研究活動情報

• 2024年09月 一般社団法人 応用生態工学会, 応用生態工学会 廣瀬賞

  源利文


• 2024年05月 公益社団法人土木学会, 環境賞, 環境DNAを活用した生物モニタリングに向けた調査手法の構築と建設現場への適用

  大成建設(赤塚真依子、高山百合子、伊藤一教、高畑陽、内池智広、渡邉千佳子、大井涼太朗、望月聖、神野桂子、土肥聡、小菅憲正)、神戸大学(源利文)


• 2023年03月 神戸市, 神戸SDGs奨励賞

  神戸大学大学院人間発達環境学研究科 源研究室


• 2021年07月 日本生態学会 / 滋賀県, 第21回 生態学琵琶湖賞

  源利文


• 2019年03月 村尾育英会, 第36回村尾育英会学術賞

  源利文

  日本国

  出版社・新聞社・財団等の賞


• 2016年12月 科学技術・学術政策研究所, 科学技術への顕著な貢献2016（ナイスステップな研究者）

  源利文

  その他の賞


• 2015年10月 神戸大学, 神戸大学学長表彰

  源利文

  日本国

  その他の賞

• Association between objective and subjective relatedness to nature and human well-being: key factors for residents and possible measures for inequality in Japan’s megacities

  Yuta Uchiyama, Akira Kyan, Masayuki Sato, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto, Kazuhiro Harada, Minoru Takakura, Ryo Kohsaka, Mieko Kiyono, Tetsuya Tsurumi, Atsuhiko Uchida, Tatsuya Saga, Kenta Yamamoto

  2025年09月, Landscape and Urban Planning, 261, 105377, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Development of an eDNA-based qPCR and dPCR method for detecting the spatial distribution and relative abundance of the critically endangered giant barb (Catlocarpio siamensis)

  Jesdakorn Ongkulee, Chatmongkon Suwannapoom, Toshifumi Minamoto, Maslin Osathanunkul

  Elsevier BV, 2025年06月, Global Ecology and Conservation, 59, e03511, 英語

  研究論文（学術雑誌）


• Development of universal PCR primers for the environmental DNA metabarcoding of cephalopod (Mollueca) diversity

  Qianqian Wu, Tomoyuki Nakano, So Ishida, Tomoyuki Komai, Yoshihiro Fujiwara, Takao Yoshida, Masaru Kawato, Shin-ichiro Oka, Katsunori Fujikura, Masaki Miya, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2025年04月, Marine Environmental Research, 208, 107094, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• マクロ生物の環境DNA分析：発展の歴史と将来への展望

  源利文

  2025年04月, 応用生態工学, (in press), 日本語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Seven-year changes in eDNA concentrations of two dominant submerged macrophytes in Lake Shinji: effects of salinity

  Teruhiko Takahara, Satoshi Yamagishi, Rina Shimoda, Akihiro Nagata, Masayuki K. Sakata, Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2025年04月, Estuarine, Coastal and Shelf Science, 315, 109165, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Reconstruction of marimo population dynamics over 200 years using molecular markers and fossil plankton remains

  Jotaro Urabe, Isamu Wakana, Hajime Ohtsuki, Masayuki K. Sakata, Yurie Ohtake, Ryotaro Ichige, Michinobu Kuwae, Toshifumi Minamoto

  2025年03月, Environmental DNA, 7, e70085, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Influence of homogenization methods on lichen species detection from environmental DNA metabarcoding

  Ayumi Sakata, Toshifumi Minamoto, Tetsuya Sado, Ryo O. Gotoh, Masaki Miya

  2025年03月, Metabarcoding and Metagenomics, 9, e144340, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Improved environmental DNA detection sensitivity of Opisthorchis viverrini using a multi-marker assay

  Riko Matsuo, Ayana Togetani, Poom Adisakwattana, Tippayarat Yoonuan, Orawan Phuphisu, Yanin Limpanon, Masayuki K. Sakata, Marcello Otake Sato, Megumi Sato, Toshifumi Minamoto

  2024年12月, Parasitology Research, 123, 419, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Methodological assessment for efficient collection of Schistosoma mansoni environmental DNA and improved schistosomiasis surveillance in tropical wetlands

  Ryosuke Osawa, Toshiaki S. Jo, Risa Nakamura, Kyoko Futami, Tomoaki Itayama, Evans Asena Chadeka, Benard Ngetich, Sachiyo Nagi, Mihoko Kikuchi, Sammy M. Njenga, Collins Ouma, George O. Sonye, Shinjiro Hamano, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2024年12月, Acta Tropica, 260, 107402, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Local environment perceived in daily life and urban green and blue space visits: Uncovering key factors for different age groups to access ecosystem services

  Yuta Uchiyama, Akira Kyan, Masayuki Sato, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto, Mieko Kiyono, Kazuhiro Harada, Minoru Takakura

  2024年11月, Journal of Environmental Management, 370, 122676, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Stability of environmental DNA methylation and its utility in tracing spawning in fish

  Itsuki T. Hirayama, Luhan Ưu, Toshifumi Minamoto

  2024年10月, Molecular Ecology Resources, 24(8) (8), e14011, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Application of dietary content analysis using dropped feces to assess damage to fisheries by great cormorants

  Tetsuo Asai, Shiori Ikushima, Michiyo Sugiyama, Tomoya Morimoto, Akiko Sudo, Toshifumi Minamoto

  Ornithological Society of Japan, 2024年09月, Ornithological Science, 23(2) (2), 125 - 128, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Detection of environmental DNA of finless porpoise (Neophocaena asiaeorientalis) in Osaka Bay, Japan

  Nagisa Hashimoto, Takashi Iwata, Natsumi Kihara, Kiyomi Nakamura, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  2024年09月, Conservation Genetics Resources, 16, 255 - 261, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Development of specific detection assays from environmental DNA of invasive diatom Cymbella janischii in Japan

  Yoko Kato-Unoki, Shigeki Mayama, Akira Kurihara, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2024年08月, Limnology, 25(3) (3), 247 - 254, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Traces of pandemic fluoroquinolone-resistant Escherichia coli clone ST131 transmitted from human society to aquatic environments and wildlife in Japan

  Toyotaka Sato, Kojiro Uemura, Mitsuru Yasuda, Aiko Maeda, Toshifumi Minamoto, Kazuki Harada, Michiyo Sugiyama, Shiori Ikushima, Shin-ichi Yokota, Motohiro Horiuchi, Satoshi Takahashi, Testuo Asai

  Elsevier BV, 2024年06月, One Health, 18, 100715, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Sensitive and efficient surveillance of Japanese giant salamander (Andrias japonicus) distribution in western Japan using multi-copy nuclear DNA marker

  Shunsuke Hidaka, Toshiaki S. Jo, Satoshi Yamamoto, Koki R. Katsuhara, Sei Tomita, Masaki Miya, Makihiko Ikegami, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  Abstract Japanese giant salamander (Andrias japonicus) is one of the largest amphibian species in the world and an iconic species in Japan. However, as its distribution has recently declined across the country, rapid and extensive monitoring of the distribution is urgently needed for its efficient conservation. Here, we used environmental DNA (eDNA) analysis to assess the Japanese giant salamander’s distribution in western Japan and, for that purpose, we collected 410 water samples from 12 rivers. We then developed a new eDNA assay for multi-copy nuclear DNA (nuDNA) of the giant salamander and compared the eDNA detectability of the nuDNA marker with that of a previous mitochondrial DNA (mtDNA) marker. Throughout the survey, we detected target eDNA from 162 water samples using either of the markers, which generally corresponded to the known natural distribution of the species. Additionally, the use of the nuDNA marker allowed for higher detection rate of target eDNA than the mtDNA marker. Moreover, the detection rate of target eDNA decreased substantially in water samples with higher conductivity and also partly in those with higher pH, suggesting their negative impacts on the salamander’s ecology. Our results demonstrated that eDNA analysis with multi-copy nuDNA marker is highly useful for efficient and sensitive surveillance of Japanese giant salamander’s distribution. Our study provided the methodology for efficiently monitoring the Japanese giant salamander’s distribution via eDNA analysis and facilitating conservation activities for them.

  Springer Science and Business Media LLC, 2024年04月, Limnology, 25(2) (2), 189 - 198, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• The effect of artificial light at night on wild fish community: manipulative field experiment and species composition analysis using environmental DNA

  Aisha Oyabu, Luhan Wu, Takehiro Matsumoto, Natsumi Kihara, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2024年04月, Environmental Advances, 15, 100457, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Monitoring of multiple fish species by quantitative environmental DNA metabarcoding surveys over two summer seasons

  Luhan Wu, Tomonori Osugi, Takashi Inagawa, Jiro Okitsu, Shogo Sakamoto, Toshifumi Minamoto

  Abstract Periodic monitoring can provide important information for the protection of endangered fish, sustainable use of fishery resources and management of alien species. Previous studies have attempted to monitor fish using non‐invasive environmental DNA (eDNA) technology, generally employing quantitative PCR to quantify the eDNA concentration. However, the throughput was limited. High‐throughput metabarcoding technology can detect the DNA of multiple species simultaneously in a single experiment but does not provide sufficient quantification. In this study, we applied a quantitative metabarcoding approach to simultaneously quantify the eDNA concentration of an entire fish assemblage in a small reservoir over two summer seasons. Traditional surveys were also conducted to investigate the individuals of fish. The eDNA concentrations were quantified using quantitative metabarcoding, and the fish species detected using this approach were highly consistent with the results of traditional fish monitoring. A significant positive relationship was observed between the eDNA concentration and fish species abundance. Seasonal changes in fish community structure were estimated using eDNA concentrations, which may reveal the activity seasons of different fish. The eDNA concentrations of different fish species peaked at different water temperatures, reflecting the differential responses of fish species to this environmental factor. Finally, by detecting outlier eDNA concentrations, the spawning activities of 13 fish species were estimated, 12 of which were roughly consistent with the current knowledge of fish spawning periods. These results indicate that quantitative eDNA metabarcoding with dozens of sampling times is useful for the simultaneous ecological monitoring of multiple fish species.

  Wiley, 2024年01月, Molecular Ecology Resources, 24, e13875, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental detection of eumycetoma pathogens using multiplex real-time PCR for soil DNA in Sennar State, Sudan

  Hiroki Hashizume, Suguru Taga, Masayuki K. Sakata, Mahmoud Hussein, Emmanuel Edwar Siddig, Toshifumi Minamoto, Ahmed Hassan Fahal, Satoshi Kaneko

  2023年12月, Tropical Medicine and Health, 51, 71, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 藻場を対象とした環境DNAの分布傾向と採水範囲の検討方法について

  赤塚真依子, 飯村浩太郎, 高山百合子, 源利文

  Japan Society of Civil Engineers, 2023年11月, 土木学会論文集, 79(17) (17), 23-27158, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Regional-scale effects of deer-induced forest degradation on river ecosystem dynamics

  Hikaru Nakagawa, Daisuke Fujiki, Hiroo Numata, Luhan Wu, Terutaka Mori, Toshifumi Minamoto

  2023年11月, Population Ecology, (in press), 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Comparison of evolutionary relationships between Branchiostoma floridae, Ciona intestinalis, and Homo sapiens globins provide evidence of gene cooption and convergent evolution

  Nanako Yano, Toshifumi Minamoto, Hiroshi Yamaguchi, Toshiyuki Goto, Takahito Nishikata

  2023年11月, International Journal of Molecular Sciences, 24(21) (21), 16009, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Effective environmental DNA collection for an endangered catfish species: testing for habitat and daily periodicity

  Teruhiko Takahara, Hideyuki Doi, Toshihiro Kosuge, Nanae Nomura, Nobutaka Maki, Toshifumi Minamoto, Katsutoshi Watanabe

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年11月, Ichthyological Research, 70(4) (4), 409 - 418, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Opposite trends in environmental DNA distributions of two freshwater species under climate change

  Qianqian Wu, Jinxin Zhou, Tatsuya Komoto, Toshiyuki Ishikawa, Naoshige Goto, Masayuki K. Sakata, Daisuke Kitazawa, Toshifumi Minamoto

  2023年09月, Ecosphere, 14(9) (9), e4651, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Spatial epidemiology model can explain the seasonal dynamics of infectious disease Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV-3) by thermoregulation behavior of the host, common carp (Cyprinus carpio)

  Takeshi Miki, Hiroki Yamanaka, Atsushi Sogabe, Koji Omori, Yasuhisa Saito, Toshifumi Minamoto, Kimiko Uchii, Mie N. Honjo, Alata A. Suzuki, Yukihiro Kohmatsu, Zen’ichiro Kawabata

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年09月, Theoretical Ecology, 16(3) (3), 195 - 208, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• An interdisciplinary approach to environmental conservation policy: a case of Satoyama redevelopment in the peri-urban area

  Masayuki Sato, Toshifumi Minamoto, Atushi Ushimaru

  Abstract This study proposes a practice and discussion for an interdisciplinary approach to policies for the conservation of suburban and peri-urban ecosystems. We highlight the need for evidence-based assessment of the current quality of the targeted nature from perspectives of natural science and problem formulation, and that causes should be investigated from the combined perspectives of social science, economic evaluation, and policy design and evaluation, with an awareness of the possibility of consensus building. In this study, based on the ongoing international trend of ecosystem conservation, an economic analysis was conducted to examine the direction of Satoyama development as a case study of urban and peri-urban ecosystem conservation. The result identified the preference and needs of citizens with regard to Satoyama ecosystems and discussed the consistency between policy targets and citizens’ evaluation.

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年07月, International Journal of Economic Policy Studies, 17(2) (2), 403 - 419, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Species traits and ecosystem characteristics affect species detection by eDNA metabarcoding in lake fish communities

  Hideyuki Doi, Shunsuke Matsuoka, Shin‐ichiro S. Matsuzaki, Mariko Nagano, Hirotoshi Sato, Hiroki Yamanaka, Saeko Matsuhashi, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto, Hitoshi Araki, Kousuke Ikeda, Atsuko Kato, Kouichi Kumei, Nobutaka Maki, Takashi Mitsuzuka, Teruhiko Takahara, Kimihito Toki, Natsuki Ueda, Takeshi Watanabe, Kanji Yamazoe, Masaki Miya

  Abstract Although environmental DNA (eDNA) metabarcoding is an exceptionally useful and powerful tool for monitoring biodiversity, little is known about whether the traits of organisms and their ecosystem characteristics affect eDNA metabarcoding performance. Nationwide surveys can provide more detailed insights, yet such studies have rarely been conducted. In order to evaluate eDNA metabarcoding performance in broad‐scale monitoring, we examined the effects of species ecological/biological traits and ecosystem characteristics on species detection rates and the implications for community analysis. In addition, we tested the effects of sample mixing and transportation methods, including cooling and freezing, on eDNA metabarcoding. On a nationwide scale, we conducted eDNA metabarcoding for fish communities in 18 Japanese lakes. By comparing species records, we observed that certain traits, including body size, body shape, saltwater tolerance and habitat preference, influenced eDNA detection. In addition, the proportion of species detected decreased significantly with an increase in lake surface area owing to ecosystem size effect on species detection. We conclude that species traits, including habitat preference, body size and ecosystem size, should be considered when assessing the eDNA metabarcoding performance in broad‐scale monitoring.

  Wiley, 2023年07月, Freshwater Biology, 68(8) (8), 1346 - 1358, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Detection of Echinococcus multilocularis in repurposed environmental DNA samples from river water

  Kensuke Mori, Akio Imamura, Itsuki Hirayama, Toshifumi Minamoto

  2023年06月, PeerJ, 11, e15431, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Comparing environmental DNA with whole pond survey to estimate the total biomass of fish species in ponds

  Rio Souma, Izumi Katano, Hideyuki Doi, Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2023年05月, Freshwater Biology, 68(5) (5), 727 - 736, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Heterogeneous preference for biodiversity in Japanese urban blue spaces based on people's nature experiences: Analysis using eDNA and satisfaction data

  Ippei Aoshima, Ryohei Nakao, Toshifumi Minamoto, Atushi Ushimaru, Masayuki Sato

  Elsevier BV, 2023年04月, City and Environment Interactions, 18, 100101, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• An efficient environmental DNA detection method for rare species: a case study of a small salamander (Hynobius boulengeri)

  Masayuki K. Sakata, Daiki Takeshita, Ryohei Nishizawa, Takuya Sato, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年03月, Analytical Sciences, 39(5) (5), 721 - 728, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Development of two new sets of PCR primers for eDNA metabarcoding of brittle stars (Echinodermata, Ophiuroidea)

  Masanori Okanishi, Hisanori Kohtsuka, Qianqian Wu, Junpei Shinji, Naoki Shibata, Takashi Tamada, Tomoyuki Nakano, Toshifumi Minamoto

  Brittle stars (class Ophiuroidea) are marine invertebrates comprising approximately 2,100 extant species, and are considered to constitute the most diverse taxon of the phylum Echinodermata. As a non-invasive method for monitoring biodiversity, we developed two new sets of PCR primers for metabarcoding environmental DNA (eDNA) from brittle stars. The new primer sets were designed to amplify 2 short regions of the mitochondrial 16S rRNA gene, comprising a conserved region (111–115 bp, 112 bp on average; named “16SOph1”) and a hyper-variable region (180–195 bp, 185 bp on average; named “16SOph2”) displaying interspecific variation. The performance of the primers was tested using eDNA obtained from two sources: a) rearing water of an 2.5 or 170 L aquarium tanks containing 15 brittle star species and b) from natural seawater collected around Misaki, the Pacific coast of central Japan, at depths ranging from shallow (2 m) to deep (> 200 m) sea. To build a reference library, we obtained 16S rRNA sequences of brittle star specimens collected from around Misaki and from similar depths in Japan, and sequences registered in International Nucleotide Sequence Database Collaboration. As a result of comparison of the obtained eDNA sequences with the reference library 37 (including cryptic species) and 26 brittle star species were detected with certain identities by 16SOph1 and 16SOph2 analyses, respectively. In shallow water, the number of species and reads other than the brittle stars detected with 16SOph1 was less than 10% of the total number. On the other hand, the number of brittle star species and reads detected with 16SOph2 was less than half of the total number, and the number of detected non-brittle star metazoan species ranged from 20 to 46 species across 6 to 8 phyla (only the reads at the “Tank” were less than 0.001%). The number of non-brittle star species and reads at 80 m was less than 10% with both of the primer sets. These findings suggest that 16SOph1 is specific to the brittle star and 16SOph2 is suitable for a variety of marine metazoans. It appears, however, that further optimization of primer sequences would still be necessary to avoid possible PCR dropouts from eDNA extracts. Moreover, a detailed elucidation of the brittle star fauna in the examined area, and the accurate identification of brittle star species in the current DNA databank is required.

  Pensoft Publishers, 2023年02月, Metabarcoding and Metagenomics, 7, e94298, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Improvement of recovery yield of macro-organismal environmental DNA from seawater samples

  Qianqian Wu, Toshifumi Minamoto

  Abstract In recent years, environmental DNA (eDNA) technology has been used in a variety of water environments. Environmental DNA concentrations in marine samples tend to be lower than those in freshwater samples, and few studies have explored methods to improve the recovery yields of eDNA from seawater samples. In this study, we compared different seawater preservation solutions (RNAlater or ATL) to improve eDNA yields. The eDNA concentrations of vertebrate and invertebrate species were compared using species-specific eDNA assays, and the number of detected fish and their compositions were compared using metabarcoding analysis. ATL treatment resulted in significantly higher eDNA yields for both vertebrate and invertebrate species than RNAlater treatment. Metabarcoding analysis revealed non-significant effects of preservation on the number of detected species and species composition. These results suggest that ATL treatment improves DNA yields without changing the species composition compared with the commonly used RNAlater treatment. The findings of this study will reduce false-negative outcomes and provide highly reliable results in future biological surveys. Graphical abstract

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年02月, Analytical Sciences, 39(5) (5), 713 - 720, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Estimating the spawning activity of fish species using nuclear and mitochondrial environmental DNA concentrations and their ratios

  Luhan Wu, Qianqian Wu, Takashi Inagawa, Jiro Okitsu, Shogo Sakamoto, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2023年01月, Freshwater Biology, 68(1) (1), 103 - 114, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Development of primer–probe sets for environmental DNA-based monitoring of pond smelt Hypomesus nipponensis and Japanese icefish Salangichthys microdon

  Teruhiko Takahara, Katsuya Fukui, Daisuke Hiramatsu, Hideyuki Doi, Masato Fujii, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年01月, Landscape and Ecological Engineering, 19(1) (1), 11 - 19, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Development of environmental DNA detection assays for snakes in paddy fields in Japan

  Ryohei Nishizawa, Ryohei Nakao, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2023年01月, Landscape and Ecological Engineering, 19(1) (1), 3 - 10, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNAを活用した藻場モニタリングにおける流れの影響について

  赤塚真依子, ムチェブエ エドウィン, 高山百合子, 織田幸伸, 源利文

  2022年11月, 土木学会論文集B2(海岸工学), 78(2) (2), I_865 - I_870, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Relationships between the eDNA concentration obtained from metabarcoding and stream fish abundance estimated by the removal method under field conditions

  Hikaru Nakagawa, Keitaro Fukushima, Masaru Sakai, Luhan Wu, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2022年11月, Environmental DNA, 4(6) (6), 1369 - 1380, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Valuing the cultural services from urban blue‐space ecosystems in Japanese megacities during the COVID‐19 pandemic

  Toshiaki Jo, Masayuki Sato, Toshifumi Minamoto, Atushi Ushimaru

  Wiley, 2022年10月, People and Nature, 4(5) (5), 1176 - 1189, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Isolation of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli from Japanese red fox (Vulpes vulpes japonica)

  Tetsuo Asai, Michiyo Sugiyama, Tsutomu Omatsu, Masato Yoshikawa, Toshifumi Minamoto

  2022年09月, MicrobiologyOpen, 11(5) (5), e1317, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Spatiotemporal changes in environmental DNA concentrations caused by fish spawning activity

  Luhan Wu, Yoshihiko Yamamoto, Shogo Yamaguchi, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2022年09月, Ecological Indicators, 142, 109213 - 109213, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Detection and persistence of environmental DNA (eDNA) of the different developmental stages of a vector mosquito, Culex pipiens pallens

  Masayuki K. Sakata, Megumi Sato, Marcello Otake Sato, Tomoe Watanabe, Honami Mitsuishi, Tomoyuki Hikitsuchi, Jun Kobayashi, Toshifumi Minamoto

  Preventing mosquito-borne infectious diseases requires that vector mosquitoes are monitored and controlled. Targeting immature mosquitoes (eggs, larvae, and pupae), which have less mobility than adults, is an effective management approach. However, conducting these surveys is often difficult due to the limitations of morphological classification and survey costs. The application of environmental DNA (eDNA) analysis can solve these issues because it allows easy estimation of species distribution and morphology-independent species identification. Although a few previous studies have reported mosquito eDNA detection, there is a gap in knowledge regarding the dynamics related to the persistence of immature mosquito eDNA. We used Culex pipiens pallens, a vector of West Nile fever, as a model species. First, we developed a species-specific detection assay and confirmed its specificity using in silico and in vitro tests. Next, we conducted laboratory experiments using breeding tanks. Water samples were collected at each developmental stage. In addition, water samples were collected daily until the seventh day after emergence from the pupae. We quantified eDNA using real-time PCR with the developed assay to investigate the dynamics of mosquito eDNA. The specificity of the developed assay was confirmed by in silico and in vitro tests. Mosquito eDNA was detected at all developmental stages and detected up to seven days after emergence of pupae. In particular, high concentrations of eDNA were detected immediately after hatching from eggs and after emergence from pupae. Highly frequent positive eDNA signals were continuously detected between egg hatching and pupa hatching. Mosquito eDNA was detected immediately after the eggs were introduced, and eDNA-positive detections continued until pupae emergence, suggesting that eDNA analysis is useful for monitoring mosquito larvae. In the future, monitoring immature mosquitoes using eDNA analysis will contribute to prevent mosquito-borne infectious diseases.

  Public Library of Science (PLoS), 2022年08月, PLOS ONE, 17(8) (8), e0272653 - e0272653, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 農業水路における環境DNA調査の適用性と環境DNAの拡散距離

  小出水規行, 源利文, 白子智康, 中村匡聡

  2022年08月, 農業農村工学会誌, 90(8) (8), 11 - 14, 日本語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Slower growth of farmed eels stocked into rivers with higher wild eel density

  Ryoshiro Wakiya, Hikaru Itakura, Tatsumu Hirae, Tadamitsu Igari, Miyuki Manabe, Noriaki Matsuya, Katsushi Miyata, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto, Takashi Yada, Kenzo Kaifu

  Wiley, 2022年06月, Journal of Fish Biology, 101(3) (3), 613 - 627, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA analysis for macro-organisms: Species distribution and more

  Toshifumi Minamoto

  Abstract In an era of severe biodiversity loss, biological monitoring is becoming increasingly essential. The analysis of environmental DNA (eDNA) has emerged as a new approach that could revolutionize the biological monitoring of aquatic ecosystems. Over the past decade, macro-organismal eDNA analysis has undergone significant developments and is rapidly becoming established as the golden standard for non-destructive and non-invasive biological monitoring. In this review, I summarize the development of macro-organismal eDNA analysis to date and the techniques used in this field. I also discuss the future perspective of these analytical methods in combination with sophisticated analytical techniques for DNA research developed in the fields of molecular biology and molecular genetics, including genomics, epigenomics, and single-cell technologies. eDNA analysis, which to date has been used primarily for determining the distribution of organisms, is expected to develop into a tool for elucidating the physiological state and behavior of organisms. The fusion of microbiology and macrobiology through an amalgamation of these technologies is anticipated to lead to the future development of an integrated biology.

  Oxford University Press (OUP), 2022年06月, DNA Research, 29(3) (3), dsac018, 英語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Detection of multiple mycetoma pathogens using fungal metabarcoding analysis of soil DNA in an endemic area of Sudan

  Hiroki Hashizume, Suguru Taga, Masayuki K. Sakata, Mahmoud Hussein Mohamed Taha, Emmanuel Edwar Siddig, Toshifumi Minamoto, Ahmed Hassan Fahal, Satoshi Kaneko

  Mycetoma is a tropical disease caused by several fungi and bacteria present in the soil. Fungal mycetoma and eumycetoma are especially challenging to treat; therefore, prevention, early diagnosis, and early treatment are important, but it is also necessary to understand the geographic distribution of these pathogenic fungi. In this study, we used DNA metabarcoding methodology to identify fungal species from soil samples. Soil sampling was implemented at seven villages in an endemic area of Sennar State in Sudan in 2019, and ten sampling sites were selected in each village according to land-use conditions. In total, 70 soil samples were collected from ground surfaces, and DNA in the soil was extracted with a combined method of alkaline DNA extraction and a commercial soil DNA extraction kit. The region for universal primers was selected to be the ribosomal internal transcribed spacer one region for metabarcoding. After the second PCR for DNA library preparation, the amplicon-based DNA analysis was performed using next-generation sequencing with two sets of universal primers. A total of twelve mycetoma-causative fungal species were identified, including the prime agent, Madurella mycetomatis, and additional pathogens, Falciformispora senegalensis and Falciformispora tompkinsii, in 53 soil samples. This study demonstrated that soil DNA metabarcoding can elucidate the presence of multiple mycetoma-causative fungi, which may contribute to accurate diagnosis for patient treatment and geographical mapping.

  Public Library of Science (PLoS), 2022年03月, PLoS Neglected Tropical Diseases, 16(3) (3), e0010274 - e0010274, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Linking the state of environmental DNA to its application for biomonitoring and stock assessment: Targeting mitochondrial/nuclear genes, and different DNA fragment lengths and particle sizes

  Toshiaki Jo, Kenta Takao, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2022年03月, Environmental DNA, 4(2) (2), 271 - 283, 英語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Development and evaluation of PCR primers for environmental DNA (eDNA) metabarcoding of Amphibia

  Masayuki K. Sakata, Mone U. Kawata, Atsushi Kurabayashi, Takaki Kurita, Masatoshi Nakamura, Tomoyasu Shirako, Ryosuke Kakehashi, Kanto Nishikawa, Mohamad Yazid Hossman, Takashi Nishijima, Junichi Kabamoto, Masaki Miya, Toshifumi Minamoto

  Biodiversity monitoring is important for the conservation of natural ecosystems in general, but particularly for amphibians, whose populations are pronouncedly declining. However, amphibians’ ecological traits (e.g. nocturnal or aquatic) often prevent their precise monitoring. Environmental DNA (eDNA) metabarcoding – analysis of extra-organismal DNA released into the environment – allows the easy and effective monitoring of the biodiversity of aquatic organisms. Here, we developed and tested the utility of original PCR primer sets. First, we conducted in vitro PCR amplification tests with universal primer candidates using total DNA extracted from amphibian tissues. Five primer sets successfully amplified the target DNA fragments (partial 16S rRNA gene fragments of 160–311 bp) from all 16 taxa tested (from the three living amphibian orders Anura, Caudata and Gymnophiona). Next, we investigated the taxonomic resolution retrieved using each primer set. The results revealed that the universal primer set “Amph16S” had the highest resolution amongst the tested sets. Finally, we applied Amph16S to the water samples collected in the field and evaluated its detection capability by comparing the species detected using eDNA and physical survey (capture-based sampling and visual survey) in multiple agricultural ecosystems across Japan (160 sites in 10 areas). The eDNA metabarcoding with Amph16S detected twice as many species as the physical surveys (16 vs. 8 species, respectively), indicating the effectiveness of Amph16S in biodiversity monitoring and ecological research for amphibian communities.

  Pensoft Publishers, 2022年02月, Metabarcoding and Metagenomics, 6, 15 - 26, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Autumn dispersal and limited success of reproduction of the deepbody bitterling (Acheilognathus longipinnis) in terrestrialized floodplain

  Shigeya Nagayama, Munehiro Oota, Tomohiko Fujita, Jyun-ichi Kitamura, Toshifumi Minamoto, Seiichi Mori, Masayuki Kato, Naofumi Takeyama, Fumiya Takino, Ryuji Yonekura, Hiroki Yamanaka

  2022年02月, Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 423, 4, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Seasonal changes in the distribution of black sea bream Acanthopagrus schlegelii estimated by environmental DNA

  Sachia Sasano, Hiroaki Murakami, Keita W. Suzuki, Toshifumi Minamoto, Yoh Yamashita, Reiji Masuda

  Springer Science and Business Media LLC, 2022年01月, Fisheries Science, 88(1) (1), 91 - 107, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA emission by two carangid fishes in single and mixed-species tanks

  Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto, Yoh Yamashita

  Springer Science and Business Media LLC, 2022年01月, Fisheries Science, 88(1) (1), 55 - 62, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Pre-centrifugation before DNA extraction mitigates extraction efficiency reduction of environmental DNA caused by the preservative solution (benzalkonium chloride) remaining in the filters

  Satsuki Tsuji, Ryohei Nakao, Minoru Saito, Toshifumi Minamoto, Yoshihisa Akamatsu

  Springer Science and Business Media LLC, 2022年01月, Limnology, 23(1) (1), 9 - 16, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Universal performance of benzalkonium chloride for the preservation of environmental DNA in seawater samples

  Toshiaki Jo, Masayuki K. Sakata, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2021年11月, Limnology and Oceanography: Methods, 19(11) (11), 758 - 768, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 藻場モニタリングのための環境DNA分析プロトコル作成に向けた検討

  赤塚 真依子, 高山 百合子, ムチェブエ エドウィン, 伊藤 一教, 渡辺 謙太, 桑江 朝比呂, 源 利文

  環境DNAを活用した藻場の増減を捉えるモニタリング方法の開発には，採水，分析手順のプロトコル化が重要である．これまでの研究で，現地調査での海草の環境DNA量は，1Lの海水を用いる従来法で定量下限以下となり，ろ過量を増やし，環境DNAを多く回収することで定量分析が可能になることを確認してきた．しかしながら，現地調査で想定される懸濁物質等により必要量をろ過できない場合の対策法は確立されていない．本研究では，低濃度で懸濁物質が多い試料から海草のDNAを多く回収する方法を検討し，現地調査に適応可能な分析方法の有効性を確認した．また，コアマモ場の入り江を対象に数値計算を実施し，採水に適した時間帯が地点毎に異なり，現地調査に向けて採水地点，時刻選定が重要であることを示した．

  土木学会, 2021年11月, 土木学会論文集B2(海岸工学), 77(2) (2), I_895 - I_900, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 淀川大堰湛水域における琵琶湖産アユの河川残留個体の存在

  瀬口雄一, 山本義彦, 竹門康弘, 源利文

  2021年11月, 魚類学雑誌, 68(2) (2), 163 - 172, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Prevalence of Antimicrobial-Resistant Escherichia coli in Migratory Greater White-Fronted Geese (Anser albifrons) and their Habitat in Miyajimanuma, Japan

  Akira Fukuda, Masaru Usui, Katsumi Ushiyama, Dipti Shrestha, Nagisa Hashimoto, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto, Osamu Yoshida, Kanako Murakami, Yutaka Tamura, Tetsuo Asai

  The spread of antimicrobial-resistant bacteria (ARB) in natural environments including wild animals is a concern for public health. Birds cover large areas, and some fly across borders to migrate in large flocks. As a migratory bird, the Greater White-fronted Goose (Anser albifrons) travels to Miyajimanuma, North Japan, each spring and autumn. To investigate the ARB in migratory birds and their surroundings, we collected 110 fecal samples of A. albifrons and 18 water samples from Miyajimanuma in spring and autumn of 2019. Isolation of Escherichia coli was performed using selective agars with or without antimicrobials (cefazolin and nalidixic acid). Isolates of E. coli were recovered from 56 fecal samples (50.9%) and five water samples (27.8%) on agars without antimicrobials. No isolates were recovered on agars with antimicrobials. One E. coli isolate derived from a fecal sample exhibited resistance to β-lactams (ampicillin and cefazolin), whereas all other isolates exhibited susceptibility to all tested antimicrobials. The resistant isolate harbored blaACC, which could be transferred to other bacteria and confer resistance to β-lactams. These results suggest a low prevalence of antimicrobial resistance in wild migratory birds and their living environments; however, wild migratory birds sometimes carry ARB harboring transferrable antimicrobial resistance genes and therefore present a risk of spreading antimicrobial resistance.

  Wildlife Disease Association, 2021年10月, Journal of Wildlife Diseases, 57(4) (4), 954 - 958, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• eDNA‐based detection of a vulnerable crocodile newt (Tylototriton uyenoi) to influence government policy and raise public awareness

  Maslin Osathanunkul, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2021年10月, Diversity and Distributions, 27(10) (10), 1958 - 1965, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA preserved in marine sediment for detecting jellyfish blooms after a tsunami

  Mizuki Ogata, Reiji Masuda, Hiroya Harino, Masayuki K. Sakata, Makoto Hatakeyama, Katsuhide Yokoyama, Yoh Yamashita, Toshifumi Minamoto

  Environmental DNA (eDNA) can be a powerful tool for detecting the distribution and abundance of target species. This study aimed to test the longevity of eDNA in marine sediment through a tank experiment and to use this information to reconstruct past faunal occurrence. In the tank experiment, juvenile jack mackerel (Trachurus japonicus) were kept in flow-through tanks with marine sediment for two weeks. Water and sediment samples from the tanks were collected after the removal of fish. In the field trial, sediment cores were collected in Moune Bay, northeast Japan, where unusual blooms of jellyfish (Aurelia sp.) occurred after a tsunami. The samples were analyzed by layers to detect the eDNA of jellyfish. The tank experiment revealed that after fish were removed, eDNA was not present in the water the next day, or subsequently, whereas eDNA was detectable in the sediment for 12 months. In the sediment core samples, jellyfish eDNA was detected at high concentrations above the layer with the highest content of polycyclic aromatic hydrocarbons, reflecting tsunami-induced oil spills. Thus, marine sediment eDNA preserves a record of target species for at least one year and can be used to reconstruct past faunal occurrence.

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年08月, Scientific Reports, 11(1) (1), 16830, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Application of environmental DNA metabarcoding in a lake with extensive algal blooms

  Qianqian Wu, Masayuki K. Sakata, Deyi Wu, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年08月, Limnology, 22(3) (3), 363 - 370, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Complex interactions between environmental DNA (eDNA) state and water chemistries on eDNA persistence suggested by meta-analyses.

  Toshiaki Jo, Toshifumi Minamoto

  Understanding the processes of environmental DNA (eDNA) persistence and degradation is essential to determine the spatiotemporal scale of eDNA signals and accurately estimate species distribution. The effects of environmental factors on eDNA persistence have previously been examined; however, the influence of the physiochemical and molecular states of eDNA on its persistence is not completely understood. Here, we performed meta-analyses including 26 previously published papers on the estimation of first-order eDNA decay rate constants, and assessed the effects of filter pore size, DNA fragment size, target gene, and environmental conditions on eDNA decay rates. Almost all supported models included the interactions between the filter pore size and water temperature, between the target gene and water temperature, and between the target gene and water source, implying the influence of complex interactions between the eDNA state and environmental conditions on eDNA persistence. These findings were generally consistent with the results of a re-analysis of a previous tank experiment which measured the time-series changes in marine fish eDNA concentrations in multiple size fractions after fish removal. Our results suggest that the mechanism of eDNA persistence and degradation cannot be fully understood without knowing not only environmental factors but also cellular and molecular states of eDNA in water. Further verification of the relationship between eDNA state and persistence is required by obtaining more information on eDNA persistence in various experimental and environmental conditions, which will enhance our knowledge on eDNA persistence and support our findings.

  2021年07月, Molecular Ecology Resources, 21(5) (5), 1490 - 1503, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA and hydrodynamic modelling

  Keiichi Fukaya, Hiroaki Murakami, Seokjin Yoon, Kenji Minami, Yutaka Osada, Satoshi Yamamoto, Reiji Masuda, Akihide Kasai, Kazushi Miyashita, Toshifumi Minamoto, Michio Kondoh

  Wiley, 2021年07月, Molecular Ecology, 30(13) (13), 3057 - 3067, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Utility of environmental DNA analysis for effective monitoring of invasive fish species in reservoirs

  Toshiaki Jo, Saki Ikeda, Arisa Fukuoka, Takashi Inagawa, Jiro Okitsu, Izumi Katano, Hideyuki Doi, Katsuki Nakai, Hidetaka Ichiyanagi, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2021年06月, Ecosphere, 12(6) (6), e03643, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA detection of an invasive ant species (Linepithema humile) from soil samples

  Tetsu Yasashimoto, Masayuki K. Sakata, Tomoya Sakita, Satoko Nakajima, Mamiko Ozaki, Toshifumi Minamoto

  Alien ant species (Formicidae, Hymenoptera) cause serious damage worldwide. Early detection of invasion and rapid management are significant for controlling these species. However, these attempts are sometimes hindered by the need for direct detection techniques, such as capture, visual observation, or morphological identification. In this study, we demonstrated that environmental DNA (eDNA) analysis can be used as a monitoring tool for alien ants using Linepithema humile (Argentine ant), one of the most invasive ants, as a model species. We designed a new real-time PCR assay specific to L. humile and successfully detected eDNA from the surface soil. The reliability of eDNA analysis was substantiated by comparing eDNA detection results with traditional survey results. Additionally, we examined the relationship between eDNA concentration and distance from nests and trails. Our results support the effectiveness of eDNA for alien ant monitoring and suggest that this new method could improve our ability to detect invasive ant species.

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年05月, Scientific Reports, 11(1) (1), 10712, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Molecular detection of giant snakeheads, Channa micropeltes (Cuvier, 1831), one of the most troublesome fish species

  Maslin Osathanunkul, Toshifumi Minamoto

  A lack of reliable tools for determining the presence and distribution of fish species can impede understanding of predator–prey interactions and fishery management. Conventional fish survey methods are invasive, and can be size or species selective. Combining netting and electrofishing is a current method used to monitor fish species in Phayao Lake (Kwan Phayao), Thailand. However, the methods are inefficient and time-consuming. Recently, locals who rely on inland fisheries in Kwan Phayao expressed their deep concerns about the giant snakehead, Channa micropeltes (Cuvier, 1831) destroying other fish there. The giant snakehead prey on many commercially important fish species, as the prey species is reduced, negative effects on both biodiversity and the fishery sector could follow. Here, an eDNA-based survey was developed to detect the presence of the giant snakehead. Water samples were collected from six sites within Kwan Phayao and 17 sites in Ing River where water flowed into and out of Kwan Payao. The eDNA of the giant snakehead was detected in water samples from all collection sites using the developed qPCR assay with various concentrations. The eDNA was shown here to be a sensitive and reliable tool for fish surveillance so there will be a better chance for developing an effective management strategy.

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年05月, Scientific Reports, 11(1) (1), 9943, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Spatiotemporal distribution of Flavobacterium psychrophilum and ayu Plecoglossus altivelis in rivers revealed by environmental DNA analysis

  Hinako Tenma, Koki Tsunekawa, Riho Fujiyoshi, Hajime Takai, Masae Hirose, Nanami Masai, Kosuke Sumi, Yuta Takihana, Sogen Yanagisawa, Kota Tsuchida, Kenichi Ohara, Toshiaki Jo, Masaki Takagi, Akiko Ota, Hiroyoshi Iwata, Yuichi Yaoi, Toshifumi Minamoto

  2021年05月, Fisheries Science, 87(3) (3), 321 - 330, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Compilation of real‐time PCR conditions toward the standardization of environmental DNA methods

  Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto, Teruhiko Takahara, Satsuki Tsuji, Kimiko Uchii, Satoshi Yamamoto, Izumi Katano, Hiroki Yamanaka

  Wiley, 2021年05月, Ecological Research, 36(3) (3), 379 - 388, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Determining an effective sampling method for eDNA metabarcoding: a case study for fish biodiversity monitoring in a small, natural river

  Masayuki K. Sakata, Takeshi Watanabe, Nobutaka Maki, Kousuke Ikeda, Toshihiro Kosuge, Hiroaki Okada, Hiroki Yamanaka, Tetsuya Sado, Masaki Miya, Toshifumi Minamoto

  2021年04月, Limnology, 22(2) (2), 221 - 235, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Simultaneous absolute quantification and sequencing of fish environmental DNA in a mesocosm by quantitative sequencing technique

  Tatsuhiko Hoshino, Ryohei Nakao, Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto

  The combination of high-throughput sequencing technology and environmental DNA (eDNA) analysis has the potential to be a powerful tool for comprehensive, non-invasive monitoring of species in the environment. To understand the correlation between the abundance of eDNA and that of species in natural environments, we have to obtain quantitative eDNA data, usually via individual assays for each species. The recently developed quantitative sequencing (qSeq) technique enables simultaneous phylogenetic identification and quantification of individual species by counting random tags added to the 5′ end of the target sequence during the first DNA synthesis. Here, we applied qSeq to eDNA analysis to test its effectiveness in biodiversity monitoring. eDNA was extracted from water samples taken over 4 days from aquaria containing five fish species (Hemigrammocypris neglectus, Candidia temminckii, Oryzias latipes, Rhinogobius flumineus, and Misgurnus anguillicaudatus), and quantified by qSeq and microfluidic digital PCR (dPCR) using a TaqMan probe. The eDNA abundance quantified by qSeq was consistent with that quantified by dPCR for each fish species at each sampling time. The correlation coefficients between qSeq and dPCR were 0.643, 0.859, and 0.786 for H. neglectus, O. latipes, and M. anguillicaudatus, respectively, indicating that qSeq accurately quantifies fish eDNA.

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年02月, Scientific Reports, 11(1) (1), 4372, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Continuous prevalence of VEB‐3 extended‐spectrum β‐lactamase‐producing Aeromonas hydrophila in a local river in gifu city, Japan

  Tomoki Aratani, Nanami Koide, Kana Hayami, Michiyo Sugiyama, Toshifumi Minamoto, Tetsuo Asai

  Wiley, 2021年02月, Microbiology and Immunology, 65(2) (2), 99 - 100, 英語, 国際誌

  研究論文（学術雑誌）


• Broad-scale detection of environmental DNA for an invasive macrophyte and the relationship between DNA concentration and coverage in rivers

  Hideyuki Doi, Yoshihisa Akamatsu, Masuji Goto, Ryutei Inui, Takashi Komuro, Mariko Nagano, Toshifumi Minamoto

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年02月, Biological Invasions, 23(2) (2), 507 - 520, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Messenger RNA typing of environmental RNA (eRNA): A case study on zebrafish tank water with perspectives for the future development of eRNA analysis on aquatic vertebrates

  Kenji Tsuri, Shizuya Ikeda, Takaya Hirohara, Yasuhito Shimada, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka

  Wiley, 2021年01月, Environmental DNA, 3(1) (1), 14 - 21, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• An illustrated manual for environmental DNA research: Water sampling guidelines and experimental protocols

  Toshifumi Minamoto, Masaki Miya, Tetsuya Sado, Satoquo Seino, Hideyuki Doi, Michio Kondoh, Keigo Nakamura, Teruhiko Takahara, Satoshi Yamamoto, Hiroki Yamanaka, Hitoshi Araki, Wataru Iwasaki, Akihide Kasai, Reiji Masuda, Kimiko Uchii

  Wiley, 2021年01月, Environmental DNA, 3(1) (1), 8 - 13, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Characterizing the spatial and temporal occurrence patterns of the endangered botiid loach Parabotia curtus by environmental DNA analysis using a newly developed species-specific primer set

  Ko Sugiura, Sei Tomita, Toshifumi Minamoto, Tappei Mishina, Akihisa Iwata, Tsukasa Abe, Satoshi Yamamoto, Katsutoshi Watanabe

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年01月, Ichthyological Research, 68(1) (1), 152 - 157, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• An Optional Low-Cost Method of Extracting Environmental DNA of Macro-Organisms from Filter Membranes in Large Scale eDNA Surveys

  Zhi Chen, Toshifumi Minamoto, Longshan Lin, Tianxiang Gao

  ResearchersLinks Ltd, 2021年01月, Pakistan Journal of Zoology, 53(1) (1), 253 - 272, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Revealing an invasion risk of fish species in Qingdao Underwater World by Eevironmental DNA metabarcoding

  Jianwei Chen, Zhi Chen, Shanshan Liu, Wenjie Guo, Di Li, Toshifumi Minamoto, Tianxiang Gao

  Springer Science and Business Media LLC, 2021年01月, Journal of Ocean University of China, 20(1) (1), 124 - 136, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• A molecular survey based on eDNA to assess the presence of a clown featherback (Chitala ornata) in a confined environment

  Maslin Osathanunkul, Toshifumi Minamoto

  2020年12月, PeerJ, 8, e10338, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Seasonal monitoring of Hida salamander Hynobius kimurae using environmental DNA with a genus-specific primer set

  Toshiaki Jo, Sei Tomita, Yukihiro Kohmatsu, Maslin Osathanunkul, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  The diversity and the abundance of amphibians have dramatically declined globally over the past 30 years, and the monitoring and conservation of their habitats is essential. However, traditional methods such as bait trapping and mark-recapture are costly, and morphological identification usually requires a high level of taxonomic expertise. Here, seasonal surveillances of Hida salamander Hynobius kimurae were performed by means of environmental DNA (eDNA) analysis with Hynobius-specific primers and a species-specific TaqMan probe. Water sampling and visual surveys were conducted seasonally in a stream in Kyoto Prefecture, Japan. Detection rates of eDNA were then calculated by real-time PCR, and eDNA site occupancy probability was estimated by multi-scale occupancy modeling. The eDNA-based detection rate of Hida salamander was 76.7%, whereas the visual survey-based detection rate was 23.3%, and target eDNA was detected at almost all sites where the presence of target species was visually confirmed. Moreover, factors relating to the site- and sample-level occurrence probabilities of the target eDNA differed depending on the developmental stage of the target species. Our findings support previous studies showing that eDNA analysis enables an effective assessment of amphibian distributions without damaging the organisms or their habitat, and we compare for the first time the site occupancy probability of amphibian eDNA throughout the life cycle of an amphibian species. The present study contributes to the development of eDNA analysis as a tool for understanding the distribution and seasonal activity of amphibian species and will thus aid in the planning of conservation measures and habitat restoration for these species.

  Inter-Research Science Center, 2020年11月, Endangered Species Research, 43, 341 - 352, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Feasibility study for seagrass beds monitoring using environmental DNA

  Edwin Muchebve, Yuriko Takayama, Maiko Akatsuka, Kazunori Ito, Toshifumi Minamoto

  Japan Society of Civil Engineers, 2020年11月, 土木学会論文集B2(海岸工学), 76(2) (2), I_949 - I_954, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 海草場を対象とした環境DNAの季節変化と環境DNA分析における採水量の検討

  赤塚真依子, 高山百合子, Edwin Muchevbe, 伊藤一教, 渡辺謙太, 桑江朝比呂, 源利文

  海草場の変化を捉えるモニタリング方法として環境DNAの活用を目指し，海草量の季節変化に伴うeDNA量の変化を把握することを目的に，水槽に生育するアマモを対象に15ヵ月の生育観察と環境DNA分析を実施した．また，実海域でのモニタリングに向けて，潮汐による流れの変化がある環境下で，季節変化の差に対して採水地点や同時刻に採水した差がどの程度であるのか調査した．15ヵ月のモニタリングでは，環境DNA量が夏に高い値を示し秋に低下する周期性を確認でき，海草が流出する時期に高くなる可能性が明らかになった．実海域調査では，同時刻に採水した１Lの分析で検出の有無が混在する結果となったが，採水量や分析量を増量し，阻害影響を低減することで定量下限を超えた値の検出が可能となり，実海域調査への適応が期待できる結果を得られた．

  土木学会, 2020年11月, 土木学会論文集B2(海岸工学), 76(2) (2), I_943 - I_948, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA revealed the fish community of Hokkaido Island, Japan, after invasion by rainbow trout

  Akio Imamura, Kana Hayami, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  In freshwater ecosystems, invasive salmonid fishes can have a significant impact on native fish species. Detecting the invasion and its negative effects is critical for the conservation of native fish communities. We examined the species composition and seasonal changes in the freshwater fish community, including salmonids, on the Kamikawa Plain, Hokkaido Island, Japan, using environmental DNA (eDNA) metabarcoding. We detected 23 fish species in 176 samples collected from 16 sites over 12 months (October 2018 – August 2019). Between 11 and 20 species were detected at each site, including five native salmonids (Oncorhynchus masou, Oncorhynchus keta, Parahucho perryi, Salvelinus leucomaenis leucomaenis and Salvelinus malma krascheninnikova). The invasive alien rainbow trout Oncorhynchus mykiss was detected at all 16 sites and it was the most commonly detected salmonid. Although we found no obvious competitive exclusion of native salmonids by rainbow trout in the study area, the invasive species occurred more often and at more sites than any of the natives. We also determined the occurrence and seasonal changes in the fish community, classified as native salmonids, invasive rainbow trout, Cypriniformes and other benthic fishes. There were fewer species overall in winter, but the sites with higher species richness in winter were on the lower reaches of the river. In addition, we detected domestic invaders, such as the topmouth gudgeon, Pseudorasbora parva, although they were less prevalent than rainbow trout. These results show the effectiveness of eDNA metabarcoding, which can be used for surveying species richness at an ecosystem scale. In particular, the detection of the early stages of establishment and spread of invasive species can be achieved by eDNA monitoring.

  Pensoft Publishers, 2020年10月, Biodiversity Data Journal, 8, e56876, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Sedimentary DNA tracks decadal-centennial changes in fish abundance

  Michinobu Kuwae, Hiromichi Tamai, Hideyuki Doi, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto, Yoshiaki Suzuki

  Far too little is known about the long-term dynamics of populations for almost all macro-organisms. Here, we examined the utility of sedimentary DNA techniques to reconstruct the dynamics in the “abundance” of a species, which has not been previously defined. We used fish DNA in marine sediments and examined whether it could be used to track the past dynamics of pelagic fish abundance in marine waters. Quantitative PCR for sedimentary DNA was applied on sediment-core samples collected from anoxic bottom sediments in Beppu Bay, Japan. The DNA of three dominant fish species (anchovy, sardine, and jack mackerel) were quantified in sediment sequences spanning the last 300 years. Temporal changes in fish DNA concentrations are consistent with those of landings in Japan for all three species and with those of sardine fish scale concentrations. Thus, sedimentary DNA could be used to track decadal-centennial dynamics of fish abundance in marine waters.

  Springer Science and Business Media LLC, 2020年10月, Communications Biology, 3(1) (1), 558, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Detection of herbivory: eDNA detection from feeding marks on leaves

  Aoi Kudoh, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto

  Wiley, 2020年10月, Environmental DNA, 2(4) (4), 627 - 634, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Sedimentary eDNA provides different information on timescale and fish species composition compared with aqueous eDNA

  Masayuki K. Sakata, Satoshi Yamamoto, Ryo O. Gotoh, Masaki Miya, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2020年10月, Environmental DNA, 2(4) (4), 505 - 518, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Selective collection of long fragments of environmental DNA using larger pore size filter

  Toshiaki Jo, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto

  Elsevier BV, 2020年09月, Science of The Total Environment, 735, 139462 - 139462, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA analysis shows high potential as a tool for estimating intraspecific genetic diversity in a wild fish population

  Satsuki Tsuji, Atsushi Maruyama, Masaki Miya, Masayuki Ushio, Hirotoshi Sato, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka

  Wiley, 2020年09月, Molecular Ecology Resources, 20(5) (5), 1248 - 1258, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Projection range of eDNA analysis in marshes: a suggestion from the Siberian salamander (Salamandrella keyserlingii) inhabiting the Kushiro marsh, Japan

  Daiki Takeshita, Shigeharu Terui, Kousuke Ikeda, Takashi Mitsuzuka, Maslin Osathanunkul, Toshifumi Minamoto

  Freshwater ecosystems are rapidly declining. The Siberian salamander (Salamandrella keyserlingii) which inhabits the Kushiro marsh in Hokkaido, Japan has lost some habitat due to human activity. There are many challenges associated with conventional monitoring methods, including cost, the need for specialist personnel, environmental impact, and ability to detect the presence of this species; thus, we investigated the feasibility of using environmental DNA (eDNA) analysis to detect its presence and identify its breeding grounds. We performed tank experiments to confirm eDNA emission from egg sacs, larvae, and adult Siberian salamanders in the water. We also performed water sampling and visual observation of egg sacs in the Kushiro marsh during the end of the breeding season and the larval season. The tank experiments found eDNA emission from all growth stages. It also implied concentrated emissions just after spawning and after hatching, and limited emissions during the incubation phase in egg sacs. We also detected eDNA in the field, likely reflecting the distribution of egg sacs or larvae. Combining this data with visual observations, it was determined that the eDNA results from the field were best explained by the number of egg sacs within 7–10 m of the sampling point. The results of this investigation show that the breeding sites and habitats of marshland species can successfully be monitored using eDNA analysis. They also suggest that the eDNA results from the marshes may reflect the biomass that is in close range to the sampling point. These results support the increased use of eDNA analysis in marshes and provide knowledge that could improve the interpretation of future results.

  PeerJ, 2020年08月, PeerJ, 8, e9764 - e9764, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Suppression of environmental DNA degradation in water samples associated with different storage temperature and period using benzalkonium chloride

  Teruhiko Takahara, Junya Taguchi, Satoshi Yamagishi, Hideyuki Doi, Shigeki Ogata, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2020年07月, Limnology and Oceanography: Methods, 18(8) (8), 437 - 445, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Estimations of riverine distribution, abundance and biomass of anguillid eels in Japan and Taiwan using environmental DNA analysis

  Hikaru Itakura, Ryoshiro Wakiya, Masayuki K. Sakata, Hsiang-Yi Hsu, Shih-Chong Chen, Chih-shao Yang, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto

  Although populations of anguillid eels have declined remarkably in recent decades, monitoring data on the spatial and temporal variation in their dynamics are often limited, particularly for tropical eel species. As there are often sympatries of multiple eel species in tropical rivers, identifying eel species based solely on morphological characteristics is challenging. Basin-scale surveys were conducted in rivers of southern Japan and northern Taiwan to investigate (1) whether the spatial distribution, abundance, and biomass of the tropical eel species, the giant mottled eel (Anguilla marmorata), can be monitored in rivers by comparing the results obtained from environmental DNA (eDNA) analysis with data from electrofishing and (2) the riverine distribution of the sympatric A. marmorata and the temperate eel species, the Japanese eel (Anguilla japonica), in this region using eDNA analysis. Although we found an much lower abundance of A. marmorata in the study region, we identified the eDNA of the species from all of the study sites (21 sites) where it was collected by electrofishing, in addition to 22 further study sites where it was not collected directly. This indicates that eDNA analysis has a greater sensitivity for detecting A. marmorata, making it a powerful tool for monitoring the spatial distribution of the species in rivers. We found a significant positive relationship between eDNA concentration and both the abundance and biomass of A. marmorata, and eDNA concentration seemed to better reflect the abundance of the species than did biomass. eDNA of both A. japonica and A. marmorata was identified from almost all rivers, indicating the sympatry of these species in this region, although the degree of sympatry differed between rivers. Though the eDNA concentration of A. japonica decreased significantly with increasing distance from the river mouth, no significant relationship was found for A. marmorata. This study is the first to demonstrate the potential usefulness of eDNA analysis for estimating the spatial distribution, abundance, and biomass of tropical eels in rivers and to further apply this method to investigate sympatry among anguillid species. eDNA analysis can help in obtaining data on the population dynamics of tropical eels, providing invaluable information for managing these species.

  2020年06月, Zoological Studies, 59, 17, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Effects of sampling seasons and locations on fish environmental DNA metabarcoding in dam reservoirs

  Kana Hayami, Masayuki K. Sakata, Takashi Inagawa, Jiro Okitsu, Izumi Katano, Hideyuki Doi, Katsuki Nakai, Hidetaka Ichiyanagi, Ryo O. Gotoh, Masaki Miya, Hirotoshi Sato, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2020年05月, Ecology and Evolution, 10(11) (11), 5354 - 5367, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Comparing the efficiency of open and enclosed filtering systems in fish and jellyfish environmental DNA quantification

  Sayaka Takahashi, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto, Reiji Masuda

  Water sampling and filtration of environmental DNA (eDNA) analysis have been performed by several different methods, and each method may yield a different species composition or eDNA concentration. Here, we investigated the eDNA of seawater samples directly collected by SCUBA to compare two widely used filtration methods: open filtration with a glass filter (GF/F) and enclosed filtration (Sterivex). We referred to biomass based on visual observation data collected simultaneously to clarify the difference between organism groups. Water samples were collected at two points in the Sea of Japan in May, September and December 2018. The respective samples were filtered through GF/F and Sterivex for eDNA extraction. We quantified the eDNA concentration of five fish and two cnidarian species by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using species-specific primers/probe sets. A strong correlation of eDNA concentration was obtained between GF/F and Sterivex; the intercepts and slopes of the linear regression lines were slightly different in fish and jellyfish. The amount of eDNA detected using the GF/F filtration method was higher than that detected using Sterivex when the eDNA concentration was high; the opposite trend was observed when the eDNA concentration was relatively low. The concentration of eDNA correlated with visually estimated biomass; eDNA concentration per biomass in jellyfish was approximately 700 times greater than that in fish. We conclude that GF/F provides an advantage in collecting a large amount of eDNA, whereas Sterivex offers superior eDNA sensitivity. Both filtration methods are effective in estimating the spatiotemporal biomass size of target marine species.

  2020年04月, PLOS ONE, 15(4) (4), e0231718, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Estimating shedding and decay rates of environmental nuclear DNA with relation to water temperature and biomass

  Toshiaki Jo, Mio Arimoto, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2020年04月, Environmental DNA, 2(2) (2), 140 - 151, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA monitoring for short‐term reproductive migration of endemic anadromous species, Shishamo smelt (Spirinchus lanceolatus)

  Tetsu Yatsuyanagi, Ryotaro Ishida, Masayuki K. Sakata, Takashi Kanbe, Hiroki Mizumoto, Yumi Kobayashi, Shoko Kamada, Satoko Namba, Hisaya Nii, Toshifumi Minamoto, Hitoshi Araki

  Wiley, 2020年04月, Environmental DNA, 2(2) (2), 130 - 139

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Multiplex real-time PCR enables the simultaneous detection of environmental DNA from freshwater fishes: a case study of three exotic and three threatened native fishes in Japan

  Toshiaki Jo, Arisa Fukuoka, Kei Uchida, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  Environmental DNA (eDNA) analysis has been used as a cost-efficient and non-invasive tool for monitoring invasive and threatened species. Previous studies typically involve two approaches; species-specific detection via PCR and multiple species detection via metabarcoding. However, the former could be costly when several species are targeted, and the latter could sometimes be insufficient to distinguish closely related species. Here, the simultaneous eDNA detection from multiple species via multiplex real-time PCR was applied to 99 ponds to evaluate the distribution of three exotic and three threatened native fish species over different seasons. We detected bluegill sunfish (Lepomis macrochirus) eDNA at 31 sites, largemouth bass (Micropterus salmoides) eDNA at 22 sites, smallmouth bass (Micropterus dolomieu) eDNA at one site, golden venus chub (Hemigrammocypris rasborella) eDNA at 11 sites, Japanese medaka (Oryzias latipes) eDNA at 26 sites, and weather loach (Misgurnus anguillicaudatus) eDNA at 41 sites. We found that eDNA detection rates were higher in early summer for all fish species. Moreover, exotic fish eDNA was detected more frequently in ponds which were easier to access by car and which have a larger surface area and higher pH. Furthermore, the detection rates of native fish eDNA were generally lower in the ponds where exotic fish eDNA was detected more frequently. Multiplex real-time PCR can help detect the distribution of exotic and threatened native species for conservation and ecosystem management. This method is expected to substantially contribute to the early detection of invasive species and the efficient protection of threatened species' habitat.

  SPRINGER, 2020年02月, Biological Invasions, 22(2) (2), 455 - 471, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 舟山近海水样环境DNA获取方法的建立

  陈治, 宋娜, 源利文, 邬倩倩, 高天翔

  2020年01月, 水生生物学報, 44(1) (1), 中国語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Evaluating intraspecific genetic diversity using environmental DNA and denoising approach: A case study using tank water

  Satsuki Tsuji, Masaki Miya, Masayuki Ushio, Hirotoshi Sato, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka

  Wiley, 2020年01月, Environmental DNA, 2(1) (1), 42 - 52, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA detection and quantification of invasive red-eared sliders, Trachemy scripta elegans, in ponds and the influence of water quality

  Aozora Kakuda, Hideyuki Doi, Rio Souma, Mariko Nagano, Toshifumi Minamoto, Izumi Katano

  Environmental DNA (eDNA) is a powerful tool for monitoring the distribution of aquatic macro-organisms. However, environmental factors, including the water temperature and water quality, can affect the inhibition and/or degradation of eDNA, which complicates accurate estimations of eDNA concentrations and the detection of the presence/absence of species in natural habitats. Further very few eDNA studies have been conducted for reptiles, especially with respect to estimating their biomass and/or abundances. Here we examined the relationship between the visually-observed number of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans) and eDNA concentrations across 100 ponds. Additionally, we evaluated the effect of water quality on red-eared slider eDNA concentration in these ponds. We found that there was a significant positive correlation between the observed number of red-eared sliders and the eDNA concentration in the ponds. On comparing various water quality indicators, including dissolved nitrogen, dissolved phosphorous, organic matter, and chlorophyll a (Chl. a), we found that only Chl. a had a negative correlation with the red-eared slider eDNA concentration, while we did not find any inhibition in the quantitative PCR. We conclude that concentrations of eDNA can potentially be used for estimating the abundance of the red-eared slider. Additionally, Chl. a might indirectly influence the degradation of eDNA through the microorganisms bonded to the phytoplankton in the ponds, as microbial activity is thought to decrease eDNA persistence.

  PeerJ, 2019年12月, PeerJ, 7, e8155 - e8155, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA metabarcoding to detect pathogenic Leptospira and associated organisms in leptospirosis-endemic areas of Japan

  Yukuto Sato, Masaru Mizuyama, Megumi Sato, Toshifumi Minamoto, Ryosuke Kimura, Claudia Toma

  Springer Science and Business Media LLC, 2019年12月, Scientific Reports, 9(1) (1), 6575, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Detection of Schistosoma japonicum and Oncomelania hupensis quadrasi environmental DNA and its potential utility to schistosomiasis japonica surveillance in the Philippines

  Raffy Jay C. Fornillos, Marcello Otake Sato, Ian Kim B. Tabios, Megumi Sato, Lydia R. Leonardo, Yuichi Chigusa, Toshifumi Minamoto, Mihoko Kikuchi, Emelda R. Legaspi, Ian Kendrich C. Fontanilla

  In recent years, the prevalence and infection intensity of Schistosoma japonicum in endemic areas of the Philippines have significantly decreased due to yearly population-based treatment strategies, yet transmission rates remain high and uninterrupted. An important indicator of active disease transmission is the presence of Schistosoma japonicum and its snail intermediate host Oncomelania hupensis quadrasi in freshwater habitats. In this study, we sought to apply a species-specific real-time PCR (qPCR) assay for the detection of S. japonicum and O. hupensis quadrasi in freshwater samples using environmental DNA approach that can complement the commonly utilized malacological survey in determining potential transmission foci in order to have a more effective snail surveillance strategy for schistosomiasis japonica in endemic areas. The newly developed assay was specific to S. japonicum and O. hupensis quadrasi with no amplification detected against non-target trematode Fasciola spp. and snails such as Lymnaea spp., Pomacea canaliculata, and Melanoides spp. that typically co-exist in the same environment. The assay effectiveness was determined using 19 environmental water samples collected from Northern Samar (N = 5 sites), Leyte (N = 11 sites) and Compostela Valley (N = 3 sites) and compared to malacological survey for determining O. hupensis quadrasi snail colonies and snail crushing to visualize S. japonicum cercariae. TaqMan qPCR targeting a short fragment of the cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene was positive for S. japonicum in 9 sites, for O. hupensis quadrasi in 9 sites, and for both S. japonicum and O. hupensis quadrasi in 5 sampling sites. Moreover, it was able to detect O. hupensis quadrasi in 3 out of 12 sites found negative and 6 out of 7 sites found positive through malacological survey, and in 4 of the 5 snail sites positive for snails with cercariae. Overall, this method can complement malacological surveys for monitoring of schistosomes in endemic areas of the Philippines, especially those with high risk of human infection.

  2019年11月, PLOS ONE, 14(11) (11), e0224617, 英語, 国際誌

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Comparison of inhibition resistance among PCR reagents for detection and quantification of environmental DNA

  Kimiko Uchii, Hideyuki Doi, Teruyuki Okahashi, Izumi Katano, Hiroki Yamanaka, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2019年11月, Environmental DNA, 1(4) (4), 359 - 367, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 環境DNAを活用した固着性水生生物モニタリング手法の成立性について

  高山百合子, 赤塚真依子, 伊藤一教, 源利文

  2019年11月, 土木学会論文集B2（海岸工学）, 75(2) (2), I_1087 - I_1092, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 海草場を対象とした環境DNAの季節変化・日変化・形態変化に関する基礎研究

  赤塚 真依子, 高山 百合子, 伊藤 一教, 渡辺 謙太, 桑江 朝比呂, 大澤 亮介, 森本 哲平, 源 利文

  土木学会, 2019年11月, 土木学会論文集. B2, 海岸工学 Journal of Japan Society of Civil Engineers. 土木学会海岸工学委員会 編, 75(2) (2), I_1075 - 1080, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Analysis of Environmental DNA and Edaphic Factors for the Detection of the Snail Intermediate Host Oncomelania hupensis quadrasi

  Fritz Ivy C. Calata, Camille Z. Caranguian, Jillian Ela M. Mendoza, Raffy Jay C. Fornillos, Ian Kim B. Tabios, Ian Kendrich C. Fontanilla, Lydia R. Leonardo, Louie S. Sunico, Satoru Kawai, Yuichi Chigusa, Mihoko Kikuchi, Megumi Sato, Toshifumi Minamoto, Zenaida G. Baoanan, Marcello Otake Sato

  Background: The perpetuation of schistosomiasis japonica in the Philippines depends to a major extent on the persistence of its intermediate host Oncomelania hupensis quadrasi, an amphibious snail. While the malacological survey remains the method of choice in determining the contamination of the environment as evidenced by snails infected with schistosome larval stages, an emerging technology known as environmental DNA (eDNA) detection provides an alternative method. Previous reports showed that O. hupensis quadrasi eDNA could be detected in water, but no reports have been made on its detection in soil. Methods: This study, thus focused on the detection of O. hupensis quadrasi eDNA from soil samples collected from two selected schistosomiasis-endemic barangays in Gonzaga, Cagayan Valley using conventional and TaqMan-quantitative (qPCR) PCRs. Results: The results show that qPCR could better detect O. hupensis quadrasi eDNA in soil than the conventional method. In determining the possible distribution range of the snail, basic edaphic factors were measured and correlated with the presence of eDNA. The eDNA detection probability increases as the pH, phosphorous, zinc, copper, and potassium content increases, possibly indicating the conditions in the environment that favor the presence of the snails. A map was generated to show the probable extent of the distribution of the snails away from the body of the freshwater. Conclusion: The information generated from this study could be used to determine snail habitats that could be possible hotspots of transmission and should, therefore, be targeted for snail control or be fenced off from human and animal contact or from the contamination of feces by being a dumping site for domestic wastes.

  MDPI AG, 2019年09月, Pathogens, 8(4) (4), 160 - 160, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Seasonal change in environmental DNA concentration of a submerged aquatic plant species

  Saeko Matsuhashi, Toshifumi Minamoto, Hideyuki Doi

  2019年09月, Freshwater Science, 38, 654 - 660, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Discovery of an unrecorded population of Yamato salamander ( Hynobius vandenburghi ) by GIS and eDNA analysis

  Yusuke Sakai, Ayane Kusakabe, Kota Tsuchida, Yuka Tsuzuku, Shogo Okada, Takuto Kitamura, Sei Tomita, Takahiko Mukai, Masataka Tagami, Masaki Takagi, Yuichi Yaoi, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2019年09月, Environmental DNA, 1(3) (3), 281 - 289, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Particle Size Distribution of Environmental DNA from the Nuclei of Marine Fish

  Toshiaki Jo, Mio Arimoto, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto

  2019年08月, ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY, 53(16) (16), 9947 - 9956, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Biomass‐dependent emission of environmental DNA in jack mackere Trachurus japonicus juveniles

  Tomoya Horiuchi, Reiji Masuda, Hiroaki Murakami, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2019年07月, Journal of Fish Biology, 95(3) (3), 979 - 981, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• How science, technology and innovation can be placed in broader visions — Public opinions from inclusive public engagement activities

  Kei Kano, Mitsuru Kudo, Go Yoshizawa, Eri Mizumachi, Makiko Suga, Naonori Akiya, Kuniyoshi Ebina, Takayuki Goto, Masayuki Itoh, Ayami Joh, Haruhiko Maenami, Toshifumi Minamoto, Mikihiko Mori, Yoshitaka Morimura, TAMAKI Motoki, Akie Nakayama, Katsuya Takanashi

  2019年06月, Journal of Science Communication, 18(03) (03), A02, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 河川横断構造物とニジマスが北海道のイワナ属の生息に与える影響：環境DNA分析の結果をもとに

  今村彰生, 速水花奈, 坂田雅之, 源利文

  サケ科イワナ属のオショロコマ（Salvelinus malma malma）は、国内では降海しない陸封型が北海道にのみ生息し、環境省レッドデータブックの絶滅危惧Ⅱ類（VU）に選定されている。一般に河川最上流域に生息し、オショロコマより下流には同属のエゾイワナ（S. leucomaenis leucomaenis）が分布するとされている。これらは、人工的河川横断構造物と外来種のニジマス（Oncorhynchus mykiss）の定着によって個体数が減少している可能性がある。そこで、環境DNA分析手法を用いて年間を通したサンプリングを行い、オショロコマ、エゾイワナ、およびニジマスそれぞれの生息の有無とその季節変化を調べた。大雪山系周辺の石狩川水系支流の支流系1、ピウケナイ川、オサラッペ川を調査地とし、構造物の上下での採水を含め、計16地点で採水を行った。その結果、支流系1流域ではオショロコマが最上流域、エゾイワナが中上流域で検出され、ニジマスは下流域でのみ検出された。ピウケナイ川流域ではオショロコマとニジマスが全地点で検出され、エゾイワナは検出されなかった。一方、オサラッペ川では3種いずれも検出率が低かった。調査地点ごとの検出の有無について一般化線形混合モデルによる解析を実施したところ、移動の時期や方向性および構造物の障壁としての機能などは明確にできなかったが、オショロコマが上流に多いのに対して、エゾイワナとニジマスは下流に多い傾向を示し、しかもオショロコマとニジマスについては排他的ではない可能性が示された。しかし、これはニジマスによる競争排除が無いことを保証せず、有効性が示された環境DNA分析を駆使し、継続的なモニタリングを行い定量的な把握を目指す必要があるだろう。

  日本生態学会, 2019年05月, 保全生態学研究, 24(1) (1), 71 - 81, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Habitat selection and migration of the common shrimp, Palaemon paucidens in Lake Biwa, Japan—An eDNA‐based study

  Qianqian Wu, Ken Kawano, Toshiyuki Ishikawa, Masayuki K. Sakata, Ryohei Nakao, Masayoshi K. Hiraiwa, Satsuki Tsuji, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2019年05月, Environmental DNA, 1(1) (1), 54 - 63, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• The life history with seasonal migration of the lacustrine shrimp Palaemon paucidens in an ancient lake in Japan

  Qianqian Wu, Yasuoki Takami, Toshifumi Minamoto, Toshiyuki Ishikawa

  2019年04月, Ecosphere, 10(4) (4), e02628, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Using environmental DNA to estimate the seasonal distribution and habitat preferences of a Japanese basket clam in Lake Shinji, Japan

  Teruhiko Takahara, Takashi Ikebuchi, Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto

  2019年03月, Estuarine, Coastal and Shelf Science, 221, 15 - 20, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA analysis reveals the spatial distribution, abundance, and biomass of Japanese eels at the river‐basin scale

  Hikaru Itakura, Ryoshiro Wakiya, Satoshi Yamamoto, Kenzo Kaifu, Takuya Sato, Toshifumi Minamoto

  Wiley, 2019年03月, Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 29(3) (3), 361 - 373, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Dispersion and degradation of environmental DNA from caged fish in a marine environment

  Hiroaki Murakami, Seokjin Yoon, Akihide Kasai, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto, Masayuki K. Sakata, Tomoya Horiuchi, Hideki Sawada, Michio Kondoh, Yoh Yamashita, Reiji Masuda

  Springer Science and Business Media LLC, 2019年03月, Fisheries Science, 85(2) (2), 327 - 337, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Effect of water temperature and fish biomass on environmental DNA shedding, degradation, and size distribution

  Toshiaki Jo, Hiroaki Murakami, Satoshi Yamamoto, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto

  2019年02月, ECOLOGY AND EVOLUTION, 9(3) (3), 1135 - 1146, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Real-time PCR assays for environmental DNA detection of three salmonid fish in Hokkaido, Japan: application to winter surveys

  Toshifumi Minamoto, Kana Hayami, Masayuki K. Sakata, Akio Imamura

  2019年01月, Ecological Research, 34(1) (1), 237 - 242, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• First use of oceanic environmental DNA to study the spawning ecology of the Japanese eel Anguilla japonica

  Aya Takeuchi, Shun Watanabe, Satoshi Yamamoto, Michael J. Miller, Tatsuhiro Fukuba, Tstsuya Miwa, Tatsufumi Okino, Toshifumi Minamoto, Katsumi Tsukamoto

  Inter-Research Science Center, 2019年01月, Marine Ecology Progress Series, 609, 187 - 196, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Usefulness of environmental DNA for detecting Schistosoma mansoni occurrence sites in Madagascar

  Marcello Otake Sato, Armand Rafalimanantsoa, Charles Ramarokoto, Alain Marcel Rahetilahy, Pascaline Ravoniarimbinina, Satoru Kawai, Toshifumi Minamoto, Megumi Sato, Masashi Kirinoki, Voahangy Rasolofo, Mathilde De Calan, Yuichi Chigusa

  Elsevier BV, 2018年11月, International Journal of Infectious Diseases, 76, 130 - 136, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 海草場を対象とした環境DNA検出方法と三次元数値解析の適用性に関する検討

  赤塚真依子, 高山百合子, 伊藤一教, 森本哲平, 源利文

  2018年11月, 土木学会論文集B2（海岸工学）, 74(2) (2), I_1225 - I_1230, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• アマモ場のモニタリング手法における環境DNAの活用について

  高山百合子, 赤塚真依子, 伊藤一教, 源利文

  2018年11月, 土木学会論文集B2（海岸工学）, 74(2) (2), I_1231 - I_1236, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA reveals nonmigratory individuals of Palaemon paucidens overwintering in Lake Biwa shallow waters

  Qianqian Wu, Ken Kawano, Yoshitoshi Uehara, Noboru Okuda, Masamichi Hongo, Satsuki Tsuji, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  University of Chicago Press, 2018年06月, Freshwater Science, 37(2) (2), 307 - 314, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Comparing local‐ and regional‐scale estimations of the diversity of stream fish using eDNA metabarcoding and conventional observation methods

  Hikaru Nakagawa, Satoshi Yamamoto, Yukuto Sato, Tetsuya Sado, Toshifumi Minamoto, Masaki Miya

  Blackwell Publishing Ltd, 2018年06月, Freshwater Biology, 63(6) (6), 569 - 580, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Quantitative monitoring of multispecies fish environmental DNA using high-throughput sequencing

  Masayuki Ushio, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Tetsuya Sado, Masaki Miya, Sho Sakurai, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto, Michio Kondoh

  2018年03月, Metabarcoding & Metagenomics, 2018, e23297, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 河川における流程500m間隔での環境DNA分析と現地採集調査による魚類検出結果の比較

  丹羽 英之, 坂田 雅之, 源 利文, 清野 未恵子

  近年環境DNA分析によるマクロ生物の分布調査法が発展しており、多くの生物種の分布調査が可能であることが示されている。一方で、水の動きのある河川において、数百メートル程度の小さな空間スケールで環境DNA分析と採集調査の結果を比較した例は少なく、希少種の生息域を詳細に把握するツールとしての有効性は十分に検証されていない。本研究では、河川に設定した複数の比較的小さな空間スケールの調査区画で、環境DNA分析と現地採集調査を行い、環境DNA分析と採集調査の結果がどの程度一致するのかを検証した。調査は兵庫県の篠山川の上流域で行い、調査対象種は同流域での分布が確認されている希少種のアカザ、オヤニラミ、スナヤツメ南方種の3種とした。調査区間を500 mの等間隔に分割した23の調査単位を設定し、各区画の下流端で採水し、本研究で開発したリアルタイムPCR系で調査対象種のDNAの検出を行った。また、採集対象を調査対象種に限定した現地採集調査を行い、調査単位（500 m）ごとに種の在不在を記録した。その結果、環境DNA分析と現地採集調査の結果が一致する割合は種によって異なっており、小さな空間スケールで環境DNA分析と現地採集調査の結果を比較した場合には、両者は単純には一致しないことが示された。環境DNA分析を希少種の保全につなげていくためには、本研究と同様の検証を積み重ねていく必要がある。

  一般社団法人 日本生態学会, 2018年, 保全生態学研究, 23(2) (2), 257 - 264, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Effect of different personal histories on valuation for forest ecosystem services in urban areas: A case study of Mt. Rokko, Kobe, Japan

  Masayuki Sato, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  2017年12月, URBAN FORESTRY & URBAN GREENING, 28, 110 - 117, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Identifying a breeding habitat of a critically endangered fish, Acheilognathus typus, in a natural river in Japan

  Masayuki K. Sakata, Nobutaka Maki, Hideki Sugiyama, Toshifumi Minamoto

  2017年12月, SCIENCE OF NATURE, 104(11-12) (11-12), 100, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Rapid degradation of longer DNA fragments enables the improved estimation of distribution and biomass using environmental DNA

  Toshiaki Jo, Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Masayuki K. Sakata, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto

  2017年11月, MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 17(6) (6), e25 - e33, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Water sampling for environmental DNA surveys by using an unmanned aerial vehicle

  Hideyuki Doi, Yoshihisa Akamatsu, Yutaka Watanabe, Masuji Goto, Ryutei Inui, Izumi Katano, Mariko Nagano, Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto

  2017年11月, LIMNOLOGY AND OCEANOGRAPHY-METHODS, 15(11) (11), 939 - 944, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Distinct seasonal migration patterns of Japanese native and non-native genotypes of common carp estimated by environmental DNA

  Kimiko Uchii, Hideyuki Doi, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2017年10月, ECOLOGY AND EVOLUTION, 7(20) (20), 8515 - 8522, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA method for estimating salamander distribution in headwater streams, and a comparison of water sampling methods

  Izumi Katano, Ken Harada, Hideyuki Doi, Rio Souma, Toshifumi Minamoto

  2017年05月, PLOS ONE, 12(5) (5), e0176541 - e0176541, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Application of environmental DNA analysis for the detection of Opisthorchis viverrini DNA in water samples

  Hiroki Hashizume, Megumi Sato, Marcello Otake Sato, Sumire Ikeda, Tippayarat Yoonuan, Surapol Sanguankiat, Tiengkham Pongvongsa, Kazuhiko Moji, Toshifumi Minamoto

  2017年05月, ACTA TROPICA, 169, 1 - 7, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Water temperature-dependent degradation of environmental DNA and its relation to bacterial abundance

  Satsuki Tsuji, Masayuki Ushio, Sho Sakurai, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka

  2017年04月, PLOS ONE, 12(4) (4), e0176608, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• A simple method for preserving environmental DNA in water samples at ambient temperature by addition of cationic surfactant

  Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto, Junichi Matsuura, Sho Sakurai, Satsuki Tsuji, Hiromu Motozawa, Masamichi Hongo, Yuki Sogo, Naoki Kakimi, Iori Teramura, Masaki Sugita, Miki Baba, Akihiro Kondo

  2017年04月, LIMNOLOGY, 18(2) (2), 233 - 241, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Nuclear internal transcribed spacer-1 as a sensitive genetic marker for environmental DNA studies in common carp Cyprinus carpio

  Toshifumi Minamoto, Kimiko Uchii, Teruhiko Takahara, Takumi Kitayoshi, Satsuki Tsuji, Hiroki Yamanaka, Hideyuki Doi

  2017年03月, MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 17(2) (2), 324 - 333, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Isopropanol precipitation method for collecting fish environmental DNA

  Hideyuki Doi, Kimiko Uchii, Saeko Matsuhashi, Teruhiko Takahara, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2017年02月, LIMNOLOGY AND OCEANOGRAPHY-METHODS, 15(2) (2), 212 - 218, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA reflects spatial and temporal jellyfish distribution

  Toshifumi Minamoto, Miho Fukuda, Koki R. Katsuhara, Ayaka Fujiwara, Shunsuke Hidaka, Satoshi Yamamoto, Kohji Takahashi, Reiji Masuda

  2017年02月, PLOS ONE, 12(2) (2), e0173073, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Random mutagenesis by error-prone polymerase chain reaction using a heavy water solvent

  Toshifumi Minamoto

  Humana Press Inc., 2017年, Methods in Molecular Biology, 1498, 491 - 495, 英語

  [査読有り]

  研究論文（国際会議プロシーディングス）


• Environmental DNA metabarcoding reveals local fish communities in a species-rich coastal sea

  Satoshi Yamamoto, Reiji Masuda, Yukuto Sato, Tetsuya Sado, Hitoshi Araki, Michio Kondoh, Toshifumi Minamoto, Masaki Miya

  2017年01月, SCIENTIFIC REPORTS, 7, 40368, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Environmental DNA analysis for estimating the abundance and biomass of stream fish

  Hideyuki Doi, Ryutei Inui, Yoshihisa Akamatsu, Kazuki Kanno, Hiroki Yamanaka, Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto

  2017年01月, FRESHWATER BIOLOGY, 62(1) (1), 30 - 39, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Effects of water pH and proteinase K treatment on the yield of environmental DNA from water samples

  Satsuki Tsuji, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2017年01月, LIMNOLOGY, 18(1) (1), 1 - 7, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Use of a Filter Cartridge for Filtration of Water Samples and Extraction of Environmental DNA

  Masaki Miya, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka, Shin-ichiro Oka, Keiichi Sato, Satoshi Yamamoto, Tetsuya Sado, Hideyuki Doi

  2016年11月, JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, 117(117) (117), e54741, 英語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）


• On-site filtration of water samples for environmental DNA analysis to avoid DNA degradation during transportation

  Hiroki Yamanaka, Hiromu Motozawa, Satsuki Tsuji, Ryohei C. Miyazawa, Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto

  2016年11月, ECOLOGICAL RESEARCH, 31(6) (6), 963 - 967, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Use of environmental DNA to survey the distribution of an invasive submerged plant in ponds

  Ayaka Fujiwara, Saeko Matsuhashi, Hideyuki Doi, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto

  2016年06月, FRESHWATER SCIENCE, 35(2) (2), 748 - 754, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Evaluation of the Environmental DNA Method for Estimating Distribution and Biomass of Submerged Aquatic Plants

  Saeko Matsuhashi, Hideyuki Doi, Ayaka Fujiwara, Sonoko Watanabe, Toshifumi Minamoto

  2016年06月, PLOS ONE, 11(6) (6), 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 市民による科学情報読み解きへの支援 -「IPCCレポートを根掘り葉掘り読む会」-

  蛯名邦禎, 伊藤真之, 梅村界渡, 源利文

  平成27年度日本科学教育学会第7回研究会（四国支部開催); [日時] 平成28年5月28日（土）; [会場]香川大学; [主催]一般社団法人日本科学教育学会

  日本科学教育学会, 2016年05月, 日本科学教育学会研究会研究報告, 30(7) (7), 17 - 20, 日本語

  研究論文（研究会，シンポジウム資料等）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境ＤＮＡ分析手法による高校生研究活動への支援

  源利文, 伊藤真之, 蛯名邦禎

  平成27年度日本科学教育学会第7回研究会（四国支部開催); [日時] 平成28年5月28日（土）; [会場]香川大学; [主催]一般社団法人日本科学教育学会

  日本科学教育学会, 2016年05月, 日本科学教育学会研究会研究報告, 30(2) (2), 21 - 24, 日本語

  研究論文（研究会，シンポジウム資料等）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• A novel environmental DNA approach to quantify the cryptic invasion of non-native genotypes

  Kimiko Uchii, Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto

  2016年03月, MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 16(2) (2), 415 - 422, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environmental DNA as a 'Snapshot' of Fish Distribution: A Case Study of Japanese Jack Mackerel in Maizuru Bay, Sea of Japan

  Satoshi Yamamoto, Kenji Minami, Keiichi Fukaya, Kohji Takahashi, Hideki Sawada, Hiroaki Murakami, Satsuki Tsuji, Hiroki Hashizume, Shou Kubonaga, Tomoya Horiuchi, Masamichi Hongo, Jo Nishida, Yuta Okugawa, Ayaka Fujiwara, Miho Fukuda, Shunsuke Hidaka, Keita W. Suzuki, Masaki Miya, Hitoshi Araki, Hiroki Yamanaka, Atsushi Maruyama, Kazushi Miyashita, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto, Michio Kondoh

  2016年03月, PLOS ONE, 11(3) (3), e1249786, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• The use of environmental DNA of fishes as an efficient method of determining habitat connectivity

  Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2016年03月, ECOLOGICAL INDICATORS, 62, 147 - 153, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Techniques for the practical collection of environmental DNA: filter selection, preservation, and extraction

  Toshifumi Minamoto, Takafumi Naka, Kazuhiko Moji, Atsushi Maruyama

  2016年01月, LIMNOLOGY, 17(1) (1), 23 - 32, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 環境DNA を用いた沿岸域における魚類モニタリング

  源 利文, 山本 哲史, 笠井 亮秀, 近藤 倫生

  環境DNA を用いて水中の生物分布を明らかにする手法が近年急速に発展している．環境DNA を用いた生物分布の推定手法は，種特異的な検出系を用いた特定の種の在不在を調べる方法と，メタバーコーディングを用いた生息種の網羅的検出の手法に大別できる．本稿では，これまでに報告されている研究例をあげながら，このような手法について概説する．海洋における環境DNA 分析手法の実施例はまだ報告例が少ないが，ここでは著者らの研究チームが実施した環境DNA 定量によるマアジ（Trachurus japonicus）の相対バイオマス推定の予備的な解析結果についても報告し，海域における環境DNA 分析手法の現時点での到達点について述べる．マアジの環境DNA 分析の結果は，海域においても環境DNAを用いたバイオマス推定が可能である事を示唆している．今後，環境DNA 分析によって沿岸域における魚類の生息状況や生態の把握はいっそう進むと期待され，本手法は水産学，魚類学，生態学など様々な分野に貢献することができるだろう．

  日本海洋学会 沿岸海洋研究会, 2016年, 沿岸海洋研究, 53(2) (2), 173 - 178, 日本語

  [査読有り][招待有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 在来希少種カワバタモロコの環境DNAによる検出系の確立

  福岡有紗, 高原輝彦, 松本宗弘, 兵庫県立農業高校生物部, 丑丸敦史, 源利文

  Tohoku University, 2016年, 日本生態学会誌, 66(3) (3), 613 - 620, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNA分析の野外調査への展開

  山中裕樹, 源利文, 高原輝彦, 内井貴美子, 土居秀幸

  Tohoku University, 2016年, 日本生態学会誌, 66(3) (3), 601 - 612, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNA分析の手法開発の現状〜淡水域の研究事例を中心にして〜

  高原輝彦, 山中裕樹, 源利文, 土居秀幸, 内井貴美子

  Tohoku University, 2016年, 日本生態学会誌, 66(3) (3), 583 - 600, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Detection of periodic patterns in microarray data reveals novel oscillating transcripts of biological rhythms in Ciona intestinalis

  Hiromi Matsumae, Ryosuke Ishiwata, Toshifumi Minamoto, Norio Ishida, Soichi Ogishima, Hiroshi Tanaka

  Springer Science and Business Media LLC, 2015年12月, Artificial Life and Robotics, 20(4) (4), 347 - 352, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species

  Masaki Miya, Yukuto Sato, Tsukasa Fukunaga, Tetsuya Sado, Keiichi Sato, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto, Hiroaki Yamanaka, Hitoshi Araki, Michio Kondoh, Wataru Iwasaki

  2015年07月, ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE, 2(7) (7), 150088, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Preliminary experiment for detection method of fish inhabiting agricultural drainage canals using environmental DNA

  KOIZUMI Noriyuki, TAKAHARA Teruhiko, MINAMOTO Toshifumi, DOI Hideyuki, MORI Atsushi, WATANABE Keiji, TAKEMURA Takeshi

  The Japanese Society of Irrigation, Drainage and Rural Engineering, 2015年06月, Irrigation, Drainage and Rural Engineering Journal, 297(83-3) (83-3), IV_7 - IV_8, 英語

  [査読有り]


• Droplet Digital Polymerase Chain Reaction (PCR) Outperforms Real-Time PCR in the Detection of Environmental DNA from an Invasive Fish Species

  Hideyuki Doi, Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto, Saeko Matsuhashi, Kimiko Uchii, Hiroki Yamanaka

  2015年05月, ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY, 49(9) (9), 5601 - 5608, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• A basin-scale application of environmental DNA assessment for rare endemic species and closely related exotic species in rivers: a case study of giant salamanders in Japan

  Sou Fukumoto, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  2015年04月, JOURNAL OF APPLIED ECOLOGY, 52(2) (2), 358 - 365, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Use of Droplet Digital PCR for Estimation of Fish Abundance and Biomass in Environmental DNA Surveys

  Hideyuki Doi, Kimiko Uchii, Teruhiko Takahara, Saeko Matsuhashi, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2015年03月, PLOS ONE, 10(3) (3), e0122763 - e0122763, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Effects of sample processing on the detection rate of environmental DNA from the Common Carp (Cyprinus carpio)

  Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto, Hideyuki Doi

  2015年03月, BIOLOGICAL CONSERVATION, 183, 64 - 69, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Monitoring fish pathogenic viruses in natural lakes in Yunnan, China

  Toshifumi Minamoto, Xiaoying Pu, Jie Xie, Yi Dong, Deyi Wu, Hainan Kong, Xiaoxia Yang, Teruhiko Takahara, Mie N. Honjo, Hiroki Yamanaka, Zen'ichiro Kawabata

  2015年01月, LIMNOLOGY, 16(1) (1), 69 - 77, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• The Release Rate of Environmental DNA from Juvenile and Adult Fish

  Atsushi Maruyama, Keisuke Nakamura, Hiroki Yamanaka, Michio Kondoh, Toshifumi Minamoto

  2014年12月, PLOS ONE, 9(12) (12), e114639, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Effects of daily temperature fluctuation on the survival of carp infected with Cyprinid herpesvirus 3

  Teruhiko Takahara, Mie N. Honjo, Kimiko Uchii, Toshifumi Minamoto, Hideyuki Doi, Takafumi Ito, Zen'ichiro Kawabata

  2014年09月, AQUACULTURE, 433, 208 - 213, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• パブリックコメント・ワークショップの試行 〜「宇宙基本計画（案）」をテーマとしたワークショップの事例報告〜

  水町衣里, 加納圭, 伊藤真之, 源利文, 中山晶絵, 蛯名邦禎, 秋谷直矩

  北海道大学高等教育推進機構 高等教育研究部 科学技術コミュニケーション教育研究部門（CoSTEP）, 2014年06月, 科学技術コミュニケーション, 15(15) (15), 123 - 136, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Differences between domesticated Eurasian and Japanese indigenous strains of the common carp (Cyprinus carpio) in cortisol release following acute stress

  Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto, Hideyuki Doi, Takafumi Ito, Zen'ichiro Kawabata

  2014年04月, ICHTHYOLOGICAL RESEARCH, 61(2) (2), 165 - 168, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Seasonal reactivation enables Cyprinid herpesvirus 3 to persist in a wild host population

  Kimiko Uchii, Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Zen'ichiro Kawabata

  2014年02月, FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 87(2) (2), 536 - 542, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• An emerging infectious pathogen endangers an ancient lineage of common carp by acting synergistically with conspecific exotic strains

  K. Uchii, N. Okuda, T. Minamoto, Z. Kawabata

  Wiley, 2013年06月, Animal Conservation, 16(3) (3), 324 - 330, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 滇池和洱海湖滨带水生植被状况与水质的关系研究

  谢杰, 吴德意, 陈雪初, 孔海南, 普孝英, 杨晓霞, 源利文, 山中裕树, 本庄三惠, 川端善一郎, 李梅新

  2013年04月, 环境科学与技术, 36(2) (2), 61 - 65, 中国語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Using Environmental DNA to Estimate the Distribution of an Invasive Fish Species in Ponds

  Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto, Hideyuki Doi

  2013年02月, PLOS ONE, 8(2) (2), e56584, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Surveillance of fish species composition using environmental DNA

  Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka, Teruhiko Takahara, Mie N. Honjo, Zen'ichiro Kawabata

  2012年08月, LIMNOLOGY, 13(2) (2), 193 - 197, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• Nationwide Cyprinid herpesvirus 3 contamination in natural rivers of Japan

  Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Hiroki Yamanaka, Kimiko Uchii, Zen'ichiro Kawabata

  2012年08月, RESEARCH IN VETERINARY SCIENCE, 93(1) (1), 508 - 514, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Estimation of Fish Biomass Using Environmental DNA

  Teruhiko Takahara, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka, Hideyuki Doi, Zen'ichiro Kawabata

  2012年04月, PLOS ONE, 7(4) (4), e35868, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Reservoirs of Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV-3) DNA in sediments of natural lakes and ponds

  Mie N. Honjo, Toshifumi Minamoto, Zen'ichiro Kawabata

  2012年03月, VETERINARY MICROBIOLOGY, 155(2-4) (2-4), 183 - 190, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• A new method for random mutagenesis by error-prone polymerase chain reaction using heavy water

  Toshifumi Minamoto, Eitaro Wada, Isamu Shimizu

  2012年01月, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 157(1) (1), 71 - 74, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Expression of spliced variants of period mRNA in the Japanese honeybee Apis cerana japonica

  Toshifumi Minamoto, Taro Fuchikawa, Isamu Shimizu

  2012年, BIOLOGICAL RHYTHM RESEARCH, 43(2) (2), 125 - 135, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Spatial-temporal analysis of water temperatures during spring in Lake Erhai, China: implications for fisheries

  Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto, Deyi Wu, Hainan Kong, Zhihong Wei, Bin Liu, Zen'ichiro Kawabata

  2012年, INLAND WATERS, 2(3) (3), 129 - 136, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Environment-KHV-carp-human linkage as a model for environmental diseases

  Zen'ichiro Kawabata, Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Kimiko Uchii, Hiroki Yamanaka, Alata A. Suzuki, Yukihiro Kohmatsu, Kota Asano, Tomoaki Itayama, Tomoaki Ichijo, Koji Omori, Noboru Okuda, Masayuki Kakehashi, Masao Nasu, Kazuaki Matsui, Masatomi Matsuoka, Hainan Kong, Teruhiko Takahara, Deyi Wu, Ryuji Yonekura

  2011年11月, ECOLOGICAL RESEARCH, 26(6) (6), 1011 - 1016, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Stress response to daily temperature fluctuations in common carp, Cyprinus carpio L.

  Teruhiko Takahara, Hiroki Yamanaka, Alata A. Suzuki, Mie N. Honjo, Toshifumi Minamoto, Ryuji Yonekura, Tomoaki Itayama, Yukihiro Kohmatsu, Takafumi Ito, Zen'ichiro Kawabata

  2011年10月, HYDROBIOLOGIA, 675(1) (1), 65 - 73, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Detection of cyprinid herpesvirus-3 DNA in lake plankton

  Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Hiroki Yamanaka, Nobuyuki Tanaka, Tomoaki Itayama, Zen'ichiro Kawabata

  2011年06月, RESEARCH IN VETERINARY SCIENCE, 90(3) (3), 530 - 532, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Transmission dynamics of an emerging infectious disease in wildlife through host reproductive cycles

  Kimiko Uchii, Arndt Telschow, Toshifumi Minamoto, Hiroki Yamanaka, Mie N. Honjo, Kazuaki Matsui, Zen'ichiro Kawabata

  2011年02月, ISME JOURNAL, 5(2) (2), 244 - 251, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Apis cerana japonica Discriminates between Floral Color Phases of the Oriental Orchid, Cymbidium floribundum

  Michio Sugahara, Toshifumi Minamoto, Taro Fuchikawa, Masanao Michinomae, Isamu Shimizu

  2010年12月, ZOOLOGICAL SCIENCE, 27(12) (12), 901 - 906, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Spatial variation and temporal stability of littoral water temperature relative to lakeshore morphometry: environmental analysis from the view of fish thermal ecology

  Hiroki Yamanaka, Yukihiro Kohmatsu, Toshifumi Minamoto, Zen'ichiro Kawabata

  2010年04月, LIMNOLOGY, 11(1) (1), 71 - 76, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Circadian clock in Ciona intestinalis revealed by microarray analysis and oxygen consumption

  Toshifumi Minamoto, Shuji Hanai, Koji Kadota, Katsutaka Oishi, Hiromi Matsumae, Manabu Fujie, Kaoru Azumi, Noriyuki Satoh, Masanobu Satake, Norio Ishida

  2010年02月, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 147(2) (2), 175 - 184, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Quantification of Cyprinid Herpesvirus 3 in Environmental Water by Using an External Standard Virus

  Mie N. Honjo, Toshifumi Minamoto, Kazuaki Matsui, Kimiko Uchii, Hiroki Yamanaka, Alata A. Suzuki, Yukihiro Kohmatsu, Takaji Iida, Zen'ichiro Kawabata

  2010年01月, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 76(1) (1), 161 - 168, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Seasonal Distribution of Cyprinid Herpesvirus 3 in Lake Biwa, Japan

  Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Zen'ichiro Kawabata

  2009年11月, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 75(21) (21), 6900 - 6904, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Detection of cyprinid herpesvirus 3 DNA in river water during and after an outbreak

  Toshifumi Minamoto, Mie N. Honjo, Kimiko Uchii, Hiroki Yamanaka, Alata A. Suzuki, Yukihiro Kohmatsu, Takaji Iida, Zen'ichiro Kawabata

  2009年03月, VETERINARY MICROBIOLOGY, 135(3-4) (3-4), 261 - 266, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• 大阪府下のミツバチ生息状態

  菅原道夫, 清水良訓, 源利文, 清水勇

  玉川大学ミツバチ科学研究所, 2006年12月, ミツバチ科学, 27(1) (1), 19 - 22, 日本語

  研究論文（大学，研究機関等紀要）


• 魚類の視覚適応の分子的基盤

  源利文, 清水勇

  日本魚類学会, 2005年11月, 魚類学雑誌, 52(2) (2), 91 - 106, 日本語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Molecular cloning of cone opsin genes and their expression in the retina of a smelt, Ayu (Plecoglossus altivelis, Teleostei)

  Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu

  2, 2005年02月, Comparative Biochemistry and Physiology - B Biochemistry and Molecular Biology, 140(2) (2), 197 - 205, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• キンリョウヘンCymbidium floribundum唇弁の着色がニホンミツバチApis cerana japonicaの訪花行動にあたえる影響

  菅原道夫, 源利文, 清水勇, 東克

  玉川大学ミツバチ科学研究所, 2003年11月, ミツバチ科学, 24(3) (3), 115 - 118, 日本語

  研究論文（大学，研究機関等紀要）


• Molecular cloning and characterization of rhodopsin in a teleost (Plecoglossus altivelis, Osmeridae)

  Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu

  2003年04月, COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY B-BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY, 134(4) (4), 559 - 570, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Molecular cloning of lysozyme-encoding cDNAs expressed in the salivary gland of a wood-feeding termite, Reticulitermes speratus

  Ai Fujita, Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu, Takuya Abe

  2002年12月, INSECT BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 32(12) (12), 1615 - 1624, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Studies of opsin genes in a smelt fish, Ayu (Plecoglossus altivelis)

  Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu

  Korean Society of PhotoScience, 2002年, Journal of Photoscience, 9(2) (2), 269 - 271, 英語

  研究論文（国際会議プロシーディングス）


• Phylogenetic relationship among osmerid and salangid fish inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences

  Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu

  Faculty of Science, Kyoto University, 2002年, Memoirs of the Faculty of Science, Kyoto University (Series of Biology), 18, 1 - 13, 英語

  研究論文（大学，研究機関等紀要）


• A novel isoform of vertebrate ancient opsin in a smelt fish, Plecoglossus altivelis

  Toshifumi Minamoto, Isamu Shimizu

  2002年01月, BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 290(1) (1), 280 - 286, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）


• Cloning of gene encoding the visual pigments in the silkworm, Bombyx mori

  Isamu Shimizu, Yoshinori Yamakawa, Toshifumi Minamoto, Katsuhiko Sakamoto

  1998年02月, APPLIED ENTOMOLOGY AND ZOOLOGY, 33(1) (1), 199 - 204, 英語

  [査読有り]

  研究論文（学術雑誌）

• 環境DNA調査の広がりと今後の期待

  源利文

  2025年01月, ミルシル, 18(1) (1), 15 - 17, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• 教科書的には正しくないことがおもしろい

  源利文

  2024年12月, 中等教育資料, (1063) (1063), 2 - 3, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• The eDNA Society International Meeting 2023, “Moving from knowledge into practice”

  Hiroki Yamanaka, Hideyuki Doi, Hitoshi Araki, Kimiko Uchii, Toshifumi Minamoto

  Abstract With the aim to gather and synthesize knowledge regarding environmental DNA analysis and its applications, The eDNA Society International Meeting 2023 was held in Otsu, Shiga, Japan, from May 17th to 19th with more than 252 participants from 19 countries. During the three core days, there were three plenary sessions with nine leading researchers in the field as invited speakers, as well as general oral sessions, a poster session, workshops presented by the society's corporate companies, and opening and closing ceremonies. The meeting had been postponed multiple times due to the COVID‐19 pandemic but was finally held in‐person, with options for online attendance, in front of Lake Biwa. This is a memorial site where the first field test for eDNA analysis in Japan was conducted. Here, we report the record of the meeting by sharing the highlights of the three core days. The proposed meeting theme, “Moving from Knowledge into Practice,” was well achieved during the meeting with energetic participants and enthusiastic discussion, which was stimulated by interesting presentations and lectures spanning from basic technical developments to practical applications.

  Wiley, 2023年11月, Environmental DNA, 5, 1191 - 1195, 英語

  会議報告等


• 生息地土壌の環境DNA分析による侵略的外来アリの分布状況把握

  源利文

  2022年04月, ペストコントロール, 198, 20 - 25, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• 環境DNAなどの生体分子を用いた水中生物の情報取得の試み

  源利文

  2020年02月, JMOAレポート, (19) (19), 1 - 10, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• 環境DNAを用いた生物調査法の発展とその応用

  源利文

  2019年11月, 科学, 89(11) (11), 1029 - 1035, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 環境DNA：水中の生物相を簡単に把握できるツール

  源利文

  2019年03月, 清流青湖, 146, 10 - 11, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• 環境DNA分析の概要と希少種の検出~水をくむだけで絶滅危惧種の分布がわかる

  源利文

  2019年03月, 化学と生物, 57(3) (3), 181 - 186, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNA技術の現状と今後の展望(座談会)—特集 環境DNAを考える

  源 利文, 乾 隆帝, 大井 和之, 藤井 暁彦

  九州環境管理協会, 2019年, 環境管理 = Environmental evaluation, (48) (48), 4 - 14, 日本語


• 種特異的な環境DNA検出によるマクロ生物の生態調査

  源利文

  2018年04月, 水環境学会誌, 41A(4) (4), 123 - 127, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 水を汲むだけの生物調査〜環境DNA技術の紹介〜

  池田幸資, 土居秀幸, 源利文

  日本技術士会, 2018年03月, 技術士, 30(3) (3), 20 - 21, 日本語

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• 環境DNAの有効性：水槽実験とフィールドでの検証

  益田玲爾, 村上弘章, 高橋宏司, 源利文, 宮正樹

  2018年02月, 海洋と生物, 40(1) (1), 17 - 22, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 環境DNAによる個体数・生物量推定の可能性

  深谷肇一, 長田穣, 源利文

  2018年02月, 海洋と生物, 40(1) (1), 47 - 53, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 環境DNAとは何か

  源利文

  2018年02月, 海洋と生物, 40(1) (1), 3 - 8, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• Environmental DNA and its application in the detection and control of fish and water borne zoonosis: Opisthorchiasis in LAOs and schistosomiasis in Madagascar

  Marcello Otake Sato, Armand Rafalimanantsoa Solofoniaina, Megumi Sato, Tiengkham Pongvongsa, Toshifumi Minamoto, Satoru Kawai, Yuichi Chigusa

  Dokkyo University School of Medicine, 2018年, Dokkyo Journal of Medical Sciences, 45(2) (2), 85, 英語

  速報，短報，研究ノート等（学術雑誌）


• 水域生態系における環境DNAモニタリング手法開発の現在

  源利文

  2017年12月, 環境技術, 46(12) (12), 624 - 629, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNAモニタリング手法の課題と展望

  源利文, 内井喜美子, 高原輝彦, 土居秀幸

  2017年12月, 環境技術, 46(12) (12), 648 - 652, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 大量シーケンスと標準DNAを利用した魚類環境DNAの網羅的・定量的モニタリング:京都府舞鶴湾での解析事例

  潮雅之, 潮雅之, 村上弘章, 益田玲爾, 佐土哲也, 宮正樹, 櫻井翔, 山中裕樹, 源利文, 近藤倫生

  2017年11月10日, 水産海洋研究, 81(4) (4), 305‐307, 日本語


• 環境DNA分析を用いた高校生による生物調査

  源利文

  2017年06月, 兵庫県高等学校教育研究会生物部会誌, 41, 2 - 5, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（その他）


• 環境DNAを用いた感染症研究への期待

  源利文

  環境中のDNA情報から微生物だけでなくマクロ生物の生態を読み解こうとする「環境DNA分析」と呼ばれる技術が急速に発展している．環境DNAとは水や土などの環境媒体に含まれるDNAの総称であり，生物体そのものに含まれるDNAや，糞や体表粘液などを介して放出されたマクロ生物の生体外DNAを含む．環境DNAの分析には大きく分けて，種特異的検出とメタバーコーディングの2種類の手法があり，目的によって使い分けられる．適用可能な対象は微生物から脊椎動物まで，遺伝子としてDNAをもつあらゆる生物（ここではウイルスを含む）であり，川や池などの陸水域だけでなく海域への適用も報告されている．本稿ではマクロ生物の環境DNA分析の現状を紹介するとともに，ウイルス学をはじめとする感染症の研究分野への応用可能性，およびそのために解決すべき課題について述べる．

  日本ウイルス学会, 2017年01月, ウイルス, 66(2) (2), 171 - 178, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）


• 環境DNAを用いて水中の生物相を知る

  源利文

  シーエムシー出版, 2016年06月, BIOINDUSTRY, 33(6) (6), 60 - 65, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 環境DNAメタバーコーディングを用いた淀川の魚類相モニタリング

  稲波璃香, 山本義彦, 近藤美麻, 上原一彦, 佐藤行人, 宮正樹, 山本哲史, 源利文

  2016年, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 63rd


• 環境DNA研究のインパクト

  岩崎渉, 佐藤行人, 源利文, 山中裕樹, 荒木仁志, 宮正樹

  2016年01月, 実験医学, 34(1) (1), 103 - 107, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• 環境DNA分析：新しい水棲生物分布調査法

  内井貴美子, 源利文, 土居秀幸, 高原輝彦, 山中裕樹, 片野泉

  Tohoku University, 2016年, 日本生態学会誌, 66(3) (3), 581 - 582, 日本語

  速報，短報，研究ノート等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• 環境DNA分析のさらなる進展にむけて

  源利文, 内井喜美子, 山中裕樹, 高原輝彦, 片野泉, 土居秀幸

  Tohoku University, 2016年, 日本生態学会誌, 66(3) (3), 621 - 624, 日本語

  速報，短報，研究ノート等（学術雑誌）

  神戸大学リポジトリ（Kernel）へのリンク


• The Release Rate of Environmental DNA from Juvenile and Adult Fish (vol 9, e114639, 2014)

  A. Maruyama, K. Nakamura, H. Yamanaka, M. Kondoh, T. Minamoto

  2015年03月, PLOS ONE, 10(3) (3), 英語

  その他


• 環境DNA：エコヘルス研究の新しいツール

  源利文

  医歯薬出版, 2014年06月, 医学のあゆみ, 249(12) (12), 1264 - 1269, 日本語

  [招待有り]

  記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）


• ANALYSIS OF mRNA VARIANTS OF PERIOD GENES IN APIS CERANA AND OTHER HYMENOPTERA INSECTS(Physiology&Biochemistry,Abstracts of papers presented at the 74^ Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

  Minamoto Toshifumi, Shimizu Isamu

  Zoological Society of Japan, 2003年, Zoological science, 20(12) (12), 1593 - 1593, 英語

• 環境DNA入門 ただよう遺伝子は何を語るか

  源利文

  単著, 岩波書店, 2022年, 日本語, ISBN: 9784000297158

  一般書・啓蒙書


• 先端の分析法 第2版

  源利文

  分担執筆, pp 756-765.「環境DNA分析」, 株式会社エヌ・ティー・エス, 2022年01月, 日本語

  事典・辞書


• 環境DNA−生態系の真の姿を読み解く−（土居秀幸・近藤倫生編）

  源利文

  共著, pp. 249-253. コラム「環境DNA分析における手法の標準化」, 共立出版, 2021年03月


• 環境DNA−生態系の真の姿を読み解く−（土居秀幸・近藤倫生編）

  坂田雅之, 徐寿明, 源利文

  分担執筆, pp. 1-35. 第1章「環境DNA分析の概要」, 共立出版, 2021年03月


• 魚類学の百科事典（日本魚類学会 編）

  源利文

  分担執筆, pp. 492-493. 「環境DNA」, 丸善出版, 2018年10月, 日本語

  事典・辞書


• In Vitro Mutagenesis Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology vol. 1498; Ed. Andrew Reeves)

  Toshifumi Minamoto

  分担執筆, pp.491-495. Random Mutagenesis by Error-Prone Polymerase Chain Reaction Using a Heavy Water Solvent, Springer New York, 2016年10月, 英語, ISBN: 9781493964703

  学術書


• 感染症の生態学（日本生態学会 編）

  源利文

  分担執筆, pp. 39-51. 第4章 「感染症の発症メカニズム」, 共立出版, 2016年03月, 日本語

  学術書


• 身近な水の環境科学 実習・測定編 （日本陸水学会東海支部会編）

  高原輝彦, 源利文, 土居秀幸

  分担執筆, pp. 159-161. コラム「水を調べるだけで生き物がわかる！環境DNAを利用した生物分布モニタリング法」, 朝倉書店, 2014年06月, 日本語

  教科書・概説・概論


• 湖の現状と未来可能性（RIHN-China Study Series No.3: 川端善一郎、孔海南、呉得意、福士由紀、窪田順平編 ）

  源利文, 川端善一郎

  分担執筆, pp. 75-86. 第５章「湖の環境改変と感染症」, 松香堂書店, 2014年03月, 日本語

  学術書


• 湖の現状と未来可能性（RIHN-China Study Series No.3: 川端善一郎、孔海南、呉得意、福士由紀、窪田順平編 ）

  谢强, 吴德意, 源利文, 山中裕树, 本庄三惠, 川端善一郎

  分担執筆, pp. 139-151. 第９章「水生植物湖滨带改善现场实证性研究」, 松香堂書店, 2014年03月, 中国語

  学術書


• 地球環境学マニュアル２ はかる・みせる・読みとく（総合地球環境学研究所編）

  源利文

  分担執筆, pp. 68-69. 第4章 4.4 「環境DNAを用いた水中動物相のモニタリング」, 総合地球環境学研究所, 2014年01月, 日本語

  事典・辞書


• 生物の多様性ってなんだろう-生命のジグソーパズル (京都大学総合博物館・京都大学生態学研究センター編)

  源利文, 清水勇

  分担執筆, pp140-164 魚類の多様性とオプシン遺伝子, 京都大学学術出版会, 2007年, 日本語, ISBN: 9784876988273

  一般書・啓蒙書


• DNAチップ活用テクノロジーと応用 (久原哲編)

  石田直理雄, 源利文

  分担執筆, pp 108-117「DNAチップを用いた生物時計機能解析－ショウジョウバエの交尾行動リズムとホヤの体内時計」, シーエムシー出版, 2006年09月, 日本語, ISBN: 9784882315902

  学術書


• 生物多様性のすすめ－生態学からのアプローチ(大串隆之編)

  清水勇, 源利文

  分担執筆, pp90-109 「見える世界が魚を変える－魚類の多様性と視覚適応」, 丸善, 2003年, 日本語, ISBN: 9784621072189

  一般書・啓蒙書

• Enhancing eDNA metabarcoding accuracy: mitigating PCR bias with droplet PCR

  Yamanaka, H., Shaffer, M. R., Scott, O. M., Alla, E. A., Minamoto, T., Kelly, R. P.

  AquaEcOmics 2025, 2025年03月, 英語

  口頭発表（一般）


• QuickConc: a novel cationic-assisted eDNA capture method for enhanced biodiversity monitoring

  Iwamoto, R., Kuroita, T., Wu, Q., Minamoto, T.

  AquaEcOmics 2025, 2025年03月, 英語

  口頭発表（一般）


• Environmental surveillance of Opisthorchis viverrini in endemic areas of Champasack

  Prasayasith, P., Valencia, J. E., Revolteado, M. J. V., Hansana, P., Pakouakue, B., Matsuo, R., Matsumura, N., Thanabouasy, C., Laymanivong, S., Sayosone, S., Banouvong, V., Buchy, P., Iwagami, M., Sato, M. O., Minamoto, T., Sato, M.

  第94回日本寄生虫学会大会, 2025年03月, 英語

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いた水田におけるカエル類の個体数密度と景観要因の関係の解析

  小倉彰紀, 鄔倩倩, 中尾遼平, 丑丸敦史, 源利文

  第72回日本生態学会大会, 2025年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたタイ肝吸虫検出系の開発および感染症生態学への応用

  松尾莉子, Prasayasith, P., Valencia, J. E., Revolteado, M. J. V., Adisakwattana, P., Yoonuan, T., Phuohisut, O., Limpanont, Y., Sato, M. O., Samo, M., Pongvongsa, T., 源利文

  第72回日本生態学会大会, 2025年03月, 日本語

  ポスター発表


• 温暖化は琵琶湖の魚類の分布にどのような影響を与えるのか？

  鄔倩倩, 周金鑫, 姚遠, 石川俊之, 北澤大輔, 源利文

  第72回日本生態学会大会, 2025年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAにおける精子特異的メチル化状態を利用したカワバタモロコの繁殖検出

  平山一槻, 源利文

  第72回日本生態学会大会, 2025年03月, 日本語

  ポスター発表


• Tracking reproductive activities using environmental DNA

  Toshifumi Minamoto

  2nd Australian and New Zealand Environmental DNA Conference, 2025年02月, 英語

  [招待有り]

  口頭発表（基調）


• QuickConc: A rapid, efficient, and power-free eDNA concentration method for diverse aquatic environments

  Ryo Iwamoto, Tomohiro Kuroita, Qianqian Wu, Toshifumi Minamoto

  2nd Australian and New Zealand Environmental DNA Conference, 2025年02月, 英語

  口頭発表（一般）


• Environmental DNA can detect the hybrid

  Masayuki K. Sakata, Nanako Yamo, Akio Imamura, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  2nd Australian and New Zealand Environmental DNA Conference, 2025年02月, 英語

  ポスター発表


• Negative effects of farmland abandonment on the reproduction of a small salamander (Hynobius setouchi)

  Nana Matsumoto, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  2nd Australian and New Zealand Environmental DNA Conference, 2025年02月, 英語

  ポスター発表


• QuickConc: A rapid, efficient, and power-free eDNA concentration method for diverse aquatic environments

  Masayuki Imai, Tomohiro Kuroita, Ryu Iwamoto, Qianqian Wu, Tshifumi Minamoto

  International Symposium on Environmental DNA for Conservation and Biomonitoring in Southeast Asia 2025 (eDNAConBio 2025), 2025年02月, 英語

  口頭発表（一般）


• 環境DNAメタバーコーディング法を活用した新たな樹上生物多様性モニタリング法の開発―樹幹流を利用して―

  坂田歩美, 佐土哲也, 岡慎一郎, 潮雅之, 宮正樹, 源利文, 蘭光健人, 池田裕二, 海老原淳, 井上侑哉, 坪田博美, 原田浩

  日本地衣学会第23回大会, 2024年11月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 迅速，効率的，かつ電力不要な eDNA 濃縮手法 (QuickConc) の開発

  黒板智博, Wu Qianqian, 岩本遼, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• ダム湖の湖底に生息する甲殻類を環境DNA分析で把握するための試み

  稲川崇史, 岡本理央, 邬倩倩, 大杉奉功, 沖津二朗, 坂本正吾, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングライブラリー調整へのドロップレットPCRの適用とその利点

  山中裕樹, Shaffer, M. R., Scott, O. M., Allan, E. A., 源利文, Kelly, R. P.

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAによる交雑の検出

  坂田雅之, 矢野七虹, 今村彰生, 山中裕樹, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAメタバーコーディングにおける地衣類の検出に及ぼす細胞破砕の影響評価

  坂田歩美, 源利文, 佐土哲也, 宮正樹

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 日本語

  ポスター発表


• 迷惑な外来珪藻ミズワタクチビルケイソウ検出ツールの開発と分布解析

  鵜木(加藤)陽子, 洲澤多美枝, Tran Thu Trang, 源利文, 増田賢嗣, 坪井潤一, 清野聡子

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• 環境DNA分析へのエピジェネティクスの導入：可能性と課題

  平山一槻, 呉盧漢, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 琵琶湖におけるブラックバス類の時空間的分布動態の解明

  岡田淳史, 脇村圭, 内井喜美子, 邬 倩倩, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• 耕作放棄地におけるセトウチサンショウウオの分布を規定する要因の推定

  松本奈々, 坂田雅之, 國政祐太, 山本優奈, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• 岡山平野における在来および外来タナゴ類の分布に関する研究

  藤野 栞太, 源 利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• 樹幹流を用いた環境DNAメタバーコーディングによる哺乳類相モニタリング法の検討

  石原湧也, 青木香澄, 坂田歩美, 宮正樹, 浜野杏平, 坂田雅之, 邬倩倩, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• メコン住血吸虫の環境ＤＮＡ検出系の開発と野外への応用

  松村奈桜, 松尾莉子, サトウ恵, Marcello Otake Sato, Joseph, Evangelista Valencia, Mark June Valiente, Revolteado、Phoyphaylinh Prasayasith, Poom Adisakwattana, Yanin Limpanon, Orawan Phuphisu, Tippayarat Yoonuan, Somphou Sayasone, 坂田雅之, 邬倩倩, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• ラオスサバナケット州におけるタイ肝吸虫の分布要因の推定

  松尾莉子, Phoyphaylinh Prasayasith, Joseph Evangelista Valencia, Mark June Valiente Revolteadom, Poom Adisakwattana, Tippayarat Yoonuan, Orawan Phuphisu, Yanin Limpanon, Marcello Otake Sato, サトウ恵, Tiengkham Pongvongsa, 源利文

  第7回環境DNA学会つくば大会, 2024年12月, 英語

  ポスター発表


• 迅速、効率的なeDNA核酸濃縮手法(QuickConc)の開発

  岩本遼, 黒板智博, Wu Qianqian, 源利文

  第４７回日本分子生物学会年会, 2024年11月, 日本語

  ポスター発表


• Monitoring the distribution of hatchery-reared spotted halibut (Verasper variegatus) juveniles after release using environmental DNA

  Murakami, H., Fukano, N., Wu, Q., Minamoto, T., Takagi, J., Kume, M., Yamanobe, T., Yamashita, Y., Mitamura, H., Wada., T.

  The 11th International Flatfish Symposium, 2024年11月, 英語

  口頭発表（一般）


• QuickConc: Fast, efficient, power-free eDNA capture

  Ryo Iwamoto, Tomohiro Kuroita, Qianqian Wu, Toshifumi Minamoto

  Biodiversity Genomics Conference 2024, 2024年10月, エスペラント

  口頭発表（一般）


• Seasonality of Opisthorchis viverrini environmental DNA detection in endemic areas of Champasack, Lao-PDR

  Prasayasith, P., Valencia, J., Revolteado, M. J., Hansana, P., Pakouakue, B., Matsuo, R., Matsumura, N., Thanabouasy, C., Laymanivong, S., Sayasone, S., Banouvong, V., Buchy, P., Iwagami, M., Sato, M. O., Minamoto, T., Sato, M.

  The 14th Lao National Health Research Forum, 2024年10月, 英語


• Eco Health/One Health towards eradication of opisthorchiasis using the environmental DNA detection as an evaluation tool

  Sato, M., Pongvongsa, T., Sayasone, S., Prasayasith, P., Valencia, J., Revolteado, M. J., Younuan, T., Adisakwattana, P., Minamoto, T., Sato, M. O.

  The 14th Lao National Health Research Forum, 2024年10月, 英語


• Investigating the habitat of Aphelocheirus nawai using environmental DNA analysis

  Tomoharu Hino, Ryota P. Kitani, Yuta Kunimasa, Toshifumi Minamoto

  The 29th Biennial Conference of Asian Association for Biology Education, 2024年10月, 英語


• Evaluation of the effectiveness of environmental education using environmental DNA analysis: Is it effective even for people who hesitate to touch living things?

  Ryota P. Kitani, Tatsuya Saga, Minoru Kasada, Mieko Kiyono, Masayuki Sato, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  The 29th Biennial Conference of Asian Association for Biology Education, 2024年10月, 英語

  ポスター発表


• Environmental DNA approach in Eco Health/One Health towards eradication of opisthorchiasis

  Sato, M., Adisakwattana, P., Sayasone, S., Prasayasith, P., Valencia, J., Revolteado, M. J., Pongvongsa, T., Younuan, T., Minamoto, T., Sato, M. O.

  21st International Congress for Tropical Medicine and Malaria, 2024年09月, 英語


• 迅速、効率的、かつ電力不要なeDNA核酸濃縮手法(QuickConc)の開発

  黒板智博, Qianqian Wu, 岩本遼, 源利文

  応用生態工学会 第２７回さいたま大会, 2024年09月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いたセトウチサンショウウオ(Hynobius setouchi)の生息に影響する環境要因の推定

  松本奈々, 坂田雅之, 國政祐太, 山本優奈, 源利文

  応用生態工学会 第２７回さいたま大会, 2024年09月, 日本語

  ポスター発表


• Estimating suitable breeding habitat for the Setouchi salamander (Hynobius setouchi) based on environmental DNA surveys

  Nana Matsumoto, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  Salamander Meeting 2024, 2024年07月, 英語

  ポスター発表


• クロダイの産卵検出における環境DNAの核/ミトコンドリア比の有効性

  石山颯人, 西田剛, 竹下大輝, 源利文, 笹野祥愛, 益田玲爾, 海野徹也, 河合賢太郎

  令和6年度日本水産学会春季大会, 2024年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAのメチル化解析に基づく魚類繁殖活動の検出

  平山一槻, 呉盧漢, 源利文

  第71回日本生態学会大会, 2024年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたニホンウナギ(Anguilla japonica)とオオウナギ(A. marmorata)の河川内分布特性

  恩田都和, 深野直孝, 三田村啓理, 久米学, 和田敏裕, 源利文, 渡邊俊, 高木淳一, 片山知史, 村上弘章

  第4回ウナギ学の現状, 2024年03月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いたニホンウナギの分布規定要因の推定

  國政祐太, 橋本渚, 木谷亮太, 三田村啓理, 久米学, 田中智一朗, 源利文

  第4回ウナギ学の現状, 2024年03月, 日本語

  口頭発表（一般）


• Comparison of terrestrial mammal detection methods using environmental DNA

  Toshifumi Minamoto, Niko Nakamura, Nagisa Hashimoto, Masayuki K. Sakata, Qianqian Wu

  BES Annual Meeting 2023, 2023年12月, 英語, British Ecological Society, Belfast, グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国), 国際会議, 国際共著していない

  ポスター発表


• Methylation analysis of environmental DNA for breeding monitoring of fish

  Itsuki T. Hiyayama, Luhan Wu, Toshifumi Minamoto

  BES Annual Meeting 2023, 2023年12月, 英語, British Ecological Society, Belfast, グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国), 国際会議, 国際共著していない

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた陸上哺乳類と鳥類の検出方法の開発

  中村仁湖, 橋本渚, 坂田雅之, 邬倩倩, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析マニュアルの発展と国際的標準化について

  源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 大阪湾におけるスナメリの分布解明

  大阪湾におけるスナメリの分布解明

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• セトウチサンショウウオの繁殖環境に関する研究

  久富早織, 坂田雅之, 中村仁湖, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• 河川における在来魚類と外来魚類の分布状況について

  太田井麻令乃, 橋本渚, 國政祐太, 平山一槻, 山本義彦, 坂田雅之, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• ラオスサバナケット州におけるタイ肝吸虫および中間宿主の分布調査

  松尾莉子, 木原菜摘, サトウ恵, Marcello Otake Sato, Phoyphailin Pasayasith, Tippayarat Yoonuan, Poom Adisakwattana, Tiengkham Pongvongsa, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• 高校生を対象とした環境DNA教育の実施とその効果の検証

  木谷亮太, 佐賀達矢, 笠田実, 清野未恵子, 佐藤真行, 丑丸敦史, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• ニホンウナギの分布を規定する要因の推定

  國政祐太, 橋本渚, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析と生態モデルによる気候変動下における生物の時空間分布予測

  邬倩倩, 周金鑫, 河本達也, 石川俊之, 後藤直成, 坂田雅之, 北澤大輔, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• 高濁度水サンプルからの環境核酸抽出方法の検討

  山本優奈, 岩本遼, 平山一槻, 小川あゆみ, 坂田雅之, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディング手法を用いたため池における水生植物のモニタリング

  小川あゆみ, 久富早織, 橋本渚, 坂田雅之, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• メコン住血吸虫の環境ＤＮＡ検出系の開発と野外への応用

  松村奈桜, 松尾莉子, 坂田雅之, 邬倩倩, 源利文

  第6回環境DNA学会九州大会, 2023年12月, 日本語

  ポスター発表


• マリモの過去150年をミジンコで復元する

  占部城太郎, 大槻朝, 大竹裕里恵, 坂田雅之, 源利文, 加三千宣, 若菜勇

  日本生態学会東北地区会第68回大会, 2023年11月, 日本語

  口頭発表（一般）


• Prospects of eDNA analysis for macro–organisms: beyond species distribution

  Toshifumi Minamoto

  International Symposium: Past, Present, and Future of the Marine Environment and Ecosystems, 2023年10月, 英語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 堆積物DNAを用いた阿寒湖における魚類個体群動態の復元

  坂田雅之, 加三千宣, 大槻朝, 若菜勇, 源利文, 占部城太郎

  日本陸水学会第87回大分大会, 2023年10月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いたニホンウナギのハビタット推定

  國政祐太, 橋本渚, 源利文

  日本陸水学会第87回大分大会, 2023年10月, 日本語

  ポスター発表


• ホシガレイVerasper variegatusの環境DNA技術の確立と種苗放流後の分布推定

  村上弘章, 深野直孝, 鄔倩倩, 源利文, 髙木淳一, 久米学, 山下洋, 三田村啓理, 和田敏裕

  令和5年度日本水産学会秋季大会, 2023年09月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析を用いた大阪湾におけるスナメリの分布およびホットスポットの解明

  橋本渚, 岩田高志, 源利文

  日本哺乳類学会2023年度大会, 2023年09月, 日本語

  ポスター発表


• The nuisance invasive species Cymbella janischii in Japan: knowledge from studies and monitoring

  Yoko Kato-Unoki, Tamie Suzawa, Akira Kurihara, Yuta Takahashi, Toshifumi Minamoto, Yoshitsugu Masuda, Jun-ichi Tsuboi, Satoquo Seino, Shigeki Mayama

  The 26th International Diatom Symposium, 2023年08月, 英語

  ポスター発表


• Environmental DNA analysis of macroorganisms: recent trend and future prospects in Japan and Worldwide

  Toshifumi Minamoto

  The XXIIIrd International Congress of Genetics, 2023年07月, 英語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Development of eDNA research in Japan and its application to environmental studies

  Toshifumi Minamoto

  Biodiversity Genomics - A Global Perspective: Satellite Meeting of The XXIIIrd International Congress of Genetics, 2023年07月, 英語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Investigation of the effect of Artificial Light at Night (ALAN) on wild fish community ~manipulative field experiment and species composition analusis using eDNA methods~

  Aisha Oyabu, Luhan Wu, Natusmi Kihara, Hiroki Yamanaka, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  口頭発表（一般）


• Application of DNA methylation analysis to eDNA studies

  Itsuki Hirayama, Luhan Wu, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  口頭発表（一般）


• Investigation of the potential applicability of eDNA as an environmental education tool

  Ryota Kitani, Mieko Kiyono, Masayuki Sato, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Horizontal and vertical distribution of environmental DNA of jack mackerel Trachurus japonicus and Japanese anchovy Engraulis japonicus in Maizuru Bay, Kyoto Prefecture

  Hiroaki Murakami, Keiichi Fukaya, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto, Kenji Minami, Kazushi Miyashita, Taishin Kameoka, Reiji Masuda, Yoh Yamashita, Michio Kondoh

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Unraveling the effects of cross rover structures on the habitat of Japanese eel

  Yuta Kunimasa, Natsumi Kihara, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Distribution of finless porpoise (Neophicaena asiaeorientalis) in Osaka Bay, Japan using eDNA analysis

  Nagisa Hashimoto, Takashi Iwata, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Seasonal movement of Rainbow Trout detected by year-round water sampling

  Akio Imamura, Masayuki K. Sakata, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Fish population dynamics in Lake Akan associated with eutrophication reconstructed by sedementary DNA

  Masayuki K. Sakata, Michinobu Kuwae, Hajime Otsuki, Isamu Wakana, Toshifumi Minamoto, Jotaro Urabe

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Development of a highly sensitive eDNA detection method

  Ryo Iwamoto, Tomohiro Kuroita, Yuta Kunimasa, Yuna Yamanmoto, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Detection of Southeast Asian liver fluke by multi-region PCR assay

  Riko Matsuo, Megumi Sato, Mercello Sato, Poom Adisakwattana, Orawan Phuphisu, Tippayarat Yoonuan, Yanin Limpanon, Yupa Chusongsang, Paporn Poodeepiyasawa, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• Regional-scale effects of deer-induced forest degradation on river ecosystem dynamics

  Hikaru Nakagawa, Daisuke Fujiki, Hiroo Numata, Luhan Wu, Terutaka Mori, Toshifumi Minamoto

  The eDNA Society International Meeting 2023, 2023年05月, 英語

  ポスター発表


• 環境DNA分析で明らかにするさくら湖の魚類相

  源利文

  さくら湖自然環境フォーラム2022, 2023年03月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 絶滅危惧種の保全と外来種対策における環境DNA分析の有効性

  源利文, 木原菜摘

  スイゲンゼニタナゴの保全を考えるワークショップ, 2023年03月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAを用いたスイゲンゼニタナゴと近縁外来種の同時検出系の開発と実践

  木原菜摘, 源利文

  第十八回外来魚情報交換会, 2023年01月, 日本語

  口頭発表（一般）


• マクロ生物の環境DNA分析: 生物分布から繁殖期推定まで

  源利文

  2023年 水生昆虫談話会・日本陸水学会共催シンポジウム, 2023年01月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Environmental DNA in lake sediment provides fish information on reconstructing past fauna in lake ecosystems

  Masayuki K. Sakata, Narumi Tsugeki, Michinobu Kuwae, Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto

  BES Annual Meeting 2022, 2022年12月, 英語

  ポスター発表


• 水中の生き物調査の新手法：環境DNA

  源利文

  公開シンポジウム「え、ニジマスって外来種なの？」, 2022年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• クモヒトデ綱(棘皮動物門) の環境DNAメタバーコーディング プライマーの開発

  岡西政典, 幸塚久典, 鄔倩倩, 進士淳平, 芝田直樹, 玉田貴, 中野智之, 源利文

  第18回棘皮動物研究集会, 2022年12月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 棘皮動物における環境DNAメタバーコーディングプライマーの開発

  小泉佳祐, 中野智之, 鄔倩倩, 幸塚久典, 小川晟人, 岡西政典, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• クモヒトデ綱（棘皮動物門）の環境DNAメタバーコーディングプライマーの開発

  岡西政典, 幸塚久典, 鄔倩倩, 進士淳平, 芝田直樹, 玉田貴, 中野智之, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 各組織が分散してデータを管理し、段階的にデータを共有・公開してデータの価値を高め活用する「データ価値共創環境」の提案

  坂本久, 庄司諒, 川北智弥, 坂田雅之, 山中裕樹, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境水からの外来種ミズワタクチビルケイソウの特異的検出

  鵜木(加藤)陽子, 真山茂樹, 栗原暁, 清野聡子, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• スナメリの検出系開発と野外適用

  橋本渚, 木原菜摘, 坂田雅之, 中村清美, 源利文, 岩田高志

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 河川横断構造物がニホンウナギの河川遡上に与える影響の解明

  國政祐太, 木原菜摘, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAにおけるDNAメチル化解析とその生態学的利用に向けたアプローチ

  平山一槻, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた陸上哺乳類の検出方法の開発

  中村仁湖, 橋本渚, 坂田雅之, 鄔倩倩, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• バラタナゴ属3種の新しい同時検出系の開発と実用可能性の検討～HRM法、マルチプレックスプローブ法の比較～

  木原菜摘, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• 定量メタバーコーディングを用いた魚類生態調査

  呉盧漢, 稲川崇史, 沖津二朗, 坂本正吾, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  [招待有り]

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングによる深海無脊椎動物の検出

  鄔倩倩, 西澤崚平, 藤原義弘, 土田真二, 吉田尊雄, 河戸勝, 駒井智幸, 源利文

  環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」, 2022年11月, 日本語

  ポスター発表


• Detection of Opisthorchis viverrini using environmental DNA

  Riko Matsuo, Megumi Sato, Marcello Otake Sato, Poom Adisakwattana, Orawan Phuphisut, Tippayarat Yoonuan, Yanin Limpanont, Yupa Chusongsang, Paporn Poodeepiyasawat, Toshifumi Minamoto

  The 20th International Congress for Tropical Medicine and Malaria, 2022年10月, 英語

  ポスター発表


• ダム湖の生物モニタリングに環境DNA技術を適用するためには？

  源利文

  ELR2022, 2022年09月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 堆積物環境DNAによる琵琶湖魚類の過去復元

  坂田雅之, 槻木玲美, 加三千宣, 土居秀幸, 源利文

  日本陸水学会第86回大会, 2022年09月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 夜間の光は魚の生態に影響を及ぼすのか？ー環境DNA技術を用いた種組成調査よりー

  大藪愛紗, 源利文

  日本陸水学会第86回大会, 2022年09月, 日本語

  ポスター発表


• 野生動物の糞便からの薬剤耐性大腸菌の分離と性状解析

  浅井鉄夫, 杉山美千代, 大松勉, 源利文

  令和4年度獣医学術中部地区学会, 2022年08月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNAと種分布モデルを用いた島根県におけるオオサンショウウオの生息実態の解明

  リュウゲンテイ, 橋本真佑, 山岸聖, 三浦祐児, 源利文, 高原輝彦

  2022年度生物系三学会中国四国地区合同大会, 2022年05月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境RNA手法の実用化に向けた検証：ニホンウナギをモデルケースにした野外調査と飼育実験から

  永田晃弘, 辻井彩花, 山岸聖, 源利文, 山中裕樹, 高原輝彦

  2022年度生物系三学会中国四国地区合同大会, 2022年05月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 堆積物コアDNAを用いた宍道湖におけるマクロ生物の近過去生息状況の推定

  山岸聖, 小室隆, 神門利之, 引野愛子, 坂田雅之, 源利文, 下田莉奈, 高原輝彦

  2022年度生物系三学会中国四国地区合同大会, 2022年05月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 外来種ミズワタクチビルケイソウ検出法の開発

  鵜木(加藤)陽子, 真山茂樹, 栗原暁, 清野聡子, 源利文

  令和4年度日本水産学会春季大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• Seda DNAを用いた宍道湖における過去の車軸藻類の復元

  小室隆, 神門利之, 加藤季晋, 引野愛子, 山岸聖, 高原輝彦, 後藤益滋, 坂田雅之, 源利文

  2022年日本地理学会春季学術大会, 2022年03月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いた薬剤耐性菌の保菌動物の探索

  橋本渚, 坂田雅之, 杉山美千代, 浅井鉄夫, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 琵琶湖における廃川の魚類ハビタットとしての活用可能性

  東坂波也翔, 松本岳大, 坂田雅之, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 多種サイト占有モデルを用いた環境DNA分析における調査デザインの最適化

  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 核DNAをマーカーとする魚類環境DNAメタバーコーディング法の野外適用

  佐々木大介, 伊藤玄, 山中裕樹, 坂田雅之, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 定量的環境DNAメタバーコーディングを用いた魚類の繁殖期の同時モニタリング

  呉盧漢, 稲川崇史, 沖津二朗, 坂本正吾, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 流水性希少サンショウウオを対象にした効率的な環境DNA検出手法の検討

  坂田雅之, 竹下大輝, 西澤崚平, 佐藤拓哉, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• 全循環湖から部分循環湖への変化が底生生物に与える影響について

  邬倩倩, 周金鑫, 河本達也, 石川俊之, 坂田雅之, 後藤直成, 北澤大輔, 源利文

  第69回日本生態学会大会, 2022年03月, 日本語

  ポスター発表


• Review of integrated research on human well-being, ecosystem services, and spatial characteristics of cities: research trends and future directions

  Yuta Uchiyama, Masayuki Sato, Atishi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

  3rd ESP Asia Conference, 2021年12月, 英語

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析の基礎と魚病を含む感染症への応用

  源利文

  令和３年度 魚病症例研究会, 2021年11月, 日本語

  [招待有り]

  口頭発表（基調）


• 大阪府内における環境DNA分析技術を用いた淡水魚分布調査の検討

  山本義彦, 鴛海智佳, 白子智康, 源利文

  第24回自然系調査研究機関連絡会議, 日本語

  ポスター発表


• 頭足綱を対象とした環境DNAメタバーコーディング検出系の開発

  鄔倩倩, 中野智之, 駒井智幸, 宮正樹, 呉盧漢, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  口頭発表（招待・特別）


• 海洋堆積物のDNA量から魚類個体数の数十年スケール変動を捉えられるか

  加三千宣, 玉井弘道, 土居秀幸, 源利文, 坂田雅之

  2021年度水産海洋学会研究発表大会, 2021年11月, 日本語


• 既知コピー数DNAから得た閾値を用いた環境DNAメタバーコーディング解析の精度向上

  大﨑優介, 渡邊和紀, 米川侑希, 中澤聡, 海野洋敬, 西山依里, 村上博昭, 松平崇弘, 坂田雅之, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAガラス濾紙サンプルの常温長期保存方法の検討

  橋爪裕宜, 源利文, 大庭伸也, 門司和彦, 星友矩

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 山口県周防大島沿岸海域における潮汐条件、採水量、採水水深別の環境DNAによる魚類検出結果比較

  片山悦治郎, 小濱智之, 立松俊和, 渡部健, 粂井孝一, 金子幸司, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 捕獲調査の代替は可能？ -プライマーの選定とDNAデータベース整備が大型無脊椎動物の検出に与える影響-

  長谷部勇太, 源利文, 竹中將起, 半田佳宏, 関将史, 白子智康

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 宮崎県延岡市沖合海域における魚類を対象とした海水及び底質の環境DNA分析

  立松俊和, 片山悦治郎, 小濱智之, 真木伸隆, 神柱武志, 鳥集一郎, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• アオコの発生した湖における環境DNAメタバーコーディングの試み

  邬倩倩, 坂田雅之, 吴德意, 山中裕樹, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 両生類を対象とした環境DNAメタバーコーディング検出系の開発と評価

  坂田雅之, 河田萌音, 倉林敦, 栗田隆気, 中村匡聡, 白子智康, 掛橋竜祐, 西川完途, モハメド ヤジット ホスマン, 西島太加志, 樺元淳一, 宮正樹, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 魚類の核環境DNAメタバーコーディング手法の開発

  佐々木大介, 山中裕樹, 坂田雅之, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 魚類繁殖活動による環境DNA濃度の時間と距離に伴う変化

  呉盧漢, 山本義彦, 山口翔吾, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• ダム湖の魚類調査における環境DNAメタバーコーディング分析の実装に向けて

  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• 花虫綱を対象とした環境DNAメタバーコーディング系の開発

  西澤崚平, 邬倩倩, 中野智之, 駒井智幸, 源利文

  環境DNA学会第4回大会, 2021年11月, 日本語

  ポスター発表


• スーダン乾燥地帯の皮膚病マイセトーマ蔓延地域土壌からの病原真菌群の検出

  Hiroki Hashizume, Suguru Taga, Masayuki K, Sakata,Mahmou, Hussein Mohamed Taha, Emmanuel Edwar Siddig, Toshifumi Minamoto,Ahmed, Hassan Fahal, Satoshi Kaneko

  日本微生物生態学会第34回大会, 2021年10月, 英語

  ポスター発表


• 環境DNA技術を感染症の分布診断に応用する

  源利文

  日本生態学会第24回公開講演会 （環境DNAの衝撃：生き物たちの過去・現在・未来を解き明かす）, 2021年03月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 産卵と被食に伴う核およびミトコンドリア環境DNAの動態:カタクチイワシとマアジを用いた水槽実験

  上村真太郎, 益田玲爾, 村上弘章, 徐寿明, 源利文

  令和３年度日本水産学会春季大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 感染症の生態学研究のためのツールとしての環境DNA

  源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 魚類環境RNAの検出最適化のためのプロトコル検証および野外適用

  高尾健太, 徐寿明, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境核酸分析によるコイの栄養状態の評価

  姜明揚, 山本義彦, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 核ＤＮＡをマーカーとした魚類環境ＤＮＡメタバーコーディングの新規手法の開発

  佐々木大介, 山中裕樹, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたメダカにおける遺伝的撹乱の検出

  中尾遼平, 北川忠生, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• ニホンジカ(Cervus nippon)環境DNAの種特異的検出系の開発

  石坂恵規, 中川光, 高柳敦, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析によるオオダイガハラサンショウウオの分布予測

  竹下大輝, 西澤崚平, 佐藤拓哉, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたバラタナゴ属3種の同時検出系確立と野外適用

  木原菜摘, 坂田雅之, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたダム湖における魚類繁殖期の推定

  呉盧漢, 稲川崇史, 沖津二郎, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• アオコの発生した湖におけるeDNA メタバーコーディング: 中国太湖を事例として

  邬倩倩, 坂田雅之, 吴德意, 山中裕樹, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAとRNAの分解に及ぼす温度とpHの影響

  釣健司, 廣原嵩也, 島田康人, 源利文, 山中裕樹

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 琵琶湖の湖底貧酸素化に伴うスジエビ及びイサザへの影響について

  河本達也, 鄔倩倩, 坂田雅之, 石川俊之, 後藤直成, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 鉢虫綱クラゲ類の環境DNAメタバーコーディング系の設計

  西澤崚平, 邬倩倩, 中野智之, 駒井智幸, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングを用いたトンボ目多様性の評価

  矢指本哲, 坂田雅之, 中尾遼平, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 堆積物環境DNAを用いた琵琶湖における過去生物情報の再構築

  坂田雅之, 槻木玲美, 加三千宣, 土居秀幸, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• ダム湖において環境DNAメタバーコーディング手法を用いる際の最適採水地点数の検討

  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 稲川崇史, 沖津二朗, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 長鎖・核DNAおよび海水サンプルを対象とした塩化ベンザルコニウムの環境DNA保存効果

  徐寿明, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  日本生態学会第68回大会, 2021年03月, 日本語

  ポスター発表


• 水中の核酸情報を用いて動物の行動や生理を解明する

  源利文

  京都大学生態学研究センター共同利用研究会：環境DNA・環境RNA研究の新たな挑戦, 2020年12月, 日本語

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAを用いた水中生物調査手法の開発と実践

  源利文

  令和２年度水産資源保護啓発研究事業 環境DNA研究開発に関する講習会, 2020年12月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 堆積物中における環境DNAの残存性とこれを応用した津波後のクラゲ類ブルームの検出

  尾形瑞紀, 益田玲爾, 張野宏也, 坂田雅之, 畠山信, 横山勝英, 山下洋, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 水田に生息するヘビ類の環境DNA検出

  西澤崚平, 中尾遼平, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析手法を用いたコイ科魚類の産卵行動の検出

  佐々木大介, 渡部健, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析によるマナマコ (Apostichopus japonicus)の繁殖期推定

  竹下大輝, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングを用いた魚類調査のための効果的なサンプリング方法の検討

  坂田雅之, 渡部健, 真木伸隆, 池田幸資, 小菅敏裕, 岡田泰明, 池田幸資, 山中裕樹, 佐土哲也, 宮正樹, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAの状態依存的な残存性

  徐寿明, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAによる魚類の繁殖期推定

  呉盧漢, 稲川崇史, 沖津二朗, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• 異種混合飼育が海産魚の環境DNAの放出量に与える影響

  村上弘章, 益田玲爾, 山本哲史, 源利文, 山下洋

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• キジハタの環境DNAに対する体サイズおよび活動量の影響

  曽根高幹大, 益田玲爾, 徐寿明, 竹下大輝, 村上弘章, 上村真太郎, 源利文

  環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• カンボジアPrey Veng州のタイ肝吸虫症高度流行地における中間宿主および保虫宿主調査

  桐木雅史, サトウマルセロオオタケ, Khieu Virak, 源利文, 千種雄一, 宮本和子

  第61回熱帯医学会大会・グローバルヘルス合同大会2020, 2020年11月, 日本語

  ポスター発表


• eDNAの放出は成長段階によって変わるのか？〜オオサンショウウオを例に〜

  森本哲平, 田口勇輝, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• メタバーコーディングによる北海道の在来魚群集とニジマスの分布把握の試み

  今村彰生, 速水花奈, 坂田雅之, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, ジャワ語

  ポスター発表


• 環境DNAから見た淀川におけるコクチバスとチャネルキャットフィッシュの分布

  山本義彦, 本郷真理, 山中裕樹, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 既知コピー数DNAから得た閾値を用いた環境DNA解析の精度向上

  渡邊和紀, 源利文, 松平崇弘, 大崎優介, 米川侑希, 鈴木武尊, 橋本みちえ, 海野洋敬

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析を用いた感染症生態学研究の可能性

  源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境RNA分析を用いたコイの繁殖行動推定

  姜明揚, 山本義彦, 呉盧漢, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAの放出量はどのような生理学的要因と関連するか

  徐寿明, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 琵琶湖産スジエビの移動行動の多型に関連した生態的・遺伝的な構造の解明

  邬倩倩, 矢井田友暉, 沢田隼, 丸山敦, 高見泰興, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• ヴィクトリア湖畔における住血吸虫環境DNAの分布

  大澤亮介, 中村梨沙, 二見恭子, 板山朋聡, 菊池美穂子, OUMA Colins, 濱野真二郎, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析を用いた再生ヨシ帯の産卵地としての評価

  佐々木大介, 渡部健, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNA分析から推定されたアユモドキを含む魚類群集の季節的変化

  杉浦航, 岩田明久, 阿部司, 源利文, 冨田勢, 山本哲史, 三品達平, 渡辺勝敏

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 琵琶湖における堆積物環境DNAを用いた過去情報の復元

  坂田雅之, 槻木玲美, 加三千宣, 越智梨月, 速水花奈, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 哺乳類環境DNAメタバーコーディング手法による薬剤耐性菌保菌動物の推定

  速水花奈, 坂田雅之, 荒谷朋紀, 浅井鉄夫, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• ヘビは環境DNA手法で検出できるのか

  西澤崚平, 中尾遼平, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• キタサンショウウオの繁殖期における環境DNA観測

  竹下大輝, 照井滋晴, 池田幸資, 三塚多佳志, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAによる魚類繁殖期の推定

  呉盧漢, 姜明揚, 山本義彦, 稲川崇史, 沖津二朗, 源利文

  日本生態学会第67回大会, 2020年03月, 日本語

  ポスター発表


• 環境DNAで生物多様性をモニターする

  源利文

  講演会「沿岸域の生物多様性と環境修復」, 2020年02月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAを用いた生物調査の基礎とその応用

  源利文

  日本環境アセスメント協会令和元年度第2回公開技術セミナー, 2020年02月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• メタバーコーディングによる北海道の在来魚群集とニジマスの分布把握の試み

  今村彰生, 速水花奈, 坂田雅之, 源利文

  2019年度北海道自然史研究会・研究大会, 2020年02月, 日本語

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いた生物調査：分析技術の基礎から最新の研究動向まで

  源利文

  三重県環境保全事業団セミナー, 2019年12月, 日本語

  [招待有り]

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Monitoring breeding behavior of Japanese giant salamander via eDNA analysis

  MINAMOTO Toshifumi, MORIMOTO Teppei, TAGUCHI Yuki, RAKAO Ryohei

  British Ecological Society Annual Meeting 2019, 2019年12月, 英語, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Sedimentary eDNA provides different information on timescale and fish species composition compared with aqueous eDNA

  SAKATA Masayuki K, YAMAMOTO Satoshi, GOTOH Ryo, MIYA Masaki, YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

  British Ecological Society Annual Meeting 2019, 2019年12月, 英語, 国際会議

  ポスター発表


• 魚類の核およびミトコンドリアに由来する環境DNAの粒子径サイズ分布

  徐寿明, 有本美於, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  第４２回日本分子生物学会年会, 2019年12月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• Environmental DNA (eDNA) analysis of pathogenic Leptospira and associated organisms in leptospirosis-endemic Okinawa areas

  Sato, Y, Mizuyama, M, Sato, M, Minamoto, T, Kimura, R, Toma, C

  第４回黒潮カンファレンス, 2019年11月, 英語, 国内会議


• 環境DNAとしてマンソン住血吸虫DNAを検出するためのろ過法の比較検討

  大澤亮介, 中村梨沙, 二見恭子, 板山朋聡, 菊池三穂子, 濱野真二郎, 源利文

  第60回日本熱帯医学会大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• Environmental DNA as a novel tool for clarifying disease ecology

  MINAMOTO Toshifumi

  第60回日本熱帯医学会大会, 2019年11月, 英語, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Opisthorchiasis and schistosomiasis from the environmental DNA/GIS perspective

  SATO Marcello Otake, RAFALIMANANTSOA Armand, SATO Megumi, PONGVONGSA Tiengkham, MINAMOTO Toshifumi, WAIKAGUL Hitra, KAWAI Satoru, FONTANILLA Ian, CHIGUSA Yuichi

  第60回日本熱帯医学会大会, 2019年11月, 英語, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 核およびミトコンドリアに由来する環境DNAの動態

  徐寿明, 有本美於, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• マンソン住血吸虫の環境DNA検出法の改善

  大澤亮介, 中村梨沙, 二見恭子, 板山朋聡, 菊池三穂子, OUMA Collins, 濱野真二郎, 源利文

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAによる湿原環境の小型両生類観測への試み

  竹下大輝, 照井滋晴, 池田幸資, 三塚多佳志, OSATHANUNKUL Maslin, 源 利文

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• ダム湖における魚類環境DNAの鉛直分布

  速水花奈, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 源利文

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• 琵琶湖産スジエビの生活史の解明

  鄔倩倩, 源利文

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いたイタセンパラの季節的移動の解明とワンド環境特性との関係

  永山滋也, 太田宗宏, 加藤雅之, 源利文, 森誠一

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年11月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• 出水前後における魚類の環境DNA量の変化―止水域での追跡事例―

  稲川崇史, 沖津二朗, 源利文, 村岡敬子, 中村圭吾

  第2回環境DNA学会神戸大会, 2019年09月, 日本語, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた魚類モニタリングの実装に向けて

  源 利文

  応用生態工学会第23回広島大会, 2019年09月, 日本語, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Application of bamboo biomass resources in agrochemical-free rice farming: effects on Odonata diversity

  HUYNH Thien, Quang, SAKATA Masayuki, K, NAKAO Ryohei, NOMURA Shinya, KLAILATI Masfiro, MINAMOTO Toshifumi, USIO Nishikawa

  日本陸水学会第84回大会, 2019年09月, 英語, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAメタバーコーディングによる希少淡水魚ゼニタナゴと関連生物の探索

  坂田雅之, 土居秀幸, 真木伸隆, 上田夏希, 杉山秀樹, 源利文

  日本陸水学会第84回大会, 2019年09月, 日本語, 国内会議

  口頭発表（一般）


• アジの核およびミトコンドリアに由来する環境DNAの水温・バイオマス依存性

  徐寿明, 有本美於, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  令和元年度日本水産学会秋季大会, 2019年09月, 日本語, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 流域の⿂類相調査における環境DNAメタバーコーディング分析法の有効性について（神奈川県・⼩出川の事例報告）

  加藤敦子, 岡田泰明, 渡部健, 真木伸隆, 小菅敏裕, 池田幸資, 松島夕佳子, 坂田雅之, 源利文

  土木学会第74回年次学術講演会, 2019年09月, 日本語, 香川大学, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 採水量・採水位置の違いによる小出川における魚類相の検出精度について

  真木伸隆, 渡部健, 岡田泰明, 小菅敏裕, 池田幸資, 松島夕佳子, 坂田雅之, 源 利文

  土木学会第74回年次学術講演会, 2019年09月, 日本語, 香川大学（香川県高松市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 堆積物環境DNA分析の過去復元への応用可能性

  坂田雅之, 源利文

  日本進化学会第２１回大会, 2019年08月, 日本語, 北海道大学（札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析による個体数の推定

  深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和志, 源利文, 近藤倫生

  日本進化学会第２１回大会, 2019年08月, 日本語, 北海道大学（札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 感染症の生態学的分析における環境DNAの利用

  源利文

  日本進化学会第２１回大会, 2019年08月, 日本語, 北海道大学（札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Distributional pattern of black sea bream Acanthopagrus schlegelii estimated from environmental DNA: seasonal changes in marine and river waters

  SASANO Sachia, MURAKAMI Hiroaki, SUZUKI Keita W, YAMASHITA Yoh, MASUDA Reiji, MINAMOTO Toshifumi

  Fisheries Society of the British Isles, Symposium 2019, 2019年07月, 英語, University of Hull (Hull City, United Kingdom), 国際会議

  口頭発表（一般）


• Biomass-dependent emission of environmental DNA in jack mackerel Trachurus japonicus juveniles

  HORIUCHI Tomoya, MASUDA Reiji, MURAKAMI Hiroaki, YAMAMOTO Satoshi, MINAMOTO Toshifumi

  Fisheries Society of the British Isles, Symposium 2019, 2019年07月, 英語, University of Hull (Hull City, United Kingdom), 国際会議

  ポスター発表


• 陸上土壌サンプルに由来する外来アリ環境DNAの検出

  矢指本哲, 坂田雅之, 先田智也, 尾崎まみこ, 中嶋智子, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 野外におけるコイの環境RNAの検出

  姜明揚, 前川和也, 中尾遼平, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 熱帯の湿地における環境DNA分析手法の検討：ヴィクトリア湖のマンソン住血吸虫を例に

  大澤亮介, 板山朋聡, 二見恭子, 濱野真二郎, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 堆積物からの環境DNA抽出法の効率化

  坂田雅之, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 水生コウチュウ目の環境DNAメタバーコーディング手法の確立

  井上碧, 中尾遼平, 源利文, 篠原忠

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 水及び土壌由来環境DNAを用いた哺乳類相の推定

  速水花奈, 坂田雅之, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 種特異的な環境DNA分析を用いたマクロ生物の検出と定量への試み

  源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 市民による環境保全活動のツールとしての環境DNA

  源利文

  平成30年度発達支援インスティテュートシンポジウム, 2019年03月, 日本語, 神戸大学（神戸市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境RNA分析を用いた環境核酸の由来組織の推定

  釣健司, 池田静也, 廣原嵩也, 島田康人, 源利文, 山中裕樹

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析法を用いた琵琶湖におけるスジエビの動態の解明

  邬倩倩, 河野健, 石川俊之, 坂田雅之, 中尾遼平, 平岩将良, 辻冴月, 山中裕樹, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析を利用した六甲山地におけるヒダサンショウウオの生息実態調査

  岸本祥, 鈴木孝典, 中村淑樹, 齊藤博之, 飯塚徹谷, 横田雅弘, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いた外来魚種の定量の試み

  後藤成美, 速水花奈, 沖津二朗, 稲川崇史, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA解析による滋賀県におけるオオサンショウウオ生息実態調査の試み

  中川亮, 若山竣登, 城本裕基, 田中聡磨, 水戸直, 源利文, 西川完途, 松井正文, 齊藤修

  「地域自然史と保全研究発表会」 関西自然保護機構2019年度大会, 2019年03月, 日本語, 大阪市立自然史博物館（大阪市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAから読み解く六甲山周辺の土地利用と淡水魚類相の関係性

  中尾遼平, 平岩将良, 山本哲史, 宮正樹, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAから探る、日本固有種シシャモの遡上と分布

  八柳哲, 神戸崇, 水本寛基, 小林由美, 坂田雅之, 源利文, 石田良太郎, 新居久也, 荒木仁志

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 核DNAマーカーを用いたマアジ環境DNAの放出率および分解率の推定

  有本美於, 徐寿明, 村上弘章, 益田玲爾, 山本哲史, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 河川における環境DNAによるアカミミガメ防除効果の検証

  金山明理, 飯塚徹谷, 横田雅弘, 鈴木孝典, 岸本祥, 中村淑樹, 齊藤博之, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• メタバーコーディング解析を用いた両生類の環境DNA検出

  河田萌音, 倉林淳, RAMAMONJISOA Noerikanto, 夏原由博, 山中裕樹, 佐藤博俊, 坂田雅之, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• キタサンショウウオの環境DNA検出系の確立と釧路湿原での適用

  竹下大輝, 照井滋晴, 池田幸資, 三塚多佳志, OSATHANUNKUL Maslin, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• オオサンショウウオの繁殖行動は水で検出可能か？～人工巣穴での環境DNA調査より～

  森本哲平, 田口勇輝, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• Visualizing environmental DNA using cytogenetics

  JO Toshiaki, MURAKAMI Hiroaki, MASUDA Reiji, OHMIDO Nobuko, MINAMOTO Toshifumi

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 英語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• SNPマーカーを用いた環境DNA分析による遺伝変異の検出

  内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 日本語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• Application of bamboo biomass resources in agrochemical-free rice farming: effects onodonate diversity

  HUYNH Thien Quang, SAKATA Masayuki K, NAKAO Ryohei, MINAMOTO Toshifumi, LAILATI Masfiro, USIO Nisikawa

  第66回日本生態学会大会, 2019年03月, 英語, 神戸国際会議場・展示場（神戸市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境ＤＮＡ分析による水中生物のモニタリング

  源利文

  平成30年度鳥取県衛生環境研究所分野別研究会 生態系の保全と調査を考える勉強会, 2019年02月, 日本語, 鳥取大学（鳥取県鳥取市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 種特異的な環境DNA検出による希少種や外来種の分布状況調査

  源利文

  第64回日本水環境学会セミナー, 2019年01月, 日本語, 自動車会館（東京都千代田区）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA分析の発展と基礎的分析技術について

  源利文

  CREST「海洋生物多様性」研究領域シンポジウム, 2019年01月, 日本語, 笹川平和財団ビル（東京都港区）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 水中生物の世界を覗く科学のメガネ〜環境ＤＮＡ

  源利文

  平成30年度第2回大阪府高等学校生物教育研究会, 2018年12月, 日本語, ヴィアーレ大阪（大阪市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA分析の応用可能性：絶対量の推定と網羅的検出

  源利文

  山口大学環境DNA研究センターキックオフシンポジウム, 2018年12月, 日本語, 国際ホテル宇部（山口県宇部市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Spatio-temporal detection patterns of fish eDNA in lentic ecosystems

  MINAMOTO Toshifumi, HAYAMI Kana, SAKATA Masayuki K, OKITSU Jiro, MIYA Masaki, GOTOH Ryo O, SATO Hirotoshi, YAMANAKA Hiroki

  British Ecological Society Annual Meeting 2018, 2018年12月, 英語, Birmingham ICC, Birmingham, UK, 国際会議

  ポスター発表


• High water temperature and fish biomass can accelerate the shedding and degradation of the Japanese jack mackerel (Trachurus japonicus) environmental DNA

  JO Toshiaki, MURAKAMI Hiroaki, YAMAMOTO Satoshi, MASUDA Reiji, MINAMOTO Toshifumi

  British Ecological Society Annual Meeting 2018, 2018年12月, 英語, Birmingham ICC, Birmingham, UK, 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA: a different approach for food/water borne helminths studies

  SATO Marcello Otake, RAFALIMANANTSOA Armand, SATO Megumi, PONGVONGSA Tiengkham, MINAMOTO Toshifumi, WAIKAGUL Jitra, KAWAI Satoru, FORNILLOS Raffy Jay C, TABIOS Ian Kim B, LEONARD Lydia R, FONTANILLA Ian Kendrich C, CHIGUSA Yuichi

  Joint International Triopical Medicine Meeting 2018, 2018年12月, 英語, Amari Watergate Bangkok, Bangkok, Thailand, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Detection of zebrafish messenger RNAs from tank water: implications for the practicability of environmental RNA analysis for aquatic macroorganisms

  YAMANAKA Hiroki, TSURI Kenji, IKEDA Seiya, SHIMADA Yasuhito, MINAMOTO Toshifumi

  British Ecological Society Annual Meeting 2018, 2018年12月, 英語, Birmingham ICC, Birmingham, UK, 国際会議

  ポスター発表


• 水を汲むだけの環境調査～環境ＤＮＡ技術の紹介

  源利文

  日本技術士会近畿本部登録環境研究会, 2018年11月, 日本語, アーバネックス備後町ビル（大阪市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA：微生物からマクロ生物へ

  源利文

  第41回日本分子生物学会年会, 2018年11月, 日本語, パシフィコ横浜（横浜市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNA：水をくんで生物分布を知る新たな手法

  源利文

  神戸市生物多様性シンポジウム, 2018年11月, 日本語, 神戸市立王子動物園（神戸市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAメタバーコーディング手法を用いたダム湖の魚類相把握

  速水花奈, 坂田雅之, 沖津二朗, 片野泉, 宮正樹, 後藤亮, 佐藤博俊, 山中裕樹, 源利文

  応用生態工学会仙台 東北地域研究発表・シンポジウム, 2018年11月, 日本語, 三春交流館「まほら」（福島県三春町）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAによる魚類分布調査への応用

  源利文

  2018年度水産海洋学会研究発表大会シンポジウム, 2018年11月, 日本語, 東京大学大気海洋研究所（千葉県柏市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 堆積物由来環境DNA抽出法の改善と過去復元への展望

  坂田雅之, 源利文

  日本陸水学会第83回大会, 2018年10月, 日本語, 岡山大学（岡山市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境中のDNAを利用して水中の生物を知る

  源利文

  清心女子高校グリーンサイエンス, 2018年10月, 日本語, 清心女子高校, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA分析を用いた遺伝的多様性評価手法における検出力の検討

  辻冴月, 宮正樹, 潮雅之, 佐藤博俊, 源利文, 丸山敦, 山中裕樹

  2018年度日本魚類学会年会, 2018年10月, 日本語, 国立オリンピック記念青少年総合センター（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法を用いたヒメダカによる遺伝的撹乱の検出

  中尾遼平, 北川忠生, 源利文

  2018年度日本魚類学会年会, 2018年10月, 日本語, 国立オリンピック記念青少年総合センター（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 木曽川ワンド・たまりにおけるイタセンパラ稚魚の環境DNA検出精度の検証

  永山滋也, 太田宗宏, 藤田朝彦, 源利文, 森誠一

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 琵琶湖産スジエビの時空間分布および移動タイミングの推定

  鄔倩倩, 河野健, 石川俊之, 辻冴月, 山中裕樹, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 長良川, 揖斐川における環境DNA定量解析を用いた生物分布モニタリング～アユと冷水病菌の季節的相互関係を探る～

  廣瀬雅惠, 政井菜々美, 常川光樹, 土田康太, 高木雅紀, 矢追雄一, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 植食性昆虫の食痕からの環境DNA検出

  工藤葵, 源利文, 山本哲史

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境ＤＮＡ分析の基礎および希少種や外来種の分布調査法について

  源利文

  日本環境アセスメント協会関西支部平成30年度第一回公開技術セミナー, 2018年09月, 日本語, 大阪ガーデンパレス, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA分析手法を用いたオオサンショウウオの繁殖期推定

  森本哲平, 中尾遼平, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析を利用した宍道湖-中海に生息する魚介類の生態解明への試み

  高原輝彦, 山岸聖, 田口淳也, 池淵貴志, 立石新, 尾形茂紀, 稲岡悠樹, 服部真也, 黒瀬裕斗, 藤井正人, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA濃度の定量データと流動モデルの統合による個体数・生物量の推定

  深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田譲, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和士, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA調査のプロトコル～その基礎と失敗しないためのコツ～

  源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAを用いた北海道固有種シシャモSpirinchus lanceolatusの河川遡上パターン検出

  八柳哲, 神戸崇, 水本寛基, 小林由美, 鎌田頌子, 南波聡子, 新居久也, 源利文, 坂田雅之, 荒木仁志

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた沿岸魚類の定量の可能性

  源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNAを用いたため池における希少昆虫タガメと侵略的外来種の関係調査

  尾形茂紀, 西脇淳浩, 山添寛治, 土居秀幸, 源利文, 須貝杏子, 高原輝彦

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングによる琵琶湖周辺河川の魚類相調査および文献資料との検出傾向比較

  中川光, 源利文, 山本哲史, 佐藤行人, 佐土哲也, 宮正樹

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAメタバーコーディングによって明らかになった六甲山周辺地域の淡水魚類相

  中尾遼平, 山本哲史, 宮正樹, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAの放出と分解に対する水温とバイオマスの影響

  徐寿明, 村上弘章, 山本哲史, 益田玲爾, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAの概論

  源利文

  しが水環境ビジネス推進フォーラム研究・技術分科会, 2018年09月, 日本語, ピアザ淡海（滋賀県大津市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAから推測されるクロダイの分布様式：海洋および河川域での季節変化

  笹野祥愛, 村上弘章, 鈴木啓太, 源利文, 山下洋, 益田玲爾

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• トンボ目を対象とした環境DNAメタバーコーディング検出系の開発

  坂田雅之, 内田圭, 佐藤博俊, 山中裕樹, 中尾遼平, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• ダム湖における魚類環境DNAメタバーコーディング手法の最適化

  速水花奈, 坂田雅之, 沖津二朗, 片野泉, 宮正樹, 後藤亮, 佐藤博俊, 山中裕樹, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• アカミミガメを対象とした野外における環境ＤＮＡ検出阻害要因の検討：野外での環境ＤＮＡ検出確率の向上に向けて

  覺田青空, 東垣大祐, 源利文, 土居秀幸, 片野泉

  応用生態工学会第22回全国大会, 2018年09月, 日本語, 東京工業大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• アカミミガメを対象とした野外における環境DNA検出阻害要因の検討：野外での環境DNA検出確率の向上に向けて

  覺田青空, 東垣大祐, 源利文, 土居秀幸, 片野泉

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• Evaluation of the fish distribution and their environmental DNA in a semi-closed bay using a three-dimensional tracer model

  YOON Seokjin, KASAI Akihide, MURAKAMI Hiroaki, MINAMI Kenji, MASUDA Reiji, MIYASHITA Kazushi, MINAMOTO Toshifumi, KONDOH Michio

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 英語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• Environmental DNA metabarcoding reveals fish species in Qingdao Underwater World

  CHEN Zhi, SONG Na, GAO Tianxiang, XU Shengyong, WU Qianqian, LI Di, CHEN Jianwei, ZHAO Linlin, MINAMOTO Toshifumi

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 英語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• An optional cost-effective method of extracting environmental DNA from filter membranes in large scale eDNA surveys

  CHEN Zhi, SONG Na, GAO Tianxiang, XU Shengyong, WU Qianqian, LI Di, CHEN Jianwei, ZHAO Linlin, MINAMOTO Toshifumi

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 英語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 16SrRNAメタバーコーディングを用いた両生類の環境DNA検出

  河田萌音, 倉林敦, Noerikanto Ramamonjisoa, 夏原由博, 山中裕樹, 源利文

  第1回環境DNA学会東京大会, 2018年09月, 日本語, 日本科学未来館（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 川の科学捜査？環境DNAで水中の生物を調べる

  源利文

  平成30年度兵庫県内水面漁連役職員研修会, 2018年08月, 日本語, 兵庫県神崎支庁舎, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAによる水中生物調査の現在と未来

  源利文

  日本環境アセスメント協会北海道支部平成30年度第一回公開技術セミナー, 2018年08月, 日本語, 札幌市教育文化会館, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• The use of SNP markers in environmental DNA to detect intraspecific genetic variation

  UCHII Kimiko, DOI Hideyuki, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki

  2018 ESA Annual Meeting, 2018年08月, 英語, Ernest N. Morial Convention Center, New Orleans, Louisiana, USA, 国際会議

  ポスター発表


• Examining PCR protocol for amplifying whole mitochondrial DNA of fish from environmental DNA

  YAMANAKA Hiroki, HIRAO Yohei, SATO Hirotoshi, MINAMOTO Toshifumi

  2018 ESA Annual Meeting, 2018年08月, 英語, Ernest N. Morial Convention Center, New Orleans, Louisiana, USA, 国際会議

  ポスター発表


• 水中生物の世界を覗く未来のメガネ？〜環境DNA

  源利文

  青翔高等学校 平成30年度サイエンスギャラリー, 2018年07月, 日本語, 大阪国際交流センター, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAで水中生物を知る

  源利文

  武庫川流域環境講演会, 2018年06月, 日本語, 神戸市役所, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Maximizing the potential of environmental DNA metabarcoding for fish detection in lentic ecosystem

  MINAMOTO Toshifumi, HAYAMI Kana, SAKATA Masayuki K, OKITSU Jiro, MIYA Masaki, GOTOH Ryo O, SATO Hirotoshi, YAMANAKA Hiroki

  ASLO 2018 Summer Meeting, 2018年06月, 英語, Victoria Conference Centre, British Columbia, Canada, 国際会議

  ポスター発表


• Detection of genetic diversity of a fish population using environmental DNA metabarcoding: Analysis strategies for eliminating sequence artifacts

  TSUJI Satsuki, MIYA Masaki, USHIO Masayuki, SATO Hirotoshi, SATO Yukuto, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki

  The 8th East Asian Federation of Ecological Societies International Congress, 2018年04月, 英語, Nagoya University, Nagoya, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• 北海道のイワナ属はニジマスと共存できるか～環境 DNA を用いた３種の分布データをもとに～

  速水花奈, 坂田雅之, 今村彰生, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 舞鶴湾におけるマアジとカタクチイワシの環境DNAの水平・鉛直分布

  村上弘章, 山本哲史, 源利文, 南憲吏, 宮下和士, 深谷肇一, 尹錫鎭, 笠井亮秀, 澤田英樹, 鈴木啓太, 益田玲爾, 山下洋, 近藤倫生

  平成30年度日本水産学会春季大会, 2018年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 琵琶湖産スジエビの生活史多型に関連した遺伝的構造の解明

  邬倩倩, 高見泰興, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境RNA分析による遺伝子発現解析にむけた基礎技術の検討

  池田静也, 平尾陽平, 多田眞証, 佐藤博俊, 源利文, 山中裕樹

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境RNAを用いたコイの繁殖行動の検出

  前川和也, 源利文, 山本義彦

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析手法を用いたタイ肝吸虫の検出系の改善

  峠谷彩奈, サトウ恵, オオタケサトウマルセロ, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析手法における基礎研究の現状と展望

  徐寿明, 村上弘章, 益田玲爾, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析を用いた遺伝的多様性検出：アユ野外個体群への適用と検出力の検討

  辻冴月, 宮正樹, 潮雅之, 佐藤博俊, 佐藤行人, 源利文, 山中裕樹

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いたため池の生物多様性を規定する要因の解明 －トンボ類および魚類を用いた事例－

  坂田雅之, 内田圭, 佐藤博俊, 山中裕樹, 中尾遼平, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA手法を用いた淡水ガメの検出系の確立

  河田萌音, 上野真太郎, 亀崎直樹, 谷口真理, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA手法を用いたオオサンショウウオの繁殖期の推定

  森本哲平, 中尾遼平, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA手法によるヒダサンショウウオの定点モニタリング

  冨田勢, 神松幸弘, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA検出による両生類の分布推定と環境要因の分析

  三嶋達郎, 大西健夫, 岩澤淳, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いて調査したクロダイの沿岸依存性と産卵期・仔魚期の分布特性

  笹野祥愛, 村上弘章, 鈴木啓太, 源利文, 山下洋, 益田玲爾

  平成30年度日本水産学会春季大会, 2018年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いて宿主と病原生物の動態を探る

  内井喜美子, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAを用いた宍道湖ヤマトシジミ資源量推定への試み

  高原輝彦, 田口淳也, 池淵貴志, 内田浩, 石田健次, 山岸聖, 尾形茂紀, 土居秀幸, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAメタバーコーディングによる六甲山周辺地域の魚類相の解明

  中尾遼平, 山本哲史, 宮正樹, 源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAで繁殖期や繁殖場所を特定する

  源利文

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAからの魚類ミトコンドリア全長配列取得に向けたPCR条件の検討

  平尾陽平, 佐藤博俊, 源利文, 山中裕樹

  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）, 国内会議

  ポスター発表


• 沖縄県北部におけるレプトスピラ環境DNAに関する研究

  水山克, 佐藤行人, サトウ恵, 源利文, クラウディアトーマ

  第55回レプトスピラ・シンポジウム, 2018年03月, 日本語, 九州大学（福岡県博多市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• The impact of biodiversity in river on valuation of urban ecosystem services: the case of Hanshin region using eDNA and the residents' life satisfaction data

  AOSHIMA Ippei, NAKAO Ryohei, MINAMOTO Toshifumi, USHIMARU Atushi, SATO Masayuki

  The 65th Annual Meeting of Ecological Society of Japan, 2018年03月, 英語, Sapporo Convention Center, Sapporo, Japan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Environmental DNA: next generation monitoring method for aquatic biodiversity

  MINAMOTO Toshifumi

  11th International Symposium Exploring the Global Sustainability, 2018年03月, 英語, Graduate School of Human Development and Environment, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNAで生息するカメ類を調べる

  源利文

  シンポジウム「岡山の陸水の生き物を考える：カメを中心に」, 2018年02月, 日本語, 岡山理科大学（岡山県岡山市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境中のDNAを利用して水中の生物を知る

  源利文

  清心女子高校グリーンサイエンス, 2018年01月, 日本語, 清心女子高校, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Identifying a breeding habitat of a critically endangered fish, Acheilognathus typus, by combining eDNA and conventional surveys

  MINAMOTO Toshifumi, SAKATA K. Masayuki, MAKI Nobutaka, SUGIYAMA Hideki

  Ecology Across Borders: Joint Annual Meeting 2017, 2017年12月, 英語, ICC Ghent, Belgium, 国際会議

  ポスター発表


• Fish larvae inside? Indirect assessment of fish larvae presence in host mussels using environmental DNA analysis.

  YAMANAKA Hiroki, YONEKURA Ryuji, KOMATSU Fumiya, KAKAMU Hiroto, TAKINO Fumiya, TADA Satoru, YAMAMOTO Yoshihiko, MINAMOTO Toshifumi

  Ecology Across Borders: Joint Annual Meeting 2017, 2017年12月, 英語, ICC Ghent, Belgium, 国際会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析を用いた希少生物種の分布推定

  源利文

  環境技術学会技術セミナー「環境ＤＮＡの最前線」, 2017年11月, 日本語, 大阪教育大学（大阪）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• カンボジアのタイ肝吸虫症:新たな流行地域の確認

  宮本和子, 松田肇, 千種雄一, 桐木雅史, サトウマルセロ, 源利文

  グローバルヘルス合同大会, 2017年11月, 日本語, 東京大学（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Development of distribution survey method for macro-organisms using environmental DNA

  MINAMOTO Toshifumi

  第149回地球研セミナー "Observation, analysis and theory in ecology for next generations -What we have achieved in global environment studies-", 2017年11月, 英語, 総合地球環境学研究所（京都市）, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• The application of eDNA technique for the monitoring of marine fish species

  KONDOH Michio, ARAKI Hitoshi, KASAI Akihide, MASUDA Reiji, MINAMOTO Toshifumi, MIYA Masaki

  第33回個体群生態学会大会, 2017年10月, 英語, 九州大学（福岡県福岡市）, 国内会議

  ポスター発表


• 雄物川本流における絶滅危惧種ゼニタナゴの再発見と繁殖地特定

  坂田雅之, 真木伸隆, 杉山秀樹, 源利文

  日本陸水学会第８２回大会, 2017年09月, 日本語, 駒ケ岳グランドホテル（秋田県仙北市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 琵琶湖及び周辺内湖における環境DNA分析手法の適用例

  鄔倩倩, 河野健, 上原佳敏, 奥田昇, 辻冴月, 山中裕樹, 源利文

  日本陸水学会第８２回大会, 2017年09月, 日本語, 駒ケ岳グランドホテル（秋田県仙北市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 佐波川、高津川におけるオオカナダモの被度と環境DNA量との関係性

  赤松良久, 土居秀幸, 後藤益滋, 小室隆, 乾隆帝, 永野真理子, 源利文

  ELR2017名古屋, 2017年09月, 日本語, 名古屋大学（愛知県名古屋市）, 国内会議

  ポスター発表


• 希少生物調査における環境DNA手法の有効性の再確認-環境DNAを用いたゼニタナゴ新規繁殖地の発見

  真木伸隆, 坂田雅之, 杉山秀樹, 源利文, 土岐君仁

  土木学会第72回年次学術講演会, 2017年09月, 日本語, 九州大学（福岡県福岡市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析手法とは

  源利文

  日本陸水学会第82回大会, 2017年09月, 日本語, 駒ケ岳グランドホテル（秋田県仙北市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA分析によるイタセンパラのモニタリング調査手法の検討

  上月佐葉子, 山本義彦, 源利文, 渡部健, 上原一彦

  土木学会第72回年次学術講演会, 2017年09月, 日本語, 九州大学（福岡県福岡市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAによるため池の外来生物分布調査－ミシシッピアカミミガメにおける適用とPCR阻害要因の検討

  相馬理央, 源利文, 土居秀幸, 片野泉

  ELR2017名古屋, 2017年09月, 日本語, 名古屋大学（愛知県名古屋市）, 国内会議

  ポスター発表


• 核DNAマーカーを用いた環境DNA分析

  内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  日本陸水学会第８２回大会, 2017年09月, 日本語, 駒ケ岳グランドホテル（秋田県仙北市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 河川やダム湖の生物調査に環境DNAは有効か

  源利文

  ELR2017名古屋, 2017年09月, 日本語, 名古屋大学（愛知県名古屋市）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• アカミミガメを対象とした目視調査と環境DNA調査の精度比較：ため池への外来種侵入予測ポテンシャルマップ構築に向けて

  覺田青空, 東垣大祐, 相馬理央, 源利文, 土居秀幸, 片野泉

  日本陸水学会第８２回大会, 2017年09月, 日本語, 駒ケ岳グランドホテル（秋田県仙北市）, 国内会議

  ポスター発表


• Environmental DNA and its application in opisthorchiasis and schistosomiasis in endemic areas

  SATO Marcello Otake, RAFALIMANANTSOA-SOLOFONIAINA Armand, PONGVONGSA Tienkam, MINAMOTO Toshifumi, WAIKAGUL Jitra, KAWAI Satoru, CHIGUSA Yuichi

  第11回蠕虫研究会, 2017年09月, 英語, やすらぎ伊王島（長崎県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Quantitative monitoring of multispecies fish environmental DNA using high-throughput sequencing

  USHIO Masayuki, MURAKAMI Hiroaki, MASUDA Reiji, SADO Tetsuya, MIYA Masaki, SAKURAI Sho, YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi, KONDOH Michio

  2017 ESA Annual Meeting, 2017年08月, 英語, Oregon Convention Center, Portland, Oregon, U.S.A., 国際会議

  口頭発表（一般）


• Longer DNA fragments enables the improved estimation of distribution and biomass using environmental DNA

  MINAMOTO Toshifumi, JO Toshiaki, MURAKAMI Hiroaki, MASUDA Reiji, SAKATA Masayuki, YAMAMOTO Satoshi

  2017 ESA Annual Meeting, 2017年08月, 英語, Oregon Convention Center, Portland, Oregon, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA survey methods: Water sampling methods using an unmanned aerial vehicle

  DOI Hideyuki, AKAMATSU Yoshihisa, WATANABE Yutaka, GOTO Masuji, INUI Ryutei, KATANO Izumi, NAGANO Mariko, TAKAHARA Teruhiko, MINAMOTO Toshifumi

  2017 ESA Annual Meeting, 2017年08月, 英語, Oregon Convention Center, Portland, Oregon, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA reflects the spatial and temporal distribution of common prawn, Palaemon paucidens, in Lake Biwa

  WU Qianqian, ISHIKAWA Toshiyuki, TSUJI Satsuki, YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

  International Congress of Ecology 2017, 2017年08月, 英語, China National Convention Center, Beijing, China, 国際会議

  ポスター発表


• 水を汲むだけの生物調査：環境DNAを用いて水中生物の種類や量を把握する技術の開発

  源利文

  近未来への招待状 ～ナイスステップな研究者2016からのメッセージ～, 2017年07月, 日本語, 文部科学省（東京都）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 「環境DNA」で神戸港の魚を調べよう！

  源利文

  海を学ぼう！「海のサイエンス」体験ツアー, 2017年07月, 日本語, 神戸市産業振興センター（神戸市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• DNAを使って水中の生き物をしらべる

  源利文

  ひょうご環境体験館特別講演会, 2017年07月, 日本語, ひょうご環境体験館（兵庫県佐用町）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAとは何か

  源利文

  第47回北洋研究シンポジウム, 2017年06月, 日本語, 北海道大学（札幌市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Species-specific detection of vertebrates and invertebrates by eDNA analysis

  MINAMTO Toshifumi

  2017 International Workshop on Environmental Genomics, 2017年06月, 英語, St. Johns, Canada, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境中のDNAを用いた絶滅危惧種の生息地探索

  源利文

  日本分析化学会第77回分析化学討論会, 2017年05月, 日本語, 龍谷大学（京都市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNAを用いた希少種および外来種の分布調査法について

  源利文

  第６７回日吉ゼミナール, 2017年05月, 日本語, 株式会社日吉（滋賀県近江八幡市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Numerical simulation on distribution of environmental DNA of Japanese jack mackerel (Trachurus japonicus) in a semi-closed bay

  YOON Seokjin, KASAI Aikihide, YAMAMOTO Satoshi, MINAMOTO Toshifumi, MINAMI Kenji, MIYASHITA Kazushi, MASUDA Reiji, KONDOH Michio

  2017 The Korean Society of Fisheries and Aquatic Sciences Spring Meeting, 2017年05月, 英語, Korea, 国際会議

  口頭発表（一般）


• 水を調べれば生物がわかる〜驚異の＜環境ＤＮＡ＞

  源利文

  読売テクノ・フォーラム第202回研究交流会, 2017年04月, 日本語, 日本プレスセンター（東京都）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 雄物川本流における稀少淡水魚ゼニタナゴの再発見

  坂田雅之, 真木伸隆, 杉山秀樹, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 兵庫県篠山市の河川における希少魚種の環境DNA検出

  河野健, 清野未恵子, 丹羽英之, 篠谷和彦, 田井彰人, 坂田雅之, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 琵琶湖沿岸における残留スジエビの検出 〜環境DNA法を用いた解析〜

  鄔倩倩, 上原佳敏, 奥田昇, 辻冴月, 山中裕樹, 源利文

  平成29年度日本水産学会春季大会, 2017年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京都港区）, 国内会議

  ポスター発表


• 大量シーケンスを用いた魚類環境DNAの多種・定量的モニタリング

  潮雅之, 村上弘章, 益田玲爾, 佐土哲也, 宮正樹, 櫻井翔, 山中裕樹, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 堆積物からのマアジの環境DNAの検出:水槽実験とフィールドでの検証

  尾形瑞紀, 益田玲爾, 村上弘章, 余田昂彌, 澤田英樹, 山下洋, 源利文

  平成29年度日本水産学会春季大会, 2017年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京都港区）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境中のDNA情報を利用した 生物相調査手法の開発と実践

  源利文

  日本畜産学会第122回大会, 2017年03月, 日本語, 神戸大学（兵庫県神戸市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNA分析手法に基づいて作成した生息適地モデルの評価ーオオサンショウウオ（Andrial japonicus）を例にー

  日高舜介, 勝原光希, 富田勢, 丑丸敦史, 山本哲史, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析を用いた生物多様性調査法の進展と応用可能性

  源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA手法の感染症生態学への応用其の二:住血吸虫の検出

  渡辺真梨奈, オオタケサトウマルセロ, 桐木雅史, サトウ恵, 池田菫, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた種内変異の評価：NGS解析に由来する偽ハプロタイプを除去する新手法

  辻冴月, 宮正樹, 潮雅之, 佐藤行人, 山本哲史, 源利文, 山中裕樹

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いたクラゲ防除技術の開発: 季節的モニタリングとポリプからの検出

  余田昂彌, 益田玲爾, 村上弘章, 尾形瑞紀, 山下洋, 源利文

  平成29年度日本水産学会春季大会, 2017年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京都港区）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAメタバーコーディングは河川魚類群集の季節的変化を検出できる

  山本哲史, 宮正樹, 佐土哲也, 中川光, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAメタバーコーディングによる魚類相の 把握-六甲山系の小河川群における事例-

  中尾遼平, 山本哲史, 宮正樹, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAの分解とサイズ分画に及ぼす水温の影響

  徐寿明, 村上弘章, 余田昂彌, 尾形瑞紀, 山本哲史, 益田玲爾, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• 核DNAマーカーを用いた環境DNA分析による交雑個体群の遺伝構造解析

  内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 異なるハビタットにおけるスズキ稚魚の生息密度と環境DNAの関係

  村上弘章, 曽我部共生, 鈴木勇人, 源利文, 笠井亮秀, 鈴木啓太, 山下洋, 益田玲爾

  平成29年度日本水産学会春季大会, 2017年03月, 日本語, 東京海洋大学（東京都港区）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• ユニバーサルプライマーを用いたサンショウウオ属(Hynobius)の環境DNA検出

  冨田勢, 神松幸弘, 山中裕樹, 永野昌博, 佐藤拓哉, 高原輝彦, 沢田隼, 勝原光希, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• ダム湖における環境 DNA を用いた生物検出法の最適化

  池田紗季, 沖津二朗, 一柳英隆, 片野泉, 中井克樹, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• カワバタモロコをモデルケースにした環境DNAを用いた最適な生物量推定方法の検討

  髙原輝彦, 松本宗弘, 源利文, 土居秀幸

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• Environmental DNA as an ecological tool for salmonid fish distribution

  ARAKI Hitodhi, KANBE Takashi, MIZUMOTO Hiroki, TAKAHARA Teruhiko, MINAMOTO Toshifumi

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 英語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• eDNA 分析で明らかになった琵琶湖産スジエビの時空間的分布

  邬倩倩, 石川俊之, 辻冴月, 山中裕樹, 高見泰興, 源利文

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 日本語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  ポスター発表


• A large scale study of aquatic plants according to eDNA analysis

  FUJIWARA Ayaka, UCHIDA Kei, SATO Hirotoshi, HAYASHI Norio, MINAMOTO Toshifumi

  第64回日本生態学会大会, 2017年03月, 英語, 早稲田大学（東京都）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いた新たな水中生物相調査手法の発展

  源利文

  第38回 グリーンサイエンスセミナー, 2017年01月, 日本語, 福山大学（広島県福山市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 新しい生物調査法「環境DNA分析」〜一杯の水から生息種がわかる〜

  源利文

  とよなか市民環境会議アジェンダ21 2016年度第一回自然学習講座, 2016年12月, 日本語, NPO法人とよなか市民環境会議アジェンダ21, 豊中市立中央公民館, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 舞鶴湾におけるマアジの環境DNA分布に関する数値実験

  尹錫鎭, 笠井亮秀, 山本哲史, 源利文, 南憲吏, 宮下和士, 益田玲爾, 近藤倫生

  2016年度水産海洋学会研究発表大会, 2016年11月, 日本語, 東京海洋大学（東京都港区）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 半水棲哺乳類ヌートリアの環境DNA分析による検出

  山中裕樹, 源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  ポスター発表


• 堆積物中の環境DNAを用いた魚類DNAのメタバーコーディング

  坂田雅之, 山本哲史, 宮正樹, 源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境中水でタイ肝吸虫 Opisthorchis viverrini DNA を検出するための環境 DNA 手法の開発

  サトウ恵, 橋爪裕宜, SATO Otake Marcello, YOONUAN Tippayarat, SURAPOL Sanguankiat, 池田菫, PONGVONGSA Tiengkham, 門司和彦, 源利文

  第57回日本熱帯医学会大会, 2016年11月, 日本語, 一橋大学（東京都千代田区）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析の現状と課題

  源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA研究におけるSNPマーカーの活用

  内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いた淀川における天然記念物イタセンパラの生息調査

  山本義彦, 近藤美麻, 内藤馨, 上原一彦, 上月佐葉子, 渡部健, 鶴田哲也, 稲波璃香, 源利文

  日本陸水学会第81回大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いた生態系の調査手法と水環境管理への応用可能性

  源利文

  第10回公益財団法人河川財団名古屋研究発表会, 2016年11月, 日本語, ウインクあいち（愛知県名古屋市）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNAを用いた渓流棲両生類ハコネサンショウウオOnychodactylus japonicusの分布調査

  片野泉, 原田憲, 相馬理央, 酒多勇輔, 源利文, 土居秀幸

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いたオオサンショウウオの生息適地モデルの作成と評価

  日高舜介, 勝原光希, 富田勢, 丑丸敦史, 山本哲史, 源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAによる魚類の生物分布・生物量推定:リアルタイムPCRとデジタルPCRの比較

  土居秀幸, 内井喜美子, 高原輝彦, 松橋彩衣子, 山中裕樹, 源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• ユニバーサルプライマーを用いたサンショウウオ類の環境DNA検出

  冨田勢, 神松幸弘, 山中裕樹, 永野昌博, 佐藤拓哉, 高原輝彦, 沢田隼, 源利文

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• ミシシッピアカミミガメの生息域調査：環境DNA技術の適用とPCR阻害要因の検討

  相馬理央, 源利文, 土居秀幸, 片野泉

  第81回日本陸水学会大会, 2016年11月, 日本語, 琉球大学（沖縄県）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Environmental DNA anlysis: introduction and some examples of target species detection

  MINAMOTO Toshifumi

  The 5th Japan-Taiwan Ecology Workshop, 2016年11月, 英語, Ryukoku University, Kyoto, Japan, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Application of environmental DNA to detect Opisthorchis viverrini in water sample in Savhannakhet, Laos

  SATO Megumi, HASHIZUME Hiroki, SATO Marcello Otake, IKEDA Sumire, YOONUAN Tippayarat, SANGUANKIAT Surapol, PONGVONGSA Tiengkham, MOJI Kazuhiko, MINAMOTO Toshifumi

  The 10th National Health Research Forum, Laos, 2016年10月, 英語, Savannakhet, Laos, 国際会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析を用いた淀川におけるイタセンパラ生息域の推定

  上月佐葉子, 稲波璃香, 源利文, 上原一彦, 山本義彦

  日本土木学会第71回年次学術講演会, 2016年09月, 日本語, 宮城県仙台市（東北大学）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAによる天然記念物イタセンパラのモニタリングの試み

  山本義彦, 内藤馨, 上原一彦, 鶴田哲也, 上月佐葉子, 渡部健, 稲波璃香, 源利文

  2016年度日本魚類学会年会, 2016年09月, 日本語, 岐阜県岐阜市（岐阜大学）, 国内会議

  ポスター発表


• Year-round migration history of ayu sweetfish assessed by environmental DNA analysis: Implications for conservation and fisheries management

  YAMANAKA Hiroki, SAKURAI Sho, YAMAMOTO Daisuke, YAMAMOTO Toshiya, MINAMOTO Toshifumi

  Ecological Society of America Annual Meeting 2016, 2016年08月, 英語, Fort Lauderdale, Florida, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Use of environmental DNA to survey the distributions of the salamander and fish species

  KATANO Izumi, HARADA Kei, SOUMA Rio, SAKATA Yusuke, DOI Hideyuki, MINAMOTO Toshifumi

  Ecological Society of America Annual Meeting 2016, 2016年08月, 英語, Fort Lauderdale, Florida, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Use of Environmental DNA for detection of fish-water borne zoonosis and perspectives to the application of the technology in Madagascar

  SATO Marcello Otake, SATO Megumi, MINAMOTO Toshifumi

  第２４回分子寄生虫学ワークショップ／第１４回分子寄生虫・マラリア研究フォーラム合同大会, 2016年08月, 英語, 帯広畜産大学（帯広市）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Estimating the distribution of the Japanese giant salamander (Andrias japonicus) by ecological niche modeling based on environmental DNA detection

  MINAMOTO Toshifumi, HIDAKA Shunsuke, KATSUHARA Koki, TOMITA Sei, YAMAMOTO Satoshi, USHIMARU Atushi

  Ecological Society of America Annual Meeting 2016, 2016年08月, 英語, Fort Lauderdale, Florida, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA method for estimating fish abundance and biomass

  DOI Hideyuki, INUI Ryutei, UCHII Kimiko, AKAMATSU Yoshihisa, KANNO Kazuki, MATSUHASHI Saeko, TAKAHARA Teruhiko, YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

  Ecological Society of America Annual Meeting 2016, 2016年08月, 英語, Fort Lauderdale, Florida, U.S.A., 国際会議

  口頭発表（一般）


• Application of environmental DNA to analysis of mitochondrial haplotypes of fish

  TSUJI Satsuki, YAMANAKA Hiroki, MIYA Masaki, YAMAMOTO Satoshi, MINAMOTO Toshifumi

  Ecological Society of America Annual Meeting 2016, 2016年08月, 英語, Fort Lauderdale, Florida, U.S.A., 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA analysis provides "snapshots" of species distribution

  MINAMOTO Toshifumi

  International symposium on alternative stable states: a unifying concept in global change ecology, 2016年07月, 英語, Kyoto University, Kyoto, Japan, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Application of environmental DNA analysis to ecological surveys

  MINAMOTO Toshifumi

  International Symposium of Probiotics Application on Aquaculture, 2016年07月, 英語, National Kaohsiung Marine University, Kaohsiung, Taiwan, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境中のDNA情報を用いて生物分布を知る

  源利文

  兵庫バイオテクノロジー研究会第35回特別講演会, 2016年06月, 日本語, 兵庫県神戸市（神戸大学）, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境中のDNAからさぐる水中の生物多様性

  源利文

  京都産業大学バイオフォーラム, 2016年06月, 日本語, 京都産業大学（京都市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNA

  源利文

  第26回環境アセスメント動物調査手法講演会, 2016年06月, 日本語, 大阪市立大学（大阪府大阪市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Analysis on relationship between fish distribution and environmental DNA in a semi -closed bay using a three dimensional regional circulation model

  YOON Seokjin, KASAI Akihide, YAMAMOTO Satoshi, MINAMI Kenji, MINAMOTO Toshifumi, MIYASHITA Kazushi, MASUDA Reiji, KONDOH Michio

  2016 Korean Society of Oceanology Spring Meeting, 2016年05月, 英語, Busan, Korea, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 堆積物からの環境DNA検出

  坂田雅之, 山本哲史, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析手法を用いたオオサンショウウオ(Andrias japonicus)の広域調査

  日髙舜介, 勝原光希, 冨田勢, 丑丸敦史, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析によるアユのミトコンドリアDNAハプロタイプの検出

  辻冴月, 宮正樹, 佐藤行人, 山本哲史, 源利文, 山中裕樹

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析によってどのような情報が得られるのか？

  源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA手法を用いたタイ肝吸虫Opisthorchis viverriniの環境水中からの検出

  橋爪裕宜, サトウ恵, Marcello Otake SATO, Tippayarat, YOONUAN, Surapol SANGUANKIAT, Tiengkham, PONGVONGSA, 門司和彦, 源利文

  第85回日本寄生虫学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮崎県宮崎市（宮崎市民プラザ）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法の感染症生態学への応用：タイ肝吸虫Opisthorchis viverriniの検出

  橋爪裕宜, サトウ恵, Marcello Otake SATO, Tippayarat, YOONUAN, Surapol SANGUANKIAT, Tiengkham, PONGVONGSA, 門司和彦, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA研究の実践と課題：生態学フロンティアへの挑戦

  荒木仁志, 神戸崇, 鎌田頌子, 源利文, 佐藤行人, 宮正樹

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA技術を沈水植物に適用する:調査手法の検討と有用性の評価

  松橋彩衣子, 源利文, 藤原綾香, 渡邉園子, 山中裕樹, 土居秀幸

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA解析用ユニバーサルプライマー’MiFish’を用いた広域河川魚類相調査

  中川光, 源利文, 山本哲史, 佐藤行人, 宮正樹

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた流水環境におけるアユの生物量の推定

  高原輝彦, 森下大悟, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文, 川田暁

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAメタバーコーディングを用いた淀川の魚類相モニタリング

  稲波璃香, 山本義彦, 近藤美麻, 上原一彦, 佐藤行人, 宮正樹, 山本哲史, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAの断片長による見た目の分解速度の違い

  徐寿明, 村上弘章, 坂田雅之, 益田玲爾, 山本哲史, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• 沿岸海域における環境DNAの分散過程に関する生簀を用いた検証実験

  村上弘章, 尹錫鎭, 笠井亮秀, 源利文, 山本哲史, 坂田雅之, 堀内智矢, 澤田英樹, 益田玲爾

  平成28年度日本水産学会春季大会, 2016年03月, 日本語, 東京都港区（東京海洋大学）, 国内会議

  口頭発表（一般）


• マルチプレックスPCRを用いた兵庫県内のため池における在来魚と外来魚の分布状況の把握

  福岡有紗, 丑丸敦史, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• デジタルPCRを用いた生物分布・生物量推定

  土居秀幸, 内井喜美子, 高原輝彦, 松橋彩衣子, 源利文, 山中裕樹

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• サンショウウオ属を対象としたユニバーサルプライマーによる環境DNAの検出

  冨田勢, 神松幸弘, 山中裕樹, 永野昌博, 源利文

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  ポスター発表


• SNPの定量的解析による遺伝子型頻度の推定

  内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹

  第63回日本生態学会大会, 2016年03月, 日本語, 宮城県仙台市（仙台国際センター）, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Spatial and temporal distribution surveys for marine jellyfish using environmental DNA

  MINAMOTO Toshifumi, FUKUDA Miho, KATSUHARA Kohki, FUJIWARA Ayaka, HIDAKA Shunsuke, YAMAMOTO Satoshi, MASUDA Reiji

  2015 Annual Meeting British Ecological Society, 2015年12月, 英語, Edinburgh, UK, 国際会議

  ポスター発表


• eDNA based non-invasive method to analyze mitochondrial haplotype of fish

  TSUJI Satsuki, YAMAMOTO Satoshi, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki

  2015 Annual Meeting British Ecological Society, 2015年12月, 英語, Edinburgh, UK, 国際会議

  ポスター発表


• 新たな環境DNAマーカーとしての核DNAの利用

  源利文, 高原輝彦, 北吉匠文, 辻冴月, 山中裕樹, 内井喜美子, 土居秀幸

  日本陸水学会第80回大会, 2015年09月, 日本語, 北海道函館市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境影響評価における新しい調査手法の試み- 環境DNAを用いたニホンザリガニ生息場の推定-

  池田幸資, 土居秀幸, 高原輝彦, 源利文, 鈴木透, 小泉逸郎, 田中一典, 布川雅典

  日本土木学会第70回年次学術講演会, 2015年09月, 日本語, 岡山県岡山市(岡山大学), 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境影響評価における新しい調査手法の試み-環境DNAを用いたイタセンパラ生息の推定-

  上月佐葉子, 渡部健, 源利文, 上原一彦, 山本義彦

  日本土木学会第70回年次学術講演会, 2015年09月, 日本語, 岡山県岡山市(岡山大学), 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA分析によるコイの季節移動の推定

  内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  日本陸水学会第80回大会, 2015年09月, 日本語, 北海道函館市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法の新展開:魚類個体群の遺伝的多様性評価の試み

  辻冴月, 山中裕樹, 源利文, 山本哲史

  日本陸水学会第80回大会, 2015年09月, 日本語, 北海道函館市, 国内会議

  ポスター発表


• デジタルPCRを用いた環境DNAによる生物量・生物分布推定

  土居秀幸, 内井喜美子, 高原輝彦, 松橋彩衣子, 山中裕樹, 源利文

  日本陸水学会第80回大会, 2015年09月, 日本語, 北海道函館市, 国内会議

  ポスター発表


• ため池の環境DNA量と生物量の比較:池干し時の採捕調査による検証

  相馬理央, 片野泉, 源利文, 高原輝彦, 土居秀幸

  日本陸水学会第80回大会, 2015年09月, 日本語, 北海道函館市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 水を汲むだけで生物分布がわかる？環境DNA 手法の開発と実践

  源利文

  第30回環境計量技術事例発表会, 2015年07月, 日本語, 兵庫県計量協会環境計量証明部会, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Environmental DNA Assessment of Rare Endemic Species and Closely Related Exotic Species: A Case Study of Giant Salamanders in Japan

  MINAMOTO Toshifumi, FUKUKMOTO Sou, HIDAKA Shunsuke, USHIMARU Atushi

  2015 Society of Wetland Scientist Annual Meeting, 2015年06月, 英語, Providence, Rhode Island, USA, 国際会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析を用いた希少在来種と近縁外来種の流域スケール調査：京都府桂川のオオサンショウウオを例に

  福本想, 丑丸敦史, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法を用いた在来および外来コイの生息地利用の推定

  内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法の新たな展開〜沈水植物の検出法の開発〜

  藤原綾香, 松橋彩衣子, 土居秀幸, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA技術を利用した沈水植物の生物量推定

  松橋彩衣子, 源利文, 藤原綾香, 渡邉園子, 土居秀幸

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA技術を用いた，ため池の生物分布調査：池干しによる採捕調査との比較

  相馬理央, 片野泉, 源利文, 高原輝彦, 土居秀幸

  日本陸水学会近畿支部会第26回研究発表会, 2015年03月, 日本語, 京都府京都市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いた魚類モニタリング

  源利文, 近藤倫生, 笠井亮秀

  日本海洋学会 2015年度春季大会 沿岸海洋シンポジウム「沿岸海洋学における観測研究の最前線I」, 2015年03月, 日本語, 東京都港区, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAを用いたクラゲ類の分布調査～舞鶴湾のアカクラゲを例に～

  福田向芳, 益田玲爾, 藤原綾香, 山本哲史, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAの正体を探る：挙動の分析と観察によるアプローチ

  橋爪裕宜, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAとマルチプレックスPCRを用いた複数魚種の同時検出

  福岡有紗, 丑丸敦史, 源利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  ポスター発表


• eDNA解析による舞鶴湾におけるマアジ資源量の推定

  山本哲史, 南憲吏, 深谷肇一, 益田玲爾, 宮下和士, 近藤倫生, 源 利文

  日本生態学会第62回全国大会, 2015年03月, 日本語, 鹿児島県鹿児島市, 国内会議

  ポスター発表


• Assessment of the effect of artificial obstructions on fish migration in a river using environmental DNA

  YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

  Joint 2014 Annual Meeting British Ecological Society and Société Française d’Ecologi, 2014年12月, 英語, Lille, France, 国際会議

  口頭発表（一般）


• A basin-scale application of environmental DNA assessment for rare endemic and exotic giant salamander species in Japan

  MINAMOTO Toshifumi, FUKUMOTO Sou, USHIMARU Atushi

  Joint 2014 Annual Meeting British Ecological Society and Société Française d’Ecologie, 2014年12月, 英語, Lille, France, 国際会議

  ポスター発表


• 魚類環境DNA用ユニバーサルプライマーの開発と次世代シーケンサを用いた分析法の確立

  宮正樹, 佐藤行人, 福永津嵩, 佐土哲也, 佐藤圭一, 源利文, 山中裕樹, 荒木仁志, 岩崎渉

  2014年度日本魚類学会年会, 2014年11月, 日本語, 神奈川県小田原市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Development of a method for detecting inhabitation of the Dojo loach using environmental DNA

  KOIZUMI Noriyuki, TAKAHARA Teruhiko, MINAMOTO Toshifumi, DOI Hideyuki, MORI Atsushi, WATABE Keiji, TAKEMURA Takeshi

  PAWEES 2014 International Conference, 2014年10月, 英語, Kaohsiung, Taiwan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• 集団における外来遺伝子頻度を定量する環境DNA手法の開発と野外への適用

  内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹

  日本陸水学会第79回大会, 2014年09月, 日本語, 茨城県つくば市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNA手法の希少生物種調査への応用: 兵庫県下のため池におけるカワバタモロコの分布調査

  源利文, 福岡有紗, 高原輝彦, 兵庫県立農業高校生物部

  日本陸水学会第79回大会, 2014年09月, 日本語, 茨城県つくば市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• ため池の動物プランクトン群集の規定要因:生産性,生態系サイズ,捕食者に着目した解析

  片野泉, 名倉明日子, 濱野紗耶加, 土居秀幸, 高原輝彦, 源利文

  日本陸水学会第79回大会, 2014年09月, 日本語, 茨城県つくば市, 国内会議

  ポスター発表


• Community ecology using environmental DNA

  DOI Hideyuki, TAKAHARA Teruhiko, MINAMOTO Toshifumi

  Evolutionary Community Ecology 2014, 2014年09月, 英語, Kyoto, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 水から抽出したDNAを用いて生息魚類を検出する方法の試み

  小出水規行, 高原輝彦, 源利文, 土居秀幸, 渡部恵司, 森淳, 竹村武士

  平成26年度農業農村工学会大会講演会, 2014年08月, 日本語, 新潟県新潟市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• The Japanese Society for Ecology and Health: J-EcoHealth - An Introduction

  J-Ecohealth

  EcoHealth2014 (The 5th Biennial Conference of the International Association for Ecology & Health), 2014年08月, 英語, Montréal, Canada, 国際会議

  ポスター発表


• Monitoring upstream migration of fish using environmental DNA: Towards a more efficient method for assessing habitat connectivity

  YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

  2014 ESA Annual Meeting, 2014年08月, 英語, Sacramento, CA, USA, 国際会議

  ポスター発表


• Marine fish surveys using environmental DNA

  MINAMOTO Toshifumi, MASUDA Reiji, TAKAHASHI Kohji, MARUYAMA Atsushi, YAMANAKA Hiroki, KASAI Akihide, KONDOH Michio

  2014 ESA Annual Meeting, 2014年08月, 英語, Sacramento, CA, USA, 国際会議

  ポスター発表


• Impact of expansion of wet rice fields on the risk of liver fluke infection in Lao P.D.R.

  MOJI Kazuhiko, PONGVONGSA Tiengkham, PHONGMANY Panom, KOUNNAVONG Sengchanh, AKKAVONG Kongsap, PHROMMALA Souraxay, BOUPHA Boungnong, TOJO Bunpei, JIANG Honwei, NISHIMOTO Futoshi, SATO Megumi, MINAMOTO Toshifumi, KOHMATSU Yukihiro, MARUYAMA Atsushi, FUNATSU Kohei, IWASAKI Shinpei, TOMITA Shinsuke, TOMOKAWA Sachi, KANEDA Eiko, WIKAGUL Jitra, WATANABE Chiho

  EcoHealth2014 (The 5th Biennial Conference of the International Association for Ecology & Health), 2014年08月, 英語, Montréal, Canada, 国際会議

  ポスター発表


• Why probability literacy is important to resolve framing conflicts in environmental issues?

  EBINA Kuniyoshi, IWAMURA Yasunobu, KAWAKATSU Kazuya, OKABE Yasuyuki, UMEMURA Kaito, ODA Toshikatsu, MINAMOTO Toshifumi, NAKAYAMA Akie, ITOH Masayuki

  14th SCA Annual Conferenc, 2014年06月, 英語, Kuala Lumpur, Malaysia, 国際会議

  口頭発表（一般）


• 同種内外来種の侵入規模の迅速把握

  内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹

  日本生態学会第61回全国大会, 2014年03月, 日本語, 広島県広島市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 水生生物の移動分散モニタリングへの環境DNA技術の適用：流水環境における研究例と展望

  山中裕樹, 源利文, 櫻井翔, 大垣寿々香

  日本生態学会第61回全国大会, 2014年03月, 日本語, 広島県広島市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAとフェノロジー研究: 現状と未来

  土居秀幸, 高原輝彦, 源利文

  日本生態学会第61回全国大会, 2014年03月, 日本語, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 核DNAをマーカーとした環境DNA解析

  源利文

  日本生態学会第61回全国大会, 2014年03月, 日本語, 広島県広島市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• オオクチバス等の外来魚モニタリングにおける環境DNA技術の有用性の検証－調査手法の違いによる結果の比較を通して―

  高原輝彦, 源利文, 土居秀幸, 木塚俊和, 満尾世志人, 角田裕志, 高村典子

  日本生態学会第61回全国大会, 2014年03月, 日本語, 広島県広島市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Large-scale environmental DNA assessment for Japanese and Chinese giant salamanders in Katsura River, Japan

  FUKUMOTO Sou, USHIMARU Atushi, MINAMOTO Toshifumi

  Frontiers in Amphibian Biology: Endangered Species Conservation and Genome Editing, 2014年03月, 英語, Higashi-Hiroshima City, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Environmental DNA release velocity from different sized fish

  MARUYAMA Atsushi, NAKAMURA Keisuke, YAMANAKA Hiroki, KONDOH Michio, MINAMOTO Toshifumi

  The 61st Annual Meeting of the Ecological Society of Japan, 2014年03月, 英語, Hiroshima City, Japan, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA分析による生物の分布および生物量の推定技術

  山中裕樹, 源利文

  第25回龍谷大学新春技術講演会, 2014年01月, 日本語, 滋賀県大津市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA技術で多様性の湖に挑む

  丸山敦, 近藤倫生, 山中裕樹, 森口滉也, 源利文, RUSUWA Bosco

  第25回龍谷大学新春技術講演会, 2014年01月, 日本語, 滋賀県大津市, 国内会議

  ポスター発表


• 見えない生き物を見つけ出す環境DNA技術

  源利文

  夢・化学21 高校生のための化学講座（浜松）, 2013年12月, 日本語, 静岡大学（静岡県浜松市）, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 環境DNAを用いた水中生物モニタリングの現状

  源利文

  第29回個体群生態学会大会, 2013年10月, 日本語, 大阪府堺市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNAを利用した同種内外来種の迅速把握

  内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹

  日本陸水学会第78回大会, 2013年09月, 日本語, 滋賀県大津市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた在来および外来オオサンショウウオの検出

  福本想, 丑丸敦史, 源利文

  日本陸水学会第78回大会, 2013年09月, 日本語, 滋賀県大津市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• STIに向けた政策プロセスへの関心層別関与フレーム設計

  工藤充, 加納圭, 水町衣里, 秋谷直矩, 森村吉貴, 高梨克也, 森幹彦, 元木環, 後藤崇志, 吉澤剛, 菅万希子, 伊藤真之, 蛯名邦禎, 源利文, 中山晶絵, 前波晴彦, 日置弘一郎, 丁瀟君

  第8回科学コミュニケーション研究会年次大会, 2013年09月, 日本語, 京都大学, 国内会議

  ポスター発表


• 上海における環境意識に関する質問票調査

  高野宏平, 蒋宏偉, 福士由紀, 張文明, 源利文

  中国環境問題研究拠点 国際シンポジウム「東アジアにおける都市化と福祉・環境問題—上海を中心に—」, 2013年07月, 日本語, 総合地球環境学研究所 中国環境問題研究拠点, 総合地球環境学研究所, 国際会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Using environmental DNA to estimate the distributions and biomass of fish

  TAKAHARA Teruhiko, DOI Hideyuki, MINAMOTO Toshifumi

  26th International Congress for Conservation Biology (ICCB 2013), 2013年07月, 英語, Baltimore, MD, USA, 国際会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 川の水をはかれば生き物がわかる？～環境DNA研究の最先端～

  源利文

  サイエンス・カフェひょうごin佐用, 2013年03月, 日本語, 兵庫県佐用町, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• 先端技術（環境DNA，次世代シーケンス）を使って生態学を変えていくには？

  土居秀幸, 高原輝彦, 源利文

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  [招待有り]

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境DNA分析の実用化：野外で使える前処理法の検討

  中貴文, 源利文, 門司和彦, 丸山敦

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNA技術を用いた外来種モニタリング手法の開発

  高原輝彦, 土居秀幸, 源利文

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境DNAを用いてタイ肝吸虫の生態を探る

  源利文, 中貴文, 船津耕平, 神松幸弘, 川端善一郎, 丸山敦, Tiengkham Pongvongsa, 門司和彦

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた魚類の在不在判定による遡河行動のモニタリング

  山中裕樹, 源利文

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• メコン中流域の魚類の移動と寄生虫感染率の変化

  船津耕平, 丸山敦, 神松幸弘, 源利文, 門司和彦

  日本生態学会第60回大会, 2013年03月, 日本語, 日本生態学会, 静岡県静岡市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた微生物マッピング：コイヘルペスウイルスを例に

  源利文

  第二回同位体環境学シンポジウム, 2013年02月, 日本語, 京都府京都市, 国内会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 環境改変と感染症―琵琶湖のコイヘルペスウイルス病を例に―

  源利文

  国際シンポジウム「湖の現状と未来可能性」, 2013年01月, 日本語, 中国上海市, 国際会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Detection and quantification of fish presence and biomass using environmental DNA to monitor population sustainability

  TAKAHARA Teruhiko, DOI Hideyuki, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki, KAWABATA Zen'ichiro

  The 9th International Conference on Environmental, Cultural, Economic and Social Sustainability, 2013年01月, 英語, Hiroshima City, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Monitoring of fish pathogenic viruses in freshwater environments

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, KAWABATA Zen'ichiro

  EcoHealth2012, 2012年10月, 英語, Kunming City, China, 国際会議

  ポスター発表


• 環境水中のウィルス定量：水域生態系での感染症研究への適用

  本庄三恵, 源利文, 川端善一郎

  日本陸水学会第77回大会, 2012年09月, 日本語, 日本陸水学会, 名古屋大学, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 環境DNAを用いた魚類相の定性的把握法

  源利文, 山中裕樹, 高原輝彦, 本庄三恵, 川端善一郎

  日本陸水学会第77回大会, 2012年09月, 日本語, 日本陸水学会, 愛知県名古屋市, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• 核酸の動態から感染症の生態を探る

  内井喜美子, 源利文, 川端善一郎

  日本陸水学会第77回大会, 2012年09月, 日本語, 日本陸水学会, 名古屋大学, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• ため池の水生動物モニタリングに環境DNAを応用する

  高原輝彦, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹, 川端善一郎

  日本陸水学会第77回大会, 2012年09月, 日本語, 日本陸水学会, 愛知県名古屋市, 国内会議

  [招待有り]

  口頭発表（招待・特別）


• Transmission dynamics of an emerging pathogen Cyprinid herpesvirus 3 and its impact on host population genetic structure

  UCHII Kimiko, OKUDA Noboru, MINAMOTO Toshifumi, TELSHOW Arndt, KAWABATA Zen'ichiro

  2012 ASLO Aquatic Sciences Meeting, 2012年07月, 英語, ASLO, Otsu City, Shiga, Japan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Seasonal and spatial distribution of Cyprinid herpesvirus 3 in water and sediment of a lagoon of Lake Biwa, Japan

  HONJO Mie N, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki, TAKAHARA Teruhiko, KAWABATA Zen'ichiro

  2012 ASLO Aquatic Sciences Meeting, 2012年07月, 英語, ASLO, Otsu City, Shiga, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Detection and quantification of fish presence/biomass in ponds using environmental DNA

  TAKAHARA Teruhiko, DOI Hideyuki, MINAMOTO Toshifumi, YAMANAKA Hiroki, KAWABATA Zen'ichiro

  2012 ASLO Aquatic Sciences Meeting, 2012年07月, 英語, ASLO, Otsu City, Shiga, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• 新興病原体コイヘルペスウイルスの野生宿主個体群における持続性

  内井喜美子, 源利文, 川端善一郎

  日本生態学会第59回大会／第５回東アジア生態学会連合大会合同大会, 2012年03月, 日本語, 日本生態学会, EAFES, 滋賀県大津市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 湖水中に溶存するDNA断片から魚類のバイオマスを推定する

  高原輝彦, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹, 川端善一郎

  日本生態学会第59回大会／第５回東アジア生態学会連合大会合同大会, 2012年03月, 日本語, 日本生態学会, EAFES, 滋賀県大津市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Seasonal and spatial distribution of Cyprinid herpesvirus 1 and Cyprinid herpesvirus 2 in Lake Biwa, Japan

  HONJO Mie N, MINAMOTO Toshifumi, KAWABATA Zen'ichiro

  Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ and The 5th EAFES International Congress, 2012年03月, 英語, 日本生態学会, EAFES, Otsu City, Shiga, Japan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Dynamics of koi herpesvirus and related factors in freshwater environments (EAFES Symposium ES09: Interactions of pathogen-host with environments)

  MINAMOTO Toshifumi

  Joint Meeting of The 59th Annual Meeting of ESJ and The 5th EAFES International Congress, 2012年03月, 英語, Otsu Ciyu, Shiga, Japan, 国際会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• 感染症の生態学的解析：コイヘルペスウイルス病を例に

  源利文, 川端善一郎

  感染症若手フォーラム2012, 2012年02月, 日本語, 長崎県長崎市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境の変化と魚の病気

  源利文

  第10回 地球研地域連携セミナー「水辺の保全と琵琶湖の未来可能性」, 2012年01月, 日本語, 滋賀県大津市, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Koi herpesvirus disease as a model of environmental disease

  MINAMOTO Toshifumi, Members of RIHN, Prohect

  The 6th RIHN International Symposium, 2011年10月, 英語, Kyoto City, Japan, 国際会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• KHV dynamics in natural freshwater environments.

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, YAMANAKA Hiroki, UCHII Kimiko, KAWABATA Zen'ichiro

  Emergence of Viral Diseases: Ecology and Evolution of Koi Herpes Virus, 2011年07月, 英語, Muenster, Germany, 国際会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• Dynamics of Cyprinid herpesvirus 3 in natural environments in Japan

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, KAWABATA Zen'ichiro

  4th Congress of European Microbiologists, FEMS 2011, 2011年06月, 英語, FEMS, Geneva City, Switzerland, 国際会議

  ポスター発表


• 水温の変動パタンが魚類の生理コストに与える影響について

  山中裕樹, 源利文, 高原輝彦, 川端善一郎

  日本生態学会第58回大会, 2011年03月, 日本語, 日本生態学会, 北海道札幌市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境DNAを用いた魚類相把握法の開発

  源利文, 本庄三恵, 山中裕樹, 川端善一郎

  日本生態学会第58回大会, 2011年03月, 日本語, 日本生態学会, 北海道札幌市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• コイヘルペスウイルス（KHV）病の発症率はストレスの影響を受けるか？

  高原輝彦, 本庄三恵, 源利文, 伊東尚史, 川端善一郎

  日本応用動物昆虫学会第55回大会, 2011年03月, 日本語, 日本応用動物昆虫学会, 福岡県福岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• コイヘルペスウイルス病が琵琶湖の野生型コイへもたらした影響

  内井喜美子, 奥田昇, 源利文, 川端善一郎

  日本生態学会第58回大会, 2011年03月, 日本語, 日本生態学会, 北海道札幌市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• コイにとっての岸辺環境の有用性とストレス回避のトレードオフ

  高原輝彦, 山中裕樹, 鈴木新, 本庄三恵, 源利文, 米倉竜次, 板山朋聡, 神松幸弘, 伊東尚史, 川端善一郎

  日本生態学会第58回大会, 2011年03月, 日本語, 日本生態学会, 北海道札幌市, 国内会議

  ポスター発表


• 中国雲单省Erhai湖における水温の時空間分布パターン

  山中裕樹, 源利文, Deyi Wu, Hainan Kong, Zhi-hong Wei, Liu Bin, 川端善一郎

  日本陸水学会第75回大会, 2010年09月, 日本語, 日本陸水学会, 青森県弘前市, 国内会議

  ポスター発表


• 全国の自然河川におけるコイヘルペスウイルスの分布

  源利文, 本庄三恵, 山中裕樹, 内井喜美子, 川端善一郎

  日本陸水学会第75回大会, 2010年09月, 日本語, 日本陸水学会, 青森県弘前市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 魚類の多様性と視物質の分子進化

  源利文

  平成22年度 日本動物学会中部地区大会公開シンポジウム, 2010年07月, 日本語, 日本動物学会中部支部会, 岐阜県岐阜市, 国内会議

  公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等


• Seasonal dynamics of CyHV-3 in natural freshwater environments

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, KAWABATA Zen'ichiro

  Workshop on the Linkage between CyHV-3 (KHV) and Humans, 2010年05月, 英語, Jerusalem, Israel, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Detection of cyprinid herpesvirus-3 (CyHV-3) in environmental water and sediments

  HONJO Mie N, MINAMOTO Toshifumi, KAWABATA Zen'ichiro

  Workshop on the Linkage between CyHV-3 (KHV) and Humans, 2010年05月, 英語, Jerusalem, Israel, 国際会議

  口頭発表（一般）


• 堆積物におけるコイヘルペスウイルスの検出・定量

  本庄三恵, 源利文, 川端善一郎

  日本生態学会第57回大会, 2010年03月, 日本語, 日本生態学会, 東京都目黒区, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 環境水中の低密度ウイルスに対する濃縮システムの開発

  田中伸幸, 板山朋聡, 源利文, 本庄三恵, 川端善一郎

  第44回日本水環境学会年会, 2010年03月, 日本語, 日本水環境学会, 福岡県福岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• コイヘルペスウイルス感染症と人間の相互作用環

  源利文, 本庄三恵, 内井喜美子, 山中裕樹, 鈴木新, 神松幸弘, 米倉竜次, 大森浩二, 板山朋聡, 田中伸幸, 浅野耕太, 白江祐介, 奥田昇, 川端善一郎

  日本生態学会第57回大会, 2010年03月, 英語, 日本生態学会, 東京都目黒区, 国内会議

  シンポジウム・ワークショップパネル（指名）


• コイの行動性体温調節と環境水温の時空間的不均一性がコイヘルペスウイルス症の蔓延に与える影響について

  山中裕樹, 曽我部篤, 大森浩二, 源利文, 三木健, 齋藤保久, 内井喜美子, 本庄三恵, 鈴木新, 神松幸弘, 川端善一郎

  日本生態学会第57回大会, 2010年03月, 日本語, 日本生態学会, 東京都目黒区, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 野外におけるコイの行動性体温調節とその季節変化：コイヘルペスウイルス病蔓延時期との対応について

  山中裕樹, 曽我部篤, 大森浩二, 源利文, 内井喜美子, 本庄三恵, 鈴木新, 神松幸弘, 川端善一郎

  日本陸水学会第74回大会, 2009年09月, 日本語, 日本陸水学会, 大分県大分市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 琵琶湖におけるコイヘルペスウイルスの動態解析

  源利文, 本庄三恵, 川端善一郎

  日本陸水学会第74回大会, 2009年09月, 日本語, 日本陸水学会, 大分県大分市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Microarray analysis of circadian gene expressions in Ciona intestinalis

  MATSUMAE Hiromi, MINAMOTO Toshifumi, HANAI Shuji, ISHIWATA Ryosuke, Izumi, K, OGISHIMA Soichi, TANAKA Hiroshi, SATOH Nori, ISHIDA Norio

  The 5th International Tunicate Meeting, 2009年06月, 英語, Naha City, Okinawa, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Seasonal distribution of cyprinid herpesvirus 3 in Lake Biwa

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, KAWABATA Zen'ichiro

  Workshop on CyHV-3 disease in an environment-human linkage, 2009年04月, 英語, Kyoto City, Japan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• 琵琶湖におけるコイヘルペスウイルスの分布と季節変化

  源利文, 本庄三恵, 川端善一郎

  日本生態学会第56回大会, 2009年03月, 日本語, 日本生態学会, 岩手県盛岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 湖岸形態と水温分布：魚類への影響の考察

  山中裕樹, 神松幸弘, 源利文, 本庄三恵, 内井喜美子, 鈴木新, 川端善一郎

  日本生態学会第56回大会, 2009年03月, 日本語, 日本生態学会, 岩手県盛岡市, 国内会議

  ポスター発表


• ウイルス状粒子の迅速濃縮法とKHVの検出

  田中伸幸, 板山朋聡, 源利文, 本庄三恵, 川端善一郎

  第42回日本水環境学会大会, 2009年03月, 日本語, 日本水環境学会, 愛知県名古屋市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• カタユウレイボヤの概日リズム

  松前ひろみ, 源利文, 花井修二, 大石勝隆, 安住薫, 石渡龍輔, 荻島創一, 田中博, 佐藤矩行, 石田直理雄

  第15回日本時間生物学会学術大会, 2008年11月, 日本語, 日本時間生物学会, 岡山県岡山市, 国内会議

  ポスター発表


• 環境水中に存在するコイヘルペスウイルスの定量

  本庄三恵, 源利文, 松井一彰, 内井喜美子, 山中裕樹, 鈴木新, 神松幸弘, 飯田貴次, 川端善一郎

  日本陸水学会第73回大会, 2008年10月, 日本語, 日本陸水学会, 北海道札幌市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Development of a Rapid Concentration System for Virus in Environmental Water

  TANAKA Nobuyuki, ITAYAMA Tomoaki, HONJO Mie N, MINAMOTO Toshifumi, KAWABATA Zen'ichiro

  12th International Conference on Integrated Diffuse Pollution Management (IWA DIPCON 2008), 2008年08月, 英語, Khon Kaen City, Thailand, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Relationship of lake morphometry and shore configuration to the temperature distribution in lagoons, and implications for its effect on fish health

  YAMANAKA Hiroki, SOGABE Atsushi, KOHMATSU Yukihiro, MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie. N, UCHII Kimiko, SUZUKI Alata A, OMORI Koji, KAWABATA Zen'ichiro

  International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages, 2008年06月, 英語, Kyoto City; Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Quantification method of Koi herpesvirus (KHV) in environmental water using cation-coated filter method and external standard virus

  HONJO Mie N, MINAMOTO Toshifumi, MATSUI Kazuaki, UCHII Kimiko, YAMANAKA Hiroki, SUZUKI Alata A, KOHMATSU Yukihiro, KAWABATA Zen'ichiro

  International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages, 2008年06月, 英語, Kyoto City; Japan, 国際会議

  ポスター発表


• International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages

  KAWABATA Zen'ichiro, MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, UCHII Kimiko, YAMANAKA Hiroki, SUZUKI Alata A, KOHMATSU Yukihiro

  International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages, 2008年06月, 英語, Kyoto City, Japan, 国際会議

  口頭発表（一般）


• Development of an on site rapid concentration system for virus in environmental water

  ITAYAMA Tomoaki, TANAKA Nobuyuki, MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, KAWABATA Zen'ichiro

  International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages, 2008年06月, 英語, Kyoto City; Japan, 国際会議

  ポスター発表


• Detection of koi herpesvirus DNA from natural river water

  MINAMOTO Toshifumi, HONJO Mie N, UCHII Kimiko, YAMANAKA Hiroki, SUZUKI Alata A, KOHMATSU Yukihiro, KAWABATA Zen'ichiro

  International Symposium on Environmental Change, Pathogens, and Human Linkages, 2008年06月, 英語, Kyoto City; Japan, 国際会議

  ポスター発表


• カタユウレイボヤのcDNAマイクロアレイの数理解析による時計候補遺伝子の抽出

  松前ひろみ, 源利文, 花井修二, 大石勝隆, 安住薫, 石渡龍輔, 荻島創一, 田中博, 佐藤矩行, 石田直理雄

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会, 2007年12月, 日本語, 日本分子生物学会, 日本生化学会, 神奈川県横浜市, 国内会議

  ポスター発表


• カタユウレイボヤ（Ciona intestinalis）の概日リズム

  源利文, 花井修次, 大石勝隆, 門田幸二, 佐藤矩行, 佐竹正延, 安住薫, 石田直理雄

  第13回日本時間生物学会学術大会, 2006年11月, 日本語, 日本時間生物学会, 東京都千代田区, 国内会議

  ポスター発表


• カタユウレイボヤ（Ciona intestinalis）における概日振動遺伝子群の探索

  源利文, 花井修次, 大石勝隆, 門田幸二, 佐藤矩行, 佐竹正延, 安住薫, 石田直理雄

  日本動物学会第77回大会, 2006年09月, 日本語, 日本動物学会, 島根県松江市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• カタユウレイボヤ（Ciona intestinalis）の概日振動遺伝子群

  源利文, 花井修次, 大石勝隆, 門田幸二, 佐藤矩行, 佐竹正延, 安住薫, 石田直理雄

  第12回日本時間生物学会大会, 2005年11月, 日本語, 日本時間生物学会, 茨城県つくば市, 国内会議

  ポスター発表


• ニホンミツバチにおける新たなperiod遺伝子 mRNAバリアントの解析

  源利文, 渕側太郎, 清水良訓, 清水勇

  日本動物学会第75回大会, 2004年09月, 日本語, 日本動物学会, 神戸市灘区, 国内会議

  ポスター発表


• ニホンミツバチ及び膜翅目昆虫におけるperiod遺伝子mRNAバリアントの解析

  源利文, 清水勇

  日本動物学会第74回大会, 2003年09月, 日本語, 日本動物学会, 北海道函館市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• アユの錐体視物質遺伝子に関する研究

  源利文, 清水勇

  日本動物学会第73回大会, 2002年09月, 日本語, 日本動物学会, 石川県金沢市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• Studies of opsin genes in a smelt fish, Ayu (Plecoglossus altivelis).

  MINAMOTO Toshifumi, SHIMIZU Isamu

  The 1st Asian Conference on Photobiology, 2002年06月, 英語, Higashiura Town, Hyogo, Japan, 国際会議

  ポスター発表


• アユのVAオプシンに関する研究

  源利文, 清水勇

  日本動物学会第72回大会, 2001年10月, 日本語, 日本動物学会, 福岡県福岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• バイカル湖における水中光の分光放射特性

  源利文, 清水勇, 道之前允直, 東正彦, 中西正己

  第65回日本陸水学会大会, 2000年09月, 日本語, 日本陸水学会, 福岡県福岡市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• アユの視物質遺伝子に関する研究（２）

  源利文, 清水勇

  日本動物学会第70回大会, 1999年09月, 日本語, 日本動物学会, 山形県山形市, 国内会議

  口頭発表（一般）


• 魚類の視物質及びチトクロームb遺伝子の分子進化

  源利文, 清水勇

  日本動物学会第68回大会, 1997年10月, 日本語, 日本動物学会, 奈良県奈良市, 国内会議

  口頭発表（一般）