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岡部 泰賢大学院医学系研究科 医科学専攻教授
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■ 受賞■ 論文
- Abstract Respiratory infections remain a major threat to global health. To counter these insults, the respiratory system has evolved multilayered defense strategies that integrate anatomical and mechanical barriers with both innate and adaptive immune responses. Mucociliary clearance (MCC) serves as a cornerstone of airway host defense, whereby coordinated ciliary beating at the luminal surface of the airway epithelium drives the efficient removal of inhaled particles and pathogens. This process provides robust, broad-spectrum protection against both routine environmental exposures and emerging respiratory pathogens. In this review, we summarize the current understanding of respiratory barrier function and defense strategies, with a particular emphasis on the immunological and metabolic mechanisms that regulate MCC. We further highlight the role of aldehyde dehydrogenases in preventing ciliary damage and preserving MCC function, thereby conferring protection against environmental stress and respiratory infections.Oxford University Press (OUP), 2026年07月, International Immunology[査読有り][招待有り]研究論文（学術雑誌）
- American Society for Clinical Investigation, 2025年05月, Journal of Clinical Investigation, 135(14) (14), 英語, パスワードが無い[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- Elsevier BV, 2025年03月, iScience, 28(3) (3), 111975 - 111975[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2024年07月, Immunological Reviews[査読有り][招待有り]研究論文（学術雑誌）
- Chronic and aberrant nucleic acid sensing causes type I IFN–driven autoimmune diseases, designated type I interferonopathies. We found a significant reduction of regulatory T cells (T regs ) in patients with type I interferonopathies caused by mutations in ADAR1 or IFIH1 (encoding MDA5). We analyzed the underlying mechanisms using murine models and found that T reg -specific deletion of Adar1 caused peripheral T reg loss and scurfy -like lethal autoimmune disorders. Similarly, knock-in mice with T reg -specific expression of an MDA5 gain-of-function mutant caused apoptosis of peripheral T regs and severe autoimmunity. Moreover, the impact of ADAR1 deficiency on T regs is multifaceted, involving both MDA5 and PKR sensing. Together, our results highlight the dysregulation of T reg homeostasis by intrinsic aberrant RNA sensing as a potential determinant for type I interferonopathies.American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2024年03月, Science Advances, 10(9) (9)[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- Lymphoid clusters in visceral adipose tissue omentum, known as milky spots, play a central role in the immunological defense in the abdomen. Milky spots exhibit hybrid nature between secondary lymph organs and ectopic lymphoid tissues, yet their development and maturation mechanisms are poorly understood. Here, we identified a subset of fibroblastic reticular cells (FRCs) that are uniquely present in omental milky spots. These FRCs were characterized by the expression of retinoic acid–converting enzyme, Aldh1a2, and endothelial cell marker, Tie2, in addition to canonical FRC-associated genes. Diphtheria toxin–mediated ablation of Aldh1a2+ FRCs resulted in the alteration in milky spot structure with a significant reduction in size and cellularity. Mechanistically, Aldh1a2+ FRCs regulated the display of chemokine CXCL12 on high endothelial venules (HEVs), which recruit blood-borne lymphocytes from circulation. We further found that Aldh1a2+ FRCs are required for the maintenance of peritoneal lymphocyte composition. These results illustrate the homeostatic roles of FRCs in the formation of non-classical lymphoid tissues.Rockefeller University Press, 2023年02月, Journal of Experimental Medicine, 220(5) (5), パスワードが無い[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- There are numbers of leukocytes present in peritoneal cavity, not only protecting body cavity from infection but also contributing to peripheral immunity including natural antibody production in circulation. The peritoneal leukocytes compose unique immune compartment, the functions of which cannot be replaced by other lymphoid organs. Atypical lymphoid clusters, called "milky spots", that are located in visceral adipose tissue omentum have the privilege of immune niche in terms of differentiation, recruitment, and activation of peritoneal immunity, yet mechanisms underlying the regulation are underexplored. In this review, I discuss the emerging views of peritoneal immune system in the contexts of its development, organization, and functions.Springer International Publishing, 2021年01月, Current topics in microbiology and immunology, 123 - 134[査読有り][招待有り]研究論文（学術雑誌）
- 2018年11月, International immunology, 30(11) (11), 483 - 484, 英語Introduction: Special Issue-The Origins of Macrophages and Their Roles Beyond Immunology[招待有り]
- Macrophages are present in virtually almost all tissues, exhibiting highly heterogeneous phenotypes as a consequence of adaptation to local tissue environments. Tissue-resident macrophages perform specialized functions that are essential for the maintenance of tissue homeostasis, and abnormalities of their functions are linked to various pathologies. Recent advances have shown that tissue-specific transcriptional programs are responsible for functional specialization of macrophages in different tissues. Here, I discuss the molecular basis of tissue-resident macrophage specialization and how it is regulated by tissue environmental cues.2018年10月, International immunology, 英語[査読有り][招待有り]研究論文（学術雑誌）
- 2016年04月, CELL, 165(3) (3), 518 - 519, 英語[査読有り][招待有り]研究論文（学術雑誌）
- 2016年01月, NATURE IMMUNOLOGY, 17(1) (1), 9 - 17, 英語, パスワードが無い[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2014年09月, ELIFE, 3(e04476) (e04476), e04476, 英語, パスワードが無い[招待有り]研究論文（学術雑誌）
- 2014年05月, CELL, 157(4) (4), 832 - 844, 英語, パスワードが無い[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2009年07月, NATURE, 460(7254) (7254), 520 - U99, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2008年11月, EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY, 38(11) (11), 3150 - 3158, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2006年03月, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 281(13) (13), 8836 - 8842, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2005年11月, JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE, 202(10) (10), 1333 - 1339, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2005年01月, NATURE IMMUNOLOGY, 6(1) (1), 49 - 56, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2003年11月, NATURE STRUCTURAL BIOLOGY, 10(11) (11), 922 - 927, 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2001年04月, Genes to Cells, 6, 375-388., 英語
Background
Infection by virus or treatment with double-stranded RNA (dsRNA) results in the activation of transcription factors including IRF-3, IRF-7 and a pleiotropic regulator NF-kappaB by specific phosphorylation. These factors are important in triggering a cascade of antiviral responses. A protein kinase that is yet to be identified is responsible for the activation of these factors and plays a key role in the responses.Results
The signal cascade was analysed using sensitive assays for the activation of IRF-3 and NF-kappaB, and various inhibitors. We found that the activation of IRF-3 and NF-kappaB by dsRNA or virus involves a process that is sensitive to Geldanamycin. Although the induction of NF-kappaB by dsRNA/virus and TNF-alpha involves common downstream pathways including IKK activation, the upstream, Geldanamycin-sensitive process was unique to the dsRNA/virus-induced signal. By an in vitro assay using cell extract, we found an inducible protein kinase activity with physiological specificity of IRF-3 phosphorylation. Furthermore, the same extract specifically phosphorylated IRF-7 in a similar manner.Conclusions
Double-stranded RNA or virus triggers a specific signal cascade that results in the activation of the IRF-3/-7 kinase we detected, which corresponds to the long-sought signalling machinery that is responsible for triggering the early phase of innate response. The signal branches to a common NF-kappaB activation cascade, thus resulting in the activation of a set of critical transcription factors for the response.[査読有り]研究論文（学術雑誌） - Virus infection triggers innate responses to host cells including production of type I interferon (IFN). Since IFN production is also induced by treatment with poly(I:C), viral double-stranded (ds) RNA has been postulated to play a direct role in the process. In the present study, we investigated the effect of dsRNA binding proteins on virus-induced activation of the IFN-beta gene. We found that PACT, originally identified as protein activator for dsRNA-dependent protein kinase (PKR) and implicated in the regulation of translation, augmented IFN-beta gene activation induced by Newcastle disease virus. Concomitantly with the augmented activity of IFN-beta enhancer, increased activity of NF-kappaB and IRF-3 and IRF-7 was observed. For the observed effect, the dsRNA-binding activity of PACT was essential. We identified residues of PACT that interact with a presumptive target molecule to exert its function. Furthermore, PACT colocalized with viral replication complex in the infected cells. Thus the observed effect of PACT is novel and PACT is involved in the regulation of viral replication and results in a marked increase of cellular IFN-beta gene expression.2001年03月, Biochemical and Biophysical Research Communications, 282, 515-523., 英語[査読有り]研究論文（学術雑誌）
- 2023年08月, BIO Ex-xpressマクロファージを標的とした創薬の可能性
- 2016年04月11日, JSI Newsl, 24(2) (2), 17, 日本語マクロファージ マクロファージと組織微小環境
- 2009年09月25日, 生化学, ROMBUNNO.1S1A-7, 日本語Eyes absentのスレオニン脱リン酸化酵素活性による自然免疫活性化の調節機構
- (株)羊土社, 2006年12月, 実験医学, 24(20) (20), 3161 - 3167, 日本語【免疫研究最前線 2007】自然免疫応答の制御 自己のDNAによる自然免疫の活性化
- 2004年11月05日, 日本免疫学会総会・学術集会記録, 34, 242, 日本語DNase IIノックアウトマウス胎仔におけるIFN‐βの致死作用
- 単著, 臨床免疫・アレルギー科, 2023年10月大網リンパ組織の発生機構
- 共著, 組織マクロファージによる恒常性維持のメカニズム, 科学評論社, 2023年07月臨床免疫・アレルギー科
- 分担執筆, 組織マクロファージ, 先端医学社, 2021年04月炎症と免疫
- 分担執筆, 組織マクロファージの遺伝子発現制御, ニューサイエンス社, 2018年12月細胞
- 分担執筆, 組織常在性マクロファージ, ニューサイエンス社, 2018年07月メディカル・サイエンス・ダイジェスト
- 分担執筆, 組織マクロファージの分化と機能, 医歯薬出版株式会社, 2018年06月医学のあゆみ 自然免疫の最前線
- 分担執筆, 腹腔マクロファージ～機能と発生の分子基盤～, 先端医学社, 2018年05月炎症と免疫
- 分担執筆, 腹腔マクロファージ研究の進歩, 医歯薬出版株式会社, 2016年10月医学のあゆみ マクロファージのすべて
- 分担執筆, スレオニン脱リン酸化酵素Eyaによる自然免疫の制御, 羊土社, 2010年08月実験医学増刊 サイトカインによる免疫制御と疾患
- 分担執筆, 自己のDNAによる自然免疫の活性化, 羊土社, 2006年12月実験医学増刊 免疫研究最前線2007
- 第53回日本毒性学会学術年会, 2026年07月, 日本語反応性アルデヒドを基盤とする気道繊毛障害[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 第54回日本免疫学会, 2025年12月, 英語Tissue-Resident Macrophages in the Regulation of Immune Niches[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- Yonsei University, College of Life Science and Biotechnology, 2025年11月, 英語Tissue-Resident Macrophages in the Regulation of Immune Niches[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- Yonsei University, College of Medicine, 2025年11月, 英語Tissue-Resident Macrophages in the Regulation of Immune Niches[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 第14回IFReC国際シンポジウム, 2024年11月, 英語The role of mucociliary clearance in airway host defense[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- Academia Sinica, Taipei-Taiwan, 2024年03月, 英語Role of retinoic acid in the formation of non-classical lymphoid tissues[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 第100回日本生理学会, 2023年03月, 英語Non-classical lymphoid organ formation in body cavity[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 第83回日本血液学会学術集会, 2021年09月Macrophage Plasticity in Homeostasis and Diseases[招待有り]
- The 73rd Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology, 2021年06月Regulation of Body Cavity Immunity[招待有り]
- 神戸大学医学研究科シグナル伝達医学研究展開センターセミナー, 2019年08月組織マクロファージの生物学[招待有り]
- 第40回 日本炎症・再生医学会, 2019年07月免疫の『場』としての脂肪組織[招待有り]
- 京王プラザホテル, 2018年07月, 日本語ビタミンA依存的な腫瘍関連肺胞マクロファージの活性化[招待有り]
- 京都大学医学部, 2018年03月, 日本語組織マクロファージの生物学[招待有り]
- 富山大学 医学部, 2018年03月, 日本語マクロファージから考える糖尿病 - マクロファージと組織微小環境 -[招待有り]
- 北海道大学遺伝子病制御研究所, 2018年03月, 日本語マクロファージの組織発生[招待有り]
- 東京大学先端科学技術研究センター, 2018年02月, 日本語生体恒常性と組織マクロファージ[招待有り]
- The 46th Annual Meeting of The Japanese Society for Immunology, 2017年12月, 英語Functional Specialization of Macrophages in Peripheral Tissues[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- The 46th Annual Meeting of The Japanese Society for Immunology, 2017年12月, 日本語Recent Advances in Macrophage Biology[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 24th East Asia Joint Symposium on Biomedical Research, 2017年10月, 英語Tissue macrophage identity[招待有り]
- 第19回免疫サマースクール2017 in 湘南, 2017年08月, 日本語組織マクロファージの発生機構[招待有り]
- The 44th Annual Meeting of the Japanese Society for Immunolgy, 2015年11月, 英語, 国際会議Tissue macrophage identity[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- Japanese Association of Cancer Immunotherapy & Japanese Society of Molecular Cell Biology of Macrophages, 2014年07月, 英語, 国際会議Tissue-derived signals in the control of macrophage identities[招待有り]口頭発表（招待・特別）
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 大阪大学, 2025年04月 - 2028年03月, 研究代表者敗血症に立脚した体腔リンパ組織の生体防御応答の解明
- 2026年02月 - 2027年12月, 研究代表者粘液繊毛クリアランスを基盤としたユニバーサル呼吸器感染予防法の創生
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 大阪大学, 2022年04月 - 2027年03月, 研究分担者アディポカインによる胸腔脂肪組織自然Bリンパ球ニッチと気道免疫制御機構の解析
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 挑戦的研究(萌芽), 2019年06月 - 2023年03月, 研究代表者新規中皮細胞が制御する体腔免疫系前年度までの解析により我々が同定した中皮細胞が体腔への白血球移動を制御する知見を得た。今年度はその分子メカニズムを明らかにするため、大網組織のシングルセルRNA-seq解析を行った結果、大網組織を構成する支持細胞が５つのクラスターに分類されることを見出し、そのうちの１つのクラスターが本研究で着目する中皮細胞に相当することをトランスクリプトーム解析により見出した。実際、ジフテリア毒素投与依存的に中皮細胞を除去したマウス大網ではそのクラスターが選択的に除去されることから、このクラスターが我々の見出した中皮細胞種を含む細胞集団であることを結論した。一方、ジフテリア毒素投与依存的に中皮細胞種を除去すると血管内皮細胞におけるいくつかのケモカイン産生が顕著に低下することを今年度新たに見出した。それらケモカインの機能を阻害すると白血球のリクルートメントが抑制されることから、中皮細胞と血管内皮細胞の機能的な相互作用が体腔への白血球リクルートメントを制御する可能性が示唆された。
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 2019年04月 - 2022年03月, 研究代表者組織マクロファージ多様性の分子基盤生体各所に存在する組織マクロファージは局在する組織に応じて特異的な機能・役割を担う『組織特異性』を有する。本研究では各組織マクロファージで特異的に発現する転写因子に着目し、それら転写因子がマクロファージの組織特異的な分化や活性化を制御する『マスター転写因子』として機能する可能性について検討した。単一細胞解析により、同一組織環境下に常在するマクロファージ間でもこれら転写因子の発現レベルに変動が生じること、その結果遺伝子発現パターンのグローバルな違いが起こることを見出した。
- 科学技術振興機構, 戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 さきがけ, 京都大学, 2019年 - 2022年, 研究代表者組織とはいわば区画化された空間であり、物理的な境界により細胞社会が隔離されることが独立した多細胞システムとして機能するために必要不可欠です。一方、境界は物質や細胞を選択的に通過させることで外界や組織間とのコミュニケーションを制御する動的な場でもあります。本研究では内臓表面で境界を形成する中皮層に着目し、組織境界層を起点とした細胞間相互作用の新たな様式を提唱します。
- 喫煙科学財団, 一般研究, 2017年04月 - 2020年03月, 研究代表者ビタミンA依存的な腫瘍関連肺胞マクロファージの活性化
- かなえ医薬振興財団, 研究助成, 2018年04月 - 2019年03月, 研究代表者組織マクロファージの多様性制御機構の解明
- 清水免疫学・神経科学振興財団, 助成, 2018年04月 - 2019年03月, 研究代表者マクロファージと組織実質細胞の相互作用
- アステラス病態代謝研究会, 研究助成, 2018年04月 - 2019年03月脂肪組織における常在性マクロファージの生理的機能
- 武田科学振興財団, 医学系研究奨励, 2018年04月 - 2019年03月, 研究代表者脂肪代謝制御における上皮増殖因子受容体陽性マクロファージの機能
- 日本免疫学会, 免疫学若手研究者自立支援 きぼうプロジェクト, 2016年 - 2019年, 研究代表者組織マクロファージの表現型多様性機構の解明
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 国際共同研究加速基金(帰国発展研究), 京都大学, 2016年 - 2019年マクロファージの組織発生機構の解明生体内において細胞の分化・増殖は周囲の組織環境(ニッチ)による支配を受ける。本研究では、マクロファージの組織発生を司るニッチの実体の解明を試みた。研究代表者は、腹腔内臓器の大網組織から産生されるレチノイン酸が腹腔マクロファージの組織発生・固有性の誘導に必須の役割を担うことを明らかにするとともに、大網組織においてレチノイン酸を非常に高発現する非血球細胞種を同定した。本細胞はレチノイン酸合成に必須な遺伝子群を発現するとともに、マクロファージの発生の場である大網乳斑の近傍に局在することから、腹腔におけるマクロファージの発生・固有性を制御するニッチ細胞として機能することが考えられた。
- 三菱財団, 自然科学研究助成, 2017年 - 2018年, 研究代表者組織マクロファージの表現型多様性機構の解明
- 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 特別研究員奨励費, 大阪大学, 2004年 - 2005年造血及びアポトーシスにおける染色体DNA分解の生理作用アポトーシスの過程では死細胞の染色体DNAが積極的に分解される。このDNA分解には死細胞内で作用するDNase(CAD,caspase-activated DNase)と、死細胞を貪した後、マクロファージで作用するDNaseIIが関与している。これまでの研究の過程で、DNaseIIを欠損するマウスではマクロファージが未分解のDNAを大量に蓄積すること、そしてIFNbを初めとする自然免疫系が構成的に活性化され、その作用によりマウスは胎生期に死滅することを示した。 本年度は、DNAを分解できず蓄積するDNaseII欠損マクロファージにおいて、IFNb、CXCL10、TNFa遺伝子が特異的に活性化されている事を明らかにした。また、DNaseII欠損マウスから調製したマクロファージやmouse embryonic fibroblast(MEF)にアポトーシス細胞を貪食させるとこれらの遺伝子が活性化されたことから、リソソームでの分解を逃れたDNAが自然免疫系を活性化することを示した。ところで、Toll-like receptor(TLR)はバクテリアDNAやウイルスRNAを認識し、自然免疫系を活性化する事が知られている。DNaseII欠損マウスと種々のTLR欠損マウスやそのアダプター因子の欠損マウスを交配することにより自己の未分解のDNAがTLRの機構を活性化している可能性を検討したが、このシグナルはTLR非依存的であった。 以上の知見により、自己DNAの分解機構の破錠がバクテリアDNAやウイルスRNAによるシグナルとは異なる経路で自然免疫系を活性化することが明らかとなった。