth, branching and spinogenesis. These results indicated that DGKβ induces neurite outgrowth and spinogenesis by activating mTORC1 in a kinase-dependent pathway.
    2020年03月, Neurochemistry international, 134, 104645 - 104645, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Yanan Zhao, Masahiro Nishida, Shuji Ueda, Yasuhito Shirai, Masaaki Habara, Hidekazu Ikezaki, Minoru Yamanoue
    Japanese Society for Food Science and Technology, 2020年, Food Science and Technology Research, 26(3) (3), 329 - 338
    研究論文(学術雑誌)

  • Ryosuke Tsumagari, Sho Kakizawa, Sakiko Kikunaga, Yoshitaka Fujihara, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Naoaki Saito, Masahito Ikawa, Yasuhito Shirai
    © 2020 Tsumagari et al. Diacylglycerol kinase g (DGKg) regulates protein kinase C (PKC) activity by converting DG to phosphatidic acid (PA). DGKg directly interacts with PKCg and is phosphorylated by PKCg, resulting in the upregulation of lipid kinase activity. PKC dysfunction impairs motor coordination, indicating that the regulation of PKC activity is important for motor coordination. DGKg and PKC are abundantly expressed in cerebellar Purkinje cells. However, the physiological role of DGKg has not been elucidated. Therefore, we developed DGKg knock-out (KO) mice and tested their cerebellar motor coordination. In DGKg KO mice, cerebellar motor coordination and long-term depression (LTD) were impaired, and the dendrites of Purkinje cells from DGKg KO mice were significantly retracted. Interestingly, treatment with the cPKC inhibitor Gö6976 (Gö) rescued the dendritic re-traction of primary cultured Purkinje cells from DGKg KO mice. In contrast, treatment with the PKC activator 12-o-tetradecanoylphorbol 13-acetate (TPA) reduced morphologic alterations in the dendrites of Purkinje cells from wild-type (WT) mice. In addition, we confirmed the upregulation of PKCg activity in the cerebellum of DGKg KO mice and rescued impaired LTD in DGKg KO mice with a PKCg-specific inhibitor. Furthermore, im-pairment of motor coordination observed in DGKg KO mice was rescued in tm1c mice with DGKg reexpres-sion induced by the FLP-flippase recognition target (FRT) recombination system. These results indicate that DGKg is involved in cerebellar LTD and the dendritic development of Purkinje cells through the regulation of PKCg activity, and thus contributes to cerebellar motor coordination.
    2020年, eNeuro, 7(2) (2)
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • 低親和性ビオチン結合タンパク質Tamavidinを用いた新規ペプチド捕捉型BioID法の開発
    吉野 健一, 西原 萌華, 上田 修司, 竹内 敦子
    日本組織細胞化学会, 2019年09月, 日本組織細胞化学会総会・学術集会講演プログラム・予稿集, 60回, 97 - 97, 日本語

  • Hayashi D, Tsumagari R, Liu K, Ueda S, Yamanoue M, Sakane F, Shirai Y
    2019年06月, Journal of biochemistry, 165(6) (6), 517 - 522, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • UEDA SyUJI, IWAMOTO EIJI, KATO YOSHIKI, SHINOHARA MASAKAZU, SHIRAI YASUHITO, YAMANOUE MINORU
    Progress in metabolomic analysis now allows the evaluation of food quality. This study aims to identify the metabolites in meat from livestock using a metabolomic approach. Using gas chromatography-mass spectrometry (GC/MS), many metabolites were reproducibly detected in meats, and distinct differences between livestock species (cattle, pigs, and chickens) were indicated. A comparison of metabolites between tissues types (muscle, intramuscular fat, and intermuscular fat) in marbled beef of Japanese Black cattle revealed that most metabolites are abundant in the muscle tissue. Several metabolites (medium-chain fatty acids, etc.) involved in triacylglycerol synthesis were uniquely detected in fat tissue. Additionally, the results of multivariate analysis suggest that GC/MS analysis of metabolites can distinguish between cattle breeds. These results provide useful information for the analysis of meat quality using GC/MS-based metabolomic analysis.ABBREVIATIONS: GC/MS: gas chromatography-mass spectrometry; NMR: nuclear magnetic resonance; MS: mass spectrometry; IS: 2-isopropylmalic acid; MSTFA: N-Methyl-N-trimethylsilyltrifluoroacetamide; CV: coefficient of variation; TBS: Tris-buffered saline; MHC: myosin fast type; PCA: principal component analysis; OPLS-DA: orthogonal partial least-squares discriminant analysis; O2PLS: two-way orthogonal partial least-squares.
    日本農芸化学会, 2019年01月, Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 83(1) (1), 137 - 147, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • 上田 修司, 岩本 英治, 加藤 良毅, 篠原 正和, 白井 康仁, 山之上 稔
    Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, 2018年10月, Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 83, 137 - 147, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • RhoA結合蛋白質として同定されたSTE20 like kinaseの筋細胞の肥大化における役割
    櫛谷 晃帆, 上田 修司, 前田 愛実, 加藤 良毅, 吉野 健一, 竹内 敦子, 山之上 稔, 白井 康仁
    (公社)日本生化学会, 2018年09月, 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集, 91回, [1T14e - 370)], 日本語

  • NISHIO Yuriko, USHIMURA Yuichi, UEDA Shuji, MAEDA Naoyuki, HATTORI Akihito, YAMANOUE MINORU
    Paratropomyosin (PTM) composes myofibril functions to weaken the rigor linkages formed between actin and myosin during postmortem aging of muscles. PTM has the similar physico-chemical properties as tropomyosin (TM) that is a regulatory protein of myofibrils. So far, it is unclear whether PTM is definitely different from TM, because the primary structure of PTM has not been determined yet. The aim of this study was to clarify structural difference of PTM from TM. PTM was prepared by column chromatography immediately after slaughter from broiler breast muscle, and purified by high-performance liquid chromatography (HPLC). Purified PTM was successfully separated from TM, and the recovered PTM molecule was reduced with dithiothreitol to separate again by HPLC. Two subunits were obtained and peptides from each digested subunit by V8 protease were recovered by HPLC, and then amino acid sequences of the peptides were analyzed by protein sequencing. As a result, some amino acid residues were replaced from that of TMα1 isoform which is the major isoform of TM, and also was different between the two subunits. Therefore, it is concluded that PTM clearly differs from TM and it is suggested that functional difference in PTM from TM is attributed to amino acid replacements in subunits composing PTM.
    2018年08月, Animal Science Journal, 89(8) (8), 1161 - 1168, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • UEDA-WAKAGI Manabu, HAYASHIBARA Kaori, NAGANO Tomoya, IKEDA Masaki, YUAN Sihao, UEDA Shuji, SHIRAI Yasuhito, YOSHIDA Ken-ichi, ASHIDA Hitoshi
    Our previous report demonstrated that epigallocatechin gallate (EGCg) promotes translocation of glucose transporter 4 (GLUT4) in skeletal muscle. In this study, we investigated the molecular mechanism of GLUT4 translocation by EGCg at the physiological concentration range. In L6 cells, EGCg induced phosphorylation of phosphatidylinositide 3'-kinase (PI3K) and downstream protein kinase C (PKC) λ/ξ without affecting the phosphorylation of insulin receptor and Akt. EGCg-induced GLUT4 translocation was suppressed by RNA interference-mediated knockdown of PI3K and treatment with PKC inhibitor Go6983. Moreover, EGCg increased Rac1 activity and actin remodelling as downstream events of PKCλ/ξ. These results indicate that EGCg induced GLUT4 translocation through a PI3K-dependent pathway, but its mode of action differed from that of insulin. EGCg also induced GLUT4 translocation through a 5'-adenosine monophosphate-activated protein kinase (AMPK)-dependent pathway. 67 kDa laminin receptor, which is a target molecule of EGCg, was not involved in EGCg-induced glucose uptake in L6 cells. The oral administration of EGCg suppressed postprandial hyperglycaemia accompanied by GLUT4 translocation through both PI3K- and AMPK-dependent pathways, and promoted glycogen accumulation in skeletal muscle of ICR mice. EGCg promotes GLUT4 translocation through both PI3K- and AMPK-dependent pathways and glycogen accumulation in skeletal muscle.
    2018年, Food and Function, 9(8) (8), 4223 - 4233, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • HAYASHI Daiki, UEDA Shuji, YAMANOUE Minoru, ASHIDA Hitoshi, SHIRAI Yasuhito
    Diabetic nephropathy (DN) is a diabetic vascular complication, and abnormal protein kinase C (PKC) activation from increased diacylglycerol (DG) production in diabetic hyperglycemia is one of the causes of DN. Diacylglycerol kinase (DGK) converts DG into phosphatidic acid. In other words, DGK can attenuate PKC activity by reducing the amount of DG. Recently, we reported that intraperitoneally administered d-α-Tocopherol (Vitamin E, αToc) induces an amelioration of DN in vivo through the activation of DGKα and the prevention of podocyte loss. However, the effect of the oral administration of αToc on DN in mice remains unknown. Here, we evaluated the effect of oral administration of αToc on DN and its molecular mechanism using streptozocininduced diabetic mice. Consequently, the oral administration of αToc significantly ameliorated the symptoms of DN by preventing the loss of podocytes, and it was revealed that the inhibition of PKC activity was involved in this amelioration.
    Japan Society for Bioscience Biotechnology and Agrochemistry, 2018年, Bioscience Biotechnology and Biochemistry, 82(1) (1), 65 - 73, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Diacylglycerol Kinase alpha is Involved in the Vitamin E-Induced Amelioration of Diabetic Nephropathy in Mice.
    Hayashi D, Yagi K, Song C, Ueda S, Yamanoue M, Topham M, Suzaki T, Saito N, Emoto N, Shirai Y
    2017年07月, Sci Rep., 7(1) (1), 2597, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Effects of intramuscular FFAs on taste-traits of Japanese Black Wagyu beef
    趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦, 山之上 稔
    King Mongkut's Institute of Technology Ladkrabang, 2016年08月, Proceedings of the 62nd ICoMST, 1, O - 05-1-4, 英語
    [査読有り]
    研究論文(国際会議プロシーディングス)

  • Detection of the connectin/titin 20-kda fragment increased in chicken sarcoplasm during postmortem aging
    仲 梓沙, 丸山 聖也, 中間 みなみ, 上田 修司, 山之上 稔
    Japanese Society of Animal Science, 2016年08月, Proceedings of the 17th AAAP Animal Science Congress, 1, 1119 - 1122, 英語
    [査読有り]
    研究論文(国際会議プロシーディングス)

  • 熟成による牛肉の脂肪および呈味性の変化
    山之上 稔, 趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦
    日本食肉研究会, 2016年06月, 食肉の科学, 57(1) (1), 142 - 144, 日本語
    研究論文(研究会,シンポジウム資料等)

  • Daiki Hayashi, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Naoki Saito, Hitoshi Ashida, Yasuhito Shirai
    To develop a functional food for improvement and/or prevention of diabetic nephropathy, we investigated whether catechins can activate DGK alpha, which is involved in the vitamin E-induced improvement of diabetic renal dysfunction. Among the catechins tested, (-)-epicatechin-3-gallate, (-)-epigallocatechin-3-gallate (EGCg), (-)-catechin-3-gallate and (-)-gallocatechin-3-gallate induced DGKa translocation from the cytoplasm to the plasma membrane, which is an index of DGKa activation. In contrast, (-)-epicatechin, (-)epigallocatechin and gallic acid did not induce the translocation. Among the four galloylated catechins, EGCg was most effective, dose-dependent and subtype-specific among type I DGKs. Importantly, EGCg did indeed up-regulate DGK alpha activity. In addition, we found that a 67 kDa laminin receptor (67LR) mediates the EGCg-induced activation of DGKa, and both 67LR and DGK alpha; are expressed in podocyte among glomerular cells. Finally, the EGCg-induced translocation of DGKa was confirmed in cultured podocytes. Thus, EGCg activates DGKa via 67LR, providing the possibility that EGCg may improve and/or prevent diabetic renal dysfunction. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
    ELSEVIER SCIENCE BV, 2015年05月, JOURNAL OF FUNCTIONAL FOODS, 15, 561 - 569, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • UEDA S, Blee AM, Macway KG, Renner DJ, Yamada S
    AMER SOC CELL BIOLOGY, 2015年, PLoS One., 26(10(3)) (10(3)), e0122886, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • 上田 修司, 小鍛治 泰斗, 清水 俊策, 本田 和久, 吉野 健一, 上曽山 博, 白井 康仁, 山之上 稔
    International trading markets of meat require the animal's age information to prevent cross-contamination of ineligible meat products. Individual livestock age is either evaluated from physiological features or verified by breeding history. However, it remains impossible to perform age verification on meat when a suspicion of error occurred in the importing country. To investigate an age-related protein in skeletal muscle of livestock, we compared protein expression among chicken pectoralis major of different ages. Results indicated that the level of expression of chicken HSPB1, one of the small heat shock proteins, was increased in aged muscles. On the other hand, other heat shock proteins, heat shock factors, and myosin heavy chain isoform did not change the expression levels in aged chicken muscle. In addition, we identified that alpha B-crystallin interacted with HSPB1 in aged chicken muscle. These results suggest that HSPB1 protein forms complexes with alpha B-crystallin in aged chicken muscle and suppose to become the candidate of age-related bio-marker for verifying the age of chicken meat.
    TAYLOR & FRANCIS LTD, 2015年, Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 79(11) (11), 1867 - 1875, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • 脂質結合ドメインを用いた新規ホスファチジン酸可視化プローブの開発
    沖本航, 中井寛子, 伊藤俊樹, 上田修司, 山之上稔, 白井康仁
    2014年12月, 日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 487th, 11, 日本語
    研究論文(その他学術会議資料等)

  • Effects of storage and cooking on free fatty acid in Japanese Black Wagyu beef broth
    YAMANOUE MINORU, NISHIDA MASAHIRO, YAMATO SAYAKA, UEDA SyUJI, IHARA IKKO, TOYODA KIYOHIKO
    2014年11月, Proc. 16th AAAP Animal Science Congress, 英語
    [査読有り]
    研究論文(国際会議プロシーディングス)

  • 筋細胞におけるHSPB1の結合分子の探索とその機能解析
    小鍛治 泰斗, 上田 修司, 吉野 健一, 山之上 稔, 白井 康仁
    (公社)日本生化学会, 2014年10月, 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集, 87回, [4P - 154], 日本語

  • T. Kano, T. Kouzuki, S. Mizuno, UEDA SyUJI, YAMANOUE MINORU, SAKANE F, SAITO N, SHIRAI YASUHITO
    We previously reported that diacylglycerol kinase 13 (DGK beta) induces neurites and branches, contributing to higher brain function including emotion and memories. However, the detailed molecular mechanism of DGK beta function remains unknown. Therefore, we constructed various mutants of DGK beta and compared their enzyme activity, intracellular localization, and ability to induce neurites and branching in SH-SY5Y cells. Even when RVH-domain and EF-hand motif were deleted, the mutant showed similar plasma membrane localization and neurite induction compared to wild type (WT), although the kinase activity of the mutant was three times higher than that of WT. In contrast, further deletion of Cl domain reduced the activity to 50% and abolished plasma membrane localization and neurite induction ability. When 34 amino acids were deleted from C-terminus, the mutants completely lost enzyme activity, plasma membrane localization, and the ability to induce neurites. A kinase-negative mutant of DGK beta retained plasma membrane localization and induced significant neurites and branches; however, the rate of induction was weaker than that of WT. Furthermore, CIA and C1B mutants, which have a mutation in a cysteine residue in the CIA or C1B domain, and the RK/E mutant, which has substitutions of arginine and lysine to glutamic acid in a cluster of basic amino acids at the C-terminus, lost their plasma membrane localization and neurite induction ability. These results indicate that in addition to kinase activity, plasma membrane localization via the Cl domain and basic amino acids at the C-terminus were indispensable for neurite induction by DGK beta. (C) 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.
    ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 2014年04月, Biochemical and Biophysical Research Communications, 447(1) (1), 89 - 94, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Becky Tu-Sekine, Minoru Yamanoue, Daniel M. Raben, Yasuhito Shirai
    Background: Diacylglycerol kinase (DGK) is a key enzyme that regulates diacylglycerol (DG) turnover and is involved in a variety of physiological functions. The isoform DGK. has a unique domain structure and is the sole member of type V DGK. To reveal the spatial and temporal expression of DGK. we performed immunohistochemical staining on paraffin sections of mouse embryos. Results: At an early stage of development (E10.5 and 11.5), the expression of DGK. was prominently detected in the brain, spinal cord, dorsal root ganglion, and limb bud, and was also moderately detected in the bulbus cordis and the primordium of the liver and gut. At later stages (E12.5 and 14.5), DGK. expression persisted or increased in the neocortex, epithalamus, hypothalamus, medulla oblongata, and pons. DGK. was also evident in the epidermis, and nearly all epithelia of the oropharyngeal membrane, digestive tract, and bronchea. At prenatal developmental stages (E16.5 and E18.5), the expression pattern of DGK. was maintained in the central nervous system, intestine, and kidney, but was attenuated in the differentiated epidermis. Conclusion: These results suggest that DGK. may play important physiological roles not only in the brain, but also in diverse organs and tissues during the embryonic stages.
    BIOMED CENTRAL LTD, 2013年10月, BMC DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 13, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Shinsuke Nozaki, Shuji Ueda, Nobuyuki Takenaka, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    The small GTPase RalA has been implicated in glucose uptake in insulin-stimulated adipocytes, although it remains unclear whether RalA has a similar role in insulin signaling in other types of cells. Recently, we have demonstrated that the Rho family GTPase Rac1 has a critical role in insulin-dependent glucose uptake in myoblast culture and mouse skeletal muscle. However, the mechanisms underlying Rac1-dependent glucose uptake, mostly mediated by the plasma membrane translocation of the glucose transporter GLUT4, remain largely unknown. The purpose of this study is to examine the involvement of RalA in Rac1 regulation of the translocation of GLUT4 to the plasma membrane in muscle cells. Ectopic expression of a constitutively activated RalA mutant indeed stimulated GLUT4 translocation, suggesting an important role of RalA also in muscle cells. GLUT4 translocation induced by constitutively activated mutation of Rac1 or more physiologically by upstream Rac1 regulators, such as phosphoinositide 3 kinase and the guanine nucleotide exchange factor FLJ00068, was abrogated when the expression of RalA was downregulated by RNA interference. The expression of constitutively activated Rac1, on the other hand, caused GTP loading and subcellular redistribution of RalA. Collectively, we propose a novel mechanism involving RalA for Rac1-mediated GLUT4 translocation in skeletal muscle cells.
    2012年11月, Cellular signalling, 24(11) (11), 2111 - 7, 英語, 国際誌
    研究論文(学術雑誌)

  • Effects of postmortem aging and cooking procedures on intramuscular fat and fatty acid composition in Japanese Black Wagyu beef.
    YAMANOUE MINORU, YANO KEIKO, HISANO EMI, UEDA SHUJI, IHARA IKKO, TOYODA KIYOHIKO
    The aim of this study was to analyze the changes in intramuscular fat of Japanese Black Wagyu beef after postmortem aging and cooking. Sample meats were taken from carcass cross-section between the sixth and seventh ribs of Japanese Black Wagyu cattle and stored at 4°C. At 7-, 14- and 28-days postmortem, total lipid was extracted with a mixture of chloroform and methanol accord
    National Organizing Committee for Technical Program, 2012年11月, Proc. 15th AAAP Animal Science Congress, 2962 - 2968, 英語
    [査読有り]
    研究論文(国際会議プロシーディングス)

  • Shuji Ueda, Sohei Kitazawa, Kota Ishida, Yuki Nishikawa, Megumi Matsui, Hikaru Matsumoto, Takuji Aoki, Shinsuke Nozaki, Tomoya Takeda, Yoshikazu Tamori, Atsu Aiba, C. Ronald Kahn, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    The Rho family GTPase Rac1 has been implicated in the regulation of glucose uptake in myoblast cell lines. However, no evidence for the role of Rac1 has been provided by a mouse model. The purpose of this study is to test the involvement of Rac1 in insulin action in mouse skeletal muscle. Intravenous administration of insulin indeed elicited Rac1 activation in gastrocnemius muscle, suggesting the involvement of Rac1 in this signaling pathway. We then examined whether insulin-stimulated translocation of the facilitative glucose transporter GLUT4 from its storage sites to the skeletal muscle sarcolemma depends on Rac1. We show that ectopic expression of constitutively activated Rac1, as well as intravenous administration of insulin, caused translocation of GLUT4 to the gastrocnemius muscle sarcolemma, as revealed by immunofluorescent staining of a transiently expressed exofacial epitope-tagged GLUT4 reporter. Of particular note, insulin-dependent, but not constitutively activated Rac1-induced, GLUT4 translocation was markedly suppressed in skeletal muscle-specific rac1-knockout mice compared to control mice. Immunogold electron microscopic analysis of endogenous GLUT4 gave similar results. Collectively, we propose a critical role of Rac1 in insulin-dependent GLUT4 translocation to the skeletal muscle sarcolemma, which has heretofore been predicted solely by cell culture studies.-Ueda, S., Kitazawa, S., Ishida, K., Nishikawa, Y., Matsui, M., Matsumoto, H., Aoki, T., Nozaki, S., Takeda, T., Tamori, Y., Aiba, A., Kahn, C. R., Kataoka, T., Satoh, T. Crucial role of the small GTPase Rac1 in insulin-stimulated translocation of glucose transporter 4 to the mouse skeletal muscle sarcolemma. FASEB J. 24, 2254-2261 (2010). www.fasebj.org
    FEDERATION AMER SOC EXP BIOL, 2010年07月, FASEB JOURNAL, 24(7) (7), 2254 - 2261, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Hoshimi Kanemura, Takaya Satoh, Shymaa E. Bilasy, Shuji Ueda, Masanori Hirashima, Tohru Kataoka
    RA-GEF-1 is a guanine nucleotide exchange factor for the small GTPase Rap1. RA-GEF-1 knockout mice show defects in vascular development starting around 7.5 days post coitum and die by 9.5 days post coitum. Here, we employed in vitro culture systems for allantois explants and endothelial cells to gain insights into the mechanism for RA-GEF-1-mediated regulation of embryonic vascular network formation. The development of the vascular plexus and the accumulation of VE-cadherin at cell-cell junctions were significantly impaired in the RA-GEF-1 knockout allantois and yolk sac. Rap1 activation as visualized by an activation-specific probe was also diminished by RA-GEF-1 knockout. Reduced accumulation of VE-cadherin at cell-cell junctions and defects in blood vessel formation in vitro due to the lack of RA-GEF-1 were suppressed by ectopic expression of constitutively activated Rap1. Overall, these results suggest the involvement of Rap1 downstream of RA-GEF-1 in the regulation of vascular network formation in mouse embryos. (C) 2009 Elsevier Inc. All rights reserved.
    ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 2009年10月, BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 387(4) (4), 754 - 759, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Takuji Aoki, Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    Background: The Dbl family guanine nucleotide exchange factor ARHGEF10 was originally identified as the product of the gene associated with slowed nerve-conduction velocities of peripheral nerves. However, the function of ARHGEF10 in mammalian cells is totally unknown at a molecular level. ARHGEF10 contains no distinctive functional domains except for tandem Dbl homology-pleckstrin homology and putative transmembrane domains. Results: Here we show that RhoA is a substrate for ARHGEF10. In both G1/S and M phases, ARHGEF10 was localized in the centrosome in adenocarcinoma HeLa cells. Furthermore, RNA interference-based knockdown of ARHGEF10 resulted in multipolar spindle formation in M phase. Each spindle pole seems to contain a centrosome consisting of two centrioles and the pericentriolar material. Downregulation of RhoA elicited similar phenotypes, and aberrant mitotic spindle formation following ARHGEF10 knockdown was rescued by ectopic expression of constitutively activated RhoA. Multinucleated cells were not increased upon ARHGEF10 knockdown in contrast to treatment with Y-27632, a specific pharmacological inhibitor for the RhoA effector kinase ROCK, which induced not only multipolar spindle formation, but also multinucleation. Therefore, unregulated centrosome duplication rather than aberration in cytokinesis may be responsible for ARHGEF10 knockdown-dependent multipolar spindle formation. We further isolated the kinesin-like motor protein KIF3B as a binding partner of ARHGEF10. Knockdown of KIF3B again caused multipolar spindle phenotypes. The supernumerary centrosome phenotype was also observed in S phase-arrested osteosarcoma U2OS cells when the expression of ARHGEF10, RhoA or KIF3B was abrogated by RNA interference. Conclusion: Collectively, our results suggest that a novel RhoA-dependent signaling pathway under the control of ARHGEF10 has a pivotal role in the regulation of the cell division cycle. This pathway is not involved in the regulation of cytokinesis, but instead may regulate centrosome duplication. The kinesin-like motor protein KIF3B may modulate the ARHGEF10-RhoA pathway through the binding to ARHGEF10.
    BIOMED CENTRAL LTD, 2009年07月, BMC CELL BIOLOGY, 10, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Shymaa E. Bilasy, Takaya Satoh, Shuji Ueda, Ping Wei, Hoshimi Kanemura, Atsu Aiba, Toshio Terashima, Tohru Kataoka
    Neural migration defects lead to various types of human malformations of cortical development including subcortical band heterotopia, which shows formation of a secondary cortical plate beneath the primary cortex and is typically caused by mutation of the DCX (doublecortin) gene. Subcortical band heterotopia is usually associated with mental retardation and epilepsy. We previously discovered RA-GEF-1 as a guanine nucleotide exchange factor (GEF) for Rap1 small GTPase. Here we have analysed its in-vivo role in formation of the adult cerebral cortex by using telencephalon-specific RA-GEF-1 conditional knockout (cKO) mice, generated by mating RA-GEF-1(flox/flox) mice with Emx1-cre knockin mice. RA-GEF-1 cKO mice showed severe defects in their brain structures including an ectopic cortical mass underlying a relatively normal cortex. The ectopic cortical mass lacked the normal six-layered lamination but preserved the subcortical connectivity as revealed by retrograde tracing. Further, RA-GEF-1 cKO mice exhibited a lower threshold for the induction of epileptic seizures. These phenotypes have a resemblance to those of human subcortical band heterotopia. In addition, the agenesis of anterior commissures, the dorsal hippocampus commissure, the corpus callosum and the enlargement of the lateral ventricles were observed in cKO mice. Our findings suggest a crucial function of RA-GEF-1 in neural migration.
    WILEY-BLACKWELL PUBLISHING, INC, 2009年05月, EUROPEAN JOURNAL OF NEUROSCIENCE, 29(10) (10), 1994 - 2008, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    Background information. Insulin-stimulated glucose uptake into skeletal muscle is crucial for glucose homoeostasis, and depends on the recruitment of GLUT4 (glucose transporter 4) to the plasma membrane. Mechanisms underlying insulin-dependent GLUT4 translocation, particularly the role of Rho family GTPases, remain controversial. Results. In the present study, we show that constitutively active Rac1, but not other Rho family GTPases tested, induced GLUT4 translocation in the absence of insulin, suggesting that Rac1 activation is sufficient for GLUT4 translocation in muscle cells. Rac1 activation occurred in dorsal membrane ruffles of insulin-stimulated cells as revealed by a novel method to visualize activated Rac1 in situ. We further identified FLJ00068 as a GEF (guanine-nucleotide-exchange factor) responsible for this Rac1 activation. Indeed, constitutively active FLJ00068 caused Rac1 activation in dorsal membrane ruffles and GLUT4 translocation without insulin stimulation. Down-regulation of Rac1 or FLJ00068 by RNA interference, on the other hand, abrogated insulin-induced GLUT4 translocation. Basal, but not insulin-stimulated, activity of the serine/threonine kinase Akt was required for the induction of GLUT4 translocation by constitutively active Rac1 or FLJ00068. Conclusion. Collectively, Rac1 activation specifically in membrane ruffles by the GEF FLJ00068 is sufficient for insulin induction of glucose uptake into skeletal-muscle cells.
    PORTLAND PRESS LTD, 2008年11月, BIOLOGY OF THE CELL, 100(11) (11), 645 - 657, 英語
    研究論文(学術雑誌)

  • Quantitative analysis of spatial regulation of low molecular weight GTPases and its medical application
    Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    Ras and Rho families of GTPases have been implicated in the regulation of a wide variety of cellular signaling. The activity of these GTPases is believed to be regulated strictly by upstream signals, which are mediated by a large number of guanine nucleotide exchange factors (GEFs). However, mechanisms underlying subcellular region-specific regulation of Ras and Rho family members remain largely unknown. As a first step to clarify these issues, we attempted to establish a novel method to detect the active GTP-bound form of the Rho family protein Cdc42 in situ. The Cdc42/Rac1 interactive binding (CRIB) domain of the Cdc42-specific target ACK1 was used as a probe for detecting the activated form of Cdc42. HeLa cells expressing various mutants of Cdc42 were fixed with paraformaldehyde, and then treated with the CRIB domain of ACK1, which was subsequently visualized by immunofluorescence microscopy. Indeed, only constitutively activated Cdc42 was detected by the ACK1 CRIB domain. This meth od is applicable to various mouse and human tissues, and has the potential to become a high-through-put drug screening system.
    SOUTHEAST UNIV PRESS, 2006年, Progress on Post-Genome Technologies, 224 - 226, 英語
    [査読有り]
    研究論文(国際会議プロシーディングス)

  • リューマチ様関節炎(RA)疾患遺伝子としてのDblプロトオンコジーンスプライシング変異体の分子的性質(Molecular characterization of Dbl proto-oncogene splicing variant as rheumatoid arthritis (RA) disease gene)
    Komai Koichiro, Arakawa Ayumi, Osawa Kayo, Gake Maiko, Ueda Shuji, Satoh Takaya, Kataoka Tohru, Shiozawa Shunichi
    (公社)日本生化学会, 2005年08月, 生化学, 77(8) (8), 947 - 947, 英語

  • Role of the Sec14-like domain of Dbl family exchange factors in the regulation of Rho family GTPases in different subcellular sites
    Ueda Shuji, Kataoka Tohru, Satoh Takaya
    2004年08月, Cellular Signalling, Vol. 16, No. 8, pp. 899-906, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Minoru Yamanoue, Shuji Ueda, Akiko Ohashi, Yumi Yoshimura, Shigemi Norioka
    In order to clarify the position where paratropomyosin binds to connectin in the A-I junction region of a sarcomere, chicken β-connectin was digested by Staphylococcus aureus V8 protease under denaturing conditions and the digested peptides were electrophoretically separated. Five peptides, 150-kDa, 100-kDa, 70-kDa, and 43-kDa fragments, were simultaneously detected by biotinylated paratropomyosin and an anti-connectin monoclonal antibody. The N-terminal sequence of the 43-kDa fragment was found to be YQFRVYAVNK, similar to the sequence of 7556-7565 amino acids in the I51 fibronectin type 3 domain that was located at the A-I junction region of human cardiac titin/connectin. Therefore, we propose that paratropomyosin binds to the 43-kDa fragment from β-connectin at the A-I junction region in both living muscle and in muscle immediately postmortem, and the N-terminus of the 43-kDa fragment is localized in the I51 domain. © 2003 by Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry.
    2003年01月, Bioscience, Biotechnology and Biochemistry, 67(3) (3), 563 - 569, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

  • Juran Kato-Stankiewicz, Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Yoshito Kaziro, Takaya Satoh
    The tyrosine kinase ACK1 phosphorylates and activates the guanine nucleotide exchange factor Dbl, which in turn directs the Rho family GTP-binding proteins. However, the regulatory mechanism of ACK1/Dbl signaling in response to extracellular stimuli remains poorly understood. Here we describe that epidermal growth factor stimulates the ACK1/Dbl pathway, leading to actin cytoskeletal rearrangements. The role of the two ACK1-binding proteins Cdc42 and Grb2 was assessed by overexpression of the Cdc42/Rac interactive binding domain and a dominant-negative Grb2 mutant, respectively. Specific inhibition of the interaction of ACK1 with Cdc42 or Grb2 by the use of these constructs diminished tyrosine phosphorylation of both ACK1 and Dbl in response to EGF. Therefore, the activation of ACK1 and subsequent downstream signaling require both Cdc42-dependent and Grb2-dependent processes within the cell. In addition, we show that EGF transiently induces formation of the focal complex and stress fibers when ACK1 was ectopically expressed. The induction of these structures was totally sensitive to the action of botulinum toxin C from Clostridium botulinum, suggesting a pivotal role of Rho. These results provide evidence that ACK1 acts as a mediator of EGF signals to Rho family GTP-binding proteins through phosphorylation and activation of GEFs such as Dbl. © 2001 Academic Press.
    Academic Press Inc., 2001年, Biochemical and Biophysical Research Communications, 284(2) (2), 470 - 477, 英語
    [査読有り]
    研究論文(学術雑誌)

■ MISC
  • 第69 回国際食肉科学技術会議(ICoMST2023)に出席して
    上田 修司, 坂田 亮一, 江草 愛, 和賀 正洋, 若松 純一, 岩﨑 智仁, オークル ガムゼ, 長澤 麻央, 有原 圭三
    2023年11月, 食肉の科学, 第64巻(第2号) (第2号)
    会議報告等

  • 畜産物の品質評価、付加価値の向上に向けたメタボロミクス技術の応用に関する研究
    上田 修司
    2023年11月, 六篠会報, 日本語
    [招待有り]
    記事・総説・解説・論説等(大学・研究所紀要)

  • 産官学連携による神戸ビーフの美味しさの研究取り組みの紹介
    北村 千晶, 上田, 修司
    2023年03月, 畜産兵庫・公益社団法人兵庫県畜産協会, (7) (7), 日本語
    [査読有り][招待有り]
    記事・総説・解説・論説等(商業誌、新聞、ウェブメディア)

  • 筋細胞の小胞体ストレス応答におけるHSPB5の結合分子の探索と機能解析
    西原萌華, 上田修司, 吉野健一, 吉野健一, 竹内敦子, 山之上稔, 白井康仁
    2020年, 日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 512th

  • 低親和性ビオチン結合タンパク質Tamavidinを用いた新規ペプチド捕捉型BioID法の開発
    吉野健一, 吉野健一, 西原萌華, 上田修司, 竹内敦子
    2019年, 日本組織細胞化学会総会・学術集会講演プログラム・予稿集, 60th

  • BioID法を用いたHSPB5の新規相互作用分子の探索
    西原萌華, 上田修司, 吉野健一, 吉野健一, 竹内敦子, 山之上稔, 白井康仁
    2019年, 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 42nd

  • ジアシルグリセロールキナーゼαの新規結合分子の探索
    木本裕子, 渡辺真以, 上田修司, 吉野健一, 山之上稔, 白井康仁
    2019年, 日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 507th

  • Tamavidin-REVを用いたタンパク質間相互作用の網羅的解析
    上田修司, 吉野健一, 山田聡一郎
    2018年01月, 和光純薬時報, 86(1) (1), 6 - 7, 日本語
    [招待有り]
    記事・総説・解説・論説等(その他)

  • 黒毛和牛の魅力創出技術セミナーの開催報告
    上田 修司, 山之上 稔
    日本食肉研究会, 2017年06月, 食肉の科学, 58(1) (1), 49 - 52, 日本語
    会議報告等

  • リチウムによるDGKβKOマウスの記憶及び感情障害の改善には、PIP2の減少とPKCβの活性抑制が関与している
    沖本 航, 中井 寛子, 石坂 光絵, 中西 広樹, 森口 茂樹, 上田 修司, 山之上 稔, 福永 浩司, 佐々木 雄彦, 原 英彰, 白井 康仁
    ジアシルグリセロールキナーゼ(DGK)は、DGをリン酸化し、ホスファチジン酸(PA)に変換する酵素である。DGはPKCの活性化剤であり、PAもmTORなどを活性化することから、DGKは生体内で重要な働きをしていると考えられている。例えば、神経系に多く発現しているDGKβをノックアウト(KO)すると、シナプスや神経突起の形態に異常をきたし、記憶及び感情障害を呈する。また、この記憶及び感情障害はリチウムの経口投与で改善する。しかし、その分子機構は未だ不明である。そこで、リチウムによる記憶及び感情障害改善機構の解明を目的に以下の実験を行った。リチウム処置後のDGKβKOマウスの大脳皮質におけるスパイン密度を調べたところ、野生型レベルまで改善されていた。このときの、大脳皮質のリン脂質量を質量分析で解析したところ、PA量はあまり変動せず、PIP2が有意に減少していることが明らかになった。また、大脳皮質におけるPKC活性を調べたところ、DGKβKOマウスではPKCγの活性が野生型に比べて亢進しており、リチウム処置で正常化することが明らかになった。さらに、DGKβKOマウスから調製した大脳皮質初代培養細胞の形態異常は、リチウム処置及びPKCγの阻害で改善した。以上のことから、リチウムによるDGKβKOマウスの記憶及び感情障害の改善には、PIP2の減少と、これに続くPKCγの活性抑制によるスパイン密度の改善が重要であることが明らかになった。(著者抄録)
    日本脂質生化学会, 2016年05月, 脂質生化学研究, 58, 229 - 233, 日本語

  • 多成分一斉解析技術による黒毛和種牛肉の食品成分の検討
    上田修司, 岩本英治, 正木達規, 谷元哲則, 渡代勝之, 白井康仁, 山之上稔
    2016年, 日本畜産学会大会講演要旨, 121st

  • Screening of novel diacylglycerol kinase alpha (DGK alpha) activator to develop drugs improving diabetic nephropathy
    Hayashi Daiki, Liu Ka, Ueda Shuji, Yamanoue Minoru, Sakane Fumio, Shirai Yasuhito
    2015年07月, JOURNAL OF PHARMACOLOGICAL SCIENCES, 128(3) (3), S102
    [査読有り]

  • ジアシルグリセロールキナーゼαの218番目のチロシンリン酸化はドメイン間相互作用と高次構造を変化させる
    脇阪昌明, 岩下智秋, 濱田大三, 濱田大三, 祇園景子, 上田修司, 山之上稔, 鶴田宏樹, 白井康仁
    2015年, 日本生化学会大会(Web), 88th

  • チロシンリン酸化がジアシルグリセロールキナーゼαのドメイン間相互作用及び高次構造に与える影響
    脇阪昌明, 岩下智秋, 濱田大三, 濱田大三, 祇園景子, 上田修司, 山之上稔, 鶴田宏樹, 白井康仁
    2015年, 日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 492nd

  • mTOR is involved in both kinase activity-dependent and -independent pathways of DGK beta-regulated neurite and branch induction
    Takuya Kano, Hiroko Nakai, Akio Nakashima, Ushio Kikkawa, Naoaki Saito, Nobuyuki Takei, Shuji Ueda, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    JAPANESE PHARMACOLOGICAL SOC, 2014年, JOURNAL OF PHARMACOLOGICAL SCIENCES, 124, 100P - 100P, 英語
    研究発表ペーパー・要旨(国際会議)

  • ジアシルグリセロールキナーゼβによる特徴的な神経突起伸にはcPKCも関与する
    中井 寛子, 加野 拓也, 上田 修司, 山之上 稔, 斎藤 尚亮, 白井 康仁
    2013年05月28日, 脂質生化学研究, 55, 44 - 47, 日本語

  • Involvement of mTOR in diacylglycerol kinase beta (DGK beta)-induced neurite blanching and spine formation
    H. Nakai, N. Takei, A. Nakashima, U. Kikkawa, N. Saito, S. Ueda, M. Yamanoue, Y. Shirai
    WILEY-BLACKWELL, 2012年09月, FEBS JOURNAL, 279, 383 - 384, 英語
    研究発表ペーパー・要旨(国際会議)

  • ジアシルグリセロールキナーゼβによる特徴的な神経突起伸にはmTORが関与する
    白井 康仁, 中井 寛子, 中西 広樹, 中嶋 昭雄, 吉川 潮, 上田 修司, 山之上 稔, 斎藤 尚亮
    2012年05月28日, 脂質生化学研究, 54, 98 - 100, 日本語

  • 食肉の熟成と筋漿中の筋漿中のコネクチン断片増加
    上田 修司, 山之上 稔
    日本食肉研究会, 2011年06月, 食肉の科学, 52(1) (1), 120 - 123, 日本語
    [招待有り]
    会議報告等

  • Katsuaki Ieguchi, Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    The Rho family of GTPases has been implicated in the regulation of intracellular vesicle trafficking. Here, we investigated the mechanism underlying the negative regulation of clathrin-mediated endocytosis of cell surface receptors mediated by the Rho family protein Rac1. Contrary to previous reports, only the activated mutant of Rac1, but not other Rho family members including RhoA and Cdc42, suppressed internalization of the transferrin receptor. On the other hand, down-regulation of Rac1 expression by RNA interference resulted in enhanced receptor internalization, suggesting that endogenous Rac1 in fact functions as a negative regulator. We identified a guanine nucleotide exchange factor splice variant designated Ost-III, which contains a unique C-terminal region including an Src homology 3 domain, as a regulator of Rac1 involved in the inhibition of receptor endocytosis. In contrast, other splice variants Ost-I and Ost-II exerted virtually no effect on receptor endocytosis. We also examined subcellular localization of synaptojanin 2, a putative Rac1 effector implicated in negative regulation of receptor endocytosis. Each Ost splice variant induced distinct subcellular localization of synaptojanin 2, depending on Rac1 activation. Furthermore, we isolated gamma-aminobutyric acid type A receptor-associated protein ( GABARAP) as a protein that binds to the C-terminal region of Ost-III. When ectopically expressed, GABARAP was co-localized with Ost-III and potently suppressed the Ost-III-dependent Rac1 activation and the inhibition of receptor endocytosis. Lipid modification of GABARAP was necessary for the suppression of Ost-III. These results are discussed in terms of subcellular region-specific regulation of the Rac1-dependent signaling pathway that negatively regulates clathrin-mediated endocytosis.
    AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC, 2007年08月, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 282(32) (32), 23296 - 23305, 英語

  • 熟成中の食肉軟化を誘起する筋原線維タンパク質パラトロポミオシンの局在と遊離について
    山之上 稔, 費 莎, 上田 修司
    日本食肉研究会, 2000年06月30日, 食肉の科学, 41(1) (1), 102 - 105, 日本語

■ 書籍等出版物
  • 黒毛和種牛肉を取り巻く環境。神戸ビーフをおいしくする魔法の成分!?
    畜産技術ひょうご, 2025年02月

  • 神戸ビーフの魅力を引き立てる!赤身肉と相性の良い薬味とは!?
    上田修司
    畜産兵庫・兵庫県畜産協会, 2024年08月

  • 次世代シーケンス技術を活用した黒毛和種の筋内脂肪形成と香りに関する研究
    上田修司
    関西畜産学会報・関西畜産学会, 2024年05月

  • 黒毛和種牛肉の輸出課題に向けた科学的なデータの集積 ― 日越の新たなパートナーシップに向けた取り組み
    上田修司
    機関誌ベトナム・公益社団法人ベトナム協会, 2024年03月

  • 牛肉輸出による国内枝肉卸売価格および生産量の下支え効果の推定
    八木浩平, 岡本泰生, 上田修司
    食肉四季報, 2024年03月

  • 産官学連携による神戸ビーフの美味しさの研究取り組みの紹介
    上田修司
    畜産兵庫・兵庫県畜産協会, 2024年02月

  • 畜産物の品質評価、付加価値の向上に向けたメタボロミクス技術の応用に関する研究
    上田修司
    単著, 食肉の科学 第64巻 第1号・日本食肉科学会, 2023年06月

  • 「総説」黒毛和種牛肉の輸出課題に向けた科学的なデータの集積
    上田 修司
    単著, 機関誌ベトナム・公益社団法人ベトナム協会, 2023年03月

  • 畜産物の品質評価、付加価値の向上に向けたメタボロミクス技術の応用に関する研究
    上田修司
    六篠会報 ・神戸大学農学部同窓会, 2023年

  • 「総説」科学的なデータに基づく日本産の黒毛和種牛肉の特性 ― 日越企業のパートナーシップの促進に向けた取り組み紹介 ―
    上田 修司
    機関誌ベトナム・公益社団法人ベトナム協会, 2022年03月

  • 和牛の魅力の科学的な情報発信の重要性について
    上田修司
    単著, 畜産コンサルタント・公益社団法人中央畜産会, 2021年07月

  • 「総説」黒毛和種牛肉の特徴的な脂質・香りの解析 ― ベトナム市場への動物性食品の輸出促進を目指して ―
    上田修司
    機関誌ベトナム・公益社団法人ベトナム協会, 2021年03月

  • 畜産物資源の有効活用向けたメタボロミクス技術の開発
    上田修司
    アグリバイオ ・北隆館, 2019年11月

  • 健康食品成分の探索に向けたBirA酵素標識法の応用
    上田 修司
    単著, アグリバイオ (北隆館), 2018年10月, 日本語
    学術書

  • 上田 修司, 吉野 健一, 山田 聡一郎
    共著, 和光純薬時報 (発行:和光純薬工業株式会社), 2018年04月, 日本語, 近年、生命現象を解明する糸口として、生体内のタンパク質間の相互作用を包括的に同定・定量するインタラクトーム解析が一つの潮流になっている。現在、タンパク質の相互作用の検出を容易にする方法として、BioID法、チラミド化合物法、アスコルビン酸ペルオキシダーゼ法などの酵素標識技術が実用化されている。本稿では、我々が実施しているBioID技術について紹介する。
    一般書・啓蒙書

  • 動物性食品の適塩普及に向けた塩味増強ペプチドの効果的な探索
    上田 修司, 山之上 稔
    単著, 公益財団法人ソルト・サイエンス研究財団, 2017年07月, 日本語, 牛肉に含まれるジペプチドについて、液体クロマトグラフィー質量分析計による網羅的な解析の結果、332ピークを検出し、多変量解析より黒毛和種牛肉により多く含まれる複数のジペプチドを推定した。また、部位別の食味アンケート調査より、牛肉のラム芯 (臀筋) で塩味が最も強く認識されることが示された。動物性食品に伴う塩分摂取を配慮する上で、塩味成分と部位に関する有用な情報を得ることができた。
    学術書

  • 上田 修司
    単著, 全国食肉事業協同組合連合会, 2016年03月, 日本語
    調査報告書


  • 上田 修司
    単著, 兵庫県, 2015年04月, 日本語
    調査報告書

■ 講演・口頭発表等
  • Application of Mass Spectrometry for Determining the Geographic Production Area of Wagyu Beef
    Shuji Ueda, Chiaki Kitamura, Mana Hosoda, Itsuko Fukuda, Yasuhito Shirai
    Boston Convention & Exhibition Center, 2023年12月, 英語
    ポスター発表

  • 黒毛和牛の筋内脂肪形成における細胞内微小環境について
    Ueda Shuji, Kitamura Chiaki, Hosoda Mana, Yamanoue Minoru, Fukuda Itsuko, Shirai Yasuhito
    Padova congress, 2023年08月, 英語
    [招待有り]
    シンポジウム・ワークショップパネル(指名)

  • Application of Mass Spectrometry for Determining the Geographic Production Area of Wagyu Beef
    Ueda Shuji, Gotou Yunosuke, Takashima Yasuharu, Suzuki Takeshi Kitamura, Chiaki, Fukuda Itsuko, Shirai Yasuhito
    Padova congress, 2023年08月, 英語
    ポスター発表

  • 畜産物の品質評価、付加価値の向上に向けたメタボロミクス技術の応用に関する研究
    上田 修司
    日本食肉科学会, 2023年03月
    [招待有り]
    口頭発表(招待・特別)

  • 筋線維芽細胞の力伝達における低分子量ヒートショック蛋白質HSPB1の機能解析
    福島国光, 上田修司, 福田伊津子, 白井康仁
    第95回日本生化学会大会, 2022年11月
    ポスター発表

  • 低分子量ヒートショックタンパク質HSPB5による小胞体ストレス抑制メカニズムの解明
    火岡優希, 上田修司, 西原萌華, 福田伊津子, 白井康仁
    第95回日本生化学会大会, 2022年11月
    ポスター発表

  • Polo-like kinase 2 plays an essential role in cytoprotection in endoplasmic reticulum stress via phosphorylation of serine 19 in HSPB5
    Yuuki Hioka, Shuji Ueda, Moeka Nishihara, Ken-ichi Yoshino, Soichiro Yamada, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    The American Society for Cell Biology Cell Bio 2021 Virtual-an Online ASCB|EMBO Meeting, 2021年12月
    ポスター発表

  • Phosphorylation of HSPB1 regulates actin-myosin contraction in muscle cells via binding to the essential light chain.
    Kunimitu Fukushima, Ken-ichi Yoshino, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai, Shuji Ueda
    The American Society for Cell Biology Cell Bio 2021 Virtual-an Online ASCB|EMBO Meeting, 2021年12月
    ポスター発表

  • Small heat shock protein suppresses apoptosis caused by endoplasmic reticulum stress in L6 myocytes
    Yumeno Mitani, Shuji Ueda, Ken-ichi Yoshino, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    The American Society for Cell Biology Cell Bio 2020 Virtual-an Online ASCB|EMBO Meeting, 2020年12月
    口頭発表(一般)

  • DGKθ is involved in cell proliferation of mouse embryonic fibroblasts and affects fetal development.
    Kazuki Ito, Shuji Ueda, Nao Koizumi, Minoru Yamanoue, Yoshitaka Fujihara, Masahito Ikawa, Yasuhito Shirai
    The American Society for Cell Biology Cell Bio 2020 Virtual-an Online ASCB|EMBO Meeting, 2020年12月
    ポスター発表

  • Proteomic analysis of senescence-like morphology induced by DNA damage in NIH3T3 cells
    Aika Hara, Yoshino Ken-ichi, Atsuko Takeuchi, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai, Shuji Ueda
    The American Society for Cell Biology Cell Bio 2020 Virtual-an Online ASCB|EMBO Meeting, 2020年12月
    ポスター発表

  • 黒毛和種の筋肉に生じる微小な脂肪細胞分布に関する研究
    上田 修司, 井上 亜希子, 山之上 稔
    第60回日本食肉研究会60周年記念大会, 2019年03月, 日本語, 日本食肉研究会, 麻布大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 鶏骨格筋パラトロポミオシン構成サブユニットによる合成アクトミオシンATPase活性阻害
    吉田 寛志, 西尾 友理子, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第125回大会, 2019年03月, 日本語, 麻布大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Effects of adding FFAs on beef taste-traits analyzed by electronic taste sensing system and sensory evaluation
    趙 婭楠, 狄 寅禘, 上田 修司, 白井 康仁, 羽原 正秋, 池崎 秀和, 山之上 稔
    日本畜産学会第125回大会, 2019年03月, 英語, 麻布大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 讃岐牛・オリーブ牛の 低需要部位の魅力を引き出す取り組み
    上田 修司
    平成30年度「オリーブ牛」セミナー, 2019年02月, 日本語, 高松国際ホテル, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • オリーブ牛をモデルに用いた 国産牛肉の低需要部位の 部位別科学分析と、その訴求に向けた罐詰の試作の評価
    上田 修司
    国産食肉等新需要創出緊急対策事業に関わるオリーブ牛の低需要部位の特性等セミナー, 2019年02月, 日本語, 香川県社会福祉総合センター, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • 試食アンケートから見るオリーブ牛のおいしさについて
    上田 修司
    平成30年度「オリーブ牛」セミナー, 2019年01月, 日本語, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • Comparative metabolomics of skeletal muscle of livestock using gas chromatography–mass spectrometry
    上田 修司, 岩本 英治, 加藤 良毅, 篠原 正和, 白井 康仁, 山之上 稔
    The American Society for Cell Biology 2018 ASCB/IFCB Meeting, 2018年12月, 英語, San Diego conventional center (California), 国際会議
    ポスター発表

  • ノックアウトマウスを用いた皮膚の創傷治癒におけるDGKθの機能解析
    山口茉子, 上田 修司, 小泉奈緒, 伊藤和樹, 伊川正人, 山之上稔, 白井康仁
    第41回人分子生物学会年会ポスター発表, 2018年11月, 日本語, パシフィコ橫浜, 国内会議
    ポスター発表

  • 平成30年度黒毛和牛の魅力創出技術構築事業の紹介
    上田 修司
    平成30年度第2 回 黒毛和牛の魅力創出技術セミナー, 2018年09月, 日本語, 神戸大学瀧川記念学術交流会館, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • 鶏骨格筋由来の組換えパラトロポミオシンサブユニットがアクチン–ミオシン間の相互作用に及ぼす影響
    吉田 寛志, 西尾 友理子, 上田 修司, 山之上 稔
    第68回関西畜産学会香川大会, 2018年09月, 日本語, 香川大学農学部, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • RhoA結合蛋白質として同定されたSTE20 like kinaseの 筋細胞の肥大化における役割
    櫛谷 晃帆, 上田 修司, 前田愛実, 加藤良毅, 吉野健一, 竹内敦子, 山之上稔, 白井康仁
    第91回日本生化学会大会, 2018年09月, 日本語, 国立京都国際会館, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Effects of intramuscular FFAs on beef taste-traits analyzed by electronic taste sensing system and sensory evaluation
    趙 婭楠, 中田 悠介, 上田 修司, 白井 康仁, 市村 さやか, 吉田 由香, 羽原 正秋, 池崎 秀和, 山之上 稔
    The 64th ICoMST, 2018年08月, 英語, Melbourne, Australia, 国際会議
    ポスター発表

  • 平成30年度黒毛和牛の魅力創出技術構築事業の紹介
    上田 修司
    平成30年度第1 回 黒毛和牛の魅力創出技術セミナー, 2018年07月, 日本語, 神戸大学瀧川記念学術交流会館, 国内会議
    口頭発表(基調)

  • 味覚センサ分析および官能評価による牛肉呈味性への筋内脂肪の影響
    趙 婭楠, 中田悠介, 上田修司, 白井康仁, 市村 さやか, 吉田 由香, 羽原正秋, 池崎秀和, 山之上 稔
    第59回日本食肉研究会大会, 2018年03月, 日本語, 東京大学農学部, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成中の牛肉の筋内脂肪変化に影響される呈味性の味覚センサおよび官能評価による分析 (第2報)
    趙 婭楠, 中田悠介, 上田修司, 白井康仁, 市村 さやか, 吉田 由香, 羽原正秋, 池崎秀和, 山之上 稔
    日本畜産学会第124回大会, 2018年03月, 日本語, 東京大学農学部, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • ジアシルグリセロールキナーゼgammaを作用点とする分子標的機能性食品の開発に向けた研究
    倉橋 弘平, 菊永 佐紀子, 上田 修司, 山之上 稔, 白井 康仁
    日本農芸化学会関西支部第501回講演会, 2017年12月, 日本語, 神戸大学農学部, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Investigation of RhoA binding proteins using BioID system
    櫛谷 晃帆, 山田 聡一郎, 吉野 健一, 加藤 良毅, 竹内 敦子, Sabourin LA, Cybulsky AV, 山之上 稔, 白井 康仁, 上田 修司
    The American Society for Cell Biology 2017 ASCB/IFCB Meeting, 2017年12月, 英語, Philadelphia conventional center, Pennsylvania, 国際会議
    ポスター発表

  • HSPB1 protein increases actomyosin ATPase activity of myofibrils fraction
    加藤 良毅, 小鍛治 泰斗, 吉野 健一, 竹内 敦子, 山之上 稔, 白井 康仁, 上田 修司
    The American Society for Cell Biology 2017 ASCB/IFCB Meeting, 2017年12月, 英語, Philadelphia conventional center, Pennsylvania, 国際会議
    ポスター発表

  • 緑茶カテキン EGCg のメチル化による糖尿病性腎症改善効果の増強
    林 大輝, 上田 修司, 山之上 稔, 芦田 均, 白井 康仁
    日本農芸化学会 関西・中四国・西日本支部 2017年度合同大阪大会(第49回講演会), 2017年09月, 日本語, 堺, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成中の牛肉における筋内脂肪変化に影響される呈味性の味覚センサおよび官能評価による分析
    趙 婭楠, 中田悠介, 上田修司, 白井康仁, 羽原正秋, 池崎秀和, 山之上 稔
    日本畜産学会第123回大会, 2017年09月, 日本語, 信州大学伊那キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成および加熱牛肉の呈味物質変化と味覚センサによる呈味性分析
    中田悠介, 趙 婭楠, 上田修司, 鈴木 杏子, 岡 恵理子, 高岡 素子, 羽原正秋, 池崎秀和, 山之上 稔
    日本畜産学会第123回大会, 2017年09月, 日本語, 信州大学伊那キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 質量分析計による黒毛和種牛肉の栄養成分のノンターゲット分析による検討
    上田修司, 岩本英治, 白井康仁, 山之上 稔
    日本畜産学会第123回大会, 2017年09月, 日本語, 信州大学伊那キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 動物性食品の適塩普及に向けた 塩味増強ペプチドの効果的な探索
    上田 修司
    ソルト・サイエンス研究財団「第29回助成研究発表会」, 2017年07月, 日本語, ソルトサイエンス研究財団, 都市センターホテル, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 多角的な視点から讃岐牛・オリーブ牛の魅力を引き出す 科学分析を主体とした取り組み
    上田 修司
    平成29年度讃岐牛・オリーブ牛振興会総会, 2017年05月, 日本語, 高松社会福祉総合センター, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • 食肉の風味に寄与する香気成分分析法の確立
    岸本 徹, 上田 修司, 岩本 英治
    日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 神戸大学鶴甲第1キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成中の食肉軟化に寄与するパラトロポミオシンを構成するサブユニットの塩基配列解析
    西尾 友理子, 上田 修司, 前田 尚之, 服部 昭仁, 山之上 稔
    日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 日本畜産学会, 神戸大学(兵庫県神戸市), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 種々の牛肉サンプルの味覚センサーおよび官能評価による呈味性分析
    趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田 修司, 羽原 正秋, 池崎 秀和, 山之上 稔
    日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 日本畜産学会, 神戸大学(兵庫県神戸市), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 黒毛和種牛肉の赤身部位の各種分析技術の検討
    上田 修司, 岩本 英治, 吉田 和利, 篠原 正和, 中田 悠介, 高杉 瑠美, 岩本 英樹, 野村 郁代, 小川 隆文, 白井 康仁, 山之上 稔
    日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 神戸大学鶴甲第1キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 黒毛和種牛肉の香成分における産地別特徴
    岩本 英治, 岸本 徹, 上田 修司
    日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 神戸大学鶴甲第1キャンパス, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 牛肉の美味しさとオリーブ牛の官能検査評価について
    上田 修司
    「オリーブ牛」ブランド化に係る事業成果報告会, 2017年01月, 日本語, 平成28年度地域コンソーシアム支援事業, JRホテルクレメント高松, 国内会議
    [招待有り]
    口頭発表(招待・特別)

  • 皮膚におけるジアシルグリセロールキナーゼγの機能解析
    菊永佐紀子, 横谷美由希, 藤原祥高, 上田修司, 山之上 稔, 高岡幸二, 伊川正人, 白井康仁
    日本農芸化学会関西支部例会 第497回講演会, 2016年12月, 日本語, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Identification of novel RhoA binding proteins by using BioID system
    櫛谷 晃帆, 加藤 良毅, Soichiro Yamada, 吉野 健一, 竹内 敦子, 山之上 稔, 白井 康仁, 上田 修司
    The American Society for Cell Biology 2016 ASCB/IFCB Meeting, 2016年12月, 英語, Moscone Center San Francisco, California, 国際会議
    ポスター発表

  • Identification of novel HSPB1 binding proteins in skeletal muscle
    加藤 良毅, 小鍛治 泰斗, 櫛谷 晃帆, 吉野 健一, 竹内 敦子, 山之上 稔, 白井 康仁, 上田 修司
    The American Society for Cell Biology 2016 ASCB/IFCB Meeting, 2016年12月, 英語, Moscone Center San Francisco, California, 国際会議
    ポスター発表

  • BioID法を用いた低分子量G蛋白質RhoAの結合蛋白質の探索
    櫛谷晃帆, 上田 修司, 加藤良毅, 吉野健一, 竹内敦子, 山之上稔, 白井康仁
    第39回日本分子生物学会年会, 2016年12月, 日本語, パシフィコ横浜 展示ホール, 国内会議
    ポスター発表

  • 熟成による黒毛和種およびホルスタイン種牛肉汁中の呈味物質量の変化
    中田 悠介, 趙 婭楠, 西田 昌弘, 井上 朋香, 上田 修司, 岡 恵理子, 高岡 素子, 山之上 稔
    第66回関西畜産学会大会, 2016年10月, 日本語, 関西畜産学会, 香川大学(香川県高松市), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 骨格筋におけるHSPB1結合蛋白質の探索と
    小鍛冶 泰斗, 加藤 良毅, 櫛谷 晃帆, 吉野 健一, 竹内 敦子, 上田 修司, 山之上 稔, 白井 康仁
    日本農芸化学会平成28年度関西支部大会, 2016年09月, 日本語, 滋賀県立大学(滋賀県彦根市八坂町2500), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Effects of intramuscular FFAs on taste-traits of Japanese Black Wagyu beef
    趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦, 山之上 稔
    62nd International Congress of Meat Science and Technology, 2016年08月, 英語, Organizing Committee of 62nd ICoMST, Swissotel Le Concorde Bangkok (Bangkok, Thailand), 国際会議
    口頭発表(一般)

  • Difference between a myofibrillar protein paratropomyosin and tropomyosin based on their primary structure
    西尾 友理子, 牛村 友一, 上田 修司, 前田 尚之, 服部 昭仁, 山之上 稔
    17th AAAP Animal Science Congress, 2016年08月, 英語, Japanese Society of Animal Science, Kyushu Sangyo University (Fukuoka, Japan), 国際会議
    ポスター発表

  • Detection of the connectin/titin 20-kDa fragment increased in chicken sarcoplasm during postmortem aging
    仲 梓沙, 丸山 聖也, 中間 みなみ, 上田 修司, 山之上 稔
    17th AAAP Animal Science Congress, 2016年08月, 英語, Japanese Society of Animal Science, Kyushu Sankyo University (Fukuoka, Japan), 国際会議
    ポスター発表

  • Beef taste-traits assessed by an electronic taste sensing system
    趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田 修司, 羽原 正秋, 池崎 秀和, 山之上 稔
    17th AAAP Animal Science Congress, 2016年08月, 英語, Japanese Society of Animal Science, Kyushu Sangyo University (Fukuoka, Japan), 国際会議
    ポスター発表

  • 筋肉の増加減退に関わるRhoAの機能解析と相互作用分子の探索
    櫛谷 晃帆, 上田 修司, 加藤 良毅, 桐村 悠佑, 石政 碧, 吉野 健一, 竹内 敦子, 山之上 稔, 白井 康仁
    第63回日本生化学会近畿支部例会, 2016年05月, 日本語, 神戸薬科大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成中の牛肉におけるリパーゼ活性の変化
    趙 婭楠, 西田 昌弘, 中田 悠介, 上田修司, 井原一高, 豊田淨彦, 山之上 稔
    日本畜産学会第121回大会, 2016年03月, 日本語, 日本獣医生命科学大学(東京都), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成による牛肉の脂肪および呈味性の変化
    山之上 稔, 趙 婭楠, 西田昌弘, 上田修司, 井原一高, 豊田淨彦
    第57回日本食肉研究会大会, 2016年03月, 日本語, 日本獣医生命科学大学(東京都), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 骨格筋コネクチン断片の組換えタンパク質とモノクローナル抗体の結合について
    仲 梓沙, 中間 みなみ, 上田 修司, 山之上 稔
    若手フロンティア2015, 2015年12月, 日本語, 神戸大学百年記念館, 国内会議
    ポスター発表

  • Insulin-like growth factor-1 induces activation and upregulating of via PI3K/Akt/mTOR pathway in muscular hypertrophy model of C2C12 cells
    櫛谷 晃帆, 上田 修司, 桐村 悠介, 加藤 良毅, 石政 碧, 佐藤 孝哉, 山之上 稔, 白井 康仁
    American Society of Cell Biology, 2015年12月, 英語, San Diego USA, 国際会議
    ポスター発表

  • Force dependent biotinylation of myosin IIA by α-catenin tagged with a Promiscuous Biotin Ligase
    UEDA SHUJI, Alexandra M. Blee, Katherine G. Macway, Derrick J. Renner, Soichiro Yamada
    The American Society for Cell Biology, 2015年12月, 英語, San Diego USA, 国際会議
    ポスター発表

  • 和牛の新たな魅力の創出に向けた科学的な取り組み
    上田 修司
    全国会長会議, 2015年11月, 日本語, 全国食肉事業協同組合連合会, ANAクラウンプラザ神戸, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • Functional analysis of diacylglycerol kinase theta deficient mice
    上田 修司, 小泉 奈緒, 山之上 稔, 伊川 正人, 白井 康仁
    19th International Conference of FFC - 7th International Symposium of ASFFBC, 2015年11月, 英語, Kobe University, 国際会議
    ポスター発表

  • Diacylglycerol kinase as target of functional food to prevent and improve diabetic renal dysfunction
    HAYASHI Daiki, Yagi Keiko, UEDA Shuji, YAMANOUE Minoru, ASHIDA Hitoshi, EMOTO Noriaki, SAITO Naoaki, SHIRAI Yasuhito
    19th International Conference of Functional Foods, Bioactive Compounds and Biomarkers: Longevity and Quality of life, 2015年11月, 英語, 神戸, 国際会議
    ポスター発表

  • 神戸大学大学院農学研究科における食肉科学教育
    山之上 稔, 上田修司
    食肉科学研究会主催懇話会, 2015年09月, 日本語, 北海道大学アグリフードセンター, 国内会議
    公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等

  • 熟成中の食肉軟化に寄与するパラトロポミオシンは同程度の質量の2サブユニットで構成されている
    西尾友理子, 山之上 稔, 牛村友一, 上田修司, 前田尚之, 服部昭仁
    日本畜産学会第120回大会, 2015年09月, 日本語, 酪農大学(江別市), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 種々の牛肉サンプルの味覚センサーによる客観的呈味性分析について
    趙 婭楠, 西田昌弘, 中田悠介, 上田修司, 羽原正秋, 池崎秀和, 山之上 稔
    平成27年度(第65回)関西畜産学会大会, 2015年09月, 日本語, 愛媛大農学部(松山市), 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成中の牛肉筋漿における筋原線維Z線近傍コネクチン断片のELISA法による定量
    山之上 稔, 丸山 聖也, 上田 修司, 白井 康仁, 佐々木 加奈
    第119回日本畜産学会大会, 2015年03月, 日本語, 日本畜産学会, 宇都宮大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Expression analysis of diacylglycerol kinase theta in mouse tissues by immunostaining and LacZ reporter assay
    UEDA SHUJI, Nao Koizumi, Minoru Yamanoue, Yasuhito Shirai
    第88回日本薬理学会, 2015年03月, 日本語, 名古屋国際会議場, Diacylglycerol kinase (DGK) regulates diacylglycerol signaling, which controls the variety of cell function. DGKθ belongs to the sole member of type V DGK. Several in vitro studies have suggested important role of DGKθ, but the physiological role of the enzyme is still unclear. In this study, to reveal the spatial expression of DGKθ, we performed the immunostaining on paraffin, 国内会議
    ポスター発表

  • Effects of storage and cooking on free fatty acid in Japanese Black Wagyu beef broth
    YAMANOUE MINORU, NISHIDA MASANORI, YAMATO SAYAKA, UEDA SYUJI, IHARA IKKO, TOYODA KIYOHIKO
    The 16th AAAP Animal Science Congress, 2014年11月, 英語, Gadjah Mada University, Indonesia, 国際会議
    ポスター発表

  • 筋細胞におけるHSPB1の結合分子の探索とその機能解析
    小鍛治 泰斗, 上田 修司, 吉野 健一, 山之上 稔, 白井 康仁
    第87回日本生化学会大会, 2014年10月, 日本語, (公社)日本生化学会, 国立京都国際会館, 国内会議
    ポスター発表

  • 熟成および加熱による黒毛和種牛およびホルスタイン種牛肉汁脂質の脂肪酸組成変化
    西田 昌弘, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦, 山之上 稔
    第64回関西畜産学会大会, 2014年09月, 日本語, 広島大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • ガレート型カテキンだけでなくビタミンEも67kDaラミニンレセプターを介してジアシルグリセロールキナーゼαを活性化する
    林 大輝, 芦田 均, 上田 修司, 山之上 稔, 白井 康仁
    2014年度日本農芸化学会関西支部大会 (第486回講演会), 2014年09月, 日本語, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Expression of diacylglycerol kinase theta during the organogenesis of mouse embryos
    UEDA Shuji, Tu-Sekine Becky, YAMANOUE Minoru, RABEN Daniel M, SHIRAI Yasuhito
    Lipid MAPS meeting, 2014年05月, 英語, LIPD MAPS, UCSD, 国際会議
    ポスター発表

  • 鶏筋原線維のプロテアーゼ分解によるコネクチン20-kDa断片の生成
    山之上 稔, 佐々木 和, 佐々木 加奈, 上田 修司, 白井 康仁
    第118回日本畜産学会大会, 2014年03月, 日本語, つくば国際会議場, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • カテキン類によるジアシルグリセロールキナーゼα活性化機構の解明
    林 大輝, 芦田 均, 上田 修司, 山之上 稔, 白井 康仁
    日本農芸化学会2014年度大会, 2014年03月, 日本語, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • カテキン類及びビタミンEは67kDaラミニンレセプターを介してジアシルグリセロールキナーゼαを活性化する (Chatechins and vitamin E activate diacylglycerol kinaseα through 67kDa laminin receptor)
    林 大輝, 芦田 均, 上田 修司, 山之上 稔, 白井 康仁
    第87回日本生化学会大会, 2014年, 日本語, 国内会議
    ポスター発表

  • クロマン環構造に着目した新規ジアシルグリセロールキナーゼα活性化剤の探索
    林 大輝, 芦田 均, 上田 修司, 山之上 稔, 齋藤 尚亮, 白井 康仁
    第124回日本薬理学会近畿部会, 2013年11月, 日本語, 日本薬理学会近畿部会, 京都ガーデンパレス, 国内会議
    ポスター発表

  • 胎性期におけるジアシルグリセロールキナーゼシータの発現解析
    UEDA Shuji, Tu-Sekine Becky, YAMANOUE Minoru, RABEN Daniel M, SHIRAI Yasuhito
    第86回日本生化学会大会, 2013年09月, 日本語, 日本生化学会, パシフィコ横浜, 国内会議
    ポスター発表

  • 熟成および加熱による黒毛和種牛肉汁中のトリアシルグリセロールおよび遊離脂肪酸の変化
    山之上 稔, 西田 昌弘, 大和 彩弥香, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦
    日本畜産学会第116回大会, 2013年09月, 日本語, 日本畜産学会, 新潟大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 熟成および加熱による黒毛和種牛肉汁の呈味性変化
    西田 昌弘, 大和 彩弥香, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦, 山之上 稔
    第63回関西畜産学会大会, 2013年09月, 日本語, 関西畜産学会, 滋賀県立大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • ジアシルグリセロールキナーゼβによる特徴的な神経突起伸長にはcPKCも関与する
    中井 寛子, 加野 拓也, 上田 修司, 山之上 稔, 斎藤 尚亮, 白井 康仁
    第55回日本脂質生化学会大会, 2013年06月, 日本語, 日本脂質生化学会, 宮城県松島町, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • The expression of diacylglycerol kinase theta during mouse embryonic development
    UEDA Shuji, Tu-Sekine Becky, YAMANOUE Minoru, RABEN Daniel M, SHIRAI Yasuhito
    The ASCB 2012 Annual meeting, 2012年12月, 英語, American Society for Cell Biology, Moscone Center, USA, 国際会議
    ポスター発表

  • DGKbetaによる神経突起伸張機構の解析
    加野 拓也, 上田 修司, 山之上 稔, 齋藤 尚亮, 白井 康仁
    第85回日本生化学会大会, 2012年12月, 日本語, 日本生化学会, 福岡国際会議場, 国内会議
    ポスター発表

  • Effects of Postmortem Aging and Cooking Procedures on Intramuscular Fat and Fatty Acid Composition in Japanese Black Wagyu Beef
    YAMANOUE Minoru, YANO Keiko, HISANO Emi, UEDA Shuji, IHARA Ikko, TOYODA Kiyohiko
    The 15th AAAP Animal Science Congress, 2012年11月, 英語, Thai Society of Animal Science, Thammasat University, Thailand, 国際会議
    ポスター発表

  • 熟成中の食肉軟化に寄与するパラトロポミオシンと調節タンパク質トロポミオシンのHPLCによる分離
    牛村 友一, 大下 恵実, 上田 修司, 山之上 稔
    第62回関西畜産学会大会, 2012年09月, 日本語, 関西畜産学会, 和歌山市, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Molecular mechanism of DGKβ- mediated neurite blanching and spine formation
    NAKAI Hiroko, TAKEI Nobuyuki, NAKASHIMA Akio, KIKKAWA USHIO, SAITO Naoaki, UEDA Shuji, YAMANOUE Minoru, SHIRAI Yasuhito
    第35回日本神経科学大会, 2012年09月, 日本語, 日本神経科学会, 名古屋国際会議場, 国内会議
    ポスター発表

  • Involvement of mTOR in Diacylglycerol kinase β (DGKβ)-induced neurite branching and spine formation.
    NAKAI Hiroko, NAKASHIMA Akio, KIKKAWA USHIO, SAITO Naoaki, TAKEI Nobuyuki, UEDA Shuji, YAMANOUE Minoru, SHIRAI Yasuhito
    The 22nd IUBMB & the 37th FEBS, 2012年09月, 英語, IUBMB & FEBS, Sevilla, Spain, 国際会議
    ポスター発表

  • Analysis of tissue distribution of diacylglycerol kinase theta
    UEDA Shuji, KIRIMURA Yuji, YAMANOUE Minoru, SHIRAI Yasuhito
    The 14th International Congress of Histochemistry and Cytochemistry, 2012年08月, 英語, International Federation of Societies for Histochemistry and Cytochemisty, Kyoto International Conference Center, 国際会議
    ポスター発表

  • ジアシルグリセロールキナーゼ_による特徴的な神経突起伸にはmTORが関与する
    白井 康仁, 中井 寛子, 中西 広樹, 中嶋 昭雄, 吉川 潮, 上田 修司, 山之上 稔, 斎藤 尚亮
    第54回日本脂質生化学会大会, 2012年06月, 日本語, 日本脂質生化学会, 九州大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 鶏肉の熟成に伴う筋漿中のコネクチン20-kDa断片増加量と筋原線維小片化の関連
    上田 修司, 小川 侑璃子, 大西 一政, 山之上 稔
    日本畜産学会第115回大会, 2012年03月, 日本語, 日本畜産学会, 名古屋大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • ジアシルグリセロールキナーゼθの機能解析
    上田 修司, 桐村 悠佑, 山之上 稔, 白井 康仁
    日本農芸化学会2012年度大会, 2012年03月, 日本語, 日本農芸化学会, 京都女子大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 筋肉細胞におけるEGCgの糖代謝に及ぼす影響について
    上田 学UEDA Manabu, 上田 修司, 白井 康仁, 芦田 均
    日本農芸化学会2012年度大会, 2012年, 日本語, 京都, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 鶏サルコメアA-I接合部におけるコネクチンとトロポミオシンの結合検証について
    大下 恵実, 福田 崇, 上田 修司, 山之上 稔
    第61回関西畜産学会大会, 2011年09月, 日本語, 関西畜産学会, 岡山大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Changes in free fatty acids of Wagyu beef during post-mortem aging and cooking, and its palatability
    YAMANOUE Minoru, YANO Keiko, HISANO Emi, UEDA Shuji, IHARA Ikko, TOYODA Kiyohiko
    The 9th Pangborn Sensory Science Symposium, 2011年09月, 英語, ELSEVIER, Toronto, Canada, 国際会議
    ポスター発表

  • 熟成および加熱による牛筋内脂肪の遊離脂肪酸量と脂肪酸組成の変化
    矢野 恵子, 久野 絵美, 井原 一高, 豊田 淨彦, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第114回大会, 2011年08月, 日本語, 日本畜産学会, 北里大学, 国内会議
    ポスター発表

  • Characterization of antibodies against the connectin/titin 20-kDa fragment increased in chicken sarcoplasm during postmortem aging
    YAMANOUE Minoru, UEDA Shuji, MATSUNAGA Kenichi, OHNISHI Kazumasa, SHIOYAMA Natsuko
    The 57th International Congress of Meat Science and Technology, 2011年08月, 英語, Association of the Belgian Meat Products Industry, Ghent, Belgium, 国際会議
    ポスター発表

  • 熟成に伴う牛肉脂肪中の遊離脂肪酸量および組成の変化
    矢野 恵子, 久野 絵美, 上田 修司, 井原 一高, 豊田 淨彦, 山之上 稔
    第60回関西畜産学会大会, 2010年09月, 日本語, 関西畜産学会, 京都大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Expression and antibody production of connectin fragment increased in sarcoplasm during postmortem aging of chicken muscle
    YAMANOUE Minoru, KUBO Takashi, MATSUNAGA Kenichi, UEDA Shuji, TAKAGI Michihiro
    The 56th International Congress of Meat Science and Technology, 2010年08月, 英語, Korean Society for Food Science and Animal Resources/ National Society of Animal Science, Jeju, Korea, 国際会議
    ポスター発表

  • 熟成に伴う豚肉筋漿中のタンパク質変化
    施 恭平, 橋本 真季, 塩山 奈都子, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第112回大会, 2010年03月, 日本語, 日本畜産学会, 明治大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 鶏サルコメアA-I接合部に及ぶコネクチンI帯末端領域構成ドメインの微生物発現
    福田 崇, 大下 恵実, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第112回大会, 2010年03月, 日本語, 日本畜産学会, 明治大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Regulation of mitotic spindle formation by the RhoA guanine nucleotide exchange factor ARHGEF10
    上田修司, 片岡徹, 佐藤孝哉
    第32回日本分子生物学会年会, 2009年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 横浜, 国内会議
    ポスター発表

  • マウス胎生期の血管形成におけるRA-GEF-1の機能解析
    佐藤孝哉, 上田修司, Shymaa E Bilasy, 平島正則, 片岡徹
    第82回日本生化学会大会, 2009年10月, 日本語, 日本生化学会, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • 背側終脳特異的RA-GEF-1ノックアウトマウスは大脳皮質ヘテロピアと交連線維系の欠損を示す
    寺島俊雄, Bilasy S E, 佐藤孝哉, 上田修司, 饗場篤, 片岡徹
    第32回 日本神経科学大会, 2009年09月, 日本語, 日本神経科学会, 名古屋, 国内会議
    ポスター発表

  • 背側終脳特異的RA-GEF-1ノックアウトマウスは大脳皮質ヘテロトピアと交連線維系の欠損を示す
    寺島俊雄, Shymaa E Bilasy, 佐藤孝哉, 上田修司, 饗場篤, 片岡徹
    第32回日本神経科学大会, 2009年09月, 日本語, 日本神経科学学会, 名古屋, 国内会議
    ポスター発表

  • 鶏筋原線維Z線近傍でコネクチンに結合するモノクローナル抗体のエピトープ決定
    塩山 奈都子, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第111回大会, 2009年09月, 日本語, 日本畜産学会, 琉球大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 豚肉の熟成に伴う筋原線維Z線近傍コネクチンの変化
    施 恭平, 橋本 真季, 上田 修司, 山之上 稔
    第59回関西畜産学会大会, 2009年08月, 日本語, 関西畜産学会, 鳥取大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Role of the small GTPase Rac1 in insulin-dependent glucose uptake in skeletal muscle cells.
    上田修司, 田守義和, 饗場篤, 片岡徹, 佐藤孝哉
    神戸大学グローバルCOEプログラム「統合的膜生物学の国際教育研究拠点」 第3回ワークショップ, 2009年07月, 英語, 神戸大学/グローバルCOE, 淡路, 国際会議
    ポスター発表

  • Impaired vascular network formation in mice lacking the Rap1 guanine nucleotide exchange factor RA-GEF-1.
    佐藤孝哉, Shymaa E Bilasy, 上田修司, 平島正則, 片岡徹
    神戸大学グローバルCOEプログラム「統合的膜生物学の国際教育研究拠点」 第3回ワークショップ, 2009年07月, 英語, 神戸大学/グローバルCOE, 淡路, 国際会議
    ポスター発表

  • Dorsal telencephalon-specific RA-GEF-1 knockout mice develop heterotopic cortical mass and commissural fiber defect.
    Shymaa E Bilasy, 佐藤孝哉, 上田修司, 饗場篤, 寺島俊雄, 片岡徹
    神戸大学グローバルCOEプログラム「統合的膜生物学の国際教育研究拠点」 第3回ワークショップ, 2009年07月, 英語, 神戸大学/グローバルCOE, 淡路, 国際会議
    ポスター発表

  • 鶏筋原線維Z線近傍コネクチン領域に対するモノクローナル抗体作製
    塩山 奈都子, 上田 修司, 山之上 稔
    日本畜産学会第110回大会, 2009年03月, 日本語, 日本畜産学会, 日本大学, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 骨格筋でのインスリン依存性糖取り込みにおけるRac1の機能解析
    上田修司, 片岡徹, 佐藤孝哉
    BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会), 2008年12月, 日本語, 日本分子生物学会/日本生化学会, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • The Rap1 guanine nucleotide exchange factor RA-GEF-1 is essential for mouse brain development.
    Shymaa E Bilasy, Takaya Satoh, Shuji Ueda, Atsu Aiba, Toshio Terashima, Tohru Kataoka
    BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会), 2008年12月, 英語, 日本分子生物学会/日本生化学会, 神戸, 国内会議
    その他

  • Dblファミリーグアニンヌクレオチド交換因子KIAA0294によるGTP結合蛋白質RhoAを介する中心体複製の制御.
    上田修司, 片岡徹, 佐藤孝哉
    BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会), 2008年12月, 日本語, 日本分子生物学会/日本生化学会, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • Functional analysis of Rap1 guanine nucleotide exchange factors RA-GEF-1 and RA-GEF-2
    Shuji Ueda, Yoko Yoshikawa, Takaya Satoh
    第3回グローバルCOE研究討論会 兼グローバルCOE第2回ワークショップ, 2008年07月, 日本語, グローバルCOE, 淡路, 国内会議
    ポスター発表

  • 筋細胞のインスリンシグナル伝達におけるRac1の機能解析
    上田 修司, 饗場 篤, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第80回日本生化学会大会・第30回日本分子生物学会年会合同大会, 2007年12月, 日本語, 日本生化学会,日本分子生物学会, 横浜, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 and its guanine nucleotide exchange factor Ost in negative regulation of receptor endocytosis
    Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    46th Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, 2006年12月, 英語, Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, サンディエゴ, 国際会議
    ポスター発表

  • 癌細胞における低分子量GTPaseの活性化の解析技術の開発
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    日本癌学会 学術総会, 2006年09月, 日本語, 横浜, 国内会議
    ポスター発表

  • 癌細胞における低分子量GTPaseの活性化の解析技術の開発
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第65回日本癌学会学術総会, 2006年09月, 日本語, 日本癌学会, 横浜, 国内会議
    ポスター発表

  • Quantitative analysis of spatial regulation of low molecular weight GTPases and its medical application
    Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    The 4th International Forum on Post-Genome Technologies, 2006年09月, 英語, Nanjing University/Southeast University/Zhejiang University/Jiangsu Science and Technology Association, Hangzhou, 国際会議
    口頭発表(一般)

  • Quantitative analysis of spatial regulation of low molecular weight GTPases and its medical applicatio
    上田 修司, 佐藤 孝哉
    4th International Forum on Post-genome Technology, 2006年09月, 英語, 中国 杭州, 国際会議
    口頭発表(一般)

  • クラスリン依存性受容体エンドサイトーシスにおける低分子量GTP結合タンパク質Rac1の機能解析
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    神戸大学21世紀COEプログラム「蛋白質のシグナル伝達機能」 平成18年度第1回研究発表会・若手ポスター発表会, 2006年08月, 日本語, 神戸大学21世紀COEプログラム「蛋白質のシグナル伝達機能」, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • Role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 and the guanine nucleotide exchange factor Ost in negative regulation of receptor endocytosis
    家口 勝昭, 上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    20thIUBMB/第20回国際生化学・分子生物学会議, 2006年06月, 英語, 京都, 国内会議
    ポスター発表

  • Critical role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 in insulin-stimulated GLUT4 translocation in skeletal muscle cells
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    20thIUBMB/第20回国際生化学・分子生物学会議, 2006年06月, 英語, 京都, 国際会議
    ポスター発表

  • Critical role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 in insulin-stimulated GLUT4 translocation in skeletal muscle cells
    Shuji Ueda, Tohru Kataoka, Takaya Satoh
    20th IUBMB Inetrnational Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress/第79回日本生化学会大会/第29回日本分子生物学会年会, 2006年06月, 英語, The International Union of Biochemistry and Molecular Biology/The The Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists /日本生化学会/日本分子生物学会, 京都, 国際会議
    ポスター発表

  • ビネキシンノックダウンによる線維芽肉腫細胞HT1080の伸展能の抑制
    山下 依子, 上田 修司, 佐藤 孝哉
    日本農芸化学会2006年度大会, 2006年03月, 日本語, 日本農芸化学会, 京都, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • Role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 and its guanine nucleotide exchange factor Ost in negative regulation of receptor endocytosis
    家口 勝昭, 上田 修司, 片岡 徹
    International Symposium of Kobe University 21 century COE Program on Siganl Transduction In Memory of Prof. Yasutomi Nishizuka, 2006年02月, 英語, 神戸大学21世紀COEプログラム, 神戸, 国際会議
    ポスター発表

  • Critical role of the Rho family GTP-binding protein Rac1 in insulin-stimulated GLUT4 translocation in skeletal muscle cells
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    International Symposium of Kobe University 21 century COE Program on Siganl Transduction In Memory of Prof. Yasutomi Nishizuka, 2006年02月, 英語, 神戸大学21世紀COEプログラム, 神戸, 国際会議
    ポスター発表

  • 骨格筋におけるインスリンシグナル伝達におけるRhoファミリーGTP結合タンパク質の機能解析
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第28回日本分子生物学会年会, 2005年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 福岡, 国内会議
    ポスター発表

  • トランスフェリン受容体のエンドサイトーシスにおけるDblファミリーグアニンヌクレオチド交換因子Ost-IIIの機能
    家口 勝昭, 上田 修司, 片岡 徹
    第28回日本分子生物学会年会, 2005年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 福岡, 国内会議
    ポスター発表

  • 骨格筋におけるインスリンシグナル伝達におけるRhoファミリーGTP結合タンパク質の機能解析
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第52回日本生化学会近畿支部例会, 2005年05月, 日本語, 日本生化学会, 神戸, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • トランスフェリン受容体のエンドサイトーシスにおけるグアニンヌクレオチド交換因子Dbsの機能
    家口 勝昭, 上田 修司, 片岡 徹
    第52回日本生化学会近畿支部例会, 2005年05月, 日本語, 日本生化学会, 神戸, 国内会議
    口頭発表(一般)

  • 骨格筋におけるインスリンシグナル伝達に関与するRhoファミリーGTP結合タンパク質の活性調節
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第27回日本分子生物学会年会, 2004年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • グアニンヌクレオチド交換因子Dbsと相互作用する分子の探索と機能解析
    家口 勝昭, 上田 修司, 片岡 徹
    第27回日本分子生物学会年会, 2004年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 神戸, 国内会議
    ポスター発表

  • RhoGEFにおけるSEC14様ドメインの機能解析
    上田 修司, 片岡 徹, 佐藤 孝哉
    第76回 日本生化学会大会, 2003年10月, 日本語, 日本生化学会, 横浜, 国内会議
    口頭発表(一般)

■ 所属学協会
  • 日本食品科学工学会
    2024年 - 現在

  • 肉用牛研究会
    2023年 - 現在

  • 関西畜産学会

  • 日本食肉学会

  • 日本薬理学会

  • 米国細胞生物学会

  • 日本畜産学会

  • 日本生化学会

  • 日本農芸化学会

■ 共同研究・競争的資金等の研究課題
  • 筋細胞に生じる高齢者特有のプロテオスタシスの低下を軽減する分子機序の解明
    上田 修司, 吉野 健一
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 神戸大学, 2023年04月 - 2026年03月

  • PL標識法による筋線維芽細胞の力伝達に関わる新機能探索と筋力低下予防への応用
    上田 修司
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 神戸大学, 2020年04月 - 2023年03月

  • 上田 修司
    学術研究助成基金助成金/基盤研究(C), 2017年04月 - 2020年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 筋肉内の遊離脂肪酸が味蕾細胞の味応答および霜降り肉の呈味性に及ぼす影響
    山之上 稔, 上田 修司, 高岡 素子, 羽原 正秋, 池崎 秀和
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 神戸大学, 2016年04月 - 2019年03月
    筋内脂肪が多く霜降り肉として美味しさが知られる黒毛和種牛肉の呈味性と脂肪の関連性を、牛肉中の遊離脂肪酸(FFA)量から明らかにした。と畜後4℃で保存した黒毛和種牛肉汁中のFFA量は熟成中に増加するが、ホルスタイン種牛肉汁中のFFA量では顕著な増加を認めなかった。味覚センサ分析法で牛肉汁の呈味性へのFFAの影響を調べた結果、苦味雑味や旨味コク等の味要素は高値を示し、熟成中の筋内FFA量の増加に伴いそれらの値は増加し、FFAの呈味要因としての可能性を示した。FFAが舌上の味蕾の味細胞を刺激することで牛肉の呈味性に影響する可能性を、マウス味細胞のCa2+イメージング法により検証を試みている。

  • 上田 修司
    学術研究助成基金助成金/基盤研究(C), 2014年04月 - 2017年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 上田 修司
    日本学術振興会, 科学研究費補助金/若手研究(B), 若手研究(B), 神戸大学, 2011年04月 - 2013年03月, 研究代表者
    低分子量G蛋白質のRhoAは骨格筋形成に不可欠な分子であるが、筋肥大におけるその役割は殆ど分かっていない。本研究では、C2C12細胞を用いた筋細胞肥大モデルにおいてRhoAの発現量と活性調節機構について検討した。IGF-1刺激によってRhoAの発現増加と持続的な活性化が認められた。RhoAの活性阻害実験では、IGF-1による筋肥大の抑制が示され、更に複数の筋肉分化に関わるシグナル分子の活性低下が観察された。また、BirA酵素標識法を本研究に導入したことで複数のRhoA結合蛋白質の同定に成功した。本研究より、IGF-1による筋肥大に関わるRhoAの活性調節機構の一端を明らかにすることができた。
    競争的資金

  • 食肉軟化に関わるコネクチンドメインの微生物発現と精製、および機能
    山之上 稔, 上田 修司
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 神戸大学, 2009年 - 2011年
    本研究は、熟成中の食肉軟化を誘起するパラトロポミオシンとサルコメアA-I接合部のコネクチンとの結合・解離機構の解明のために、A-I接合部領域のコネクチン断片を遺伝子工学的手法で作製し、両タンパク質の結合を調べている。一方で食肉の熟成中にサルコメアZ線近傍のコネクチンが断片になり、筋漿中に遊離し増加するが、コネクチン断片増加と食肉軟化の関連性を明らかにするために、微生物中に発現させ精製した組換えコネクチン断片を抗原に、抗コネクチン断片抗体を作製している。

  • 佐藤 孝哉
    科学研究費補助金/特定領域研究, 2009年
    競争的資金

  • 上田 修司
    日本学術振興会, 科学研究費補助金/特定領域研究, 特定領域研究, 神戸大学, 2006年 - 2006年, 研究代表者
    低分子量GTPaseであるRasファミリーとRhoファミリーは、細胞内シグナル伝達のON/OFFを制御する分子スイッチとして機能しており、これらの活性調節異常は癌の発症に深く関与している。我々は、活性型低分子量GTPaseとエフェクター分子の特異的な結合特性に基づき、様々なエフェクター分子由来のポリペプチドプローブを作製し、低分子量GTPaseの活性化を免疫染色の要領で検出する方法を開発した。18年度は、Rasに対する新規プローブの開発を目指して、候補に挙がったエフェクター分子からプローブを作製し、低分子量GTPaseに対する特異性の検討を行った。また、プローブの検出感度の向上を目指して、エフェクター分子の結合ドメインを複数個繋ぐ事により結合力の強化を図った。活性の定量化法としては、データの客観性を高める手段として、プローブの検出を酵素免疫染色法(ELISA)で行う比色定量法を開発した。また、共焦点顕微鏡で撮影した蛍光免疫染色画像の蛍光強度をデジタル解析する事で、細胞内の低分子量GTPaseの活性の強さを3次元的に視覚化する事が可能になった。今回作製したプローブを用いて、癌培養細胞を検討したところ、Rasの恒常的活性型変異を有する癌細胞(SW480、PANC-1)では内在性Rasの活性が強く検出された。この結果は、従来法である細胞可溶化液を用いて行うプルダウンアッセイの結果と一致していた。細胞機能の多くは、複数の低分子量GTPaseの複雑なクロストークによって制御を受けている事から、さらに低分子量GTPase毎に異なる蛍光波長で検出する事ができるプローブを作製した。低分子量GTPaseの活性型変異体を発現する細胞で検討したところ、これらのプローブを用いれば二つの低分子量GTPaseの活性を同一細胞上で同時に検出し、比較する事ができる事がわかった。
    競争的資金

  • 上田 修司
    日本学術振興会, 科学研究費補助金/若手研究(B), 若手研究(B), 神戸大学, 2005年 - 2006年, 研究代表者
    インスリンによる血糖値降下作用は,糖輸送担体(GLUT4)の細胞膜への移行促進によって起こる。我々は,骨格筋のGLUT4の細胞膜移行の制御にアクチン細胞骨格を調節するRhoファミリー低分子量GTPaseが関与していると仮説を立て、検討している。18年度は、GLUT4にタグ配列を挿入したGFP-GLUT4-Mycを安定発現する分化効率が非常に高いL6細胞株を新に作製した。これを用いて、17年度に明らかにしたインスリン刺激で強く活性化されるRhoファミリーのRac1の機能解析を行った。筋管に分化誘導後のL6細胞にRac1の恒常的活性型変異体を、アデノウィルス発現システムを用いて過剰発現させ検討したところ、活性型Rac1はインスリン刺激と同様にアクチン細胞骨格の再構成を伴うGLUT4の細胞膜移行を強く促進した。RNAi干渉法によるRac1のノックダウンによって、L6細胞のインスリン刺激依存的なGLUT4の細胞膜移行が抑制される事から、我々はこれらの結果を個体レベルで更に検証するため、Cre/loxPシステムを用いてRac1の骨格筋特異的なノックアウトマウスを作製した。筋肉クレアチンキナーゼのプロモーター下流でCreを発現するトランスジェニックマウス(MCK-Cre)とRac1のfloxマウスを掛け合わせて、Rac1(flox/flox : MCK-Cre)マウスを作製し、後肢筋を調べたところ、タンパク質レベルでRac1の発現が著しく減少している事を確認した。
    競争的資金

  • 佐藤 孝哉
    科学研究費補助金/特定領域研究, 2006年
    競争的資金

  • 佐藤 孝哉
    科学研究費補助金/基盤研究(B), 2005年
    競争的資金

  • 佐藤 孝哉
    科学研究費補助金/特定領域研究, 2005年
    競争的資金

研究シーズ

■ 研究シーズ
  • ヒートショック蛋白質誘導剤の瘢痕・褥瘡治癒への応用
    シーズカテゴリ:ライフサイエンス, 環境・農学, 自然科学一般
    研究キーワード:ヒートショック蛋白質, 創傷治癒, 長期臥床, 高齢者, 地域医療
    研究の背景と目的:皮膚は、防御壁として生体の表面を保護する。外傷、熱傷、化学物質暴露で損傷が生じると、皮膚は速やかに傷口を塞ぎ、修復する。しかし、自然治癒能力を超えると、治癒が遅れ、瘢痕(はんこん)を残す。また、高齢者では、長期臥床による皮膚損傷から褥瘡(じょくそう)が生じる。在宅医療の現場では、褥瘡管理は大きな問題である。我々は、ヒートショック蛋白質に着目し、皮膚の治癒能力を高める方法の開発を目指している。
    研究内容:ヒートショック蛋白質は、分子量によって低分子量ヒートショック蛋白質(HSPB)と高分子量ヒートショック蛋白質が存在し、変性蛋白質を修復する分子シャペロンとして機能する。ヒートショック蛋白質は、様々なストレスに応答し、速やかに発現誘導される。我々は、HSPBの発現誘導剤に着目し、既存の薬剤から発現誘導可能な薬剤を探索し、様々な臓器・組織でHSPBを発現誘導させた時の機能を検証している。
    期待される効果や応用分野:我々は、既存薬から新たな薬剤開発の可能性を探るドラッグ・リポジショニングを展開している。瘢痕・褥瘡を減らすことでQOLの向上を図るなど、農学部として医療貢献できることを目指して参りたい。
  • 皮膚の細胞老化予防因子の探索とその臨床応用
    シーズカテゴリ:ライフサイエンス, 環境・農学, ナノテク・材料
    研究キーワード:ヘルスケア, 細胞老化, プロテオミクス解析, 皮膚疾患, ドラッグ・リポジショニング
    研究の背景と目的:細胞は、様々なストレスによってDNA損傷が蓄積することで老化する。皮膚では、加齢による「生理的老化」と、紫外線による「光老化」が存在する。高齢化の増加により、老化に関連した皮膚疾患の増加することが見込まれる。我々は、細胞老化の治療に繋がる薬剤の開発を進めている。
    研究内容:我々は、薬剤を用いた細胞老化モデルで、発現が増減する蛋白質をプロテオミクス解析し、老化抑制の鍵遺伝子を探索している。現在、検出された幾つかの候補遺伝子の中から薬剤ターゲットとして相応しい有用な遺伝子の検証を進めている段階である。本研究の実証試験として、ポリマー基剤に鍵遺伝子を調節する薬剤を含ませたクリームを調製し、皮膚老化の動物実験モデルの患部に塗擦し、薬剤の効果を観察する計画を立てている。

    老化

    期待される効果や応用分野:我々は、人的資源の豊富な農学部の利点を活かし、様々な細胞を用いたウェットな実験を実施している。その応用先として、我々は、既存薬から新たな薬剤開発の可能性を探るドラッグ・リポジショニングを展開している。不可逆的な老化現象に対して、老化障害を減らすことでQOLの向上を図るなど、農学部として医療貢献できることを目指して参りたい。
  • 動物性脂質の健康機能性とその食品分野への応用
    シーズカテゴリ:ライフサイエンス, 環境・農学, 人文・社会
    研究キーワード:n-9系脂肪酸(オメガ9), 小胞体ストレス, 健康, フレイル予防, ヒト介入試験
    研究の背景と目的:動物、植物、魚類に含まれる栄養成分で、脂質に含まれる脂肪酸の種類と量は大きく異なる。植物油は健康、動物性脂肪は不健康なイメージが強いが、高級ブランドな牛肉や豚肉には、融点の低いモノ不飽和脂肪酸であるパルミトレイン酸が約5%、オレイン酸が約50%と多く含まれている。我々は、オリーブ油を用いた地中海式食事法の健康効果をヒントに、動物性脂質の健康機能性の開発し、実用化を進めている。
    研究内容:健康寿命の延伸には、老衰(フレイル)の予防が喫緊の課題である。フレイルは、食欲・消化吸収能の低下による低栄養が一因に上げられる。日々のフレイル予防として身体機能の維持に栄養摂取をサポートする栄養補助食品の需要は高い。我々は、黒毛和種牛肉に含まれる脂質分子種の網羅的な解析(リピドミクス解析)を通して、脂質の物性や用途に応じた抽出方法の開発を進めてきた。また、脂質の過剰蓄積による脂肪毒性は、糖尿病、高血圧、脂質異常症など高齢者疾患の原因となるが、我々は、脂肪毒性による小胞体ストレスを動物性脂質が抑制する分子機序の解明を進めている。 本研究では、天然の動物性脂質を材料にした精油の健康機能の開発を通して、n-9系脂肪酸の栄養機能の根拠を積み上げ、協力老人福祉施設機関と高齢者の摂取時の注意点、食欲不振の改善効果、健康機能のメリットなど協議し、食品分野での動物性脂質を用いた製品の実用化を図る。

    リピドミクスグラフ

    期待される効果や応用分野:我々の研究プロジェクトに協力して頂くことで、我々が保有する生化学的手法によって得られたデータ等を元に、高齢者のQOL向上に資するセンサー機器開発、高齢者の栄養代謝・嗜好性に関するデータ収集、及び消費者のニーズが期待される低栄養や、肥満症予防に向けた食品開発へのサポートが期待されます。
    関係する業績:Metabolites 2021, 11(4), 203; https://doi.org/10.3390/metabo11040203 日本畜産学会第128回大会シンポジウム「畜産学分野におけるメタボロミクスの可能性」
  • 黒毛和種の霜降り遺伝子の発現を誘導するサプリメントの開発
    シーズカテゴリ:環境・農学, ライフサイエンス, 自然科学一般
    研究キーワード:黒毛和種, 高付加価値, 遺伝子発現解析, 適正管理, 脂肪組織
    研究の背景と目的:黒毛和種(wagyu)は、高品質な牛肉として知られている。黒毛和種の魅力は、キメの細かい脂肪交雑(霜降り)が上げられる。我々は、赤身肉に生じる霜降り形成に関わる遺伝子8種類を発見し(米国特許出願)、それら遺伝子の発現を調節することで、狙った部位(例えばモモやバラ)の霜降り量と質を調節する飼料管理・肥育方法の開発を進めている。
    研究内容:黒毛和種の赤身肉には、肉眼では見えないほど小さな脂肪組織(微小サシ)が多数存在する。我々は、次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現解析より、微小サシ周辺の細胞外基質を構成するコラーゲン線維のネットワークを明らかにした。我々は、微小サシの発生に黒毛和種に特有な細胞外分泌因子による新たな細胞内シグナル伝達経路を提唱している。現在、神戸大学が代表で黒毛和種等国産食肉の適正管理技術の研究開発プラットフォームを構築し、産官学で黒毛和種の新たな畜産経営に取り組む体制作りを進めている。

    特徴的遺伝子コラーゲン

    期待される効果や応用分野:センサー装着した肥育牛の遠隔管理など「畜産のIoT化」が期待される中、家畜の肉質の品質を血中の微量な細胞外分泌因子のセンシングで見える化ができれば、本研究により、輸出拡大に向けて高付加価値な畜産物の生産、次世代農業に相応しい管理技術の構築、新たなブランド品種の創出への波及効果が期待される。
    関係する業績:Genes 2021, 12(8), 1107; https://doi.org/10.3390/genes12081107. 関西畜産学会 (2021) ポスター発表 日本食肉研究会 (2021) ポスター発表
  • メタボロミクス技術の食品成分分析への応用
    シーズカテゴリ:ライフサイエンス, 環境・農学, 自然科学一般
    研究キーワード:メタボロミクス, ガスクロマトグラフィー質量分析, 黒毛和種, 美味しさ, 輸出
    研究の背景と目的:代謝成分を一斉解析するメタボロミクス技術の進歩は目覚ましく、様々な食品分野の品質評価、反応機構の解明に活用されるようになってきた。しかし、食品毎に生体組織に由来した組織構造、栄養成分に大きな違いがあることから、成分抽出や、その後の分析に工夫が必要であることも分かってきた。我々は、様々な質量分析計を使用して、食品中に含まれる栄養成分を再現性高く、分析する技術開発を進めている。
    研究内容:食品成分のメタボロミクス技術は、従来の個別に食品成分を定量するのではなく、多成分を一度に解析し、栄養成分の量的変動を包括的に比較する手法である。我々は、アミノ酸、有機酸、脂肪酸などをガスクロマトグラフィー質量分析(GC/MS)で検出し、リン脂質、中性脂肪は、高速液体クロマトグラフィー質量分析(LC/MS)で分析することで、従来の食品分析ではカバーできない多数の栄養成分を網羅的に皮革解析することが可能である。我々の技術を用いて、牛肉の栄養成分を検討したところ、黒毛和種とホルスタインの牛肉で特徴的な栄養成分を同定することができた。図は、専門化による官能評価結果とメタボロミクスのデータを統合させ、OPLS解析モデルを構築し、和牛の香りに寄与する栄養成分の探索を行った結果を示す。

    メタボロミクス解析の狙い黒毛和種とホルスタイン種の比較

    期待される効果や応用分野:本研究により、従来の食品分析ではカバーできない多数の栄養成分を検出することができた。今後は、産学連携を深め、農作物の輸出に向けて食品の品質評価に活かしたい。
    関係する業績:1) Ueda, S., Iwamoto, E., Kato, Y., Shinohara, M., Shirai, Y. and Yamanoue, M. (2018): Biosci Biotechnol Biochem. 18:1-11. e0122886. 2) 上田修司 (2019): アグリバイオ 3 (12) : 34-36.
  • 細胞老化の予防因子探索に向けたBirA 酵素標識法の応用 
    シーズカテゴリ:ライフサイエンス, 自然科学一般 , 環境・農学
    研究キーワード:細胞老化, ヒートショック蛋白質, 遺伝子, 代謝
    研究の背景と目的:健康長寿の実現には、高齢者の細胞ストレスに対する脆弱性を補い、高齢者の心身機能に応じた細胞の頑強性を高めるアンチエージング戦略が重要である。近年、加齢に伴って,ヒートショック蛋白質(HSPB)が増減することで、細胞保護する事例が報告されている。 我々は、高齢者の身体機能の低下予防として、HSPBの細胞保護機能に着目し、細胞ストレス存在下における標的蛋白質の探索を進めている。
    研究内容:細胞内の蛋白質相互作用の解析は,抗体を用いた免疫沈降法が一般的だが、相互作用の弱い複合体や、微量な結合蛋白質の検出は、著しく困難であった。我々が実施しているBirA酵素標識法は、生きた細胞内の蛋白質間相互作用を、ビオチンで標識するユニークな酵素標識技術である。 我々は、これまでにBirA酵素標識法を用いて、① 細胞ストレス存在下でHSPB-BioID2によってビオチン標識される91個の蛋白質同定に成功し (図はビオチン標識蛋白質の網羅的な検出画像)、小胞体ストレス依存的機能するPolo-like kinase2 (PLK2) を新たに同定した。我々の発見した蛋白質は、細胞老化においても重要な機能が予測されるため、各種細胞老化モデルを用いて検討を進めている。

    ヒートショック蛋白質の働きBirA酵素標識法について

    期待される効果や応用分野:今後は、地域医療、エンジニアリング・食品産業と連携し、アンチエージングに向けた早期診断マーカー、予防サプリメントの開発などに応用して参りたい。
    関係する業績:1) Ueda, S., Blee, AM., Macway, KG., Renner, DJ. And Yamada, S. (2015): PLoS One 10(3): e0122886. 2) 上田修司 et al.(2018): 和光純薬時報 86 (1) : 6-7
     
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