SEARCH

Search Details

NAKATA Shuya
Graduate School of System Informatics / Department of System Informatics
Assistant Professor

Research activity information

■ Award
  • Oct. 2024 CBI学会2024年大会, Excellent Presentation Award, Exploring Synthetically Accessible Chemical Spaces with Product-of-Expert Chemical Language Models
    中田柊也

  • Oct. 2024 CBI学会2024年大会, Student Travel Award, Exploring Synthetically Accessible Chemical Spaces with Product-of-Expert Chemical Language Models
    中田柊也

  • Oct. 2022 CBI学会2022年大会, Excellent Poster Award, Protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models
    中田柊也

  • Sep. 2022 第11回生命医薬情報学連合大会, 優秀ポスター賞, Diffusion-based generative modelによるタンパク質-リガンド結合構造生成
    中田柊也

■ Paper
■ MISC
  • 深層生成モデルを用いた分子動力学シミュレーションの高速化
    中田柊也
    15 Dec. 2024, CBI学会誌, 12(4) (4), Japanese
    Book review

■ Lectures, oral presentations, etc.
  • 生成モデルの基礎と生命科学への応用
    中田柊也
    2025年度 情報処理学会関西支部 定期講演会, Nov. 2025, Japanese
    [Invited]
    Public discourse

  • Controlling Molecular Conformation Sampling with Diffusion Models via Bias Potentials
    中田柊也
    CBI学会2025年大会, Oct. 2025, Japanese
    Oral presentation

  • Exploring Synthetically Accessible Chemical Spaces with Product-of-Expert Chemical Language Models
    中田柊也
    第14回CBI若手の会講演会, Feb. 2025, Japanese
    [Invited]
    Invited oral presentation

  • Exploring Synthetically Accessible Chemical Spaces with Product-of-Expert Chemical Language Models
    中田柊也
    CBI学会2024年大会, Oct. 2024, Japanese
    Oral presentation

  • Efficient exploration of ultra-large virtual chemical spaces with product-of-experts chemical language models
    Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka
    ACS Fall 2024, Aug. 2024
    Oral presentation

  • SMILES言語モデルを用いた仮想化合物空間の効率的な探索
    中田柊也
    第455回CBI学会講演会, May 2024, Japanese
    [Invited]
    Invited oral presentation

  • Efficient exploration of the chemical space through the composition of property-specific SMILES language models
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    第8回ケモインフォマティクス秋の学校, Nov. 2023, English
    Poster presentation

  • Efficient Exploration of Combinatorial Chemical Spaces with Composite SMILES Language Models
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    第46回ケモインフォマティクス討論会, Nov. 2023, English
    Poster presentation

  • Composing Property-Specific SMILES Language Models for Multi-Objective Drug-Like Molecule Generation
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    CBI学会2023年大会, Oct. 2023, English
    Poster presentation

  • End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models
    中田柊也
    第7回CBI若手の会講演会, Dec. 2022, Japanese
    [Invited]
    Invited oral presentation

  • Protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    CBI学会2022年大会, Oct. 2022, English
    Poster presentation

  • Diffusion-based generative modelによるタンパク質-リガンド結合構造生成
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    第11回生命医薬情報学連合大会, Sep. 2022, Japanese
    Poster presentation

  • Molecular dynamics simulations of GABAA receptor and general anesthetics
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    CBI学会2021年大会, Oct. 2021, English
    Poster presentation

  • 全原子及び粗視化分子動力学シミュレーションによる全身麻酔薬分子機構の解析
    中田柊也, 森義治, 田中成典
    第15回分子科学討論会, Sep. 2021, Japanese
    Poster presentation

■ Research Themes
  • 拡散モデルに基づく分子立体構造サンプリング手法の開発
    中田 柊也
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究, 神戸大学, Apr. 2026 - Mar. 2029

TOP