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石井 尊生
大学院農学研究科 資源生命科学専攻
教授

研究者基本情報

■ 学位
  • 農学博士, 京都大学
■ 研究ニュース
■ 研究キーワード
  • 植物遺伝
  • 植物育種
■ 研究分野
  • 環境・農学 / 遺伝育種科学
  • ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学
  • ライフサイエンス / 遺伝学
■ 委員歴
  • 日本育種学会, 幹事

研究活動情報

■ 受賞
  • 2018年09月 日本育種学会, 第134回講演会日本育種学会優秀発表賞 (2), Exomeと果実・葉形状にみる日本のウメの多様性
    沼口孝司, 赤木剛士, 北村祐人, 大江孝明, 石川亮, 石井尊生
    国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2018年09月 日本育種学会, 第134回講演会日本育種学会優秀発表賞, ジャポニカ型栽培イネ（日本晴）の非脱粒性に関与する新規遺伝子座の離層形成への効果
    杉山 昇平, 辻村 雄紀, 大塚 宏太郎, Htun, Than Myint, 石井 尊生, 石川 亮
    国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2016年09月 日本育種学会, 第130回講演会日本育種学会優秀発表賞, Oryza rufipogonとインディカ型栽培イネ（カサラス）の戻し交雑集団を用いた種子脱粒性に関する新規遺伝子座の探索
    岡 佑美, 竹中 祥尭, 高間 菜摘, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 辻村 雄紀, 石井 尊生, 石川 亮
    国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2014年09月 日本育種学会, 第126回講演会日本育種学会優秀発表賞, 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用と離層形態
    井上 千鶴, Than Myint Htun, 井上 加奈子, 池田 健一, 石井 尊生, 石川 亮
    国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2014年03月 日本育種学会, 第125回講演会日本育種学会優秀発表賞, 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用
    井上 千鶴, Than Myint Htun, 石井 尊生, 石川 亮
    国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2013年10月 神戸大学, 学長表彰, 顕著な研究功績
    石井 尊生
    その他の賞

  • 2013年09月 六篠会, 六篠国際賞, 顕著な研究功績
    石井 尊生
    その他の賞

■ 論文
  • Sathya Lim, Chhourn Orn, Hiroki Saito, Ryo Ishikawa, Yutaka Sato, Takashige Ishii
    2024年06月, Journal of Crop Research, 69, 1 - 7
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Yoshiki Tokuyama, Miku Omachi, Shiori Kushida, Kiwamu Hikichi, Shuhei Okada, Kazumitsu Onishi, Takashige Ishii, Yuji Kishima, Yohei Koide
    Springer Science and Business Media LLC, 2023年12月, Planta, 259(1) (1), 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Koji Numaguchi, Tomoaki Kashiwamoto, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii, Yuto Kitamura
    Japanese apricot (Prunus mume) is an important fruit tree in East Asia. ‘Nanko’, the primary cultivar of Japanese apricots, usually suffers from scab, a disease caused by Venturia carpophila. However, there have been few reports on the phenotypic variation in scab resistance/susceptibility and the underlying genetic factors. In this study, we investigated the severity of naturally occurring scabs based on fruit lesions in 108 Japanese apricot accessions over four consecutive years. In each year, both resistant and susceptible accessions were observed, and significant annual correlations were detected among the ratios of diseased fruits (Rt; 0.52–0.76) and among the disease severity indices (Sv; 0.55–0.79). We also conducted a genome-wide association study (GWAS) based on exon-targeted resequencing, and significant peaks were detected in the data from 2017 and 2018. The candidate genes involved in disease resistance are located near nine single-nucleotide polymorphisms. These genes may be associated with the susceptibility of ‘Nanko’ lineages to scab. These findings shed light on the phenotypic and genetic profiles of scab resistance in P. mume and will assist future breeding programs with improving scab resistance.
    MDPI AG, 2023年07月, Horticulturae, 9(8) (8), 872 - 872, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Shohei Sugiyama, Motoki Sakuta, Yuki Tsujimura, Yudai Yamaguchi, Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Koji Numaguchi, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    Asian rice (Oryza sativa) was domesticated from O. rufipogon, and reduced seed-shattering behaviour was selected to increase yields. Two seed-shattering loci, qSH3 and sh4, are involved in reducing seed shattering in both japonica and indica rice cultivars, while qSH1 and qCSS3 are likely specific to japonica cultivars. In indica cultivars, qSH3 and sh4 fail to explain the degree of seed shattering, as an introgression line (IL) of O. rufipogon W630 carrying domesticated alleles at qSH3 and sh4 still showed seed shattering. Here we analysed differences in seed-shattering degree between the IL and the indica cultivar IR36. The values for grain detachment in the segregating population between the IL and IR36 were continuous. Based on QTL-seq analysis using the BC1F2 population between the IL and IR36, we detected two novel loci, qCSS2 and qCSS7 (QTLs for the Control of Seed Shattering in rice on chromosomes 2 and 7), which contributed to the reduced seed shattering in IR36. We further investigated the genetic interaction of qCSS2 and qCSS7 under the presence of qSH3 and sh4 mutations in O. rufipogon W630 and found that IL carrying IR36 chromosomal segments covering all four loci are required to explain seed-shattering degree in IR36. Since qCSS2 and qCSS7 were not detected in previous studies on seed shattering in japonica, their control may be specific to indica cultivars. Therefore, they are important to understanding the history of rice domestication as well as to adjusting the seed-shattering degree of indica cultivars to maximise their yield.
    2023年05月, Molecular genetics and genomics : MGG, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Phuong Dang Thai Phan, Akinori Nishimura, Chika Yamamoto, Pham Thien Thanh, Toshihiro Niwa, Yaddehige Priya Jayantha Amarasinghe, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    Japanese Society of Breeding, 2023年, Breeding Science, 73(4) (4), 373 - 381, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
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  • Sathya Lim, Anna Onoda, Chhourn Orn, Hiromu Iwamoto, Ryo Ishikawa, Hiroki Saito, Yutaka Sato, Takashige Ishii
    More than half-century ago, local rice varieties were collected from Indochinese countries (Cambodia, Thailand, Laos, and Vietnam). Of these, 162 local varieties were examined for 7 grain-size traits: seed length/width/thickness, brown rice length/width/thickness, and 100-seed weight. Since these traits varied considerably, a survey of functional mutations was performed in the genes related to these traits. In total, 19 markers (12 InDel and 7 dCAPS markers) were used to investigate the mutations at 14 grain-size loci of GW2, GS2, qLGY3, GS3, GL3.1, TGW3, GS5, GW5, GS6, TGW6, GW6a, GLW7, GL7, and GW8. Significant allele effects were observed with six markers detecting base substitution mutations at GW2 and GS3 and insertion/deletion mutations at GS5, GW5, and GW6a, suggesting that these mutations might have affected the grain trait and caused variation among local varieties in the Indochinese countries. In addition to grain size, the hull color, grain color, and glutinosity were also examined using a survey of loss-of-function mutations at major responsible loci. Most phenotypes were reflected based on functional mutations at these loci. Since the local varieties have wide genetic variation, they are important genetic resources for future rice breeding.
    2022年12月, Plants (Basel, Switzerland), 12(1) (1), 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
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  • Ryo Ishikawa, Cristina Cobo Castillo, Than Myint Htun, Koji Numaguchi, Kazuya Inoue, Yumi Oka, Miki Ogasawara, Shohei Sugiyama, Natsumi Takama, Chhourn Orn, Chizuru Inoue, Ken-Ichi Nonomura, Robin Allaby, Dorian Q Fuller, Takashige Ishii
    Asian rice (Oryza sativa L.) is consumed by more than half of the world's population. Despite its global importance, the process of early rice domestication remains unclear. During domestication, wild rice (Oryza rufipogon Griff.) acquired non-seed-shattering behavior, allowing humans to increase grain yield. Previous studies argued that a reduction in seed shattering triggered by the sh4 mutation led to increased yield during rice domestication, but our experiments using wild introgression lines show that the domesticated sh4 allele alone is insufficient for shattering loss in O. rufipogon. The interruption of abscission layer formation requires both sh4 and qSH3 mutations, demonstrating that the selection of shattering loss in wild rice was not as simple as previously suggested. Here we identified a causal single-nucleotide polymorphism at qSH3 within the seed-shattering gene OsSh1, which is conserved in indica and japonica subspecies but absent in the circum-aus group of rice. Through harvest experiments, we further demonstrated that seed shattering alone did not significantly impact yield; rather, yield increases were observed with closed panicle formation controlled by SPR3 and further augmented by nonshattering, conferred by integration of sh4 and qSH3 alleles. Complementary manipulation of panicle shape and seed shattering results in a mechanically stable panicle structure. We propose a stepwise route for the earliest phase of rice domestication, wherein selection of visible SPR3-controlled closed panicle morphology was instrumental in the sequential recruitment of sh4 and qSH3, which together led to the loss of shattering.
    2022年06月, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119(26) (26), e2121692119, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
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  • Miki Ogasawara, Naoya Miyazaki, Gotaro Monden, Kenta Taniko, Sathya Lim, Masahide Iwata, Takashige Ishii, Jian Feng Ma, Ryo Ishikawa
    2021年09月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 134(9) (9), 3013 - 3022, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
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  • Yaddehige P.J. Amarasinghe, Mitsuharu Otsuka, Sathya Lim, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    AbstractCultivated rice (Oryza sativa L.) was domesticated from the Asian wild species O. rufipogon. Compared with cultivated rice, wild rice has spikelets/seeds with long barbed awns. In order to evaluate the role of awns in wild rice, four seed groups with different awn lengths (full, half, quarter and no awns) were prepared, and the following seed dispersal movements were investigated under simulated natural conditions as observed in the tropical Asian habitat: (1) seed detachment from the parent plant; (2) falling angle of mature seed; (3) ability to slip into small spaces; (4) horizontal movement on the ground and (5) horizontal movement in water. As a result, awns were found to enhance the detachment of matured seeds from the panicles in the initial seed dispersal step. They regulated vertical orientation in the air, and the vertical form may enable seeds to squeeze to the ground. The awned seeds also showed advantages in horizontal movements on the ground and in the water. In most of the experiments, seeds with full awns showed the best performance for seed dispersal, suggesting that wild rice keeps long awns to survive under natural conditions. Since seed awning is dominantly controlled by wild functional alleles at several loci, wild rice may be able to prevent a drastic reduction of awn length.
    Cambridge University Press (CUP), 2020年12月, Seed Science Research, 30(4) (4), 319 - 324, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
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  • Koji Numaguchi, Takashi Akagi, Yuto Kitamura, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    Domestication and population differentiation in crops involve considerable phenotypic changes. The logs of these evolutionary paths, including natural/artificial selection, can be found in the genomes of the current populations. However, these profiles have been little studied in tree crops, which have specific characters, such as long generation time and clonal propagation, maintaining high levels of heterozygosity. We conducted exon-targeted resequencing of 129 genomes in the genus Prunus, mainly Japanese apricot (Prunus mume), and apricot (Prunus armeniaca), plum (Prunus salicina), and peach (Prunus persica). Based on their genome-wide single-nucleotide polymorphisms merged with published resequencing data of 79 Chinese P. mume cultivars, we inferred complete and ongoing population differentiation in P. mume. Sliding window characterization of the indexes for genetic differentiation identified interspecific fragment introgressions between P. mume and related species (plum and apricot). These regions often exhibited strong selective sweeps formed in the paths of establishment or formation of substructures of P. mume, suggesting that P. mume has frequently imported advantageous genes from other species in the subgenus Prunus as adaptive evolution. These findings shed light on the complicated nature of adaptive evolution in a tree crop that has undergone interspecific exchange of genome fragments with natural/artificial selections.
    2020年10月, The Plant Journal, 104(6) (6), 1551 - 1567, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Yaddehige Priya Jayantha Amarasinghe, Rie Kuwata, Akinori Nishimura, Phuong Dang Thai Phan, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    2020年04月, RICE, 13(1) (1), 26 - 26, 英語, 国際誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Numaguchi K, Kitamura Y, Ishikawa R, Ishii T
    ウメ(Prunus mume)はPrunus属の果樹であり,300以上の品種が東アジアを中心に分布しているが,日本の実ウメ,小ウメ,花ウメおよび台湾由来のウメもこれらに含まれる.そこで,日本と台湾のウメの過去の集団動態を推定するために,53品種(実ウメ20品種,小ウメ8品種,花ウメ20品種,台湾5品種)のSSRマーカー20座における遺伝子型のデータセットに基づき,近似ベイズ計算(approximate Bayesian computation)を用いた解析を行った.まず,6つの起こりうる分岐シナリオから最適モデル(事後確率0.501)を推定し,そのモデルの集団動態に関するパラメーターの中央値を算出した.また,ウメの世代時間を7年(生殖可能年齢)と仮定し,世代数を年代に換算した.最適モデルでは,日本と台湾の集団が10360年(95%信頼区間:2079-56910年)前に初めに分岐し,その後3633年(95%信頼区間:1218-12740年)前に日本の集団から花ウメが分かれ,最終的に2387年(95%信頼区間:623-6258年)前に実ウメと小ウメが分化したと推定された.これらの分岐年代は粗く推定されたものであるが,異なった気候条件を伴う地理的隔離により日本と台湾のウメが分化し,その後日本で人の用途に応じて花ウメ,実ウメ,小ウメが最近分化したことを示唆する結果となった.
    近畿作物・育種研究会, 2020年, Journal of Crop Research, 65, 31 - 35, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Rieko Shishido, Masahiro Akimoto, Tin Htut, Tadashi Sato, Takashige Ishii
    2019年09月, Breeding Science, 69(3) (3), 471 - 477, 英語, 国内誌
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Funa Ogawa, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    イネにおいて小穂開花は種子生産に直結する受粉のための重要な過程のひとつである.小穂開花には,温度,湿度,光および物理的なストレスが大きく影響している.そこで,小穂開花に必要な要因を明らかにするために,まず日本型イネ品種の日本晴を用いて,4つの蒸散を制御した条件下(水没,シャワー,油,高湿度条件と表記)で小穂の開花調査を行なった.水没条件では,植物体の穂のみからの蒸散が可能な状態を設定した.その他の3条件では,水,油,高湿度により穂からの蒸散を制御するように設定した.それぞれの条件につき,開花直前の15小穂を残した4穂を処理し,翌日の午後に開花率を調査した.そして,同じ調査を3日間繰り返し,それぞれの処理区の開花率の平均値を比較した.水没条件下では多くの小穂が開花し,平均83.3%の開花率であった.一方,シャワーおよび油処理の条件下ではほとんど開花が見られなかった(シャワー:17.8%,油:0.6%).また,高湿度条件下ではほぼ半数(46.1%)の小穂の開花が観察された.これらの平均開花率はそれぞれ無処理のコントロール区(約92%)のものと比較すると有意に低い値となった.これらの結果は,内穎と外穎からの蒸散は小穂の開花に必要であることを示唆するものであった.次に,野生イネを用いて,外穎の先端に位置する芒からの蒸散が開花時間に関与しているか否かを調査した.3個体から8穂を準備し,１次枝梗ごとに交互に小穂の芒を切除した.植物体を野外の自然条件下に配置し,翌朝開花した全ての小穂の正確な開花開始時刻を分刻みで記録した.その結果,芒の有無によって開花開始時間に有意な差がないことがわかった.芒からの蒸散は直接開花開始時間には関係しなかったが,小穂の開花の正確なスイッチは内穎または外穎の表面からの蒸散に同調しているものと思われた.
    近畿作物・育種研究会, 2019年, Journal of Crop Research, 64, 31 - 35, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Yaddehige P, J. Amarasinghe, Rie Kuwata, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    野生イネの種子の長い芒は自然状態での繁殖に必要な形質の一つである.しかし,イネの栽培化において,長い芒は種子の収穫や作業の邪魔になるため,より短い芒を持つ個体が徐々に選抜されてきたと考えられる.そこで,無芒性のイネの栽培化過程を明らかにするため,O. rufipogon W630(反復親)とO. sativa IR36(一回親)間のBC2F7世代の146系統からなる戻し交雑自殖系統群を育成した.そしてそれらから,もっとも短い芒を持つG5系統を選抜した.このG5系統は,167のSSRマーカー座のうち20座においてIR36の対立遺伝子がホモ型であること,また野生イネの遺伝的背景において7箇所のIR36の染色体断片を持つことがわかった.そこで,この系統をさらにW630と交雑して,160個体からなるBC3F2植物を作出した.これらを圃場に展開し,第5小穂の芒の長さのデータに基づき,無芒性に関するQTL解析を行った.その結果,第2染色体上に弱い効果を持つ1カ所のQTLと第4染色体上に強い効果を持つ2カ所のQTLが検出された.さらに,関連するマーカーの位置情報から,第4染色体上の2つのQTLはAn-1およびLABA1と同座であること,また第2染色体上のQTLは新規のものであることが示唆された.これら3つの遺伝子座によって,O. rufipogon W630とG5系統の芒の長さの違いがほぼ説明されるものの,まだいくつかの無芒性に関する微動遺伝子が無芒のIR36ゲノム中に存在すると考えられる.
    近畿作物・育種研究会, 2019年, Journal of Crop Research, 64, 43 - 46, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Koji Numaguchi, Shogo Ishio, Yuto Kitamura, Kentaro Nakamura, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    Japanese Society for Horticultural Science, 2019年, The Horticulture Journal, 88(2) (2), 222 - 231, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Yuki Tsujimura, Shohei Sugiyama, Kotaro Otsuka, Than Myint Htun, Koji Numaguchi, Cristina Castillo, Takashi Akagi, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    Springer Science and Business Media LLC, 2019年, Theor. Appl. Genet., 132(9) (9), 2615 - 2623, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    Springer Singapore, 2018年03月, Rice Genomics, Genetics and Breeding, 207 - 221, 英語
    [査読有り]
    論文集(書籍)内論文

  • Ryo Ishikawa, Masahide Iwata, Kenta Taniko, Gotaro Monden, Naoya Miyazaki, Chhourn Orn, Yuki Tsujimura, Shusaku Yoshida, Jian Feng Ma, Takashige Ishii
    2017年10月, PLOS ONE, 12(10) (10), e0187224, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Ryo Ishikawa, Akinori Nishimura, Than Myint Htun, Ryo Nishioka, Yumi Oka, Yuki Tsujimura, Chizuru Inoue, Takashige Ishii
    2017年04月, GENETICA, 145(2) (2), 201 - 207, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mai Ikemoto, Mitsuharu Otsuka, Pham Thien Thanh, Phuong Dang Thai Phan, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    2017年02月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 92(1) (1), 21 - 26, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Yuki Tsujimura, Chizuru Inoue, Than Mynt Htun, Yumi Oka, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    栽培イネ(Oryza sativa L.）はアジアの野生イネO. rufipogonから栽培化されたことが知られている.栽培化では種子脱粒性の喪失など農業上好ましい形質が選抜された.これまでの研究から,ジャポニカ型栽培イネ日本晴の非脱粒性には3つの遺伝子座(qSH1,sh4,qSH3)が報告されている.一方,部分的な離層形成を示すインディカ型栽培イネのIR36 の非脱粒性にはsh4とqSH3座が関与していると考えられる.ジャポニカ型栽培イネとインディカ型栽培イネの脱粒程度の違いを説明する主要因はqSH1座の遺伝子型である.しかしながら,インディカ型栽培イネの非脱粒性を支配する遺伝子座についてはsh4とqSH3座以外に詳しいことは分かっていない.我々はこれまでの研究において,野生イネO. rufipogon W630の遺伝的背景において,qSH3とsh4座において日本晴の対立遺伝子を持つイントログレッション系統IL(3+4)を作出している.このIL(3+4)はqSH3とsh4座においてインディカ型栽培イネIR36と同様に栽培イネの対立遺伝子を持っているが,野生イネに似た強い脱粒性を持つ.本研究では,これらの脱粒性の違いに着目し両者のF1ならびにF2植物の脱粒性の評価を行った.F1植物の離層形成について樹脂切片を用いて観察したところ,IL(3+4)と同様の離層形成が見られたため,IR36には未知の遺伝子座における劣性変異が存在する可能性が示唆された.続いて,F2植物を評価したところ,種子脱粒性に明瞭な分離が観察された.以上の結果から,インディカ型栽培イネIR36の非脱粒性には,未知の遺伝子座における変異が存在する可能性が確認された.今後は戻し交雑系統などを作出し,これらの新規遺伝子座の同定を進める必要がある.
    近畿作物・育種研究会, 2017年, Journal of Crop Research, 62, 19 - 23, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Ryo Ishikawa, Takafumi Watabe, Ryo Nishioka, Pham Tien Thanh, Takashige Ishii
    Differences in floral morphologies affect pollination behaviour in many flowering plants. In the genus Oryza, several differences in the size of floral organs are known. In this study, we focused on the differences in the size of floral organs between common cultivated rice, Oryza sativa L. and its wild ancestor, O. rufipogon. We compared floral morphologies between cultivated rice O. sativa cv. Nipponbare and O. rufipogon W630. We first evaluated temporal changes in filament and anther lengths. W630 had longer filaments with rapid elongation within 15 min after spikelet opening. W630 also had longer anthers than Nipponbare, and size of anther was consistent throughout all time examined. We also analysed other six floral traits, and found that W630 had higher stigma and style length, as well as lemma and palea length, but lower lemma and palea width. Quantitative trait locus (QTL) analysis was performed to identify the loci controlling these floral traits, using backcross recombinant inbred lines derived from a cross between Nipponbare and W630. A total of 11 significant QTLs were identified. Of these, two pairs of QTLs for lemma and palea length and one pair for lemma and palea width overlapped, suggesting that common genetic factors may be the reason for the differences in these traits. In addition, we performed QTL analysis for grain size, and found that QTLs for grain size coincided with those for lemma and palea size, indicating that grain size is partly controlled by glume capacity. The QTLs identified in this study will be informative for understanding genetic changes associated with rice domestication.
    Scientific Research Publishing, 2017年, American Journal of Plant Science, 8, 734 - 744, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）
    神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク

  • Ryo Nishioka, Hiromi Mikazuki, Than Myint Htun, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    栽培イネ（Oryza sativa L.）はアジアの野生イネO. rufipogon に由来する．イネの栽培化初期において，つまり種子が非脱粒性である植物の出現以前において，穂の形態は鍵となった形質であると考えられている．なぜなら，栽培イネのように穂が閉じた形態をしている野生イネは，種子の脱落を一時的に抑制することが観察されているからである．以前我々は，この穂の形態を支配する主要な遺伝子座は第4染色体に座乗しているSPR3であり，OsLG1遺伝子の発現制御に関係していることを明らかにした．しかし我々は同時に，研究材料であったO. sativa NipponbareとO. rufipogon W630間のBC2F8世代の戻し交雑自殖系統のいくつかに，SPR3遺伝子座に野生イネの対立遺伝子を持たないにもかかわらず，穂が開帳性であるものを見つけた．そこで本研究では，野生イネにおける穂の開帳性を支配する新たな遺伝子領域の推定を行うために，それらからAsN136系統を選抜した．このAsN136系統は，180のSSRマーカー座のうち27座において野生イネの対立遺伝子がホモ型であること，またNipponbareの遺伝的背景において9つの野生イネの染色体断片を持つことがわかった．そこで，この系統をNipponbareと交雑して，150個体からなるBC3F2世代の分離集団を作出した．これらを圃場に展開し，穂の形態調査を枝梗基部の観察に基づき行った．そして，27の分子マーカー座の遺伝子型のデータ用いて，穂の形態に関するQTL解析を行った．その結果，第5および11染色体上に2つのQTLが推定された．また，それぞれの集団全体の形質分離に対する寄与率は37.6%と4.9%であった．効果の大きかった第5染色体に座乗する遺伝子座については，BC3F3世代の植物を用いてその効果の後代検定を行った．その結果，穂の形態に関する新たな因子がRM421とRM274の分子マーカー座間の領域に存在することが示唆された．今後，OsLG1の発現解析および新規遺伝子座のファインマッピングを行うことにより，穂の開帳性を制御する遺伝子のメカニズムが明らかになると思われる．
    近畿作物・育種研究会, 2016年, Journal of Crop Research, 61, 23 - 26, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mai Ikemoto, Tetsuya Ohyagi, Pham Thien Thanh, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    イネにおける1年生と多年生の分化はこれまでイネの遺伝学者や生態学者にとって大きな関心事のひとつであった．本研究では，生殖に関係する形質のうち，節からの出芽・出根能力およびひこばえの発生能力に焦点を当てた．これらの形質は，多年生の性質を持つ栽培イネOryza sativa Nipponbareと1年生の野生イネO. rufipogon W630の間の戻し交雑自殖系統によって評価した．まず，登熟前と登熟後の時期に，戻し交雑自殖系統の植物より上位第1節および第2節を収集した．個体あたり5組の節は3週間水に半分浸した状態で保った後，節からの発生した芽と根を調査した．戻し交雑自殖系統の植物の第1 節からはどちらの時期でも芽の発生がほとんど見られなかったが，それらの多くは第2節からの出芽能力を持っていた．出根能力は登熟後の第1節にはほとんど見られなかったが，登熟前のほぼ半数の第1節からは根の発生が見られた．また，多くの戻し交雑自殖系統の植物の第2節からはどちらの時期でも根の発生が見られた．戻し交雑自殖系統における連続的な頻度分布は登熟後の第2 節からの出芽・出根能力に関してみられたため，これらのデータを基にQTL解析を行ったところ，有意な遺伝子座は検出されなかった．この結果は，水温などの環境要因が形質評価に影響したのではないかと思われる．次に，ひこばえの発生能力については，圃場に展開したもう1組の戻し交雑自殖系統を用いて，出穂後約60日に有効分げつに対するひこばえ数の割合を調査した．これらのデータを用いてQTL解析を行ったところ，第8 染色体上のRM25とRM44の間にLOD値が4.2のQTLが1つ検出された．このQTLの位置確認には，推定領域に関して染色体断片を置換した系統を用いた解析が今後必要となる．
    近畿作物・育種研究会, 2016年, Journal of Crop Research, 61, 13 - 17, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Chhourn Orn, Rieko Shishido, Masahiro Akimoto, Ryo Ishikawa, Than Myint Htun, Ken-Ichi Nonomura, Yohei Koide, Men Sarom, Seng Vang, Sakhan Sophany, Ouk Makara, Takashige Ishii
    2015年12月, BREEDING SCIENCE, 65(5) (5), 430 - 437, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Hao Yin, Masahiro Akimoto, Reunreudee Kaewcheenchai, Masahiro Sotowa, Takashige Ishii, Ryuji Ishikawa
    2015年10月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 90(5) (5), 269 - 281, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Inhibition of abscission layer formation by an interaction of two seed-shattering loci, sh4 and qSH3, in rice
    Chizuru Inoue, Than Myint Htun, Kanako Inoue, Ken-ichi Ikeda, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    2015年02月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 90(1) (1), 1 - 9, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Identification of QTL for Striga hermonthica resistance using backcross population derived from a cross between Oryza sativa (cv. Nipponbare) and O. rufipogon
    Atera AE, Onyango JC, Thanh PT, Ishii T, Itoh K
    2015年, J Agr Sci, 7, 99 - 105, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Aloka Lanka Ranawake, Oliver Escano Manangkil, Shinya Yoshida, Takashi Ishii, Naoki Mori, Chiharu Nakamura
    2014年11月, BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT, 28(6) (6), 989 - 998, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Orn Chhourn, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    2014年09月, BREEDING SCIENCE, 64(3) (3), 199 - 205, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Orn Chhourn, Ryo Ishikawa, Sakhan Sophany, Ouk Makara, Takashige Ishii
    カンボジアのイネ品種における遺伝的多様性の評価を276系統の在来品種ならびに60系統の改良品種を用いて行った.在来品種は50年以上前に収集されたもので,"floating rice(浮稲)","rice in dry regions(乾燥地稲)","non-glutinous rice(粳稲)","glutinous rice(糯稲)"の4つに分類されている.また,改良品種は国内で育成された35系統および外国から導入された25系統からなる.これらよりDNAサンプルを抽出し,12対の染色体にそれぞれ座乗する12個のSSRマーカーを用いて解析を行った.まず,遺伝子多様度の値に基づき在来品種分類群内における遺伝的多様性を調べたところ,それぞれほぼ同じレベルの変異がみられ,在来品種276系統全体における遺伝子多様度は0.55であった.一方,国内で育成された改良品種35系統を用いて調べたところ,遺伝子多様度は0.46というやや低めの値が得られた.このようにカンボジアで育成された改良品種の遺伝的多様性が在来品種より減少したことは,近代の植物育種法の導入とこれまでの社会状況の変化によるものと考えられた.しかし,外国から導入された25系統を含めた,改良品種60系統全体における遺伝子多様度は0.61であった.このことは,現在カンボジアで栽培されている改良品種は,国内育成品種と外国導入品種を混在させることによって高い遺伝的多様性が維持されていることを示すものである.カンボジアで育成された4つの在来品種分類群と国内改良品種における分化の程度をNei の遺伝的距離に基づき調査したところ,0.09という一番低い値が"non-glutinous rice"と国内改良品種の間で検出された.この結果は,国内改良品種が主に在来品種の"non-glutinous rice"グループから育成されたことを示唆するものであった.また"floating rice"と他の4群の間では,0.32-0.51という高い値が観察され,深水生態環境が"floating rice"の独特な遺伝的分化に大きく影響したことが示唆された.
    近畿作物・育種研究会, 2014年, Journal of Crop research, 59, 37 - 41, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Jeffrey A. Fawcett, Tomoyuki Kado, Eriko Sasaki, Shohei Takuno, Kentaro Yoshida, Ryuichi P. Sugino, Shunichi Kosugi, Satoshi Natsume, Chikako Mitsuoka, Aiko Uemura, Hiroki Takagi, Akira Abe, Takashige Ishii, Ryohei Terauchi, Hideki Innan
    2013年12月, PLOS ONE, 8(12) (12), e83720 (12 pages), 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • CONSTRUCTION OF MICROSATELLITE LINKAGE MAP AND DETECTION OF SEGREGATION DISTORTION IN INDICA RICE (ORYZA SATIVA L.)
    Muhammad Arshad Javed, Fahrul Zaman Huyop, Takashige Ishii, Azman Abd Samad, Tariq Mahmood, Muhammad Saleem Haider, Muhammad Saleem
    2013年12月, PAKISTAN JOURNAL OF BOTANY, 45(6) (6), 2085 - 2092, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Takashige Ishii, Koji Numaguchi, Kotaro Miura, Kentaro Yoshida, Pham Thien Thanh, Than Myint Htun, Masanori Yamasaki, Norio Komeda, Takashi Matsumoto, Ryohei Terauchi, Ryo Ishikawa, Motoyuki Ashikari
    2013年04月, NATURE GENETICS, 45(4) (4), 462 - 465, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Phan Thi Thanh, Cristian Ioan Vladutu, Shahryar F. Kianian, Pham Thien Thanh, Takashige Ishii, Miyuki Nitta, Shuhei Nasuda, Naoki Mori
    2013年04月, BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT, 27(2) (2), 3627 - 3637, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Striga infestation in Kenya: Status, distribution and management options
    Atera AE, Ishii T, Onyango JC, Itoh K, Azuma T
    2013年, Sust Agr Res, 2, 99 - 108, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Phuong Dang Thai Phan, Hiroki Kageyama, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    2012年09月, BREEDING SCIENCE, 62(3) (3), 256 - 262, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Atera AE, Itoh K, Azuma T, Ishii T
    2012年03月, Weed Biol Manag, 12(1) (1), 53 - 62, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Kazuyuki Mori, Nobuhiro Mukojima, Takashi Nakao, Seiji Tamiya, Yu Sakamoto, Norio Sohbaru, Kazuya Hayashi, Hitomi Watanuki, Kazuhiro Nara, Kaoru Yamazaki, Takashige Ishii, Kazuyoshi Hosaka
    2012年02月, AMERICAN JOURNAL OF POTATO RESEARCH, 89(1) (1), 63 - 72, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Response of NERICA Rice to Striga hermonthica Infections in Western Kenya
    Evans A. Atera, Kazuyuki Itoh, Tetsushi Azuma, Takashige Ishii
    2012年, INTERNATIONAL JOURNAL OF AGRICULTURE AND BIOLOGY, 14(2) (2), 271 - 275, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Farmers’ perception and constraints to the adoption of weed control options: the case of Striga asiatica in Malawi
    Atera AE, Itoh K, Azuma T, Ishii T
    2012年, J Agr Sci, 4, 41 - 50, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Takashige Ishii, Takashi Hiraoka, Tomoyuki Kanzaki, Masahiro Akimoto, Rieko Shishido, Ryo Ishikawa
    2011年12月, RICE, 4(3-4) (3-4), 170 - 177, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Kazuyuki Mori, Yu Sakamoto, Nobuhiro Mukojima, Seiji Tamiya, Takashi Nakao, Takashige Ishii, Kazuyoshi Hosaka
    2011年08月, EUPHYTICA, 180(3) (3), 347 - 355, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Pham Thien Thanh, Phuong Dang Thai Phan, Naoki Mori, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    2011年03月, BREEDING SCIENCE, 61(1) (1), 76 - 79, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Than Myint Htun, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    野生イネ(Oryza rufipogon)は種子脱粒性を示すが,この性質は栽培イネ(O.sativa)においては収量低下につながるため,栽培化の過程で淘汰されている.これまでに,脱粒性を支配する効果の強い2つの遺伝子座(qSH1とsh4)が明らかにされてきたが,これらの解析は栽培イネの遺伝的背景で行われたものである。本研究では,イネの栽培化過程において脱粒性がどのように失われたかを解明するため,まず,野生イネの遺伝的背景に栽培品種「日本晴」の非脱粒性を促す対立遺伝子を戻し交雑によって導入した系統をSSRマーカーを用いた選抜に基づき育成した.これらの置換系統における脱粒性程度を経時的に計測したところ,開花後5日目の脱粒強度は栽培イネよりも低く,野生イネとほぼ同じであり,置換系統の種子基部に離層が形成されつつあることを示していた.さらに,10日以降の置換系統の脱粒強度は,「日本晴」の約半分であった.以上の結果から,栽培イネの非脱粒程度はqSH1とsh4の2つの遺伝子座だけでは説明できず,野生イネには離層形成を促進する新たな因子が存在することが示唆された.
    近畿作物・育種研究会, 2011年, Journal of Crop research, 56, 39 - 44, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Phuong Dang, Thai Phan, Pham Thien Thanh, Naoki Mori, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    栽培品種の遺伝的背景における遠縁種由来の有用農業形質の評価は戻し交雑集団を用いると効率的である.そこで本研究では,まず野生イネ系統O.rufipogon W630を栽培イネ品種Oryza sativa Japonica NipponbareおよびIndica IR36でそれぞれ戻し交雑し,自殖を繰り返した159および170系統からなるBC2F8世代の系統群を育成した.これらよりDNAを抽出し,ゲノムをカバーする約180のマイクロサテライトマーカー座の遺伝子型を調べたところ,ほぼホモ型に固定していた.次にこれら系統を用いて,湛水条件下における葉鞘の伸長程度に基づき、湛水回避性に関するQTL解析を行ったところ,3つ(第2,3,10染色体上)および2つ(第3,4染色体上)のQTLがそれぞれNipponbareおよびIR36の遺伝的背景の自殖系統群で推定された.これらのうち,それぞれ1つの遺伝子座において,野生種の対立遺伝子が湛水条件下での葉鞘を伸長させる効果を持っていた.検出された野生種の対立遺伝子は,洪水地帯における直播栽培に適したイネの改良に有用であると考えられた.
    近畿作物・育種研究会, 2011年, Journal of Crop research, 56, 45 - 49, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • QTL analysis for flowering time using backcross population between Oryza sativa Nipponbare and O. rufipogon
    Pham Thien Thanh, Phuong Dang Thai Phan, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    2010年08月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 85(4) (4), 273 - 279, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Allelic interaction at seed-shattering loci in the genetic backgrounds of wild and cultivated rice species
    Ryo Ishikawa, Pham Thien Thanh, Naoto Nimura, Than Myint Htun, Masanori Yamasaki, Takashige Ishii
    2010年08月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 85(4) (4), 265 - 271, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Genetic diversity and origin of timopheevi wheat inferred by chloroplast DNA fingerprinting
    Naoki Mori, Yasutaka Kondo, Takashige Ishii, Taihachi Kawahara, Jan Valkoun, Chiharu Nakamura
    2009年12月, BREEDING SCIENCE, 59(5) (5), 571 - 578, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Evaluation of genetic diversity among wild rice populations of Oryza rufipogon in Myanmar and Cambodia
    Kageyama H, Akimoto M, Shishido R, Sein T, Htut T, Sarom M, Sato T, Ishii T
    近畿作物・育種研究会, 2009年, Journal of Crop Research, 54(54) (54), 47 - 51, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Evaluation of genetic diversity among rice local varieties in Vietnam
    Takashi Hiraoka, Nobuyuki Ikeda, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    近畿作物・育種研究会, 2009年, Journal of Crop Research, 54(54) (54), 125 - 130, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mapping of quantitative trait loci associated with cold tolerance at the post-germination stage in rice
    A. L. Ranawake, T. Ishii, N. Mori, S. Yoshida, C. Nakamura
    2008年02月, BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT, 22(1) (1), 536 - 540, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • The role of alternating culture temperatures and maltose in enhancing the anther culture efficiency of salt tolerant indica rice (Oryza sativa L.) cultivars, Pokkali and Nona Bokra
    Muhammad A. Javed, Takashige Ishii, Osamu Kamijima, Shuji Misoo
    2007年06月, PLANT BIOTECHNOLOGY, 24(3) (3), 283 - 287, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Sujay Rakshit, Arunita Rakshit, Hideo Matsumura, Yoshihiro Takahashi, Yoshitaka Hasegawa, Akiko Ito, Takashige Ishii, Naohiko T. Miyashita, Ryohei Terauchi
    2007年02月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 114(4) (4), 731 - 743, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Noriaki Aoki, Takayuki Umemoto, Shinya Yoshida, Takashige Ishii, Osamu Kamijima, Ushio Matsukura, Naoyoshi Inouchi
    2006年09月, EUPHYTICA, 151(2) (2), 225 - 234, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mitochondrial microsatellite variability in common wheat and its ancestral species
    Takashige Ishii, Chisa Takahashi, Nobuyuki Ikeda, Osamu Kamijima, Naoki Mori
    2006年06月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 81(3) (3), 211 - 214, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • 野生イネの種子脱粒性、穂の開帳性、頴の色を支配する遺伝子のマッピング
    石井 尊生, 崎山 弘樹, 石川 亮, 上島 脩志
    2006年, 近畿作物・育種研究, 51, 23 - 26, 日本語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Discrepancy of two ecotypes of Oryza sativa L. to salinity at germination and seedling stage
    Javed MA, Ishii T, Kamijima O, Misoo S
    2006年, Annals Biol, 22, 201 - 211, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mechanism of high photosynthetic capacity in BC2F4 lines derived from a cross between Oryza sativa and wild relatives O-rufipogon
    C Masumoto, T Ishii, T Hatanaka, N Uchida
    2005年12月, PLANT PRODUCTION SCIENCE, 8(5) (5), 539 - 545, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • DNA variation in the metallothionein genes in wild rice Oryza rufipogon: Relationship between DNA sequence polymorphism, codon bias and gene expression
    NT Miyashita, K Yoshida, T Ishii
    2005年06月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 80(3) (3), 173 - 183, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Development of near isogenic lines targeting wild QTL from Oryza rufipogon in the genetic cackground of O.sativa by marker-assisted selection and backcrossing.
    IKEDA N, KAMIJIMA Osamu, ISHII Takashige
    神戸大学, 2005年, Mem. Grad. Sci.Technol.,Kobe Univ., 23-A:37-49, 37 - 49, 英語
    [査読有り]
    研究論文（大学，研究機関等紀要）

  • C Vitte, T Ishii, F Lamy, D Brar, O Panaud
    2004年12月, MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS, 272(5) (5), 504 - 511, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • K Yoshida, NT Miyashita, T Ishii
    2004年11月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 109(7) (7), 1406 - 1416, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Z Hashimoto, N Mori, M Kawamura, T Ishii, S Yoshida, M Ikegami, S Takumi, C Nakamura
    2004年11月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 109(8) (8), 1586 - 1596, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Chloroplast and nuclear DNA variation in common wheat: insight into the origin and evolution of common wheat
    S Hirosawa, S Takumi, T Ishii, T Kawahara, C Nakamura, N Mori
    2004年10月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 79(5) (5), 271 - 282, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Enhancement of rice leaf photosynthesis by crossing between cultivated rice, Oryza sativa and wild rice species, Oryza ryfipogon
    C Masumoto, T Ishii, S Kataoka, T Hatanaka, N Uchida
    2004年09月, PLANT PRODUCTION SCIENCE, 7(3) (3), 252 - 259, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Wild-QLT-allele effect in the background of Japonica (Nipponbare) and Indica (IR36) cultivars.
    ISHII Takashige, BAUTISTA N S, SHIMADZUTSU K, KOBAYASHI N, UCHIDA Naotsugu, KAMIJIMA Osamu
    IRRI, 2003年, Advances in Rice Genetics, pp.133-135, 英語
    [査読有り]
    論文集(書籍)内論文

  • Trait-improving wild QTL alleles identified using advanced backcross QLT analysis from a cross between cultivated rice, Oryza sativa and wild rice, O. rufipogon.
    BAUTISTA N S, SHIMADZUTSU K, TERANISHI T, TAKAMATSU S, KOBAYASHI N, UCHIDA Naotsugu, KAMIJIMA Osamu, ISHII Takashige
    2003年, Advances in Rice Genetics, pp.135-138, 英語
    [査読有り]
    論文集(書籍)内論文

  • Salinity tolerance of three Basmati rice lines: A comparative study of yield related characters.
    JAVED M. A, SHABBIR G, MISOO Shuji, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu
    2003年, Kinki J. Crop Sci. Breed., 48,pp.7-12., 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Marker-assisted evaluation of germplasm resources for plant breeding
    Xu Y, Ishii T, McCouch SR
    International Rice Research Institute, 2003年, Rice Science: Innovations and Impact for Livelihood, 213 - 229, 英語
    [査読有り]
    論文集(書籍)内論文

  • QTL analysis for plant and grain characters of sake-brewing rice using a doubled haploid population
    S Yoshida, M Ikegami, J Kuze, K Sawada, Z Hashimoto, T Ishii, C Nakamura, O Kamijima
    2002年12月, BREEDING SCIENCE, 52(4) (4), 309 - 317, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • N Asakura, C Nakamura, T Ishii, Y Kasai, S Yoshida
    2002年11月, MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS, 268(3) (3), 321 - 330, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • 農業形質から評価した在来アズキ系統の遺伝的多様性
    伊勢村武久, 石井尊生, 三十尾修司, 上島脩志
    神戸大学, 2002年, 神戸大学大学院自然科学研究科紀要, 20-B, 165 - 176, 日本語
    研究論文（大学，研究機関等紀要）

  • 伊勢村武久, 石井尊生, 斎藤大樹, 野田千代, 三十尾修司, 上島脩志
    日本, 韓国, 中国, 台湾, ブータンおよびネパールにおいて収集された在来アズキ203系統を供試材料としてDNAレベルの遺伝的変異を解析した. RAPD法により48個のプライマーを用いて解析した結果, 全部で413本の明瞭なバンドが検出され, そのうち97本のバンドで多型が認められた. これらのRAPDバンドを用いると, 供試系統のほとんどを識別することができた. そこで, 多型を示したバンドの有無について1-0データマトリクスを作成し, Simple matching coefficientを求めて非類似度を算出した. その結果, 各地域間の非類似度は, 地域内のそれよりも大きな値を示した. 特に, ブータン-ネパール地域の系統群と日本および韓国-中国-台湾地域の系統群との間において, それぞれ0.615および0.598と極めて大きな値が認められた。全系統間の非類似度をもとにUPGMA法によりクラスター分析を行ったところ, ほぼ日本, 韓国-中国-台湾地域およびブータン-ネパール地域に対応したグループに供試系統を分類することができた. これらのことから, 地域間での在来系統の交流があまりなかったことが推察された. また, 本研究では, 在来アズキ系統にはDNAレベルで大きな遺伝的変異が存在し, これらが今後の育種素材として有用であること, さらに, ブータン-ネパール地域の系統と東アジア地域の系統との雑種集団を用いることにより, 種内レベルでの分子地図作成が可能であることが示唆された.
    日本育種学会, 2002年, 育種学研究, 4(3) (3), 125 - 135, 日本語
    [査読有り]
    研究論文（大学，研究機関等紀要）

  • Construction of molecular linkage map between Oryza sativa and O. rufipogon, using microsatellite markers
    Ishii T, Takamatsu S, Ito H, Ikeda N, Isemura T, Kamijima O
    2002年, Rice Genet Newsl, 19, 97 - 100, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species
    T Ishii, N Mori, Y Ogihara
    2001年11月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 103(6-7) (6-7), 896 - 904, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Nuclear- and chloroplast-microsatellite variation in A-genome species of rice
    T Ishii, Y Xu, McCouch, SR
    2001年08月, GENOME, 44(4) (4), 658 - 666, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • RAPD, RFLP and SSLP analyses of phylogenetic relationships between cultivated and wild species of rice
    NS Bautista, R Solis, O Kamijima, T Ishii
    2001年04月, GENES & GENETIC SYSTEMS, 76(2) (2), 71 - 79, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Ultra-simple DNA extraction method for marker-assisted selection using microsatellite markers in rice
    N Ikeda, NS Bautista, T Yamada, O Kamijima, T Ishii
    2001年03月, PLANT MOLECULAR BIOLOGY REPORTER, 19(1) (1), 27 - 32, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Assignment of a brown planthopper (Nilaparvata lugens Stal) resistance gene bph4 to the rice chromosome 6
    M Kawaguchi, K Murata, T Ishii, S Takumi, N Mori, C Nakamura
    2001年03月, BREEDING SCIENCE, 51(1) (1), 13 - 18, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Microsatellites and microsynteny in the chloroplast genomes of Oryza and eight other Gramineae species
    T Ishii, McCouch, SR
    2000年06月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 100(8) (8), 1257 - 1266, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mapping and genome organization of microsatellite sequences in rice (Oryza sativa L.)
    S Temnykh, WD Park, N Ayres, S Cartinhour, N Hauck, L Lipovich, YG Cho, T Ishii, McCouch, SR
    2000年03月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 100(5) (5), 697 - 712, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Diversity of microsatellites derived from genomic libraries and GenBank sequences in rice (Oryza sativa L.)
    YG Cho, T Ishii, S Temnykh, Chen, X, L Lipovich, McCouch, SR, WD Park, N Ayres, S Cartinhour
    2000年03月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 100(5) (5), 713 - 722, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Comparative molecular mapping in Ceratotropis species using an interspecific cross between azuki bean (Vigna angularis) and rice bean (V-umbellata)
    A Kaga, T Ishii, K Tsukimoto, E Tokoro, O Kamijima
    2000年01月, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 100(2) (2), 207 - 213, 英語
    [査読有り]
    研究論文（学術雑誌）

  • Mitochondrial genome differentiation in the genus Phyllostachys
    F Taguchi-Shiobara, T Ishii, T Terachi, K Tsunewaki
    1998年01月, JARQ-JAPAN AGRICULTURAL RESEARCH QUARTERLY, 32(1) (1), 7 - 14, 英語
    研究論文（学術雑誌）

  • Hideo Maeda, Takashige Ishii, Hirokazu Mori, Junji Kuroda, Masato Horimoto, Itsuro Takamure, Toshiro Kinoshita, Osamu Kamijima
    1997年12月, Breeding Science, 47(4) (4), 317 - 320
    研究論文（学術雑誌）

  • Susan R. McCouch, Xiuli Chen, Olivier Panaud, Svetlana Temnykh, Yunbi Xu, Yong Gu Cho, Ning Huang, Takashige Ishii, Matthew Blair
    1997年09月, Plant Molecular Biology, 35(1-2) (1-2), 89 - 99
    研究論文（学術雑誌）

  • Tetsuya Yamada, Shuji Misoo, Takashige Ishii, Yasuhiro Ito, Keigo Takaoka, Osamu Kamijima
    1997年09月, Breeding Science, 47(3) (3), 229 - 236
    研究論文（学術雑誌）

  • Phylogenetic relationships among rice species based on chloroplast genome differentiation
    Ishii T, Tsunewaki K
    1997年, Science of the Rice Plant, 3, 48 - 53

  • 近縁野生種を用いたバレイショ体細胞雑種のゲノム構成と戻し交雑世代における染色体数の変異
    山田哲也, 中川久美, 保坂和良, 三十尾修司, 石井尊生, 上島脩志
    1997年, 近畿作物・育種研究, 42, 47 - 48

  • バレイショ二倍性半数体間の体細胞雑種系統における細胞質ゲノムの構成
    栗谷由美, 山田哲也, 三十尾修司, 石井尊生, 淡野一郎, 上島脩志
    1997年, 近畿作物・育種研究, 42, 49 - 50

  • A. Kaga, M. Ohnishi, T. Ishii, O. Kamijima
    1996年10月, Theoretical and Applied Genetics, 93(5-6) (5-6), 658 - 663
    研究論文（学術雑誌）

  • Kuldeep Singh, Takashige Ishii, Arnold Parco, Ning Huang, Darshan S. Brar, Gurdev S. Khush
    1996年06月, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 93(12) (12), 6163 - 6168
    研究論文（学術雑誌）

  • Phylogenetic relationships between cultivated and wild species of rice as revealed by DNA polymorphisms
    Ishii T, Nakano T, Maeda H, Kamijima O, Khush GS
    1996年, Rice Genetics III, 367 - 372

  • Centromere mapping and orientation of the cytological, classical, and molecular linkage maps of rice
    Khush GS, Singh K, Ishii T, Parco A, Huang N, Brar DS, Multani DS
    1996年, Rice Genetics III, 57 - 75

  • Takashige Ishii, Toshitsugu Nakano, Hideo Maeda, Osamu Kamijima
    1996年, Genes and Genetic Systems, 71(4) (4), 195 - 201
    研究論文（学術雑誌）

  • R. Dalmacio, D. S. Brar, T. Ishii, L. A. Sitch, S. S. Virmani, G. S. Khush
    1995年01月, Euphytica, 82(3) (3), 221 - 225
    研究論文（学術雑誌）

  • Takashige Ishii, Darshan S. Brar, Gerard Second, Gurdev S. Khush, Koichiro Tsunewaki, Takashige Ishii, Koichiro Tsunewaki
    1995年, Japanese Journal of Genetics, 70(5) (5), 643 - 652, 英語
    研究論文（学術雑誌）

  • T. Ishii, D. S. Brar, D. S. Multani, G. S. Khush
    1994年, Genome, 37(2) (2), 217 - 221
    研究論文（学術雑誌）

  • T. Ishii, T. Terachi, N. Mori, K. Tsunewaki
    1993年03月, Theoretical and Applied Genetics, 86(1) (1), 88 - 96
    研究論文（学術雑誌）

  • T. Ishii, K. Tsunewaki
    1991年, Genome, 34(5) (5), 818 - 826
    研究論文（学術雑誌）

  • CYTOPLASMIC AND NUCLEAR-DNA DIFFERENTIATION IN CULTIVATED RICE SPECIES
    T ISHII, T TERACHI, N MORI, K TSUNEWAKI
    1991年, RICE GENETICS II, 655 - 657, 英語
    研究論文（国際会議プロシーディングス）

  • Takashige Ishii, Olivier Panaud, D. S. Brar, G. S. Khush
    1990年08月, Plant Molecular Biology Reporter, 8(3) (3), 167 - 171
    研究論文（学術雑誌）

  • Chromosomal location of ribosomal RNA genes in rice by in situ hybridization.
    Islam-Faridi MN, Ishii T, Kumar V, Sitch LA, Brar DS
    1990年, Rice Genet. Newsl., 7, 143 - 144

  • RFLP analysis of rice mitochondrial DNA
    Ishii T, Tsunewaki K
    1989年, Rice Genet Newsl, 6, 153 - 155

  • Takashige Ishii, Toru Terachi, Koichiro Tsunewaki
    1988年, Japanese Journal of Genetics, 63(6) (6), 523 - 536, 英語
    研究論文（学術雑誌）

  • Takashige Ishii, Toru Terachi, Koichiro Tsunewaki
    1986年, Japanese Journal of Genetics, 61(6) (6), 537 - 541, 英語
    研究論文（学術雑誌）

■ MISC
  • 石川 亮, 山形 悦透, 小出 陽平, 石井 尊生, 石川 隆二, 秋本 正博, 津田 勝利, 藤田 大輔
    日本育種学会, 2023年, 育種学研究, advpub, 日本語

  • Who was the mother of wheat?: a view from genetic variation in chloroplast DNA among wheat species
    Naoki Mori, Yuko Hidehira, Takashige Ishii, Chiharu Nakamura
    The domestication of wheat and barley was the most important step in the emergence of farming communities that led to the ancient civilizations of Mesopotamia. Several lines of evidence indicate that emmer wheat was the earliest form of domesticated wheat derived from wild emmer wheat. Chloroplast DNA fingerprinting of wild and domesticated emmer wheat revealed that two dis
    2009年, Proc. 4th International Conference on Energy Efficiency and Agricultural Engineering, 725 - 729, 英語

  • The salinity tolerance evaluation of two eco-types of Oryza sativa L. at different growth stages in successive salinity levels.
    Javed M.A, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu, MISOO Shuji
    2006年, 3rd. Int.. Conf. on Sustainable Agriculture for Food, Energy, and Industry, 英語

  • Photosynthesis, growth and yield of BC2F4 lines derived from Oryza sativa and wild rice species, O. rufipogon.
    Chisato Masumoto, Takashige Ishii, Tomoko Hatanaka, Naotsugu Uchida
    2004年, Proceedings of the 4th International Crop Science Congress, 26, 英語

  • QTL analysis for several agronomic characters using four BC2 poppulations between wild and cultivated rice species.
    ISHII Takashige
    2003年, Proc. Int. Genet.Resour. Work. Oryza., pp.7-10, 英語

  • Origins of domesticated emmer and common wheat inferred from chloroplast DNA fingerprinting.
    MORI Naoki, ISHII Takashige, ISHIDO T, HIROSAWA S, WATATANI H, KAWAHARA T, NESBITT M, BELAY G, TAKUMI Shigeo, OGIHARA Y
    Instituto Sperimentale per la Cerealicoltura, 2003年, Proc. Xth Int. Wheat Genet. Symp., Vol.1,pp.25-28, 25 - 28, 英語

  • Variation in chloroplast microsatellite loci among wild and cultivated species of Emmer wheat
    Mori N, Ishii T, Ishido T, Belay G, Takumi S, Kawahara T, Ogihara Y, Nakamura C
    2002年, Proc 4th Int Triticeae Symp, 英語

  • ベトナム・ミヤンマーにおける野生イネの収集
    石井 尊生
    2000年, 近畿作物・育種研究, 45, 73 - 76, 日本語

  • RFLP分析に基づくイネ属Aゲノム種の系統関係
    石井尊生
    1994年, 東北大学遺伝生態研究センター通信, 26, 1 - 3

  • Aegilops searsii is a possible cytoplasm donor to Ae. Kotschyi and Ae. variabilis.
    Siregar UJ, Ishii T, Tsunewaki K
    1988年, Proc. VII Int. Wheat Genet. Symp. Cambridge, 1, 145 - 151

■ 書籍等出版物
  • Information and data on natural introgression
    Takashige ISHII
    分担執筆, OECD Environment, Health and Safety Publications, 2021年

  • Rice Genomics, Genetics and Breeding - Domestication loci controlling panicle shape, seed shattering and seed awning
    Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    その他, Springer, 2018年, 英語
    学術書

  • 植物学の百科事典
    石井 尊生
    その他, 丸善出版（日本植物学会 編）, 2016年06月, 日本語
    事典・辞書

  • 植物ゲノム科学辞典
    石井 尊生
    その他, 朝倉書店, 2009年04月, 日本語, 量的形質遺伝子座
    事典・辞書

  • ミヤンマーの野生イネ
    石井尊生
    アジア遊学 勉誠出版, 2003年

  • 葉緑体ゲノムからみた系統関係
    石井尊生, 常脇恒一郎
    稲学大成 農山漁村文化協会, 1990年

■ 講演・口頭発表等
  • Target capture法に基づく日本と中国のウメの集団構造および系統関係について
    沼口孝司, 赤木剛士, 北村祐人, 石川亮, 石井尊生
    園芸学会 平成30年度秋季大会, 2019年03月, 日本語, 園芸学会, 明治大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • QTL analysis for awnlessness using a backcross population between Oryza rufipogon and O. sativa IR36
    Priya J.A. Yaddehige, Rie Kuwata, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    近畿作物・育種研究会 第186回例会, 2018年11月, 英語, 近畿作物・育種研究会, 京都大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 熱帯アジアにおける栽培イネから野生イネへの遺伝子流動について
    谷尾侑香, ORN Chhourn, 秋本正博, 宍戸理恵子, HTUN Than Myint, PHAN Phuong, Dang Thai, 野々村賢一, 小出陽平, 石川亮, 石井尊生
    育種学研究, 2018年09月, 日本語

  • 野生イネOryza meridionalisを用いて同定されたイネ種子亜鉛濃度を支配するqGZn9は連鎖した２つの遺伝子座によって制御される
    宮崎直哉, 谷古健太, 岩田将英, 門田剛太郎, Orn Chhourn, 吉田周作, 石井尊生, 馬建鋒, 石川亮
    日本育種学会第134回講演会, 2018年09月, 日本語, 日本育種学会, 岡山大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 穂の開帳性が栽培イネ(Oryza sativa)の穂形態に与える影響について
    窪田芳生, 西岡諒, 石井尊生, 石川亮
    日本育種学会第134回講演会, 2018年09月, 日本語, 日本育種学会, 岡山大学, 国内会議
    ポスター発表

  • ジャポニカ型栽培イネ（日本晴）の非脱粒性に関与する新規遺伝子座の離層形成への効果
    杉山昇平, 辻村雄紀, 大塚宏太郎, Than Myint Htun, 石井尊生, 石川亮
    日本育種学会第134回講演会, 2018年09月, 日本語, 日本育種学会, 岡山大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • イネ育種における野生イネ利用の可能性
    石川亮, 宮崎直哉, 杉山昇平, 窪田芳生, 馬建鋒, 石井尊生
    日本育種学会第134回講演会, 2018年09月, 日本語, 日本育種学会, 岡山大学, 国内会議
    シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

  • Exomeと果実・葉形状にみる日本のウメの多様性
    沼口孝司, 赤木剛士, 北村祐人, 大江孝明, 石川亮, 石井尊生
    日本育種学会第134回講演会, 2018年09月, 日本語, 日本育種学会, 岡山大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza rufipogon における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用
    杉山昇平, Cristina Castillo, 岡佑美, Than Myint Htun, 野々村賢一, 石井尊生, 石川亮
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2018, 2018年07月, 日本語, 国立遺伝学研究所, 国内会議
    ポスター発表

  • オーストラリア由来の野生イネOryza meridionalis を用いたイネ種子亜鉛濃度を支配する遺伝子座の同定
    宮崎直哉, 谷古健太, 岩田将英, 門田剛太郎, Orn Chhourn, 吉田周作, 石井尊生, 馬建鋒, 石川亮
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2018, 2018年07月, 日本語, 国立遺伝学研究所, 国内会議
    ポスター発表

  • イネにおける小穂の開花メカニズムの解明に向けて
    小川風和, 石川亮, 石井尊生
    近畿作物・育種研究会 第185回例会, 2018年06月, 日本語, 近畿作物・育種研究会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • ジャポニカ型栽培イネOryza sativa 日本晴の非脱粒性に関与する新規遺伝子座の同定
    辻村雄紀, Than Myint Htun, 沼口孝司, 高間菜摘, 杉山昇平, 石井尊生, 石川亮
    第59回日本植物生理学会年会, 2018年03月, 日本語, 植物生理学会, 札幌コンベンションセンター, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネの繁殖に必須の種子脱粒性に関わる遺伝子座の同定
    辻村雄紀, Than Myint Htun, 沼口孝司, 高間菜摘, 杉山昇平, 石井尊生, 石川亮
    第49回種生物学シンポジウム, 2017年12月, 日本語, 種生物学会, すかっとランド九頭竜, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogonと栽培イネOryza sativaの交雑系統群を利用した新規Na+ 輸送系遺伝子・変異の探索
    堀内智貴, 石川亮, 田野井慶太朗, 小林奈通子, 石井尊生, 堀江智明
    日本育種学会第132回講演会, 2017年10月, 日本語, 日本育種学会, 岩手大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • ウメ遺伝資源における収穫期および果実形質の多様性
    沼口孝司, 北村祐人, 仲慶晃, 大江孝明, 土田靖久, 石川亮, 石井尊生
    日本育種学会第132回講演会, 2017年10月, 日本語, 日本育種学会, 岩手大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • ウメ黒星病抵抗性に関与するQTLの同定に向けて
    沼口孝司, 北村祐人, 石川亮, 石井尊生
    園芸学会 平成29年度秋季大会, 2017年09月, 日本語, 園芸学会, 酪農学園大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネと野生イネの戻し交雑系統群を用いたイネの花器官を支配する遺伝子座の同定
    石川 亮, 渡部 貴史, 西岡 諒, Pham Thien Thanh, 石井 尊生
    日本育種学会第131回講演会, 2017年07月, 日本語, 日本育種学会, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • インディカ型栽培イネIR36の非脱粒性を支配する新規遺伝子座の探索
    辻村 雄紀, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 西村 彬則, 杉山 昇平, 岡 佑美, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第131回講演会, 2017年07月, 日本語, 日本育種学会, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネ（Oryza rufipogon）の遺伝的背景で芒を短くするためには - イネの栽培化における無芒性の検証にむけて –
    池本 麻衣, 大塚 光晴, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第131回講演会, 2017年03月, 日本語, 日本育種学会, 名古屋大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネと野生イネの戻し交雑系統群を用いたイネの花器官を支配する遺伝子座の同定
    石川 亮, 渡部 貴史, 西岡 諒, Pham Thien Thanh, 石井 尊生
    日本育種学会第131回講演会, 2017年03月, 日本語, 日本育種学会, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • エンマーコムギの戻し交雑自殖系統を用いた栽培化関連形質の解析
    島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Cristian, 石井 尊生, Kianian Shahryar, 森 直樹
    日本育種学会第131回講演会, 2017年03月, 日本語, 名古屋大学, ［目的] エンマーコムギ (Triticum turgidum ssp. dicoccum) は、コムギ属の中で最も初期に栽培化されて起源した栽培種の一つであり、初期農耕の起源と世界各地への伝播において重要な役割を果たした。本研究では、コムギ栽培化の初期に起こった遺伝的変化を解明することを目的として、祖先野生種 (T. turgidum ssp. dicoccoides) の遺伝的背景を持つ戻し交雑自殖系統を育成し、栽培化関連形質を評価することによりこれらを支配するQTLの解析を進めている。 ［方法］ 栽培エンマーコムギ (以下Dcm1001と呼ぶ)と野生エンマーコムギ (以下Dcc63) の交雑から野生種の遺伝的背景を持つ戻し交雑自殖系統 (BC2F14) を育成した（図１）。これらの栽培化関連形質を評価し、分子マーカーによるQTL解析により、, 国内会議
    ポスター発表

  • インディカ型栽培イネIR36の非脱粒性を支配する新規遺伝子座の探索
    辻村 雄紀, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 西村 彬則, 杉山 昇平, 岡 佑美, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第131回講演会, 2017年03月, 日本語, 日本育種学会, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生エンマーコムギの遺伝的背景に栽培種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統を用いた栽培化関連形質の解析
    島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Cristian, 石井 尊生, Kianian Shahryar, 森 直樹
    第11回ムギ類研究会, 2016年12月, 日本語, 岡山大学 資源植物学研究所, エンマーコムギはコムギ属の中で最も初期に栽培化されたコムギの一つとされている。本研究では、エンマーコムギの栽培化の初期に起こった遺伝的変化の解明を目的として、野生エンマーコムギと栽培エンマーコムギから作出された野生種の遺伝的背景を持つ戻し交雑自殖系統について、それらの栽培化関連形質を調査した。また、分子マーカーによるQTL解析を行うことで、エンマーコムギの栽培化関連形質を支配するQTLの染色体上の位置や効果を推定した。, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogon由来の穂の開帳性に関する遺伝子座と関連遺伝子の発現について
    西岡 諒, 三日月 裕美, 田中 裕, 沼口 孝司, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogonと栽培イネO. sativaの戻し交雑自殖系統を用いた節からの出芽能力の評価
    池本 麻衣, 大八木 徹弥, Pham Thien Thanh, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogonとインディカ型栽培イネ（カサラス）の戻し交雑集団を用いた種子脱粒性に関する新規遺伝子座の探索
    岡 佑美, 竹中 祥尭, 高間 菜摘, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 辻村 雄紀, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • ジャポニカ型栽培イネ（日本晴）の非脱粒性に関与した遺伝子座の推定
    辻村 雄紀, Than Myint Htun, 沼口 孝司, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    ポスター発表

  • ウメ遺伝資源における黒星病およびかいよう病抵抗性の評価
    沼口 孝司, 北村 祐人, 土田 靖久, 仲 慶晃, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    ポスター発表

  • Oryza rufipogonとインディカ型栽培イネ（カサラス）の戻し交雑集団を用いた種子脱粒性に関する新規遺伝子座の探索
    岡 佑美, 竹中 祥尭, 高間 菜摘, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 辻村 雄紀, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第130回講演会, 2016年09月, 日本語, 日本育種学会, 鳥取大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Evaluation of seed-shattering behaviour in early rice domestication
    Ryo Ishikawa, Yumi Oka, Yuki Tsujimura, Natsumi Takama, Chizuru Inoue, Than Myint Htun, Takashige Ishii
    8th World Archaeology Congress, 2016年09月, 英語, Doshisha University, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • A closed panicle played an important role in rice domestication
    Ryo Nishioka, Koji Numaguchi, Pham Thien Thanh, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    8th World Archaeology Congress, 2016年09月, 英語, Doshisha University, 国際会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogon由来の穂の開帳性を支配する遺伝子座の推定と効果の検証
    西岡 諒, 三日月 裕美, 田中 裕, 沼口 孝司, 石川 亮, 石井 尊生
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ, 2016年07月, 日本語, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 熱帯アジアの野生イネOryza rufipogon
    石井 尊生
    イネ属近縁野生種研究会, 2016年07月, 日本語, 遺伝学研究所, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • インディカ型栽培イネ（カサラス）の非脱粒性を支配するsh4座以外の遺伝子座の探索
    岡 佑美, 竹中 祥尭, 高間 菜摘, 井上 千鶴, 辻村 雄紀, Than Myint Htun, 石井 尊生, 石川亮
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ, 2016年07月, 日本語, 名古屋大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 栽培イネの祖先となった野生イネとは？
    石井 尊生
    第６回北海道イネ研究会, 2016年06月, 日本語, 北海道大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Identification of quantitative trait loci controlling seed-shattering behaviour in rice
    Yuki Tsujimura, Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    PAG Asia 2016, 2016年06月, 英語, Grand Copthorne Waterfront Hotel, 国際会議
    ポスター発表

  • Allelic interaction at awing loci in the genetic backgrounds of wild and cultivated rice
    Mai Ikemoto, Mitsuharu Otsuka, Pham Thien Thanh, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    PAG Asia 2016, 2016年06月, 英語, Grand Copthorne Waterfront Hotel, 国際会議
    ポスター発表

  • 野生イネと栽培イネの間で検出されたアルミニウムストレス耐性を支配する遺伝子座qAl1の遺伝学的解析
    和田 もりえ, 岩田 将英, 横正 健剛, 吉田 周作, Pham Tien Thanh, 石井 尊生, 馬 建鋒, 石川 亮
    日本育種学会第129回講演会, 2016年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネおよび栽培イネの遺伝的背景における芒の長さを支配する遺伝子座の対立遺伝子間の相互作用
    池本 麻衣, 大塚 光晴, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第129回講演会, 2016年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogonと栽培イネO. sativaの戻し交雑集団を用いた穂の開帳性に関するQTL解析
    西岡 諒, 三日月 裕美, 田中 裕, 沼口 孝司, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第129回講演会, 2016年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    ポスター発表

  • オーストラリア由来の野生イネOryza meridionalisを用いた種子亜鉛濃度に関わる遺伝子座の同定
    岩田 将英, 谷古 健太, 門田 剛太郎, Orn Chhourn, 吉田 周作, 石井 尊生, 馬 建鋒, 石川 亮
    日本育種学会第129回講演会, 2016年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    ポスター発表

  • インディカ型栽培イネKasalathの脱粒性喪失に関与した新規遺伝子座の探索
    岡 佑美, 井上 千鶴, Than Myint Htun, 竹中 祥尭, 辻村 雄紀, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第129回講演会, 2016年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生エンマーコムギの遺伝的背景に栽培種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統を用いた栽培化関連形質の解析
    島田 沙織, 牛 恒一, Vladutu Christian, 石井 尊生, Kianian Shahryar, 森 直樹
    第10回 ムギ類研究会, 2015年12月, 日本語, 三重大学農学部, エンマーコムギの栽培化初期に起こった遺伝的変化を明らかにするため、野生エンマーコムギの遺伝的背景に栽培種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統(BC2F12)を育成し、SSRマーカーを用いた栽培化関連形質の解析を行った。その結果、まだメーカー数が藤生部であるが穂軸の脆弱性や１穂あたりの小穂数、粒数、など栽培化に関連した重要な形質に関与するQTLの座乗位置を推定することができた。, 国内会議
    ポスター発表

  • 栽培エンマーコムギの遺伝的背景に野生種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統を用いた栽培化関連QTLの解析
    宮崎 裕貴, Pham-Minh Ngoc, Vladutu Christian, 石井 尊生, Kianian Shahryar, 森 直樹
    第10回 ムギ類研究会, 2015年12月, 日本語, 三重大学 農学部, エンマーコムギの栽培化初期に起こった遺伝的変化を明らかにするため、栽培エンマーコムギの遺伝的背景に野生種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統(BC2F12)を育成し、SSRマーカーを用いた栽培化関連QTLの解析を行った。その結果、穂軸の脆弱性や１穂あたりの小穂数、粒数、など栽培化に関連した重要な形質に関与するQTLの座乗位置を推定することができた。, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生二粒系コムギの遺伝的背景に栽培種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統群の作出：栽培化関連形質の遺伝学的解析に向けて
    森 直樹, 牛 恒一, Vladutu Cristian, 石井 尊生, Kianian Shahryar
    日本育種学会第１２８回講演会, 2015年09月, 日本語, 新潟大学, エンマーコムギ(Triticum turgidum ssp. dicoccum)は今から約1万年前に野生二粒系コムギ（別名パレスチナコムギ、T. turgidum ssp. dicoccoides）から栽培化されて誕生した。このコムギは新石器時代から数千年にわたってムギ農耕の主要な作物として利用されたことが知られている。我々はこの栽培化の過程でゲノムにどのような変化が起こったのかを明らかにするため、これまでに栽培種と野生種の交雑に由来するF2集団や栽培種の遺伝的背景に野生種の染色体断片を導入した戻し交雑系統群を用いて解析してきた。今回、栽培化初期の遺伝的変化を捉えることを目的として、野生二粒系コムギの遺伝的背景に栽培エンマーコムギの染色体断片を導入した戻し交雑系統群を作成したので報告する。, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネ(Oryza rufipogon) の遺伝的背景における種子脱粒性と穂の開帳性の関係
    井上 千鶴, Than Myint Htun, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第128回講演会, 2015年09月, 日本語, 日本育種学会, 新潟大学, 国内会議
    ポスター発表

  • Evaluation of the domestication-related traits in rice
    Ryo Ishikawa, Yumi Oka, Ryo Nishioka, Mai Ikemoto, Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Koji Numaguchi, Takashige Ishii
    Early rice cultivation systems and their impact on social evolution and the environment., 2015年09月, 英語, University College London, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • Evaluation of genetic variation among wild and cultivated rice in Cambodia
    Orn Chhourn, Rieko Shishido, Masahiro Akimoto, Ryo Ishikawa, Than Myint Htun, Ryo Nishioka, Men Sarom, Sakhan Sophany, Ouk Makara, Takashige. Ishii
    日本育種学会第128回講演会, 2015年09月, 英語, 日本育種学会, 新潟大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネOryza rufipogon由来の穂の開帳性を支配する遺伝子座の推定
    西岡 諒, 三日月 裕美, Than Myint Htun, 石川 亮, 石井 尊生
    近畿作物・育種研究会 第179回例会, 2015年05月, 日本語, 近畿作物・育種研究会, 奈良県立橿原考古学研究所, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza rufipogonと栽培イネO. sativaの戻し交雑自殖系統を用いた節からの出芽・出根能力およびひこばえの発生能力の評価
    池本 麻衣, 大八木 徹弥, Pham Thien Thanh, 石川 亮, 石井 尊生
    近畿作物・育種研究会 第179回例会, 2015年05月, 日本語, 近畿作物・育種研究会, 奈良県立橿原考古学研究所, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネと栽培イネのアルミニウムストレス耐性を支配する遺伝子座の同定とその効果
    和田 もりえ, 岩田 将英, 吉田 周作, Pham Thien Thanh, 石井 尊生, 馬 建鋒, 石川 亮
    日本育種学会第127回講演会, 2015年03月, 日本語, 日本育種学会, 玉川大学, 国内会議
    ポスター発表

  • インディカ型栽培イネ(Oryza sativa cv. IR36)における種子脱粒性の喪失に関与した遺伝子座数の推定
    西村 彬則, Than Myint Htun, 井上 千鶴, 岡 佑美, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第127回講演会, 2015年03月, 日本語, 日本育種学会, 玉川大学, 国内会議
    ポスター発表

  • Evaluation of genetic variation among wild rice populations in Cambodia
    Orn Chhourn, Rieko Shishido, Hiroki Kageyama, Masahiro Akimoto, Ryo Ishikawa, Makara Ouk, Sarom Men, Takashige Ishii
    日本育種学会第127回講演会, 2015年03月, 英語, 日本育種学会, 玉川大学, 国内会議
    ポスター発表

  • A closed panicle regulated by OsLG1 was a selected trait during rice domestication
    TAKASHIGE ISHII
    Plant & Animal Genome XXIII, 2015年01月, 英語, San Diego, USA, 国際会議
    [招待有り]
    シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

  • Seed shattering behaviour and abscission layer formation in rice
    Cizuru Inoue, Than Myint Htun, Yumi Oka, Kanako Inoue, Ken-ichi Ikeda, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    Marchantia Workshop 2014, 2014年12月, 英語, Centennial Hall, Kobe University, 国際会議
    ポスター発表

  • 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座の相互作用と離層形態
    井上 千鶴, Than Myint Htun, 井上 加奈子, 池田 健一, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第126回講演会, 2014年09月, 日本語, 日本育種学会, 南九州大学, 国内会議
    ポスター発表

  • 戻し交雑自殖系統を用いたエンマーコムギの栽培化関連形質の遺伝学的解析
    森 直樹, Ngoc Pham Minh, Vladutu Cristian, Thanh Pham Thien, Thanh Phan Thi, 石井 尊生, Kianian Shahryar
    日本育種学会 第１２６回講演会, 2014年09月, 日本語, 南九州大学, エンマーコムギ (Triticum turgidum ssp. dicoccum)は、約１万年前に野生種 (パレスチナコムギ、T. turgidum ssp. dicoccoides) から栽培化されて誕生した。このコムギは新石器時代から数千年にわたり西南アジアからヨーロッパにかけて主要な穀物として利用されたことが知られている。我々はコムギの栽培化初期の遺伝的変化を明らかにするため、エンマーコムギとパレスチナコムギのF1にエンマーコムギを戻し交雑し、エンマーコムギの遺伝的背景に野生種の染色体断片を導入した戻し交雑自殖系統を作成した。本講演では、この系統を用いて脱粒性などの栽培化関連形質のQTL解析を行ったので報告する。, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネと栽培イネのアルミニウムストレス耐性を支配する遺伝子座の同定
    和田 もりえ, 岩田 将英, 吉田 周作, Pham Thien Thanh, 石井 尊生, 馬 建鋒, 石川 亮
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2014, 2014年07月, 日本語, 東京大学, 国内会議
    シンポジウム・ワークショップパネル（公募）

  • 野生イネ(Oryza rufipogon)における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用
    井上 千鶴, Than Myint Htun, Orn Chhourn, 岡 佑美, 石井 尊生, 石川 亮
    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2014, 2014年07月, 日本語, 東京大学, 国内会議
    シンポジウム・ワークショップパネル（公募）

  • 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用
    井上 千鶴, Than Myint Htun, 石井 尊生, 石川 亮
    日本育種学会第125回講演会, 2014年03月, 日本語, 日本育種学会, 東北大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における栽培化関連形質の評価
    西村 彬則, 岩崎 友哉, 山本 知佳, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第125回講演会, 2014年03月, 日本語, 日本育種学会, 東北大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Identification of a quantitative trait locus involved in abscission layer formation for seed shattering in Asian wild rice, Oryza rufipogon
    Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Orn Chhourn, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
    日本育種学会第125回講演会, 2014年03月, 英語, 日本育種学会, 東北大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Evaluation of genetic diversity among rice varieties in Cambodia
    Orn Chhourn, Ryo Ishikawa, Sakhan Sophany, Ouk Makara, Takashige Ishii
    7th International Conference of Rice Genetics, 2013年11月, 英語, Dusit Thai Hotel Manila, Philippine, 国際会議
    ポスター発表

  • Closed panicles in rice domestication
    Ishii T, Numaguchi K, Miura K, Yoshida K, Thanh PT, Htun TM, Yamasaki M, Matsumoto T, Terauchi R, Ishikawa R, Ashikari M
    International Rice Genetics Symposium, 2013年11月, 英語, Manila, Philippines, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • A closed panicle trait regulated by OsLG1 in domesticated rice, Oryza sativa L.
    Ryo Ishikawa, Kotaro Miura, Kentaro Yoshida, Koji Numaguchi, Than Myint Htun, Pham Thien Thanh, Takashi Matsumoto, Masanori Yamasaki, Ryohei Terauchi, Motoyuki Ashikari, Takashige Ishii
    7th International Rice Genetics Symposium, 2013年11月, 英語, Dusit Thai Hotel Manila, Philippine, 国際会議
    ポスター発表

  • A closed panicle trait regulated by OsLG1 in domesticated rice, Oryza sativa L.
    Ryo Ishikawa, Kotaro Miura, Kentaro Yoshida, Koji Numaguchi, Than Myint Htun, Pham Thien Thanh, Takashi Matsumoto, Masanori Yamasaki, Ryohei Terauchi, Motoyuki Ashikari, Takashige Ishii
    7th International Conference of Rice Genetics, 2013年11月, 英語, Dusit Thai Hotel Manila, Philippine, 国際会議
    ポスター発表

  • 穂が閉じることによって野生イネはどう変化したか？
    沼口 孝司, Htun Than Myint, Thanh Pham Thien, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第124回講演会, 2013年10月, 日本語, 日本育種学会, 鹿児島大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Evaluation of genetic variation among wild rice populations of Oryza rufipogon
    Ishii T
    Expert Consultation Workshop on the Use of Rice Wild Relatives for Rice Improvement, 2013年10月, 英語, Shizuoka, Japan, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • Genetic analysis of domestication traits in emmer wheat using an F2 population
    Naoki Mori, Phan Thi Thanh, Cristian Vladutu, Pham Thien Thanh, Takashige Ishii, Miyuki Nitta, Shuhei Nasuda, Shahryar Kianian
    12th International Wheat Genetics Symposium,, 2013年09月, 英語, Pacifico Yokohama, Japan, Emmer wheat (Triticum turgidum ssp. dicoccum) was a principal crop in the development and spread of Neolithic agriculture in the Old World. It represents the primitive situation in the domestication of AABB tetraploid wheat. It has non free-threshing (hulled) habit and relatively fragile rachis, although it has non-shattering spike. The more advanced forms of tetraploid whea, 国際会議
    ポスター発表

  • Molecular genetic analysis of the QTLs involved in the domestication of emmer wheat
    Thanh P. T, C. Vladutu, S. Kianian, T. Ishii, T. Pham, S. Nasuda, M. Nitta, N. Mori
    日本育種学会 第122回講演会, 2012年09月, 英語, 京都産業大学, Significant association between wheat and human began in southwest Asia more than 10000 years ago. Emmer wheat was one of the founder crop that was domesticated from wild emmer wheat. In the present study, QTL analysis was carried out to estimate the valuable QTLs underlying the domestication of emmer wheat., 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Evaluation of genetic variation among wild populations and local varieties of rice in Vietnam
    Ishii T
    Rice Symposium: Trends in Rice Research to Overcome Stresses in a context of Climate Change, 2012年09月, 英語, Hanoi, Vietnam, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • Evaluation of genetic variation among wild populations and local varieties in rice
    Ishii T
    Rice and Language across Asia Symposium, 2011年11月, 英語, Cornell Univ, USA, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • 山田錦の両親系統における酒造好適性にかかわる染色体領域の推定
    八軒 雄大, 吉田 晋弥, 石井 尊生, 太田 淳, 明石 貴裕, 西村 顕, 森 直樹
    日本育種学会 第120回講演会, 2011年09月, 日本語, 福井県立大学、福井, 国内会議
    ポスター発表

  • 野生イネの遺伝的背景における栽培イネの非脱粒性遺伝子の効果
    石川 亮, Than Myint Htun, 山崎 将紀, Pham Thien Thanh, 石井 尊生
    第52回日本植物生理学会年会, 2011年03月, 日本語, 日本植物生理学会, 東北大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネ (Oryza rufipogon)の種子有芒性の評価および遺伝子マッピング
    大塚 光晴, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第119回講演会, 2011年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネ Oryza sativa Nipponbareを野生イネO. rufipogon W630で戻し交雑した自殖系統群を用いた植物と種子の形態形質に関するQTL解析
    山本 知佳, 岩崎 友哉, 石川 亮, 石井 尊生
    日本育種学会第119回講演会, 2011年03月, 日本語, 日本育種学会, 横浜市立大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Wild rice: Interesting materials for plant breeding and genetics
    Ishii T
    Special Seminar in International Platform for Asian Agricultural Education, 2010年11月, 英語, Kasetsart Univ, Thailand, 国際会議
    公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等

  • Domestication of rice
    Ishii T
    Special Seminar in International Platform for Asian Agricultural Education, 2010年11月, 英語, Chiang Mai Univ, Thailand, 国際会議
    公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等

  • Gene mapping using molecular markers
    Ishii T
    International Workshop on Agrobioresource Conservation and Pest Management in Southeast Asia, 2010年06月, 英語, Kobe, Japan, 国際会議
    公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等

  • QTL analysis for spikelet opening time using backcross inbred lines between Oryza sativa Nipponbare and O. rufipogon
    Pham Thien Thanh, Phan Dang, Thai Phuong, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    日本育種学会第117回講演会, 2010年03月, 英語, 日本育種学会, 京都大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Estimation of outcrossing rate of Asian wild rice, Oryza rufipogon, under field condition
    Phan Dang Thai Phuong, Hiroki Kageyama, Ryo Ishikawa, Takashige Ishii
    日本育種学会第117回講演会, 2010年03月, 英語, 日本育種学会, 京都大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • QTL analysis for useful agronomic characters using backcross inbred lines between Oryza rufipogon and O. sativa Japonica Nipponbare
    Pham Thien Thanh, Ryo Ishikawa, Naoki Mori, Takashige Ishii
    6th International Conference of Rice Genetics, 2009年11月, 英語, Manila Hotel, Philippine, 国際会議
    ポスター発表

  • QTL analysis for useful agronomic characters using backcross inbred lines between Oryza rufipogon and O. sativa Japonica Nipponbare
    Thanh PT, Ishikawa R, Mori N, Ishii T
    International Rice Genetics Symposium, 2009年11月, 英語, Manila, Philippines, 国際会議
    ポスター発表

  • Evaluation of genetic diversity among wild rice populations of Oryza rufipogon in Myanmar and Cambodia
    Ishii T
    International Symposium on Wild Rice, 2009年11月, 英語, Bangkok, Thailand, 国際会議
    [招待有り]
    口頭発表（招待・特別）

  • Who was the mother of wheat?: a view from genetic variation in chloroplast DNA among wheat species
    Mori, N, Hidehira, Y, Ishii, T, Nakamura, C
    4th International Conference on Energy Efficiency and Agricultural Engineering, 2009年10月, 英語, Rousse, Bulgaria, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • Intraspecific variation of chloroplast DNA in Aegilops speltoides
    Naoki Mori, Hiroyuki Watatani, Takashige Ishii, Yasutaka Kondo, Taihachi Kawahara, Chiharu Nakamura
    6th International Triticeae Symposium, 2009年06月, 英語, Kyoto University, Kyoto, Japan, 国際会議
    ポスター発表

  • Evaluation of genetic variation in rice
    Ishii T
    Asian International Symposium for Agriculture, 2009年03月, 英語, Kobe, Japan, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • Mitochondrial microsatellite variability in the ancestral species of wheat (Aegilops speltoides Tausch.)
    Yoshiaki Ohmichi, Takashige Ishii, Chiharu Nakamura, Naoki Mori
    GENES & GENETIC SYSTEMS, 2007年12月, 英語, GENETICS SOC JAPAN

  • 野生イネ由来の種子脱粒性、穂の開帳性、種子色を支配する遺伝子のマッピング
    石井 尊生, 崎山 弘樹, 石川 亮, 上島 脩志
    近畿作物育種研究会, 2005年07月, 日本語, 近畿作物育種研究会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネ由来の種子脱粒性, 穂の開帳性, 種子色を支配する遺伝子のマッピング
    石井 尊生, 崎山 弘樹, 石川 亮, 上島 脩志
    近畿作物・育種研究会第159回例会, 2005年, 日本語, 日本育種学会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネ遺伝資源のオンファーム保存システム構築のための実証的調査Ⅰ ミャンマーにおける事例
    秋本 正博, 宍戸 理恵子, 石井 尊生, 石川 隆二, 上埜 喜八, 中村 郁郎, 佐藤 洋一郎, 佐藤 雅志
    日本育種学会（育種学研究第７卷別冊1-2号p.296）, 2005年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza rufipogon由来の光合成能力関連QTLをもつ準同質遺伝子系統の光合成特性
    増本 千都, 石井 尊生, 池田 延行, 畠中 知子, 内田 直次
    日本作物学会（日本作物学会紀事74巻第1号96-97）, 2005年, 日本語, 日本作物学会, 未記入, 国内会議
    ポスター発表

  • 普通糸コムギならびにその祖先種でみられたコムギミトコンドリアマイクロサテライト座における多様性
    高橋 知佐, 森 直樹, 上島 脩志, 石井 尊生
    近畿作物・育種研究会第159回例会, 2005年, 日本語, 日本育種学会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 耐塩性および非耐塩性イネ間のFｌ雑種の葯培養における培地中NaCl濃度の影響
    三十尾 修司, 松本 学, Javed, M. A, 石井 尊生, 上島 脩志
    日本育種学会（育種学研究第７卷別冊1-2号p.236）, 2005年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • ミャンマーにおける野生イネの調査
    石井 尊生
    日本育種学会（育種学研究第７卷別冊1-2号p.80）, 2005年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • The salinity tolerance evaluation of two eco-types of Oryza sativa L. at different growth stages in successive salinity levels.
    Javed M. A, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu, MISOO Shuji
    3rd Int. Conf. on Sustainable Agriculture for Food, Energy, and Industry,, 2005年, 英語, 未記入, Canada, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • QTL analysis for several agronomic characters using BC2 populations between Oryza meridionalis and O. sativa.
    ISHII Takashige, ITO K, HARA D, KOBAYASHI N, UCHIDA Naotsugu, KAMIJIMA Osamu
    5th Int. Rice Genet. Symp,, 2005年, 英語, 未記入, Philippines, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • Production and evaluation of chromosome segment substitution lines having wild QTL regions for yield, photosynthesis activity and grain width between Oryza sativa cv. IR36 and O. rufipogon.
    IKEDA N, ASHIDA T, MASUMOTO C, UCHIDA Naotsugu, KAMIJIMA Osamu, ISHII Takashige
    5th Int. Rice Genet. Symp,, 2005年, 英語, 未記入, Philippines, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • Improvement of the anther culture efficiency in recalcitrant salt tolerant indica rice varieties.
    Javed M. A, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu, MIOO Shuji
    The 1st. Int.. Symp. on Sustainable Agriculture for Subtropical Regions, 67,, 2005年, 英語, 未記入, China, 国際会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネ(Oryza sativa Nipponbare)の遺伝背景における野生イネ(Oryza rufipogon)由来の脱粒性遺伝子の作用について
    二村 直人, 石川 亮, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会第106回講演会, 2004年09月, 日本語, 日本育種学会, 三重大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • イネ品種「兵庫北錦」と「北陸142号」の雑種集団を用いた心白発現及び粒大に関するQTL分析
    澤田 桂子, 久世 淳子, 吉田 晋也, 池上 勝, 中村 千春, 石井 尊生, 上島 脩志
    日本育種学会第106回講演会, 2004年09月, 日本語, 日本育種学会, 三重大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza. rufipogon および栽培イネO. sativa Nipponbare交配由来のBC2F4集団を用いた諸形質に関するQTL解析
    山下 晃弘, 内田 直次, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会, 2004年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネ（Oryza sativa Nipponbare) の遺伝的背景における野生イネ（O. rufipogon)由来の脱粒性遺伝子の作用について
    二村 直人, 石川 亮, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会, 2004年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • イネ品種「兵庫北錦」と「北陸142号」の雑種集団を用いた心白発現および粒大に関するQTL解析
    澤田 桂子, 久世 淳子, 吉田 晋弥, 池上 勝, 中村 千春, 石井 尊生, 上島 脩志
    日本育種学会, 2004年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Estimation and comparison of salinity tolerance during seedling stage in several indica rice cultivars.
    JAVED M A, MISOO Shuji, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu
    日本育種学会, 2004年, 英語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza rufipogon由来の脱粒性遺伝子のマッピング
    二村 直人, 石川 亮, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会第104回講演会, 2003年09月, 日本語, 日本育種学会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 祖先２倍種の葉緑体DNA における分子多型から見た４倍性コムギの起原
    綿谷 浩之, 石井 尊生, 河原 太八, 山根 京子, 中村 千春, 森 直樹
    日本育種学会 育種学研究, 2003年09月, 日本語, 日本育種学会, 神戸大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネ（Oryza rufipogon）の二つのアルコール脱水素酵素遺伝子座領域（Adh1 とAdh2）における塩基多型
    吉田 健太郎, 石井 尊生, 宮下 直彦
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネでみられた葉緑体およびミトコンドリアマイクロサテライト座における多型性
    隈本 寿彦, 佐藤 雅志, 石川 隆二, 佐藤 洋一郎, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 野生イネOryza rufipogon 由来の脱粒性遺伝子のマッピング
    二村 直人, 石川 亮, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 米アミロペクチンの超長鎖合成の遺伝解析
    青木 法明, 梅本 貴之, 石井 尊生, 吉田 晋弥, 上島 脩志, 松倉 潮, 井ノ内 直良
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 窒素固定バクテリアエンドファイトHerbaspirillum sp.B501 の内生菌数にみられる野生および栽培イネ間差異
    安部 匡, 南沢 究, 石井 尊生, 東谷 篤志, 佐藤 雅志
    神戸大学農学部秋季公開セミナー－農学を新発見－．, 2003年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 祖先２倍種の葉緑体DNA における分子多型からみた４倍性コムギの起原
    綿谷 浩之, 石井 尊生, 河原 太八, 山根 京子, 中村 千春, 森 直樹
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • 栽培イネOryza sativa × 野生イネO. rufipogon のBC2F2 系統の光合成特性− Rubisco, Rubiscoactivase， スクロース代謝関連酵素に関して−
    増本 千都, 石井 尊生, 内田 直次
    日作紀, 2003年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • イネ栽培種×野生種交雑系統BC2F4 系統の光合成と生長
    増本 千都, 石井 尊生, 内田 直次
    熱帯農業, 2003年, 日本語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • アズキにおけるマイクロサテライトマーカーの開発
    松尾 明子, 渡辺 純平, 池田 優子, 伊勢村 武久, 石井 尊生, 上島 脩志
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 日本語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • QTL analysis for several agronomic characters using four BC2 poppulations between wild and cultivated rice species.
    ISHII Takashige
    Int. Genet. Resour. Workshop on the genus Oryza., 2003年, 英語, 未記入, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • Effects of culture media and alternate temperatures on anther culture of salt tolerant indica rice cultivars.
    JAVED M A, MISOO Shuji, ISHII Takashige, KAMIJIMA Osamu
    日本育種学会，育種学研究, 2003年, 英語, 日本育種学会, 未記入, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • イネ野生種（Oryza rufipogon）由来の脱粒性遺伝子のマッピング
    石川 亮, 上島 脩志, 石井 尊生
    日本育種学会第101回講演会, 2002年03月, 日本語, 日本育種学会, 玉川大学, 国内会議
    口頭発表（一般）

  • タケアズキ×アズキの雑種集団を用いた連鎖地図の作成
    加賀秋人, 月本恭幸, 所英理子, 石井尊生, 木村忠彦, 上島おさ志
    育種学雑誌, 1996年, 日本語

  • アズキ×ヒメツルアズキの雑種分離集団における諸形質とRAPDマーカーの遺伝分析
    加賀秋人, 大西昌子, 石井尊生, 三十尾修司, 木村忠彦, 上島おさ志
    育種学雑誌, 1994年, 日本語

■ 所属学協会
  • 近畿作物育種研究会

  • 日本遺伝学会

  • 日本育種学会

■ 共同研究・競争的資金等の研究課題
  • 半世紀以上眠るイネ在来品種遺伝資源の凱旋復活に向けて
    石井 尊生, 齋藤 大樹, 佐藤 豊, 石川 亮
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(B), 神戸大学, 2022年04月 - 2026年03月, 研究代表者

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(B), 2018年04月 - 2022年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 挑戦的研究（萌芽）, 2018年06月 - 2021年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 特別研究員奨励費, 2016年04月 - 2018年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(B), 2014年04月 - 2018年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 石井 尊生, 宍戸 理恵子, 石川 亮, 野々村 賢一, 小出 陽平
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(B), 2014年04月 - 2017年03月, 研究代表者
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(C), 神戸大学, 2011年04月 - 2014年03月, 研究代表者
    イネの栽培化にどのような遺伝子座が大きく関与したのかを検証するために、栽培イネ品種2種（日本型、インド型）およびアジアの野生イネ系統を交雑し、それぞれの遺伝的背景を持つ4つの戻し交雑自殖集団を用いて、栽培化関連形質に関するQTL解析を行った。その結果、栽培イネおよび野生イネの遺伝的背景をもつ2集団でそれぞれ共通して検出された遺伝子座は、イネの栽培化の初期に関わった遺伝子座であることが示唆された。
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 特別研究員奨励費, 神戸大学, 2011年 - 2013年, 研究代表者
    本研究は、アジアの野生イネ(Oryza rufipogon W630)を2種類の典型的な栽培品種(O. sativa Japonica NipPonbareおよびO. sativa Indica IR36)で戻し交雑した自殖系統を用いて、野生イネ由来の有用農業形質に関する新規遺伝子を探索することを目的としている。 まず、O. sativa Japonica Nipponbareで戻し交雑した161の自殖系統については、昨年度第4および第5染色体上の2カ所に早朝開花性に関するQTLが検出された。そこで、それぞれの領域で様々な長さの染色体断片を持つ個体を選抜し形質調査を行ったところ、1カ所のQTL領域のみを持つ個体では有意な早朝開花性は概察されなかった。一方、第4および第5染色体上の2カ所のQTL領域を持っ個体では早朝開花性がみられた。そのため、これら2つのQTL領域を野生イネから栽培イネに導入すれば、早朝開花性によって高温を回避できる優良栽培品種が育成できると考えられた。 もう1つの、O. sativa Indica IR36で戻し交雑した172系統からなる戻し交雑自殖系統については、5っの種子形質(種子重、種子長、種子幅、玄米長、玄米幅)および5つの農業形質(出穂期、桿長、穂長、穂形、分げつ数)に関するQTL解析を行った。その結果、合計15カ所のQTLが推定された。昨年度、同じ形質に関してNipponbare遺伝的背景の系統で検出されたものと比較したところ、第1染色体上の稗長、第4染色体上の穂形ならびに第8染色体上の出穂期に関するQTL領域が重複していた。これらのうち、第1および第4染色体の領域にはSD1ならびにSPR3の遺伝子座が含まれていたため、これらはイネ栽培種JapollicaおよびIndicaの双方の遺伝的背景で効果を持っ遺伝子座であると考えられた。
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(C), 神戸大学, 2008年04月 - 2011年03月, 研究代表者
    イネの栽培化を促した遺伝子を明らかにするために、栽培イネが獲得した穂の非開帳性に焦点を当てた。そこでまず、野生イネの遺伝的背景に栽培イネ由来の穂の非開帳性に関する準同質遺伝子系統を育成した。次に、これら系統を用いて種子採集効率と他殖率についての圃場調査を行った。その結果、穂が閉じることによって、種子の脱粒程度が緩和され、種子が集めやすくなること、また他殖が抑えられることによって、自殖性作物へと導かれたことが示唆された。
    競争的資金

  • 石井 尊生, 宍戸 理恵子, 秋本 正博, 石川 隆二, 佐藤 洋一郎, 佐藤 雅志, 中村 郁郎
    日本学術振興会, 科学研究費, 基盤研究(B), 神戸大学, 2006年04月 - 2009年03月, 研究代表者
    熱帯アジアのミャンマー(イラワジデルタ周辺および西部地帯)、ベトナム(メコンデルタ周辺)およびカンボジア(プノンペンおよびトンレサップ湖周辺)にて、栽培イネの祖先となった野生イネの遺伝資源としての遺伝学的および生態学的特性を明らかにするため、野生イネ自生集団における遺伝的多様性をDNA レベルで調査するとともに、それらと生態型や集団を取り巻く環境などの様々な要因との関連性の評価を行った。
    競争的資金

  • 石井 尊生
    日本学術振興会, 日仏交流促進事業（SAKURAプログラム）, 神戸大学, 2006年09月 - 2008年08月, 研究代表者, 国際共著している
    競争的資金

  • イネ近縁野生種由来の収量関連形質の遺伝解析
    石井 尊生
    農林水産省, 受託研究：有用遺伝子活用のための植物（イネ）・動物ゲノム研究, 神戸大学, 2002年04月 - 2007年03月, 研究代表者

  • 野生イネに潜む有用形質を支配する遺伝子の検出―野生種を利用した稲育種に向けて―
    石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 奨励研究(A), 神戸大学, 2000年 - 2001年
    イネ野生種が持つ栽培種に存在しない有用遺伝子を検出するため、以下の実験を行った。まず、野生イネの材料としてミヤンマー由来のOryza rufipogon W630を用い、2種類の典型的な栽培品種(O. sativa Japonica cv. NipponbareおよびO. sativa Indica cv. IR36)で交雑し、それぞれ約200個体からなるBC_2戻し交雑集団を作成した。次に、これらを圃場に展開し、出穂期、最大光合成能、桿長、穂長、有効分げつ数、、種子100粒重、籾長、籾幅、玄米長、玄米幅、収量の11形質について調査した。BC_2集団は様々な形質を調査し終わる登熟期まで、葉を大量にサンプリングできなかったので、各BC_2自植後代約15系統の幼葉をまとめて回収しDNAを抽出した。これらのDNAは鋳型として調整し、マイクロサテライトマーカー座についての遺伝子型を調べるためにPCRを行った。なお、使用したマイクロサテライトマーカーは交配親間で多型がみられ、ほぼゲノムをカバーしている約75マーカーであった。11形質についてのデータならびに分子マーカー座の遺伝子型のデータをもとに、量的形質遺伝子座(QTL)解析を行ったところ、有意となった領域はNipponbare戻し交雑集団では55ヶ所、IR36戻し交雑集団では51ヶ所見出された。これらのうち、それぞれ半数強の領域において、野生種の対立遺伝子が各形質の計測値を増加させる効果を持っていた。2つの異なった栽培品種の遺伝的背景においては、野生種由来のQTLは6領域で共通していた。収量に関しては、第1染色体上の1領域で検出された野生種のQTLが両集団において収量を向上させる効果を持っていた。従って、この野生種由来のQTLは栽培イネのJaponicaおよびlndica双方において収量を向上させる効果を持つ可能性が示唆された。

  • 種およびゲノム特異的突然変異に基づくイネ属植物の系統進化の解明
    石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 奨励研究(A), 神戸大学, 1997年 - 1998年, 研究代表者
    分子レベルでの変異に基づくイネ属植物の系統進化の解明のため、以下の実験を行った。材料はAゲノム種より栽培種2種29系統、野生種2種30系統、Aゲノム以外の種より野生種6種20系統(Cゲノム種3系統、CDゲノム種5系統、BCゲノム種5系統、Eゲノム種4系統、Fゲノム種1系統、未同定4倍体ゲノム種1系統)の計79系統を用いた。これらよりDNAを抽出し、まず葉緑体ゲノムにおける遺伝子間領域20カ所をPCR法により増幅した。Aゲノム種内では増幅断片長にほとんど変異がみられなかったが、イネ属植物内では約半数の領域で欠失により生じた多型がみられた。次に、核・葉緑体の両ゲノムの単純反復配列領域についてもPCR法により増幅を行った。核ゲノム由来の24領域と葉緑体ゲノム由来の10領域において検出された増幅断片長の多型の割合を比較したところ、核ゲノムにおける単純反復配列領域は非常に増幅突然変異に富むことが観察された。以上の結果より、イネ属植物における系統関係について以下のことが明らかになった。イネ属植物内では、E、Fゲノム種が他のものと比較して大きく分化しており、A、BC、C、CDゲノム種はそれぞれ同程度に分化しクラスターを形成している。Aゲノム種内においては、野生種のO.perennisのオセアニア、アフリカおよびアメリカ型が大きく分化しており、栽培種のO.sativaはO.perennisのアジア型と、もう1つの栽培種であるO.glaberrimaは野生種のO.breviligulataとグループを作ることが明らかになった。これは、栽培種のO.sativaとO.glaberrimaの祖先野生種はそれぞれO.perennisのアジア型とO.breviligulataであることを示唆するものであった。

  • RFLPおよびRAPD分析法による栽培イネの祖先の解明
    石井 尊生
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 奨励研究(A), 神戸大学, 1995年 - 1995年, 研究代表者
    本研究では分子生物的手法を用いて栽培イネの祖先を明らかにすることを試みた。材料は栽培イネを含むAゲノム種より、栽培種2種14系統(O. sativa8系統、O. glaberrima6系統)、栽培イネと同じゲノム構成を持つ野生種2種16系統(O. perennis13系統、O. breviligulata3系統)の、計30系統を用いた、これらよりDNAを抽出し、分子レベルでの変異を検出するため、核、葉緑体、ミトコンドリアの3つのゲノムについてのRFLP分析および全DNAを用いたRAPD分析を行った。さらに、これら4つの分析それぞれについて、各系統間における類緑度を求め系統樹を作成した。まず、核、葉緑体、ミトコンドリアの3つのゲノム間における分化の違いについては、これらはほぼ同調して分化していたが、特に核ゲノムでの分化の程度が他の2つより大きいことが明らかになった。さらに、RFLP分析とRAPD分析の変異の検出頻度について比較したところ、RAPD分析の方がより多くの変異を検出できることがわかった。以上の結果をまとめ、総合的に分子レベルにおける栽培イネと野生イネとの系統関係について調べたところ、Aゲノム種内において、野生種のO. perennisのオセアニア、アフリカおよびアメリカ型が大きく分化しており、栽培種のO. sativaはO. perennisのアジア型と、もう1つの栽培種であるO. glaberrimaは野生種のO. brebiligulataとグループを作ることが明らかになった。これは、栽培種のO. sativaとO. glaberrimaの祖先野生種はそれぞれO. perennisのアジア型とO. breviligulataであることを示唆するものであった。

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